卻說公孫軒轅接任族長之後，便夜晚隨廣成子修道，白天便處理族中事務，將一切打理得井井有條，有熊族在他的帶領下漸漸地發展壯大起來，附近部族聞他乃是有德之人，於是紛紛投入了他的麾下，漸漸地形成了以熊、羆、貔、貅、虎、雕爲首的強大的氏族聯合部落，有熊族也因此成爲了中原地區強大的部族。
那時田無邊際，耕作無數，軒轅遂在神農的基礎上大力發展農耕，乃以步丈畝，以防爭端，將部族的土地重新分配，協調勞作，如此有熊族的糧食大大地增產。在糧食充足的情況下，軒轅又大力訓練軍隊，治軍嚴格，軍隊實力頓時大增。
陳都的神農聞軒轅有大才，且聞軒轅出生時的異象，暗思道：伏羲聖皇與吾生時有神龍繞樑慶賀，如今聞公孫軒轅生時亦有神龍來賀，料想他必定是我人族在吾之後的共主！
神農於是下詔令公孫軒轅來陳都，公孫軒轅收到詔書之後，在廣成子的陪同下一路駕雲朝着陳都方向而來，一日之後方纔到達。
神農接到門衛的稟報，親自出到城門迎接軒轅。只見軒轅身高九尺，雙眉如劍，一雙眼睛炯炯有神，燦若星辰，站在那裡自有一股王者之氣散發而出，期間隱含着淡淡的霸氣。神農一見，心中嘆息：好一個英姿颯爽的人兒！
軒轅見神農親自來迎，心中一驚，忙跪倒拜道：“有熊族族長公孫軒轅拜見共主！”廣成子也向神農稽首行禮道：“貧道廣成子見過人皇！”
神農對着廣成子點了點頭，接着笑呵呵地扶起軒轅，對他道：“軒轅不必多禮！吾聞軒轅乃是人族有德之人，今日終於一見，果然是人中之龍啊！”
軒轅謙虛地說道：“共主過獎了！軒轅不敢當。”
神農請兩人進了議事大殿，各自就座之後方對軒轅道：“吾自得位於伏羲聖皇之後已有數十載，這些年來吾戰戰兢兢，不敢有絲毫差池，惟恐弱了我人族，如今終於不負聖父所望，人族在我手中總算一路走了過來。只是吾如今年事已老，對族中事務有心無力，軒轅，你乃德才兼備之人，吾欲將共主之位傳與你。”
軒轅聞言忙站起身來道：“軒轅何德何能，豈敢成爲共主？”
神農搖搖頭道：“軒轅，你不必妄自菲薄，你之能吾知，望你以我人族大業爲重，莫要推辭！”
軒轅聞言點頭嚴肅地說道：“既是如此，軒轅定不負共主之望！”
神農聞言笑道：“如此纔是！”於是召開人族大會，在會上宣佈將於一個月之後證道，並將共主之位傳給軒轅，衆大臣都沒有異議，畢竟神農身爲共主，而且他們也多聞軒轅乃是德才兼備之人，自是可以繼承大位。
一個月之後，又是陳都中央的高臺上，三尊聖像仍然穩穩地立在上方，似在俯視着人間的一切。陳都又是人山人海，熱鬧非凡。
一聲鐘響，神農拉着軒轅出現在衆人眼前，衆人頓時安靜了下來，靜靜地等待着神農說話。
就在這時，只見自三十三天之上飛來一輛九龍御輦，九龍御輦正站立着人教弟子玄都大法師。
玄都大法師躬身行了個禮，然後從袖中取出太清符詔，展了開來，神農見狀忙領着衆人拜倒於地，恭聽太清法旨。
只見玄都大法師念道：“太清太上道德天尊敕令：人族共主姜氏神農，自成爲人皇以來治天下，務利之已矣，不望其報；不貪天下之財，而天下共富之；不以其智能自貴於人，而天下共尊之。今可得道，飛昇火雲宮，當歷無量量劫不滅！另着人族公孫軒轅繼位。欽此！”
神農拜了九拜，雙手接過太清符詔，拉着軒轅登上了高臺，拈香祭拜了三尊聖像，隨後轉身高聲說道：“神農自成爲共主以來不敢有絲毫懈怠，天幸如今下任共主已出，神農也可放心離去，今日神農禪位，天下共知！”言罷從袖中取出人皇至寶崆峒印，捧着來到軒轅面前，表情嚴肅地說道：“軒轅，今日我把人族的未來交到你的手中，你定要將我人族帶領壯大！”
軒轅接過崆峒印，高舉道：“軒轅絕不辜負重託。”一句話說的堅強有力。
這時，一股澎湃的王者之氣從崆峒印中爆發出來，五條九爪金龍在陳都上空飛舞盤旋，吟嘯連連，天降無量功德，有一成落在孔宣的身上，同樣孔宣三花盡顯，一黑袍道人瞬間從孔宣體內跳出，二人互相見禮了下，那黑袍道人又跳進孔宣體內，卻是孔宣藉助授業地皇的功德斬去惡屍，達到斬二屍的境界，剩餘九成落在神農身上，神農頓時爆發出五彩霞光，照亮了整個陳都，天音鳴唱，無邊金蓮涌起，神農一路道行飆升至大羅金仙，瞬間證得了地皇道果！
神農上了九龍御輦，對軒轅說道：“皇弟，從此人族就交給你了，吾去也！”說完便駕着九龍御輦飛往火雲洞去了。
見事已了，衆人便都散了去。自此人族進入了人皇的統治階段。