5艘傷痕累累的光年星艦返回了與林兮匯合的星域，隨後在林兮艦隊的護衛下返回王朝邊界。在那裡，一艘博士派來的特殊運輸船已經等待許久，接着工作人員便小心翼翼地把楚君歸卸下來的幾個巨大貨箱裝上了運輸船。
隨後林兮就得到了新的命令，讓她護送這艘運輸船返回博士的研究中心，而途中如果這艘運輸船出現意外，或是船體的顏色轉爲紅色，就要立刻且徹底的摧毀它！
命令上，沒有提運輸船上的幾百名船員。馬上就要晉升的林兮現在已經能明白命令的言外之意。如果運輸船出現意外，那就不能顧及船上的船員了。
這個命令有些殘忍，可是林兮也不是小孩子了。她很清楚暗紅在王朝內部擴散會帶來怎樣的災難。事發至今還不到三個月，人類已經失去了5個星系和十幾億人口。那些人多半已經遇難。
返回光年，楚君歸就重新回顧了這場戰鬥，地面戰倒是沒什麼，深紅似乎沒有發展地面部隊的準備，完全看不到陸軍和守衛部隊的存在。那座建築物應該是座星艦加工廠，可是使用的生產方式是楚君歸根本無法理解的。在那裡，一堆亂七八糟的垃圾往一起一湊，就能變成星艦？這裡面必然有楚君歸認知之外的因素，關鍵還是那涌動的暗紅。
這一次楚君歸近距離地觀察了涌動的暗紅，並且作了許多試探。但是無論物理衝擊、能量還是輻射，都對暗紅毫無影響。只有極少數的能量可以透入暗紅，但是滲透的比例極低。楚君歸回想了一下暗紅色中被爆炸衝擊波影響到的幾件漂浮物位置，換算出了滲透的能量比例：不到十萬分之一。不過他隨即想到一個可能，也許自己看到的距離不是真正的距離，暗紅色內部說不定基本物理定律都有所改變，所以看到的未必就是真的。
此外這也是楚君歸第一次面對深紅艦隊。戰鬥過程無比激烈，數以千計的微型深紅星艦根本不要命似地往光年星艦上撲。不過似乎深紅星艦里根本就沒有艦員，有的只是那種涌動的紅色？霧族星艦本來就是消耗品，而深紅看來連回收利用都不考慮，雙方都不怕死，自然打得天翻地覆。最後還是重巡的持續火力和厚重裝甲起了作用，拼掉了所有深紅的艦隊。
楚君歸用極度低溫和吸能材料製成的囚箱成功捕獲了幾艘微型星艦，希望能對博士的研究有幫助。
剛剛返回光年，陳耳的通訊就到了。才短短時間不見，他似乎又胖了一點。看到楚君歸，陳耳勉強擠出一個笑容，說：“你這次的突襲收穫巨大，我們現在可以確認，這個未知的敵人，嗯，我們已經正式命名爲深紅。可以確認深紅正在生產星艦，而且是以我們無法理解的方式，以遠超我們的速度在生產。它們看起來用的是人類科技，但內核完全不一樣。另外一件事，就是和最初時相比，同樣體積的星艦戰力提升了1%。這是分析了所有數據樣本後得出的準確結論，體積的誤差不超過0.1立方米。”
“你的意思是，它們還在進步？”
“不，我們更傾向於認爲，它們正在適應我們的宇宙。”
“也就是說，我們的科技水平實際上是落後的？”
“落後是肯定的，很可能代差無法彌補。”
楚君歸皺眉，說：“這可真不是一個好消息。”
陳耳重重地吐了一口氣，說：“你送回來的樣本正在研究，也許還會有好消息。” “希望如此。”楚君歸話是這麼說，實際上是不抱希望。親身和深紅戰鬥過之後，楚君歸已經深切體會到兩個文明之間的巨大差距。深紅用人類的科技就把人類兩大帝國打得擡不起頭來，如果用上他們自己的科技，結果更不必說。至於爲什麼深紅不用自己的科技而要用人類的，還不清楚原因。但就算是用人類科技，也不是什麼好消息。
楚君歸已經發現，和最初的星艦相比，深紅現在的星艦線條更流暢，性能更好，品種也在減少。這說明深紅已經開始在優化，而且優化的速度相當之快。看起來評估戰力只提升了1%，但這1%是在短短一個月的時間裡提升的。這意味着深紅很可能已經消化了一部分科技。
“接下來該怎麼做？”楚君歸問。
“全面動員，採用戰時機制；同時嘗試和對方溝通，看看能不能談判，不過希望不大。”陳耳嘆了口氣。
通訊頻道中一時沉默，片刻後陳耳說：“爲什麼我們就發展不了人工智能呢？”
這個問題楚君歸也想知道，但就是沒有答案，也沒有例外。沒有人工智能，主腦功能嚴重受限，人類的科技和生產水平都受到制約。由人類組成的軍隊就會有恐懼、有制約，和純屬消耗品的無人部隊相比劣勢非常明顯。
“現在想這個也沒有用，又解決不了。”
陳耳點了點頭，說：“對了，最近我們開始梳理過去的秘密項目，有許多這樣的項目因爲某個原因啓動，但是後來不得不終止。這種情況下，許多項目資料會被封存或是銷燬。我發現有一個項目很有意思，它的編號是SSG6733212。不過這個項目是最高密級，我的權限不夠，無法查閱。如果你有興趣的話，可以請博士幫忙。”
這段話沒頭沒尾，不過陳耳專門提出這個項目肯定有原因。楚君歸看了下博士的通訊頻道，發現處於暫時無法接通的狀態，這一般是意味着博士正忙於重要的實驗，不能打擾。楚君歸就把項目的事暫時放到一邊，畢竟現在深紅的重要性壓倒一切。
轉眼之間幾天過去了，這段時間深紅又擊潰了聯邦守軍，擴張了一個星系。王朝和聯邦都宣佈緊急狀態，開始全力組織周邊星系的居民撤離。這是一個浩大的工程，需要撤離的星系多達20個，涉及人口110億人。在如此龐大的人口面前，王朝和聯邦動員了幾乎所有能動員的運輸船，還徵用了大量民間的運輸船執行撤離，但仍是不夠用，撤退進度十分緩慢，恐怕2個月都撤不完。
這個時候，智者忽然發來請求，要求和楚君歸面談。
楚君歸覺得有些奇怪，全息影像技術早在1000年前就普及了，他和智者又都有數據化多線程的處理能力，直接通過數據交流的方式效率極高，而且更加全面，爲什麼還要面談？
不過智者既然提了，楚君歸也未反對，決定過去看看究竟發生了什麼。楚君歸登上自己的旗艦，飛向了不遠處懸停的一艘星艦。