而隨着軒轅退位，人族中顓頊繼承人皇之位，他在軒轅跟蚩尤大戰之時，便知道了人族兵權的好處，於是顓頊在有意無意間徹底的掌控了人族的兵權，隨後他定婚姻，制嫁娶，分男nv之別，定長幼之序，自此男尊nv卑之始也。
之後，顓頊又遷都於帝丘，對官職名稱進行了改革，開始以分管民事的xing質命名官職。並設重、黎分別掌管觀天象制歷授時和按統一的歷法進行社會活動的天、地指揮官，統理天下神職人員和民事人員，絕地天通開啓了以民事紀官的新時代。之後他又對中國區域建置進行明確規劃，確定了兗徐揚、雍、樑九州的名稱和分轄區域。
他還改革甲歷，始以建寅月爲曆元。在二十四節氣史上第一次明確地把以物侯觀測爲重點轉移到以天象觀測爲重點，有了曆元、正朔、五星、營室等概念，定下一年四季。進入治歷明時的新階段，歷名《顓頊歷》。
顓頊還命樂官飛龍氏融匯中國八個大區域的流行樂曲“條風”、“明庶風”、“清明風”、“景風”、“涼風”、“闔闔風”、“不周風”、“廣莫風”的風格特點，創作成“圭水之曲”，主題是“召氣而生物”，然後鑄成銅質樂鍾，作“五基六英之樂”，名爲《承雲》，用來在“萬國諸侯”到國都開大會時“享上帝，朝諸侯”，創了第一首國歌。
顓頊在位期間，人族雖然沒有大的進步，但是社會卻進步不小，九百年後顓頊證道五帝之首，飛昇火雲洞。而在顓頊之後繼承人皇之位的則是帝嚳。
帝嚳治民，像雨水澆灌農田一樣不偏不倚，遍及天下，凡是日月照耀的地方，風雨所到的地方，沒有人不順從歸服。史書頌之：“祖自軒轅，玄囂之裔，生言其名。木德治世。撫寧天地，神聖靈賓，教訖四海，明並日明。”
帝嚳在位期間，人民豐衣足食，好像重歸了上古神農時代一樣，衣食無憂的幸福安康生活。
帝嚳之後是爲唐堯，唐堯得百姓愛戴，得到不少部族首領的讚許，因此唐堯也是一位不錯的人皇。
相傳帝堯仁德如天，智慧如神。接近他，就像太陽一樣溫暖人心；仰望他，就像雲彩一般覆潤大地。他富有卻不驕傲，尊貴卻不放縱。他戴的是黃sè的帽子，穿的是黑sè衣裳，硃紅sè的車子駕着白馬。他能尊敬有善德的人，使同族九代相親相愛。同族的人既已和睦，又去考察百官。百官政績昭着，各方諸侯邦國都能和睦相處。
此時，帝堯繼位已有數十年之久，人族在其帶領之下，發展迅速，如今的實力已經超過了歷代。因爲人口的增長，原先的土地卻是不夠住了。於是，不斷的有人族北遷，而北方的妖族經過這些年的修養，數量上也在增長，所以這些年妖族也是逐步的南遷，人妖之間不可避免的就出現了些衝突，如此卻是招來了隱忍多年的妖族的不滿。
媧皇宮內，女媧高坐在雲臺之上，忽然繡眉一皺，嘆息聲在媧皇宮內響起。卻是女媧推算天機，得知妖族的又一次劫難將要到來，而這次劫難卻是應在人族的身上。
果然，在帝堯晚年之時，人族迎來了一場天大的水災，只是此時帝堯年事已高，降妖治水很是力不從心，便將共主之位傳與舜。
而舜在繼位之後也沒有讓帝堯失望，帝舜通過觀測北斗星，來考察日、月及金火、土五星的運行是否有異常，接着舉行臨時儀式祭告諸聖，用把祭品放在火上燒的儀式祭祀天地四時，用遙祭的儀式祭祀名山大川，又普遍地祭祀了各路神祗。他收集起公侯伯子男五等侯爵所持桓圭、信圭、躬圭、谷璧、蒲璧五種yu制符信，選擇良月吉日，召見四嶽和各州州牧，又頒發給他們。
隨後帝堯巡視四方，回來後告祭祖廟和父廟，用一頭牛作祭品。以後每五年巡視一次，在其間的四年中，各諸侯國君按時來京師朝見。舜向諸侯們普遍地陳述治國之道，根據業績明白地進行考察，根據功勞賜給車馬衣服。
舜開始把天下劃分爲十二個州，疏浚河川。規定根據正常的刑罰來執法，用流放的方法寬減刺字、割鼻、斷足、閹割、殺頭五種刑罰，官府裡治事用鞭子施刑，學府教育用戒尺懲罰，罰以黃金可用作贖罪。因災害而造成過失的，予以赦免；怙惡不悛、堅持爲害的要施以刑罰。
舜的所作所爲，天下悅服。可與此同時，人族水患在不少妖族的推動下越來越嚴重，只是舜對此道卻是不甚瞭解，爲了以防因爲自己的不懂而干擾治水，舜便將治水的重任交予人族另一位大賢，鯀。
這鯀的父親是顓頊帝，顓頊的父親是昌意，昌意的父親是黃帝。鯀和他的父親當初都是名滿人族，是爭奪人皇之位的有力人選，可惜後來他們都給共主做了大臣，結果卻被罷黜。鯀幼時曾淂神人傳授，習得一身本事，自從接到治水之大任以後兢兢業業，勞心勞力。
然而鯀即使再強，區區一人之力又豈可攔得住這無匹的洪災，即使人族聚集在一起羣策羣力也也扛不住這可怕的天災。不過，鯀對此事還是義不容辭，在得到帝舜的授命之後，鯀便收拾行裝，會同衆人一起前去治水。
鯀採取攔堵之法，利用nv媧娘娘造人之後留在人族的息壤，製造堤壩、大山迫使黃河大水歸位，又攔江蓄水，讓百姓農業有了灌溉之源。前後十五年，鯀最終憑藉人族自己的力量將氾濫的黃河給制服了。
只可惜鯀卻不知，堵不如疏的道理，如此阻攔黃河大水，雖然短時間內有所成效，但是黃河水越堵將來撕開所形成的破壞也就越大，更何況黃河之內還有不少的妖族興風作浪，更是加劇了大壩崩潰的速度。
果然在一天雨夜中，黃河大壩被洪流沖塌，遮天蔽日的黃河水脫離了約束，向着廣闊的平原衝去，無數的xing命就這樣慘死在一場洪災之中，原本廣袤的平原變成了大海，海上漂流着無數的屍體，數不清的冤魂飄散不去，滔天的怨氣直衝雲霄。
此次洪水的爆發，也標誌這鯀治水的失敗。
而就在洪水暴發淹死無數的人族之時，九天之上幾道憤怒的冷哼聲響起，很顯然是人族的幾位聖人有些惱怒妖族的所作所爲了。只是他們身爲聖人，超脫天地自然不能隨意對那羣螻蟻出手。
而人族的那些金仙，卻是受到了雲揚的命令，這是天道對人族的考驗，讓他們不要出手。
不過另一方面，人族的三皇五帝雖然不能直接對螻蟻出手，但不代表他們不可以間接地出手。
火雲洞中，三皇以及五帝中的三位他們的眼中也都閃爍着怒火，很顯然妖族的行爲以及觸犯了這些無上聖人以及準聖大圓滿強者的底線了。殺氣最盛的軒轅人皇，直接右手一伸，閃爍着耀眼金光的軒轅劍從虛空中出現。
“軒轅劍，去吧！幫助新的人皇斬殺那些敢對人族出手的妖孽，將他們全部滅掉。”軒轅的眼中充滿了殺機，自己在位時，妖族什麼時候敢猖狂過，如今三皇時代過去，就以爲我人族好欺負嗎？
而其餘的五位人皇沒有絲毫阻攔的意思，反而各自點了點頭，伸出自己的食指向着軒轅劍中注入無上的神力，在加上軒轅自己本身的力量，毫不懷疑這一刻的軒轅劍絕對有着將聖人給滅殺的能力。這是攜帶着整個人族皇者憤怒的力量，人族的氣運佔據洪荒九成已經要徹底的穩定下來，洪荒九成的氣運，就算是鴻鈞也能給拉下馬來，更何況是聖人了。
待到六位強者將屬於自己的神力注入到軒轅劍中後，軒轅反手一拍打在軒轅劍的劍柄上，虛空瞬間破開，軒轅劍破空而去眨眼間消失不見。
而另一方面，鯀在治水失敗後，人族遭受天大的災難，讓鯀心中愧對人族無數人的期望。而舜也嘆息不已，鯀在人族中也是一位賢能之士，本以爲自己退位後便可以將人皇之位傳與鯀。只可惜現在治水不利，人族死傷慘重，必須要一位人來頂缸，於是鯀被處死在羽山。
鯀死之時，天際陡然一道亮如白晝的閃電一閃即逝，旋即一聲驚天雷鳴炸響，天地隨之一暗，旋即傾盆大雨滂沱而下，遍佈整個北部之地。
而在鯀死去的肉身中，一個小孩剖腹而出（由此可見，最早的剖腹產是在中國最古老的時代便有的）。而在小孩出世之後，大雨落下將其身上血跡衝去，一位老農路過此地，將小孩帶走。因爲小孩是在下雨之時誕生，故而老農給他起名叫——禹。