再說軒轅即位後，總結神農氏炎帝時代的農業生產經驗，祭祀天地百神，劃野分州，計田設井，教民因時播種五穀蔬菜，馴養畜禽。軒轅和他的臣下，有很多發明創造。傳說他命大撓制定天干地支，用來計算年月日，從此中國有了年月日的計算，後人稱之爲“黃帝歷”或者“黃曆”。
而後，軒轅又命容成製作蓋天（渾天儀之類），觀察天象；使羲和佔日，常儀佔月，臾區占星宿；命隸首作算數，制定度量衡之制，用來計量物之輕重、長短、多寡；命倉頡完善文字；命寧封爲陶正，製作釜、甑、碗、碟，進一步完備人們的飲食器物；命赤將爲木正，共鼓、揮作弓，夷牟作矢，雍父作杵、臼；
繼承發揚伏羲所傳的音樂之道，命伶倫定律呂，將竹管截成十二個長短不同的竹段，按照聲音的高下清濁分爲十二個音階，製成各種樂器；命榮猨鑄十二鍾，以和五音；命元妃嫘祖教民養蠶制絲，供作衣料；伯余製作衣裳和鞋子。
軒轅自己作冕垂旒充纊，定玄衣黃裳，於是袞冕衣服之制興。興建築宮室，以避寒暑。與岐伯、雷公探討醫藥之學，將神農所留之術發揚廣大。命俞跗、岐伯、雷公察明堂，究息脈；巫彭、桐君處方餌，防治疾病。
至此，人族又一次飛躍，神農讓位之事，頓時成一段佳話。
軒轅爲帝，是土德，土爲黃色，故名黃帝。但三皇五帝未齊，人族尚未圓滿，劫難自然要來。
那在偏遠之地的九黎部落的強者蚩尤，覺得部落的生活太過清苦，人族弱小能佔得福地，心裡實在不平衡，最後忍耐不住爆發了，率領九黎族，在東方大肆征討！而這蚩尤也是奇特，巫族的血脈，人族的魂魄，竟然修煉到了大巫之境界。而這讓刑天卻是驚訝莫名。
“你是說那蚩尤？”乾元最近一直都在穩定心境，對外面的事情幾乎不管不問，因此對神農已經歸位，軒轅接位的事情全部都不知道，如果不是今天刑天來問他蚩尤的事情，他還真不知道時間已經過了那麼久了。
“恩，我巫族就剩下相柳，我，九鳳三個大巫，我怎麼會在洪荒之中感受到其他大巫的氣息，雖然陌生，但是敢肯定那是巫族大巫不會錯。”刑天見乾元眉頭一挑就知道，他一定知道。
“恩，你說的不錯，蚩尤的確是你巫族大巫不假，但他也是人族蚩尤。”乾元沒有擡頭，繼續煉他的丹藥，說了句讓刑天莫名其妙的話。
“什麼意思？”刑天眉頭一鄒，他自然知道這些人都是說一句留一句，好表現自己是多麼的高深莫測，讓人敬畏。
乾元當然不會知道刑天在他心裡鄙視自己，“呵呵，天道至公，后土祖巫身化輪迴，積累了大量的功德，而巫族要麼被封印在祖巫殿，要麼就是在那窮山惡水的九黎，因此功德沒有被消耗，如此大功德，天道自然要獎勵。所以天道就降下了一次機會給巫族。”乾元絲毫沒有在意刑天的臉色變化，他當然知道即使是天道給了這次機會，但是天上還有六個聖人，哪個願意巫族再回來呢？
刑天一說完就準備奔出去，卻發現他自己動不了了。驚訝的看着乾元，要知道他自從到了這裡，乾元基本上就是不聞不問，而刑天也沒有事情可做，就閉關修煉肉身，偶爾出去找人打一架，乾元從來就沒有說什麼。但是今天卻將自己給禁錮了。
“老實的待在這裡，洪荒的事情，我和通天說了不摻和，所以不到萬不得已，你就給我老實的待在這裡。”乾元說完後，就恢恢手，將刑天給轟了出來。而刑天也是無奈，只好天天觀察着洪荒的形勢，將心急火燎都壓在心底。
而乾元也不管其他，安心的平靜自己的心境，爭取突破現在的修爲。他已經可以猜測出，洪荒一定是熱鬧非凡，闡教弟子幾乎全部下山，而天庭，也要出手，甚至可能引出了一些隱世的大神通者，比如盤王，但是天道大勢人族大興是無法改變的，所以乾元現在卻是隻能顧着自己了。
起初軒轅在闡教弟子的幫助下，大敗蚩尤，追殺蚩尤三百里，蚩尤震怒，使用巫族秘法煉製蚩尤魔刀，而後更是擺出了簡化的都天十二神煞大陣，將軒轅和闡教一干修士打的一泄千里，潰不成軍。直殺到鉅鹿軒轅才收拾殘軍抵擋蚩尤，餓蚩尤也因爲士兵疲勞而停下來休整，因此雙方都選擇在鉅鹿上對峙起來。
鉅鹿，軒轅帥營。
軒轅看着自己的老師，和一干的師叔，心裡窩囊，前兩個聖皇都已經歸位，他們功德讓整個人族都銘記，而自己接位以來幾乎沒有做什麼值得後世人仰望的事情。如何讓本來就野心滿懷的軒轅甘心。“老師，那蚩尤既然如此厲害，可有人能夠降他？”軒轅也沒有辦法，掃視了眼衆人，將眼睛轉到廣成子身上。
“這個，也不是沒有。”廣成子也是臉上無光，自己已經將闡教的臉給丟盡了，前面的截教就在眼前，如何讓他不氣憤，“人教玄都**師乃是我等大師兄，三教首徒，道行高深，法力通玄。如果有他相助，自然是水到渠成。”
“那老師爲何不去請玄都師伯來呢？”軒轅一聽有人能治蚩尤，也忘記了什麼忌諱，脫口而出。
“這，這個”廣成子一聽軒轅之語氣也是無奈，臉色難看道，“玄都師兄修的無爲之道，比喜爭鬥。爲師卻是請不來。”
軒轅一聽也是鄒起了眉頭，這不是白說嗎？
“共主，我們請統領幫忙怎麼樣？”一個下首的人族修士見闡教弟子無法，本來就討厭他們的囂張跋扈，自然要打擊他一下。
“你可有辦法，請統領出手？”軒轅一聽，立馬就高興起來，人族統領雖然從來不干涉人族的事情，也沒有出現在人族，但是人族卻都信奉他，比之
女媧也是無不及。而傳說他的實力更是匹敵聖人，因此軒轅如何能不激動。