第二波的流感卻與第一波不同，這一波流感傳染性非常強，其死亡率也比普通流感高了近五十倍，尤其在二十至三十五歲的青壯年族羣中死亡率特別高，其症狀除了高燒、頭痛之外，還有臉色發青和咳血等，許多人早上還正常上班，中午染病，晚上便死亡了。dm
面對突然爆發的災難，各國政府這纔開始努力隔離病患，對所有公共場合進行消毒，幾乎所有國家都宣佈限制公民進入公共場所，包括電影院、舞廳、體育館等場所一律被關閉。
所有人都要儘量呆在家中，避免交叉感染，但是他們也僅限於隔離和預防，由於沒有特效藥，整個望鄉星的醫療水平又不高，各國都沒有什麼好的辦法消除這些可怕的流感病毒。
在所有國家之中，中華帝國開始預防最早，其方法也最爲徹底。方嘯宇有在前世非典中的經驗，做出了非常多的規定。
第一，號召全國開始了衛生大清理活動，消除衛生死角，較少疾病的傳播途徑。第二，中華財團下屬的各化工廠大量生產次氯酸和過氧乙酸，定期分發到各地政府，由各地清潔隊對所有公共場所定期進行消毒。第三，除了要求居民儘量待在家中以外，還要求他們儘量帶上口罩，並儘量避免吃生食，水也要煮開五分鐘後才能飲用。
除了這些規定方嘯宇早在第一次流感出現之後，就從受感染的士兵中間採集了病理植株，交給醫學院研究特效藥，甚至小風也將病理植株掃描進芯片，在模擬環境下進行對比和研究。但是任何一種藥品的研製，都需要長時間的研究和臨牀驗證，不是一兩年可以搞出來了。
９０９年５月，第二波流感開始大爆發以後的兩個月，中華帝國境內終於也出現了病例，就連馬達加斯加島上的中華軍士兵中的病例，也開始出現顯著增加，甚至出現死亡。
對於這些病例方嘯宇非常重視，他立刻要求衛生部長孫小眉專門開闢醫院安置這些病患並進行免費治療。孫小眉也很重視，親自帶人給這些人制定治療方案，結果在治療中，孫小眉意外的發現中華帝國特產的青黴素和磺胺類藥物對這種流感有抑制作用，雖然無法完全治癒，但能很快減輕症狀。
中華帝國很快將這一成果向全世界公佈出來，同時中華帝國各大製藥廠開始加班加點生產藥品，第一批藥品除了供給國內使用之外，方嘯宇開始平價向東協的各盟國供應，讓各國的國內民衆看到了治癒的希望，當地局勢很快穩定下來。此外方嘯宇也開始在各盟國推行中華帝國的各種防範經驗，使得這些國家的病情得到了有效控制，死亡人數直線下降。
見到東協各國的病情得到了有效緩解，雅曼帝國等各個國家立刻向中華帝國提出了購買藥品的要求。對於這些國家的要求，方嘯宇是不會坐視不理的，他宣佈對各國藥品的需求，中華帝國敞開供應，不論是磺胺、青黴素，還是用於消毒的次氯酸和過氧乙酸都在供應之列。中華帝國毫不藏私的行爲讓各國爲之欣喜，中華帝國在各國民衆中的形象，一時間高大了起來。
中華財團雖然稍微壓低了各種藥品的價格，但還是賺的盆滿鉢滿，不過方嘯宇並沒有因爲藥品賺錢而欣喜，他最焦急的是在馬達加斯加島上的十萬中華軍士兵，爲此方嘯宇再次進入芯片和小風商量特效藥研製的問題。
“小風，爲什麼特效藥如此難以研製。”方嘯宇的意念進入了小風的控制大廳。
小風顯出了實體回答道：“主人，這是很正常的情況，任何一種特效藥的研製都是非常複雜的過程，何況這個世界的醫療水平很低，研製速度也慢。”
方嘯宇點點頭：“的確，我也是忽視了醫療方面，我還認爲在這樣沒有抗生素的時代，有了青黴素就可以在很長時間之內高枕無憂了，就連中藥方面也沒有着緊。”
小風道：“一種藥是不能包治百病的，這非常正常。主人也不必自責，其實我一直在進行生物醫藥方面的研究，對於中草藥和抗生素方面研究的的確不多。”
方嘯宇道：“現在我最擔心的，就是馬達加斯加島的陸軍士兵，不知道有沒有什麼方法，可以讓我不會受到感染。”
小風道：“你怎麼會有這種想法？”
方嘯宇道：“我想到馬達加斯加島去，看望那些士兵，爲他們提振士氣。”
小風道：“你的身體經過了芯片的改造，已經部分具備了後世地球人的強悍體格，對於這種低級傳染病本來就是完全免疫的。”
“啊？那你不早說。”方嘯宇道：“我先去馬達加斯加島了，你可要抓緊時間研製特效藥啊。”說完他就離開了芯片空間。
小風自語道：“要不是爲了研究那些特殊藥劑，怎麼會耽誤這麼長時間，看來我也要關注一下這種低級傳染病的特效藥研製了。”
６月初，方嘯宇不顧衆多官員的勸告，毅然決定乘船到馬達加斯加島，看望在那裡住了大半年的遠征軍士兵。得到這一消息舉世震動，人們紛紛猜測這位全世界最有權勢的皇帝陛下，到底是在島的周圍繞上一圈作秀，還是真的會去看望士兵。結果方嘯宇的行動讓世人大爲吃驚，他居然在馬達加斯加島近海，將所有護衛留在了船上，獨自一人換乘衝鋒舟登上了馬達加斯加島。
方嘯宇的這一做法不但讓擔任護航艦隊指揮官的萬勇中將嚇了一跳，也讓在馬達加斯加島上駐守的陸軍官兵們嚇了一跳，當他們得知方嘯宇單人獨舟來到了島上時，衆多官兵立刻前往迎接。
此時遠征軍的總司令，前國防軍第十二軍的軍長肖成第一個走到了方嘯宇身邊激動的道：“陛下，你怎麼能輕易犯險，到這種地方來。”