斯凱之所以能夠及時的趕過來，就是因爲菲茲和西蒙斯終於破解了仿拉德克里夫博士的機器人。
儘管說仿拉德克利夫博士機器人的眼睛能夠將看到的一切信息傳送到拉德克利夫博士的手裡，但只要提前做防備的話，切斷任何的網絡信號流通，就能夠阻止一切信息的流出。
菲茲花費了很長時間來破解仿拉德克利夫博士機器人的編碼，但最後他還是失敗了，原因在於這個機器人身上的所有編碼都是亂碼，根本沒有任何的用處，它自身的運轉完全不依靠這些編碼，而是靠他的“大腦”。
的確是“大腦”，我想看起來跟真實的人類大腦構造一模一樣，只不過它並不是由血肉構成的，而是由光能量構成的，功能跟生物肉體大腦並無區別，通過量子能儲存數據，就像是突觸一般在相互衝突。
但這一切都是艾達在閱讀了黑暗神書之後所擁有的能力，一切原始大腦裡的東西，記憶，知識和慾望，所有的一切都變成數據儲存在量子大腦裡，雖然說黑暗神書並沒有賦予它最真實的靈魂，但是卻將她往量子智能的道路上狠狠的向前推了一大步。
當看到這個量子大腦的時候，西蒙斯驚呆了，她親眼看過拉德克里夫博士測繪過另外一個大腦，而這個大腦的主人屬於梅琳達，這樣的發現嚇的西蒙斯花容失色。
正是因爲及時發現了這一點，西蒙斯纔在關鍵時刻通知了斯凱，而斯凱才及時抽出身來救了科爾森。
不過這個時候，他們需要面對更大的麻煩，比利被九頭蛇的人強壓着來到了密室內，九頭蛇的人用槍指着他的頭威脅要求山姆和L·T把黑暗神書交出來，否則他們就殺了他。
這種事情山姆和L·T並沒有決定的權利，即便是被槍頂着腦袋的人是他們的親兄弟，山姆只能狠心的說他根本不認識這個人，用他來威脅他們根本沒用。
這樣的話山姆和L·T能說，但科爾森卻並不能視若無睹，最後他還是用黑暗神書交換了比利，只不過就在九頭蛇的人準備從地上拿起黑暗神書時，黑暗神書直接從他們的面前倒飛了回去，突然出手的赫然是斯凱。
想也不想，立時槍聲大作，有斯凱在，九頭蛇的人根本佔不到上風。
就在這個時候，比利拿起掉在他腳下的黑暗神書直接朝着迷宮基地的內部跑去，然而看到倒在地上的梅琳達的時候，他下意識的停下腳步幫忙。
結果也不用說了，“梅琳達”突然出手打暈了比利，一把將黑暗神書奪過來，就在她剛剛鬆口氣的時候，拉德克里夫博士就突然出現在她的面前，從她手上拿過了黑暗神書，同時非常得意的對她說道：“這才正是你應該做的事情，我會永遠的感激你的。”
說完，拉德克里夫博士站起身來，轉身就走，絲毫沒有將“梅琳達”扶起來的意思，爬倒在地上的“梅琳達”忍不住面色一變，下意識的哀求道：“請帶我一起走吧！求你了！”
拉德克利夫博士停下腳步，轉過身看了“梅琳達”一眼，滿是可憐的說道：“抱歉，你是堅持不了多久的，這一點在你設計的時候就已經註定了，對不起！親愛的！”
說完之後，不再搭理“梅琳達”近乎死寂的面孔，拉德克里夫博士直接轉身離開了。
而在這個時候，凌霄卻突然出手了，隱形中的他先是摧毀了附近的一切監控系統，然後再出現在了“梅琳達”的面前，在她一片欣喜的神色中，一把抓緊她，然後直接瞬移離開了。
如果僅僅是一具普通的智能機器人，凌霄並沒有多少的興趣，但是這裡的“梅琳達”並不一樣，她具有真正的梅琳達才擁有的一切記憶，這本身就是非常有價值，再加上她身上的量子大腦，讓凌霄捨不得錯過。
對於拉德克里夫博士拿走黑暗神書，凌霄並不在意，雖然說閱讀黑暗神書的人，都能擁有非常強大的技能，但是每個人所能獲得的技能是不同的，這個每個人腦海中最深層的渴望有關。
比如說伊萊·莫洛最渴望的是得到無中生有的能力，所以他得到了；艾達最渴望的是跟普通人一樣，所以她得到了製作量子大腦的能力；至於，拉德克里夫博士得到了什麼能力，暫時還沒有人知道。
雖然說拉德克里夫博士拿走了黑暗神書，但是一切卻還都在凌霄的掌控之中，如果他願意，他隨時能夠將那本書給搶回來，就算是拉德克利夫博士躲在深海里也是一樣。
沒錯，拉德克里夫博士的確是躲在了深海中，躲在了一個名叫安東·艾文諾夫的富豪的私人潛艇當中。
只不過這艘私人潛艇相當的老舊，他們甚至是前蘇聯解體時遺留下來的產物，擁有一定的攻擊能力，但非常的簡單，畢竟潛艇上並沒有太多的專業操控潛艇的退役軍人。
安東·艾文諾夫正是納迪爾參議員在九頭蛇的上線，他也是一名實業家，一名軍火武器商，正是他們這樣的人他擁有龐大的資金支撐起一個九頭蛇新的分部的運作，至於他爲什麼要這麼做，那就得問他自己了。
神盾局通過幾次現身的幾名九頭蛇特工的身份，鎖定了安東·艾文諾夫，而凌霄則是通過格蘭特·沃德獲得這一情報的，而就在這個時候，格蘭特·沃德已經帶個人駕駛着一艘非常先進的潛艇，悄悄地跟在了拉德克利夫博士的身後，鎖定了另一艘潛艇，什麼時候想要動手，就隨他們說了算了。
說實話，儘管通過九頭蛇拉德克里夫博士重新拿到了黑暗神書，但一切並沒有他所想象的那麼良好。
且不說每天都得躲在不見天日的海底潛艇中，而且安東·艾文諾夫和他的手下對待拉德克里夫的態度並不那麼好，甚至可以說有些惡劣，如果不是拉德克里夫想要任何的材料，安東·艾文諾夫都能夠弄來，否則的話，他們之間的合作早就結束了。當然，原因還有神盾局和星際移民局對他不停的追捕。
不過拉德克里夫沒有想到，科爾森很快就找到了對付他的辦法，那是一個女人，一個得了癌症的女人，一個和艾達長得一模一樣的女人，準確的來說艾達就是按照這個女人的模樣來製造的，而她正是拉德克里夫博士的前妻，一個名叫艾格尼絲·凱茨沃思的可憐女人。
就在科爾森試圖利用艾格麗絲當做誘餌來釣拉德克里夫的時候，一個突發的新聞打斷了他的行動，納迪爾參議員出事了，她自己的辦公室突然發生了爆炸，就在神盾局的諸人在冷笑納迪爾參議員又在自導自演的時候，從前方傳來消息，已經得到證實，納迪爾參議員的屍體已經被找到，這一次她真的死了。
聽到這個消息，所有人都感到愕然，不過他們很快就意識到了另外一個問題，納迪爾參議員的死亡，神盾局的嫌疑最大，畢竟就目前而言，納迪爾參議員主導的參議員全面調查對神盾局帶來了很大的麻煩。
尤其是以斯凱爲首的異人，讓人忍不住懷疑是某個擁有特殊能力的異人出手。
斯凱親自清點神盾局和星際移民局所有的異人，最後確定沒有任何一個異人私自動手。
經過了一番調查之後，神盾局的諸人鎖定了一個嫌疑對象，一個名叫塔克·肖克利的人。
之前肖克利和神盾局之間有數次接觸，基本上可以確定他就是監察者的高層之一，也是九頭蛇的人，同樣和納迪爾參議員有過非常深入的接觸，就是他在納迪爾參議員辦公室爆炸之前幾分鐘，出現在納迪爾參議員的辦公室。