“將關押在聖教會的所有黑巫師全部消滅以絕後患”，輪迴者們不是沒想過這個方案，但出於兩個方面的考慮或主觀原因放棄了這個計劃：
巫師監獄很難闖入，被封印在石中的黑巫師們亦處於半生半死的狀態難以幹掉，並不像尋常電影中的正面組織那樣被和平矇蔽了雙眼安於現狀，聖教會對監獄的看守數百年如一日的嚴密，輪迴者可以爲了利益一會扮壞人一會扮好人，但並不敢真的和聖教會開戰。
更重要的是，如果以暴烈的手段殺光了被關押的所有巫師，那聖教會總部就沒有能吸引黑巫女王前來的誘餌價值了，如果一個強大到極點的boss漫無目的地隨便一躲，要找出她就比較麻煩了。
最後一個原因就：輪迴者們沒考慮到儲存在這些被捕巫師體內的魔力。
很多巫師在被捕前都進行了一些抵抗，封印罪犯的石塊亦能隔絕魔力的滲入，但這成百上千的巫師不可能個個都是魔力耗盡後才被關押起來的……他們的魔力雖都不充盈，累加起來卻達到了一個十分驚人的程度。電影中正面角色們只是打斷了這些被控制巫師的咒語吟唱便萬事大吉，但在這個真實的世界中，黑巫女王卻依靠吸收這些巫師體內殘存的魔力，在沒有損耗任何魔力的情況下就催生出了瘟疫樹！
——
【支線任務，阻擋滅絕：
滅世的瘟疫正在醞釀中，摧毀即將毀滅人類文明的瘟疫樹
完成獎勵：c級支線劇情x1，2000獎勵點
失敗懲罰：無】
【支線任務，黑暗勢力：
隱藏於黑暗中數百年的，黑巫師議會終於成功復活女王。摧毀黑巫師議會。消滅參與黑巫女王復活的所有黑巫師
完成獎勵：c級支線劇情x1，3000獎勵點
失敗懲罰：未全部消滅取消支線獎勵，逃脫一名扣除500獎勵點】
這兩個支線任務便是輪迴者們放棄第一個主線的可能收益了。說“可能”，是因爲還沒拿到手。而且即使不放棄第一個主線，他們也可能會接到其他的支線任務。
但即使只做完懲罰性的第二階段主線任務，他們獲得的獎勵也會比做正常任務要稍高一些了。
前提是完成，不死人。
——
聖教會的守衛拿起各種奇特的魔法武器，開始包圍從地下鑽出的巨大瘟疫樹，這棵龐然大物已經長大了驚人的大小，如同躺倒的巨獸般塞在教堂的穹頂之下，粗枝虯結。盤纏堆積了一地，主幹接近穹頂的上端已經開始結成一個個巨大的球體，彷彿是樹幹上生出的腫塊一般，這些不規則大球上的裂縫處還傳來隱隱約約的紅光，那是魔法在其內部滋生孕育瘟疫蒼蠅了，一旦成熟，腫塊就會裂開，放出數以萬計的瘟疫蒼蠅，人類將再次迎接一次大洗牌。
雖然經受訓練且裝備着形形色色功能各異的反魔法物品，但此刻身處聖教會的所有修士。竟沒人能立馬認出這棵八百年沒現身過的大樹……除了獵巫人。
“是瘟疫樹。”寇特已經幾百年沒被嚇到過了，但依舊迅速冷靜下來，堅毅冷酷的臉龐上流微微滲出幾絲冷汗。他衝着周圍發呆的人羣大吼道：“別傻站着了，去拿汽油，燒掉這東西！”
彷彿聽懂了獵巫人要對付自己的辦法，龐大的瘟疫樹主幹表面一陣扭曲蠕動，一股碧綠色的煙氣從樹皮表面噴涌而出，迅速向周圍瀰漫！
……
“差不多了，守衛全都往教堂裡面去了。”衆輪迴者在教堂外等了幾分鐘，直到確認裡面的正反兩派已經開打，才放心地通過教堂外門。走入聖教會的地盤。
口袋中的一件小道具忽然響起了刺耳的警報，張昊林伸手掏出了聲音來源。是空氣檢測計，自從遭遇了機械輪迴者們的偷襲過後。張昊林就一直將它放在戒指外，此刻果然派上用場了。
“檢測到對人體有害氣體的存在，濃度低。”持有者將設備小小顯示屏上的字唸了出來，擡頭看向衆人：“這可不太妙啊，翁偉，用風系魔法驅散掉。”
“好！”
“喂，專業的在這呢！”翁偉才舉起魔杖，藍雨就不滿地插嘴提醒了他們一句，纖細的手臂平舉握拳，一股絲毫不弱於另一隊隊長磁場控制發動時氣勢的魔力波動激盪而出，一個風速不高卻體形巨大的氣旋在教堂上空形成，中心氣壓驟然降低，把從教堂中瀰漫逸散出來綠色毒煙像油煙機抽風一樣匯成條狀，一股腦地抽向高空，周圍紐約市區雖然不甚新鮮卻無毒的氣體迅速化風滑過輪迴者們身邊涌向教堂，填補了空氣缺失，也消弭了衆人中毒的可能。
“漂亮。”誇獎了一句後，他們進入了教堂。
聖教會的守衛至少一半是普通人，此刻被毒氣襲擊後橫七豎八地躺了一地，僅存的精銳和幾名長老，加上寇特，對峙着從瘟疫樹中破殼而出的數名黑巫師。
寇特偏頭看了衆輪迴者一眼，隨即回頭繼續盯着面前不遠處站着的一個古怪人形存在。
瘟疫樹底下有數個人影，其中幾個是先前輪迴者們追過的黑巫師，而站在正中間的就是黑巫女王無疑了。深褐色的身體看上去像是用爛泥塗滿了全身，被硫酸潑過似的臉上坑坑窪窪，勉強才能看出五官，頭髮與其說是生物的毛髮，更像是一根根細細的藻絲纏在頭上，後腦勺的部位垂着一根極粗的馬尾辮，仔細觀察才能看出，那分明就是一段從頭裡長出來的脊椎骨。
【黑巫女王：力量313，智力892，身體強度219，精神1720，敏捷673，細胞活力189。能量充盈度：中】
這東西確實不是人類，可到底是怎麼產生的？
一名打扮復古的長老握着一根長長的法杖，緊張地看着從正門進來的幾名輪迴者：“他們是誰。寇特。”
“不知道，但應該站在我們這邊。”雖和輪迴者們關係不怎麼樣。但獵巫人用沉悶的聲音做出了正確的判斷。
……
教堂內部的空氣一陣顫動，四面的窗戶全部在清脆的響聲中破碎開來，樹幹上雖然漸漸稀釋卻仍在繼續往外逸散的黃綠色煙氣被空氣中的數個小氣旋匯成長長的細條，沿着破開的窗戶被引向教堂外，匯入上空那個更加巨大的“抽油煙機”氣旋中，被送往了威脅不到衆人的高空，教堂內的環境瞬間清晰乾淨了許多。
“非長老的成員，把還活着的人弄出去搶救下！”見到輪迴者們出手對付毒煙。聖教會長老們的臉色稍霽，同樣盯住了場中的黑巫女王。
捂着口鼻憋氣憋得滿臉通紅的幾名教堂守衛如聞大赦，趕緊四下尋找活着的同僚，抱着傷員逃也似地離開了教堂。
“咯咯咯……一復活就能馬上見到你真是高興，寇特，我很想念你呢，這幾百年來你過得好嗎。”黑巫女王尖聲笑着，用彷彿情人般關心的語氣問候着宿敵，隨後目光從獵巫人身上移向輪迴者們：“沒想到這麼多年過去了，巫師里居然出現叛徒了。是想抱人類的大腿享受舒服的生活，對抗你們的女王？”
“我們不是巫師，只是會用魔法的人類罷了。”藍雨絲毫不怵。同樣笑眯眯地回答道：“就算是巫師，難道就非要把消滅人類當成正事嗎？”
“人類像老鼠一樣拼命繁殖，破壞着這個世界，瘋狂地消耗着資源，威脅着整個自然。”女王猙獰醜陋的臉上露出了擬人的憤怒表情：“人類就是這個世界的害蟲，你們不屬於自然，必須將人類清除掉，其他生命才能順利地活下去！”
“您的說法我沒法一一反駁，因爲有些確實是實話。”張昊林忍不住插嘴了。和這種超級反派對話的機會可不是想有就有的，可要好好珍惜。更別提其他隊友還在精神鏈接中飛快地交流着戰術和對策，需要有人站出來小小地拖一下時間。
“所有生命都想拼命繁殖。只看能不能辦到罷了；所有生命都消耗資源，只是快慢不同；人類建造城市侵佔其他生物的生存空間……螞蟻也做同樣的事情，爲什麼您不說螞蟻不屬於自然？人類從猿猴進化而來，在自然中誕生，在自然中生存，在自然中進化發展，只是規模比其他生物大了一點而已。我的觀點是，人類無論做什麼，都是自然的一部分，女王陛下一邊用老鼠來比喻我們，一邊又說我們不屬於自然，這就完全是爲了孤立我們而誹謗了，恕我不能接受。”
“嘖嘖，幾百年過去了，人類不僅能耐和破壞力越來越大，還學會狡辯了呢。”黑巫女王冷笑着盯住了張昊林，“這種噁心的生物，果然還是消滅了最好。”
“人類破壞環境，這是不好的，我不想爲誰辯護。但這依舊是自然的一部分，沒有東西有資格因爲人類拉屎撒尿往河裡倒廢水而消滅我們。”電磁異能者一邊和隊友暗中交流着，一邊強詞奪理地嘴硬着：“傳說您是自然孕育出來滅絕人類的，那我想問一句，如果自然母親想消滅我們，直接讓地裡長不出莊稼河水對人類有毒不就好了？爲什麼要造個你這樣噁心的東西出來多此一舉？”
“冒昧問一句，尊敬的女王。”克洛伊也忍不住發聲了：“您說人類不是自然，那把人類消滅乾淨後，您打算怎麼處置巫師羣體？是要讓我們也全自殺，讓世界徹底回到自然的狀態？還有，你們把我的朋友放在哪裡了，如果米蘭達受到傷害，我絕對不會原諒你們！”
“哼，米蘭達是誰？又一個叛變的女巫麼。”反派大boss被嘴炮弄得有些啞口無言，冷哼了一聲後繼續說：“只要巫師們自然地生活，當然有權繼續存在下去……”
“自然地生活，是指光着身子在森林裡跑，餓了吃水果，困了睡草地嗎？那可真是幸福的生活呢。”精神鏈接中的討論已經有了結果，瘟疫正在醞釀，多拖時間並沒有好處，是時候開搞了：“比起說廢話，坦率地承認您看不起沒有魔法的普通人，然後痛痛快快打一架決勝負，不是更直截了當？”
“唔，聽上去，你這隻小老鼠很有自信呢，也好，動手吧，讓我看看人類現在有了什麼手段！”
——
數個汽油桶被甩到了空中，凌空被幾道風刃割裂，穹頂之下像下雨般落下了大灘汽油，一個小火球不偏不倚地射入這灘易燃液體，呼的一聲中將汽油點燃開來。
“哈哈哈，幾百年前的老招，還想對付我第二次嗎？”瘟疫樹上燃起熊熊大火，黑巫女王卻不以爲意地大笑幾聲，隨即消失在了原地。
黑巫師議會的幾名高階巫師各施手段，與聖教會的幾名長老大打出手，黑巫女王則依靠着驚人的速度，撲向了獵巫人寇特。
輪迴者們當然可以掩護男主，但他們另有打算。
翁偉和茅東保護着克洛伊迅速地衝向地下，剩下的輪迴者們，則不管大boss，率先開始攻擊黑巫師議會的殘餘幾人，打算先把獎勵極高的一個支線任務做掉，除了藍雨要維持驅散毒煙的氣旋無法全力出手外，所有人都是使出最強的攻擊，力求瞬間結束第一階段的戰鬥。
一道快到幾乎看不清的殘影衝向寇特，獵巫人幾百年前趁着女巫王虛弱殺死了她，根本沒想過全盛狀態的敵人強到如此地步，剛剛將大名鼎鼎的屠巫劍從背後拔出，還沒來得及揮舞第一刀，胸腹便被狠狠擊中，黑巫女王一手架住寇特持劍的雙臂，一手將利爪插在獵巫人胸口——魔力涌動，獵巫人的體表浮現出幾股蜿蜒的發光經絡，一股神奇的能量從他身體內沿着刺入自己胸膛的指甲倒流向宿敵體內……那股讓他橫行敵對之前，震懾巫師數百年的永生之力，頃刻間跑得乾乾淨淨。
黑巫女王從仇敵身上取回了暫存於體外的超強恢復能力，真正成爲了完全體。
——(。)