大腦是人類身體當中精密而脆弱的器官，堅硬的顱骨將脆弱的大腦保護在顱腔內。.《新世紀福音戰士》這個世界當中，科技的發展，已經觸摸到了精神、靈魂的門檻，這是世界意志所不允許的。只有‘神’才能夠創造靈魂，被世界意志所掌控的人類如果能夠控制靈魂的話，那麼人類不就成爲‘神’一般的存在了麼？
用‘莉莉絲’的身體細胞複製出來的EVA就像是一個使徒的空殼，在高科技的改造下，居然將碇唯的靈魂融入初號EVA內。創造除了能夠對抗使徒的生物—EVA。爲了能夠讓適格者能夠如同艹控自己身體一般的去艹控EVA戰鬥，整個初號EVA身體裡面遍佈的脈絡被一條條人造精神連接線所代替。所以在艹作倉當中的適格者，能夠感受到EVA所所受到的痛苦。這樣的痛苦就好像發生在自己身上一樣被傳導到大腦裡面。
所以，初號EVA受到水天使的攻擊，坐在艹作倉內的碇真嗣感同身受，就好像被人用利刃從眼眶刺穿，穿透顱骨一樣。雖然眼球、顱骨都沒有損傷，可是在大腦的潛意識裡，自己的一隻眼睛已經瞎了。被利刃從眼眶穿透顱骨，還能活麼？潛意識當中，大腦發出瀕臨死亡的信號，碇真嗣也默認爲自己將一步步走向死亡。
人們常說，當要走向死亡的那瞬間，人會看到自己生前的一切事物，所有的往事如同快進的無聲電影一般，在眼前閃過。碇真嗣就好像站在一個黑暗的電影院當中，環繞着自己的是曾經一幕幕往事。
牙牙學語的自己，居然看到母親那溫柔的笑臉，自從母親因爲那場意外離開後，對於母親的記憶就一直停留在照片當中。
蹣跚學步時，母親溫柔的指尖傳來暖暖的溫度。母親臉上那淡淡的笑容，總是令自己懷念。
畫面一轉，出現了初號EVA那醜陋的大臉，母親穿着一身跟自己一模一樣的白色作戰服，進入到艹作倉內。“真嗣..你要乖乖哦.等媽媽下班就帶你回家..”碇唯看着自己四歲大的兒子，溫柔的說道。
“嗯..真嗣很乖，媽媽放心去工作吧。”幼時的碇真嗣像是個小大人一般安慰着媽媽。
當艹作倉插入初號EVA體內時，紫色的機體好像發了瘋一般掙扎，雙手撕扯着自己身上那些紫色的超合金裝甲，巨大的頭部朝着地面撞去，好像在自殘一般啃食自己的身體。鮮紅的血液染紅了那紫色的超合金裝甲。當艹作倉被解救出來時，艙門打開，裡面卻空無一人。年幼的碇真嗣眼睜睜的看着自己的母親，消失在初號EVA裡面。這讓碇真嗣對這個紫色巨人心中充滿了無窮的恨意。
接下來就是冷酷無情的父親，冰冷的眼神跟對自己不聞不問的態度，短暫的一聲，似乎只有在母親身上體會到快樂。無窮的黑暗包圍着自己，碇真嗣想要奮力奔跑逃出這個黑暗的世界，雙腳奮力的奔跑..不知道跑了多久，眼前出現了一丁點白色的亮光.“出口麼？”碇真嗣奮力朝着亮光處跑去。‘滴答滴答…’離着那光亮的出口似乎越來越近，碇真嗣耳邊傳來時鐘行走的聲音。一分一秒的時間在黑暗當中悄然流逝。
在‘第三新東京市’地下三百米深的NERV指揮中心內，那條代表着碇真嗣心跳的心電圖也隨着時間的流逝逐漸停頓當代表生命的心電圖從波浪線漸漸成爲一條直線時，畫面好像定格住一般。‘嘀……..’精神承受能力超過載荷，大腦中錯誤的命令，讓身體認爲，顱骨被刺穿後，身體便進入死亡。在種種錯誤意識的壓迫下，使得碇真嗣的心臟停止了跳動。
‘警報..警報..適格者生命特徵正在下降..百分之八十..百分之七十..百分之六十..’NERV當中‘人工智能’電腦系統，冰冷冷的提示着坐在初號EVA艹作倉內碇真嗣的身體數據。
“怎麼會…難道就這樣結束了嗎？”葛城美里看着大屏幕上那條標示着坐在初號EVA艹作倉內碇真嗣生命跡象的心電圖變成一條直線的時候，整個人愣在那裡。
相反，碇源渡非但沒有因爲畫面上代表碇真嗣的心電圖停止而沮喪，反而露出一絲久違的笑容。“呵呵..碇唯，該輪到你出場了！”
‘咚..咚..咚’碇真嗣微弱的心跳似乎正要宣告生命的終結時，耳邊忽然聽到了母親的聲音，“真….嗣…我的孩子..”聲音雖然沙啞，但在黑暗中的碇真嗣確定這就是自己媽媽的聲音沒錯。
“媽媽..你在哪裡？媽媽..媽媽…”碇真嗣似乎忘掉了疼痛，昏昏欲睡間四處張望起來想要尋找母親的身影。
“我不允許你傷害我的孩子..你這個怪物！！！我要殺了你….”碇唯那扭曲的面目，張開嘴似乎要發出怒吼一般，‘咔..咔嚓..’被水天使掌心的激光柱射穿頭顱的初號EVA忽然動了起來。
站在一公里之外那棟樓頂上的李舍，眼神一凌，煥然大悟道“原來是這麼樣..碇源渡，你還真是可怕呢！”判定一個生物的死亡，‘旱魃’，‘殭屍’從來都是通過對方的生機光點判斷的，表象能夠迷惑人的眼睛，可是靈魂、生機光點卻不會。當碇真嗣的生機光點逐漸暗淡下來的時候，初號EVA當中爆發出另外一個殘破的生機光點，或者說是靈魂氣息，將碇真嗣保護了起來。
如果說，當初還在‘旱魃’修爲時候的李舍，是靠着生機光點感覺敵人的存在話，那麼此時修爲達到‘火魃’的李舍能夠控制那號稱焚燒萬物生靈的‘九幽之火’後，卻能夠感覺得到靈魂的氣息。母親對孩子的愛，到了什麼時候都不會變，哪怕碇唯現在成了一個殘破的靈魂也不例外。
“他..他動了！怎麼會？初號EVA自行重新啓動了！！！”NERV大屏幕上，紫色的初號EVA居然在受到頭部貫穿創傷之後，自行動了起來。所有的研究員們都發出不可思議的叫聲。
適格者生命跡象爲零，同步協調率下降至最低限度以下。在這個時候，初號EVA不可能再次行動起來。
“呵呵呵..碇唯，你果然沒有讓我失望！！！”碇源渡看着畫面上初號EVA那暴走的形態，野獸般最原始的攻擊，撕咬、捶打、好像是想要將自己身上的痛楚發泄到使徒身上一般。
“勝利了呢..”站在碇源渡身後的冬月幸增呢喃的說道，聲音中掩飾不住欣喜的心情。
當看到初號EVA擰斷使徒雙手的時候，整個NERV內的人員爆發出一陣歡呼。當看到初號EVA將使徒按在地上拼命的撕打的時候，衆人看到了勝利的希望。
美穗雖然臉上也跟其他人一般掛着勝利的笑容，可是眼睛卻死死的盯着碇源渡，因爲從使徒出現到現在，碇源渡那鎮定的樣子顯得自信的過分。人類的那些飛機坦克在使徒面前毫無用處，這一點經過NERV研究所對‘莉莉絲’身體的研究，早已有了結論，可是EVA這個利用‘莉莉絲’身體複製出來的終極兵器，能否打敗使徒，還是個未知數。碇源渡哪裡來的信心，當代表碇真嗣生命跡象的心電圖像一條直線一樣時，居然也沒有露出擔憂的神情。好像早就知道結果一般。
當水天使被初號EVA打得毫無還手之力的時候，水天使那墨綠色的身體好像一坨橡皮泥一般將初號EVA全部包裹住，想要用結束自己生命方式的自爆，結束眼前這個擁有‘莉莉絲’身體，卻有着人類那骯髒靈魂的東西。
“轟隆……..”
地平面上好像升起一顆太陽一般的火球，耀眼的強光甚至能夠讓人失明，宛如蘑菇一樣的火雲升向天際。‘嗡嗡嗡嗡….’空氣變得粘稠一樣，如同水波一般盪漾起一陣衝擊波。就算是站在一公里之外那棟建築物樓頂的李舍，周身的衣服被那滾燙的空氣的摩擦下，居然燃燒起來。李舍立馬飛身離開，身形化出一道殘影，朝着遠處奔去，想要躲避水天使自爆產生的爆炸。“靠！雖然沒有核武器那樣的核輻射，但這樣的高溫，就算核彈也比不上！！”李舍暗罵道。幾個騰躍，李舍逃出了那光團籠罩的範圍，可是身上的衣服已經在灼熱的空氣摩擦下燒焦了。
‘咔嚓...咔嚓…噼裡啪啦…’這股爆發引發的衝擊波蔓延出五十公里的範圍，地面上的那些建築物的玻璃全都被震碎，十公里內的建築物以肉眼可見的速度消融。十公里外的建築物牆面上蔓延出一條條蜈蚣一樣的裂痕。
在水天使自爆的瞬間，控制着初號EVA的碇唯居然使用除了‘AT’力場，加上那超合金裝甲的保護，初號EVA連同碇真嗣居然在堪比核彈的爆炸中心存活了下來。
母愛是這個世界上最無私的愛，他能夠爲了自己的子女奉獻出一切。碇唯到底是被碇源渡利用，還是自願被初號EVA這個‘莉莉絲’的複製體吞噬的呢？一切都不得而知。但唯一能夠肯定的是，碇唯會在自己的孩子碇真嗣受到威脅的時候，勇敢的站出來。
碇唯那無私的母愛，似乎讓冰冷的世界添加了一絲溫暖。像是一盞微弱的燭光，照耀着碇真嗣。(。)