然而，隨着人類所掌握的力量越來越強大，甚至在漫長的歲月中，出現了不少驚才絕豔的，足以比肩各系蓋亞所創造出來的原初之神一級的強者，人類的慾望和野心，也越發的膨脹起來。
這些強者中的一些人，脫離了人類的身份，加入了神靈一系，成爲轉身之神，也有一些人，已經不再滿足於屈居神靈之下，轉而開始帶領着人類反抗神靈，甚至想要將神靈踩在腳下，構築起一個完全由人類掌握的世界。
人與神的矛盾越積越深，最終爆發了出來，一場人與神以及魔獸之間的漫長戰爭，在全球範圍內開起了，幾乎每一天，都會有人類的強者或者是神靈隕落，一開始的時候，蓋亞並沒有太過在意這些事情，那些神靈雖然大都是自己的念頭所化，但是被分化出去之後，就已經和蓋亞沒有太大的關係，即使被殺死了，對蓋亞也不會有任何的影響，至於那些人類強者，更是不會被蓋亞在乎了。
但是隨着戰事的不斷升級，越多越多的戰火被點燃，各種破壞力強大的魔法和神術，不斷地被開發出來，更是導致了戰鬥所帶來的破壞性不斷加強，甚至已經有着向危及整個星球的事態發展，眼見於此的蓋亞，也終於坐不住了。
感受到星球受到威脅而惱火的蓋亞直接出手了，她先是構築出一片虛影世界作爲監獄，將那些由自己的念頭和力量分化出來的神靈，以及一些人類高手進階的轉身之神，全都囚禁在了裡面，同時又發動一場波及全球的大洪水，準備將剩餘的人類也都清理掉。
就在這個時候，作爲人類意識集合體的阿賴耶，立馬站住來阻止，她一邊偷偷地將消息傳遞給了人類中的賢者，讓人類早做準備，以便躲過了這一劫，一邊懇請着蓋亞，請求她再給人類一次機會。
雖然對於阿賴耶這個和自己位格相差不大，差不多能和自己同等對話的存在，蓋亞相當重視，但是也不絕對不會因爲阿賴耶，就輕易地更改自己的決定。
大洪水還是被髮動了，不過，因爲有了阿賴耶的通風報信，已經事先有了準備的人類，雖然依舊損失慘重，但還是有不少幸運之人，逃過了此劫。這時候，蓋亞在阿賴耶的勸說下，怒火也已經消退了不少，眼見人類逃過了一劫，也就沒有準備繼續追究下去心思。
不過，因爲有了先前的例子，爲了防止人類再鬧出什麼事端，蓋亞也不是完全沒有準備，她發動了全球範圍的靈能潮汐，將這個世界的魔力因子，大部分收納到了漩渦之地，有意識的製造出了世界範圍的神秘力量衰退，同時還剝奪了代表着人類力量的魔法知識，封禁了人類汲取魔力的渠道，將那些強大的魔法與這個世界的魔力因子一起全都封禁於根源之中。
不僅如此，蓋亞還專門製造出了，以月之王爲藍本的名爲真祖的族羣，讓他們去充當這個世界自然的調停者，星之觸覺，以作爲人類中一旦有誰再危害到這個星球時，直接出手懲罰和清理他們的手段。
在蓋亞的一番操作之下，這個世界的法則，逐漸的被改變了，神秘力量開始不斷消退，除了真祖生來就被蓋亞賦予了強大的力量之外，那些缺少了知識的傳承，又很難從自然中，汲取魔力元素的人類，想要獲取神秘的力量變得更加艱難了，以至於這幾百年間，也只出現了一個梅林，成功踏足半神之境，當然了，這更多的，還是要歸功於梅林身上那一半夢魘的血統。
按照蓋亞的設想和規劃，這個世界，最終將會演變爲一個沒有任何神秘力量的世界，到了那個時候，無論人類如何發展，失去了神秘力量的加持，自然就無法對代表了最大神秘的蓋亞或者是這顆星球本身，造成任何的損傷。
然而，讓蓋亞沒想到的是，她雖然改變了世界的規則，但是卻也無法改變人心，更無法磨滅人類對於力量的追求，雖然大部分人，都開始通過製造工具來，藉助器械，使用技術和手段，讓自己獲得外物的力量，慢慢的走上了科技的道路。
卻仍舊有一些，曾經感受過魔法的強大，並保有了一小部分魔法傳承卻無法在當今環境下，直接使用魔法的人類，竟然獨闢蹊徑的開發出了通過在自己身體內銘刻特殊的魔法迴路，將自身塑造成一個類似於轉換器的一般的存在，從而繼續汲取使用這個世界剩餘的那些微薄魔力的方法，當然了，也因爲神秘度降低了，汲取的力量變少了，這些效果遠沒有那些曾經直接使用出的魔法強大，同時也可以被其他一些手段所替代，於是他們將這種力量，自嘲的稱之爲魔術。
這些人對於魔法的追求，可謂是孜孜不倦，甚至已經達到了一種病態的偏執，爲了重新獲取魔法的力量，絲毫不在意去使用任何手段，更是進行了許多慘無人道的實驗，而這一團原初黑暗能量，也正是那種種實驗中機緣巧合之下的產物.......
做出這件事的，是人類魔術師之中一個名爲瑣羅亞斯德教的組織，他們對外宣稱是永恆存在之神的後代，當然了，其中不乏自我吹噓的成分，但是這個組織，也的確有一些底氣，蓋因他們的祖上，的確曾出現過兩個強大的轉身之神，阿胡拉瑪茲達和安哥拉.紐曼，這兩個在轉身之神之中，也是相當有名的存在，明明是親兄弟，卻偏偏因爲理念不同，一直都處於敵對的狀態，從出起就開始爭鬥，一直爭鬥到進階神靈還沒有停止下來，彼此之間可謂是不死不休。
不過，兩兄弟的運氣也算不錯，雖然彼此不死不休，卻沒有隕落在人與神的那一段漫長爭端之中，後來成功的活到了蓋亞出手，和其他神靈以及轉神之神一起，被圈禁在了虛世界裡面。