隨後，最高軍事當局根本不顧敵強我弱的總體形勢，一意孤行強行調集全國各處大軍在徐州附近開始集結，企圖與日軍決戰，因而使會戰在後期陷於被動。儘管如此，這次會戰也大大的消耗了日軍有生力量，遲滯了日軍進攻速度，爲隨後的武漢保衛戰贏得了時間。
整個徐州會戰，日軍前後共動用8個師、5個旅約30萬人。蕭家軍以及、**部隊前後有70個師約100萬人，從四月初到九月份前後歷時5個月。這次會戰鉗制和消耗了日軍有生力量，除了給了日軍以巨大打擊外，還遲滯了日軍進攻速度，此戰最重要的影響在於使中國人民相信自己有擊敗日本的能力。
1938年9月，根據蕭飛的決定，玄武師駐守的臨沂開始在在沂（水）蒙（陰）地區成立根據地併成立了蕭家軍駐防山東守備司令部，統一指揮山東的蕭家軍各部隊。在蕭家軍的帶領下各地的武裝開始在冀魯邊、魯西、膠東、魯東、魯中、魯東南、湖西、蘇皖邊等地廣泛開展游擊戰爭，開闢了新的地區，擴大了根據地。年底玄武師下轄有8個加強團5W餘人，3個預備團2W餘人、5個輜重大隊2W餘人。總計9W餘人。
在短短半年多的時間裡，從菏澤一帶到魯西平原、從冀魯邊區到蘇魯豫皖邊區，再到臨沂、日照一帶，大片的山東南部土地落入蕭飛的控制之中。蕭飛爲加強對軍隊的絕對領導，將蕭家軍各部分配來的一批有作戰經驗的幹部分配到各支隊擔任領導工作，對部隊進行了初步整頓，調整和配備了各級領導骨幹，加強了蕭飛對部隊的絕對領導，從而加速了山東抗日武裝的正規化建設。這些由蕭飛領導的抗日武裝，土生土長，由小到大，由弱變強，到1938年底已發展到二十萬之衆，爲蕭飛進一步收復山東提供了必要的武裝力量。
此後經過半年多的發展，蕭飛通過美國駐河南的領事關係大批購買了包括重型榴彈炮、山炮在內的重各種口徑的10餘條火炮生產線！加上購買的火炮數量，現在蕭家軍的整體實力擴大了2倍之多。
經過統計青龍師已有近12W部隊，玄武師有9萬的部隊，朱雀師、白虎師2個師團也有18W之衆！1938年11月29日蕭家軍在臨沂河南洛陽召開了軍事整改大會，蕭飛重新調整了兵力部署。
“各位軍官、各位弟兄們！我很高興能在這裡再一次看見你們！跟你們歡聚一堂！”蕭飛開始了演講。
“啪啪啪！”“啪啪啪！”底下坐着的士兵、軍官們紛紛鼓起掌來。“弟兄們！經過半年多的發展，咱們蕭家軍從最初的民團幾萬人發展到了現在的幾十萬部隊！這裡面都是你們的功勞！雖然我們蕭家軍在臨沂、臺兒莊一帶損失慘重！但是我們打勝了！你們都是好樣的！”蕭飛頓了頓。底下再次響起來熱烈的掌聲。
“弟兄們！由於我們的部隊增速過快，已經大大超過了我們預期的目標！表面上我們雖然隸屬於**，但是我們決不是他們一些人手裡的旗子！所以從現在起，我宣佈河南、山東2省雖然歸屬國民政府，但是我們的各項措施都將會有我們自己決定！根據軍部的計劃、部署！現在起，我宣佈：我們蕭家軍底下的4個師全部改爲軍一級番號！具體的由候再參謀長宣佈！”蕭飛喝了一口水坐了下去。
“什麼？我們自己決定？“將軍那不是我們自己獨自自治了？”“是啊！將軍！”底下的人一聽自己要獨自了，個個議論紛紛。
“弟兄們！聽我說！我們不是自治，我們在山東、河南的各項指令我們說了算！誰也別想管到我們！但是我們表面還是屬於國民政府管理！但是在這2個地方我們說了算！誰要是欺負我們咱們就狠狠的揍他！”蕭飛揮揮手示意大家安靜補充說道。
“哈哈！這樣啊！太好了！那以後我們就不用鳥那些國民政府了！”“就是！以後我們還不是想怎麼幹就怎麼幹！”士兵們一聽是這麼回事，興奮的討論起來。
“行了！繼續聽參謀長的！”蕭飛喝了口水喊道，立即場面安靜了下來。看見場面安靜了候再起身開口道：“各位軍官、各位弟兄們！下邊我宣佈蕭家軍軍部第121號整改命令！
青龍師改爲青龍軍、白虎師改爲白虎軍、玄武師改爲玄武軍、朱雀師改爲朱雀軍！從現在起，每一軍裡面滿編人數爲10W人！爲了方便大家理解具體的計劃如下：青龍軍軍長張大膽，軍銜爲中將。玄武軍軍長韓春，軍銜中將。白虎軍軍長李林，軍銜中將。朱雀軍軍長吳升，軍銜中將！川軍軍長王銘章，軍銜中將！每一個軍級單位下轄5個作戰師：1師、2師、三師、4師、五師。每個師2W人，下轄4個加強團1團、2團、3團、4團，每一個團5000餘人下轄5個營，團級火力爲重機槍50挺、輕機槍100挺、98式毛瑟5000支、大刀2000把、手榴彈500箱、90mm輕迫擊炮200門、150mm中迫擊炮100門。另外每一個師額外下轄2個重型炮團1w餘人：1炮、二炮。
每個炮團有裝備最新的美式火炮M7“牧師”自行榴彈炮50門、M40“遠程湯姆”155毫米自行火炮40輛、M2型105mm榴彈炮50門、M59型155mm榴彈炮50門、75mm山炮100門、105mm山炮150門。下轄4個炮營。
青龍軍抽調一師其餘以後駐防連雲港、日照、臨沂、藤縣一帶；玄武軍抽調一師其餘以後駐守山東菏澤、商丘、棗莊一帶；白虎軍抽調一師其餘駐守菏澤、安陽、洛陽一帶；川軍全體官兵駐守夏邑縣、商丘一帶密切注意徐州的鬼子動向；朱雀軍1個師跟各軍抽調的部隊組成預備隊在淮陽縣駐軍隨時支援前線，其餘各部配合省內的警察、民兵分別駐守各個城市！”候再說完以後敬了個軍禮坐了回去。
“太好了！這下我們一個營就有1000餘人啊！”“太棒了！！我們的重炮團有大小500多門以後再也不用怕鬼子了！”“就是啊！”“哈哈！以後鬼子碰見我們還不是就只有跑的份了啊！”底下的士兵們興高采烈的、眉飛色舞的高聲討論着。
看見士兵們這麼興奮，蕭飛也是由衷的開心。是啊！多久了，蕭家軍跟鬼子打仗一直就是被鬼子的炮火壓着打，要不是鬼子仗着自己的炮火猛烈自己的部隊也不會每次作戰後都是傷亡慘重。現在自己手裡有4個整編軍外加川軍的一個軍、算上輜重大隊總共正規軍的實力就在近50W左右！雖然自己的兵力發展很是迅速但是基本上也已經飽和了！自己目前的實力只能供應的起這些正規軍的日常開銷！再加上河南、山東各地的民兵差不多手裡就有近80萬的部隊！這可真是手握重兵了！雖然目前跟日軍相比差距還是很大，但是蕭飛畢竟有了阻擋日軍大範圍進攻的實力！
“弟兄們！再告訴你們個好消息！從今天開始每個士兵的軍銜提高一級，班長當排長、排長當連長、連長當營長、營長當團長、團長當師長！士兵們的軍餉每人每月多拿4塊大洋！”蕭飛乘機說道。
“太好了！“”將軍萬歲！“”將軍萬歲！“蕭家軍萬歲！”士兵們這次徹底的沸騰了！
以此同時的國民政府也於1938年12月召開了大會，委員長重新劃分了全國戰區。調整了兵力部署：特意囑咐第一戰區司令長官：衛立煌。帶領着第2、第3集團軍，共12個步兵師，一個步兵旅，一個騎兵師，一個騎兵旅。重點監視河南、山東南部一帶的蕭家軍。
此時的**兵力總計：250個步兵師，29個獨立步兵旅；13個騎兵師，10個獨立騎兵旅。僅步兵師來看，經過一年多的抗戰，不但沒被日軍消滅，反比1938年1月的210個步兵師，多出40個師。**各個軍隊在對日作戰中，也得到提高和加強。
此時徐州會戰早已經結束了！中日雙方都在靜靜的*着各自的傷口，準備瞅準機會隨時給對手一擊！
經過幾天的部署，蕭飛在交代完所有的軍務以後立刻回到了家中。此時蕭飛的兒子都已經出生2個多月了！蕭飛心裡可是一個勁的惦記着。
很快，蕭飛就帶着些隨從急急趕回了淮陽縣城。
“煙兒！煙兒！”蕭飛一到家門口就急不可耐的跳下了車朝屋子裡跑去。“將軍好！”門口的哨兵看見蕭飛回來頓時一個個的跟打了雞血似的，個個站的筆直！蕭飛對着衆人一笑便繼續往院子奔去。