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“各位，我有一件事要向大家宣佈！從今天開始，我不再擔任飛魚公司的統制，統制的職位，由宇飛來接任！我相信，他更加適合這個職位，他會帶領飛魚公司走向更加強大，最終實現我們的目標的！”從海邊的靶場回來之後，飛魚公司的高層們就召開了一個會議，在會上，羅三姑當衆向大家宣佈，辭去統制的職位，把整個飛魚公司交給龍宇飛來管理。
“玉華，這樣不是挺好的麼？你出任統制，我擔任副統制，也是一樣的！”龍宇飛皺了皺眉頭。之前羅三姑並未和他商量，這讓他有些措手不及。
“不了！宇飛，飛魚公司成立到現在，我基本沒有對公司做出什麼貢獻。你的才能，我相信大家也都認可了！你出任飛魚公司的統制，這纔是最好的結果。我相信，你一定能夠帶領我們過上好日子的。以後我就專心照顧你的生活好了！”羅三姑堅決的說道。她原本就不是一個貪戀權勢的人，在和龍宇飛成親之後，更是明白了自己到底想要過什麼樣的生活。因此，這才做出這樣的決定的。
“我同意由副統制出任飛魚公司的統制！飛魚公司能有今天的成就，副統制功不可沒！現在飛魚公司正處於高速發展的過程當中，由副統制來爲飛魚公司掌舵，我們必然能夠發展的更好的！”後勤官趙毅第一個贊同道。當初在飛魚島的時候，龍宇飛拿出新式步槍的設計圖紙，他就已經知道龍宇飛不是一般人了。隨後，飛魚公司成立，並且發展到現在的規模，這更加使得他們父子三人對龍宇飛十分的欽佩。
“我也同意！現在已經不比我們當初了。飛魚公司現在也是家大業大，由副統制來管理飛魚公司，這是最好的！再說了，反正副統制和統制都成爲了一家人，誰擔任統制都是一樣的！”軍務官牛猛也說道。飛魚軍成立，新式步槍以及今天剛剛試射的迫擊炮即將裝備部隊，這讓牛猛感到，飛魚軍的未來將是不可限量的。以前當海盜的時候，他可從來沒有想過會有這麼一天的。而他對於這一切的締造者龍宇飛，也完全是心悅誠服的。畢竟，沒有龍宇飛的話，就不會有飛魚公司的今天，他們都還在海上過着提心吊膽的日子，說不定什麼時候就會把命給丟掉，哪像現在一樣，威震整個棉蘭老島呢？
政務官李德成也沒有反對，畢竟這是羅三姑親自做出的決定，他也不好多說什麼。正如牛猛所言，羅三姑和龍宇飛已經成爲了一家人了，這飛魚公司完全就已經是他們的私產了。
至於新加入飛魚公司的政務副官劉明德以及飛魚市的市長吳永興，也都紛紛表示支持。幾乎在最開始的時候，他們就認爲龍宇飛纔是飛魚公司的主事者。結果也證明他們的判斷是正確的，羅三姑只不過是名義上的統制而已，實際上大小事都是由龍宇飛來決定的。他們對於龍宇飛正位飛魚公司的統制，沒有任何的牴觸，反而認爲這是理所應當的。在這個時代，即便是在海外，婦女的地位也不高。讓一個女人出任飛魚公司的統制，還是讓他們覺得有些彆扭的！
第二天，飛魚公司就正式的向所有人宣佈，由副統制龍宇飛出任飛魚公司的統制。這一改變，在整個飛魚公司，幾乎沒有引起任何的不滿，彷彿大家都認爲這是理所應當的一樣。甚至那些新加入飛魚公司的華人反而認爲這是理所應當的一樣。飛魚島的老人並不多，精壯也大都加入了飛魚軍，成爲了飛魚軍的骨幹，他們也是非常支持龍宇飛的。這使得龍宇飛的在飛魚公司內的地位非常的穩固！
龍宇飛上臺之後，立刻對飛魚公司進行了改組。最開始的時候，飛魚公司人口太少，即便吳家村加入飛魚公司之後，也只有一千五百多人而已。現在，飛魚公司的人已經擴大了二十倍，並且還在持續的上升着。龍宇飛這個統制，每天處理飛魚公司的事就忙的要死了，這讓他幾乎沒有多少時間用在科研上了。因此，他急需對飛魚公司的組織架構進行改革，讓他能夠從這些瑣事當中解脫出來，把精力放在科研上面，對於飛魚公司的發展，他只需要負責大方向就可以了！
在龍宇飛的主導下，飛魚公司首先進行了軍政分離。軍務方面，組成飛魚軍司令部，由龍宇飛親任飛魚軍總司令。飛魚軍司令部下轄作戰和後勤兩個方面。作戰部隊方面，由原來的軍務官牛猛出任飛魚軍第一旅旅長。此刻，飛魚軍已經有二十個步兵連了，在迫擊炮研製成功之後，每一個步兵連將增加一個6人制的火力組，負責一門迫擊炮的操作，這使得每個步兵連的人數也上升到了一百五十人。另外，每4個步兵連組成一個步兵營，營部直屬一個警衛排，一個偵察排，一個有6門迫擊炮的炮兵排，加之營部的其他人員，整個步兵營一共有七百五十餘人。飛魚軍第一旅現在一共組建了4個步兵營，所缺的火炮，都等着兵工廠生產出來呢！不過，按照現在的編制，至少需要40門迫擊炮才行，飛魚兵工廠加班加點也需要兩三個月的時間才能夠生產出來。後勤方面，組建飛魚軍後勤部，部長則還是有之前的後勤官趙毅出任。負責飛魚軍的後勤保證以及軍工研發和生產方面的事務。
政務方面，組建政務部，由原來的政務官李德成出任政務部部長。政務部下轄財政、民政、工商、農業、內政等幾個部門。其中，財政和工商方面，有原來的政府副官劉明德負責，農業方面由飛魚市市長吳永興兼任，民政方面則有一個叫周元的人擔任，他是之後加入飛魚公司的一個華人村落的村長。內政方面，則是由吳永興的兒子吳大牛出任。之前吳大牛在飛魚軍任步兵連連長，不過他年紀也不小了，都是快四十歲的人了，一線作戰部隊，還真不是他這個年紀的人待的地方。因此，由他負責內政方面的事務，正好合適。在加入飛魚公司的華人越來越多之後，飛魚軍內也進行了一輪淘汰，年齡超過三十五的人，除了連長以上的軍官之外，都被要求退役了。退役之後，他們直接當上了飛魚城的警察，負責飛魚城的治安。
飛魚公司的這一次改革，使得飛魚公司的組織結構更加的合理，龍宇飛也從這些瑣事當中解脫出來，全身心的投入到了科研方面。很快，飛魚公司在蒸汽機的研製上就取得了成功，可以自行生產小型的蒸汽機了，這爲飛魚公司的工業發展插上了一雙翅膀，工廠所需要的動力問題都得到了解決，各種工廠猶如雨後春筍一般的成長出來。
另外，在龍宇飛的牽頭之下，兵工廠也開始了小口徑野戰炮的研製。迫擊炮雖然重量輕，但射程近，威力也小，不能作爲壓制地方炮兵的火炮。在欺負這些土著的時候，迫擊炮就已經足夠了。但是，總有一天飛魚軍會和西方強國對上的，到時候就需要威力更大，射程更遠的野戰炮才行。同時，飛魚軍註定不可能偏安一隅，將來不管是攻佔呂宋島還是向南洋的其他地區擴張，都需要一支強大的海軍。在海軍戰艦方面，飛魚軍是無法和西方強國相比的，這就使得飛魚軍只能從其他方面想辦法了。比起海戰當中還在使用圓形實心炮彈的西方強國，使用新式大炮的飛魚軍，肯定會佔很大便宜的。這樣就給了飛魚軍一個以弱勝強的機會了！
飛魚公司的改革完成之後，整個飛魚公司都開始進入了高速發展階段。陸續有華人村落慕名而來加入飛魚公司，使得飛魚城的人口進一步的上升着。飛魚城的建設進度，也加快了不少。飛魚公司組織大量的人力，圍繞飛魚城，沿着阿古桑河開闢出了數萬畝的良田，足以養活飛魚城的全部人口。到了1836年年中的時候，飛魚城的總人口已經超過五萬人了，已經佔到了棉蘭老島的華人總數的大半了！
飛魚軍組建了4個步兵營之後，更是加強了訓練。爲了提高部隊的戰力，新任旅長牛猛更是整天泡在部隊裡面，和士兵們一同吃住，一同訓練。雖然新兵訓練很苦很累，但也成效顯著，到1836年1月份的時候，新兵訓練完成，這4個步兵營已經形成了戰鬥力。另外還組建了兩個新的步兵營，也開始了訓練。
兵工廠在牛猛的催促之後，加班加點的終於生產出了四十門迫擊炮，裝備到了一線部隊當中。炮兵們經過半個月的訓練，消耗了上千發的炮彈之後，總算也有模有樣了。這時，飛魚軍的戰爭準備算是完成了！