話說自從神農氏自從繼承人皇之位以後，兢兢業業，凡事親力親爲，以身作責，並且推廣自己以前在有姜部落的一些做法，將耕種五穀的方法傳播到各個部落。至此五穀開始在全人族部落開始種植。
人類學會種植五穀後，人族的食物危機解決了，而且有了多餘的糧食，但是許多吃不完的糧食卻因爲保存不好而毀壞。雖然以前伏羲的時候部落裡也同樣蓄養一些吃不完的獵物，但是大多數獵物難養而且兇猛，容易傷人。
神農又從這些獵物中選出了豬、牛、馬、羊、狗、雞等溫馴好養的六種動物在整個人族部落進行蓄養，族人們便將其統稱爲“六畜”。從此六畜便進入了家養的時代，族人多餘的糧食也可以用來蓄養六畜而不至於因保存不好而毀壞了，而人們也不需要經常因爲肉食而去打獵了，大大減少了不必要的傷亡。
從此人們不再缺少食物，並且還有剩餘，有些部落或人家有時剩餘多了不但自己吃不完而且六畜也同樣吃不完又不能長期保存，無奈只得扔掉，浪費不已。神農針對這個問題特意召開大會徵求衆大臣的意見，最後終於想出了一個辦法，仿造以前自己在有姜部落的做法，在各個部落裡開設了集市，並且在陳都更是建了一整條街的大集市。
如此人們有多餘的物品便拿到集市裡互相交換自己認爲值得和有用的東西，不僅大大減少了浪費，更將之用在了有用的地方，而且各個部落間也開始有了商品交易，大大加強了部落間的聯繫和交流。
那時候人族還是仍然採用淄衣氏發明的獸皮裹身，而神農氏在尋找五穀中發現有一種叫麻的植物，可以治麻爲布，製作衣裳，穿着卻是比獸皮舒服，而且也比獸皮容易得到，於是將之推廣，從此人們開始用麻布來做成衣裳，不用再穿獸皮，逐漸走出愚昧！
自從伏羲氏發明了陶壎、琴瑟等樂器以來，人們除了生產開始有了自己的業餘活動，但是伏羲氏發明的樂器卻是過於難學，不利於推廣，神農氏決定改進這些樂器，於是乃取東海之桐，削之爲琴，結絲爲弦，長三尺六寸六分，上有五絃，曰：宮、商、角、徵、羽。其聲可道天地之德，能表神農之和，能使人們娛樂，人皆謂之爲神農琴也！卻是更加容易學習和推廣。
當時人族大多數人族部落烤制食物皆用手，如若不小心常會被灼傷，更是缺少盛物的器皿，神農於是將有姜部落以土製成各種可是盛裝的器皿，謂之爲陶器，向全人族推廣，自此人們可以用陶器來盛食物，方便了許多。
那時人們雖然已經知道了春夏秋冬，更有了伏羲曆法，但是卻對農事作用不大，不知該在什麼時候種植谷種，什麼時候是收穫的季節，神農於是乃歷數年觀察四時變化，冷暖交替，在伏羲時代的歷法上加以改進，立歷日，立星辰，分晝夜，定日月，月爲三十日，十一月爲冬至。從此人們懂得了什麼時候該是種植谷種，什麼時候該是收穫，如此五穀生產大大增加了許多。
農業和畜牧業的出現，不但解決了人族的糧食問題，而且因爲從此人們開始有了多餘的物品，因此原始的商品交易開始了，集市也隨之出現了。如此一系列的治理措施下來，人族的生活明顯有了較大的提高，人口也增加迅速，呈現出一副比伏羲時代更加興旺的態勢。而且各個部落之間的交流更加的頻繁，大大加速了人族的發展。
神農氏管理部落，治理天下很有方法，其曰：“丈夫丁壯而不耕，天下有受其飢者，婦人當年而不織天下有受其寒者。”他以德治人，不望其報，不貪天下之財，而天下共富之。智貴於人，天下共尊之。他以德以義，不賞而民勤，不罰而邪正，不忿爭而財足，無制令而民從，威厲而不殺，法省而不煩。對百姓無有相害之心，刑政不用而治，甲兵不起而王，是以諸侯大臣盡皆擁護，百姓人人愛戴！
不過這時候人族雖然不起戰禍，但是還經常會遭受一些猛獸妖物的襲擊，於是神農發明了以木製弓，獸筋爲弦，鳥翎作羽，削木爲箭，武裝部分族人，以保護族人的安全。
神農見族人們的生活在他的治理下日漸好了起來，心裡高興不已，走在陳都的大街小巷上，看着熙熙嚷嚷的往來族人，心中充滿了自豪感。而同時人族各個部落也都呈現出一片初興的景象。
不過這時神農也遇到了困擾，卻是神農經常得聽到有些老弱族人偶爾遇上頭痛、發燒之事仍然無法治癒，有些族人就這樣死掉了，甚至一些壯年男女發生這樣的狀況也就無法幹活了，只能躺在牀上等着好轉，而且這些現象現在越來越多，再就是誤食毒物或被毒蟲、毒蛇所傷的族人越來越多，人族卻是束手無策，只能眼睜睜的看着族人死去。原來當時人族不識醫藥，是以每有生病便不知如何治療，故而常有死亡。
這個問題也困擾神農許久，只是以前有太多地族中事物需要*持和處理，並沒有花太多地精力在這方面，這一問題也沒有得到有效地解決。而如今人族得大多重要事情已然解決，自己也應該想個辦法來解決這一問題。
族人們的疾苦，神農氏瞧在眼裡，疼在心頭。怎樣爲族人治病？神農苦思冥想了三天三夜，終於想出了一個辦法。原來神農因爲找尋五穀之事，對植物相對比較瞭解，知道有些植物是可以治病的，可是還有更多的植物卻是有毒，而且有毒和無毒是看不出來的。於是神農便立誓走遍天下，嚐遍百草、使人們知道什麼能吃，什麼不能吃，哪些吃了有害，而哪些吃了有益，哪些又可以醫治什麼病痛，等等。神農決定將這些記錄下來，以供人們參考。
卻說人皇神農氏既然決定要嘗百草，以身試草，讓後人知道什麼可吃，什麼有毒，什麼病狀用什麼藥來醫治，於是召集羣臣，告訴衆人自己準備嘗百草之事。
羣臣聽罷，紛紛大驚，匍匐在地大哭苦勸道：“不可啊，聖皇您對人族的貢獻之大，人族就是傾盡九天之水也無法償還，您的安危關乎人族命運，怎麼還能讓您冒着生命危險去嘗百草呢！”
神農聽罷，哈哈一笑道：“我的安危又怎麼能比得上億萬族人的安危呢。現在我的族人們正面臨着病痛的威脅，我作爲人族共主又怎麼能不去解決呢？”衆人苦勸，神農還是一一回絕。
眼看神農決心已定，任由衆人如何苦勸也不會更改了，有一個名爲鼎光的臣子越衆而出，向神農施禮道：“聖皇您爲人族共主，生身性命關乎人族的前途命運，非比尋常。既然您一定要行嘗百草之舉，我願隨行，效聖皇聖德，爲生民百姓貢獻一份力量。”
其他臣子見狀，也是紛紛要求隨行，以分擔神農的風險。畢竟神農身爲人族共主，對人族至關重要，只要能夠爲他的安全出一份力，衆多人族精英又何惜自身生命。神農開始不允，後來見衆人之意甚誠，也只得答應了。
第二天，神農氏帶了一批臣民，在陳都無數臣民的痛哭之下離開了陳都，向大山走去。他們走哇、走哇，腿走腫了，腳起繭了，還是不停地走，整整走了七七四十九天，來到一個地方。只見高山一峰接一峰，峽谷一條連一條，山上長滿奇花異草，大老遠就聞到了香氣。
神農他們正往前走，突然從峽谷竄出來一羣狼蟲虎豹，把他們團團圍住。神農馬上讓臣民們奮力殺搏，向野獸們殺去。打走一批，又擁上來一批，一直打了七天七夜，才把野獸都趕跑了。
這時，臣民們說這裡太險惡，勸神農回去。神農搖搖頭說：‘不能回！黎民百姓病了沒醫的，我又怎麼能回去呢！‘他說着領頭進入了峽谷，來到一座茫茫大山腳下。
這山半截插在雲彩裡，四面是刀切崖，崖上掛着瀑布，長着青苔，溜光水滑，看來沒有登天的梯子是上不走的。臣民們又勸他算了吧，還是趁早回去。神農搖搖頭：‘不能回！黎民百姓病了沒醫的，還在苦苦煎熬，我們怎麼能回去呢！‘
他站在一個小石山上，對着高山，上望望，下看看，左瞅瞅，右瞄瞄，打主意，想辦法。後來，人們就把他站的這座小山峰叫‘望農亭‘。
然後，他看見幾只金絲猴，順着高懸的古藤和橫倒在崖腰的朽木，爬過來。神農靈機一動，有了！他當下把臣民們喊來，叫他們砍木杆，割藤條，靠着山崖搭成架子，一天搭上一層，從春天搭到夏天，從秋天搭到冬天，不管颳風下雨，還是飛雪結冰，從來不停工。整整搭了一年，搭了三百六十層，才搭到山頂。傳說，後來人們蓋樓房用的腳手架，就是學習神農的辦法。而神農氏親自搭成的木架之所在，也就成了後世傳說中神農架的由來。
神農帶着臣民，攀登木架，上了山頂了，嘿呀！山上真是花草的世界，紅的、綠的、白的、黃的，各色各樣，密密叢叢。神農喜歡極了，他叫臣民們防着狼蟲虎豹，他親自採摘花草，放到嘴裡嘗。爲了在這裡嘗試草藥、找醫藥，神農就叫臣民在山上栽了幾排冷杉，當做城牆防野獸，在牆內蓋茅屋居住。後來，人們就把神農住的地方叫‘木城‘。
白天，他領着臣民到山上嘗百草，晚上，他叫臣民生起篝火，他就着火光把它詳細記載下來：哪些草是苦的，哪些熱，哪些涼，哪些能充飢，哪些能醫病，都寫得清清楚楚。
有一次，他把一棵草放到嘴裡一嘗，霎時天旋地轉，一頭栽倒。臣民們慌忙扶他坐起，他明白自己中了毒，可是已經不會說話了，只好用最後一點力氣，指着面前一棵紅亮亮的靈芝草，又指指自己的嘴巴。臣民們慌忙把那紅靈芝放到嘴裡嚼嚼，喂到他嘴裡。神農吃了靈芝草，毒氣解了，頭不昏了，會說話了。從此，人們都說靈芝草能起死回生。
臣民們擔心他這樣嘗草，太危險了，都勸他還是下山回去。他又搖搖頭說：‘不能回！黎民百姓病了沒醫的，還在痛苦中煎熬，我們又怎麼能回去呢！‘說罷，他又接着嘗百草。
他嘗完一山花草，又到另一山去嘗，還是用木杆搭架的辦法，攀登上去。一直嚐了十數年，踏遍了無數的山山嶺嶺，期間也無數次的中毒，可是在自己的水晶肚和自己對藥草的理解下，最後還都是轉危爲安。
可惜他還只是嚐了一部分的藥草，神農也不泄氣，他相信總有一天自己能將大部分藥草的特性都記錄下來，不過最初那些以鼎光爲首的跟隨神農前來的臣民也都大半身死，沒死的那幾個也都被神農趕回去了，並且讓他們帶回去了這些年神農嘗百草所得。
這天神農來到一座名爲發鳩山的大山之下。這座大山上的植物也是很多，有很多還是神農以前沒有見過的。神農欣喜之下，把一株自己以前從未見到過的小草放入了自己口中。
這草剛一入口，神農霎時間只覺得天旋地轉，猛的一下載到在了地上。
這一次的毒性雖然比神農以前中的毒要強上許多，但是以神農的水晶肚的神奇原本是不至於此的。可是這株草的毒性居然引發了神農一直以來體內混合壓制的其他毒性，無數種毒混合在一起發生了變異早已不是凡間之毒了。
神農想要像以前用各種可以解毒的藥草都試過了，可是卻都沒多少效果，腹中疼痛更甚，這感覺就好像自己的腸子斷裂開來一樣。嘗試了好幾次，結果依舊，神農只好放棄了，不過還是忍着劇痛將這一藥草記錄了下來，並命名爲“斷腸草”，希望以後族人不要再搗自己的覆轍，隨後神農又深深的想到：“想不到自己居然要死在這裡了，可惜自己的理想還沒有實現，還沒有幫族人們解決病痛的威脅。”
神農渾身不斷冒着冷汗，他感覺到自己的肚子像碾心一般的疼痛，腸子好象斷裂成了好幾節一般。正當神農以爲自己即將喪命，意識也逐漸陷入了迷糊，隱隱約約間，突然聽到一聲嘆息的聲音傳來：“唉，爲了人族之事，你受這樣的苦已經不是一次兩次了，到現在你的心中可有悔意？”
“爲了族人，即使任何事情我依然不後悔。”神農在聽聞到聲音之後，雖然他無法開口說話，但還是用緊守的心神之念回答道。
“你這又是何苦，要是爲了人族要讓你放棄生命與靈魂你也不悔嗎？”那個聲音再次響起。
“即使放棄生命與靈魂，我也要完成我的夢想！”神農用自己最後唯一清醒的一絲意識回答道。
“誒！癡兒。”隨後只見一個玄奧的身影出現在神農身旁，不是太上老君還是誰，原來老君在八景宮算到自己的徒弟神農氏將有一難，於是馬上趕來，這纔有了剛纔的一幕。
神農體內之毒便是讓大羅金仙之流來處理的話那也是相當的棘手的，可是對於作爲聖人來說並不是什麼難事，更何況老君更善於煉丹，很快的老君就排解了神農體內的毒性。
毒性一除，神農也沒用多久就轉醒了過來。神農清醒之後，一見自己的老師太上聖人正在自己的身邊，馬上知道了是自己的老師救自己，不敢怠慢，馬上俯首道：“不肖弟子神農多謝老師救命之恩。”
老君扶起神農，滿意的看着神農氏，淡淡道：“你很好，比我想象的做的還好！你既有此心，爲師也不願阻你，此也是你的功德。不過你雖然天賦異稟，而且還學了太清道法，可畢竟還是凡人之軀，很多藥草對你來說卻是劇毒。”
老子隨後拿出一鼎和一條色呈褐色，長有三尺六寸的神鞭給他，道：“此乃神農鼎和赭鞭，前者乃爲師仿造先天靈寶乾坤鼎所制，賜你煉製丹藥只用，後者乃是爲師取先天乙木之精所煉成的寶物，可辨識萬千草木，只要用此鞭打過便可知這種植物有毒無毒，卻是方便你辨別百草。”
隨後又一指神農，只見一道紫光沒入神農眉心，道：“這乃是爲師億萬年來的煉丹心得，希望你能將其發揚廣大，造福萬民，爲師走了。”隨後身行消失不見了。神農見到老師走了，不過還是想老君消失的方向恭恭敬敬地扣了三個頭，心中默默的道：“老師放心，神農一定不辜負您的期望。”
隨後又經過數十年的辯嘗，神農終於幾乎將所有的草木都嚐遍了，並且將這些都一一記錄了下來，此時距離神農離開陳都已經七七四十九年了，於是神農準備返回陳都對自己嘗百草得來的寶貴記錄進行整理、編撰以及傳播工作。