至此整個行朝全部遷到了瓊州，趙昺下旨放假三天，讓衆臣安排家事和衆軍進行休整。δ81中δ文網而這幾天他也沒有閒着，分別召見了瓊州舊將，詳細瞭解他離開後的各種情況。然後又請太后提議舉行朝議，就行朝的人事和軍事等緊要問題進行商討。太后應允，卻稱病沒有出席，下懿旨由陛下代爲主持，只將議後的決議告之即可。
三月初一日，在大慶殿舉行了行朝遷瓊後的第一次大朝會。頒佈詔令升瓊州爲府，作爲大宋臨時行在，管瓊州和昌化軍兩州；同時改吉陽軍爲崖州府，領吉崖州和萬安軍。以江璆知瓊州府，以蔡完義知崖州府，趙與珞升爲戶部侍郎。同時撤銷瓊州制置司，以文天祥爲右相兼樞密院副使，應節嚴爲參知政事，劉師勇爲樞密院僉事。
同時對各軍進行整編，原帥府軍改爲殿前侍衛親軍，下轄前、後、左、右、中，五軍，兵額六萬，仍以趙孟錦爲都統；將行朝所屬各軍和勤王義勇皆歸於殿前禁軍，亦改編爲五軍，兵額四萬，以江銘爲都統。同時將各部水軍統一遍爲殿前水軍，下轄白沙水軍、澄邁水軍和臨高水軍，及直屬摧鋒軍、勇敢軍，兵額四萬萬人，以劉洙爲都統。
同時保留御前護軍，兵額萬人，以倪亮爲都統。如此行朝共有兵力十五人，裁減的兵額暫歸於轉運司輜重軍。另外成立皇城司，將原帥府的總計司、匠作司、修造所和事務局及護軍侍衛營劃入其中。入內侍省仍以王德爲都知，竇興爲副都知，負責宮內一切事宜。而行朝各部及瓊州各州縣官員暫不做變動，仍各司其職。
詔令一下，朝廷上下都大鬆口氣，因爲早有流言傳出，遷瓊後陛下將對行朝官員進行清洗，換成潛邸舊臣。而6相也在準備精減官員，以便減少財政開支，那樣大批官員將會賦閒，因此到瓊後人心浮動，惶惶不安，都在爲自己謀求後路。因此上朝時大家是個個蔫頭耷腦，提心吊膽，害怕回家之後就已經沒了飯碗，可結果大出衆臣意外，當然是無不讚陛下仁德。
按照宋朝慣例，在端午節應賜給百官夏服，完整的五件套包括“潤羅公服、紅羅繡抱肚、黃縠汗衫、小綾勒帛”，以及扇子兩把，主要使用羅和縐紗兩種夏季面料。夏日不得不穿着外套的時候，還可以貼身先穿上一件用細小單枝竹管串接成網狀的竹衣，俗稱“隔汗衣”入農曆六月，最酷暑時，則換上“葛紗”，到了“葛衣期”。瓊州不比臨安，一年四季都是熱的，太后體諒改慣例爲三月三賜夏服。
緊接着趙昺又從總計司管轄的內藏庫中撥出錢糧補了朝廷所欠薪俸，撫卹歷次戰鬥中陣亡的臣僚、軍兵。而遷瓊的官員都意外的了筆小財，也在城中置地修宅。而他們同時也現瓊州並非過去所想的那樣荒蕪，窮苦，市場上物資豐富，價格低廉，且當地俚民也並非所想的那樣動輒打家劫舍，粗鄙不堪，漸漸也都心安……
趙昺大把的錢撒出去，將好不容易積攢的家底都花去了大半，而剩下的錢卻不敢再亂花，不僅要應付接下來的花銷，還要修補戰船，打造兵器，準備撈回老婆本。所以他將在船上的研究成果賜給6秀夫，讓其立刻遣人前往各處尋找事宜建造鹽田所在，並將帶回和繳獲的戰船選出堪用的進行改造，裝配弩炮和火箭射架，自己的社稷號也交由周翔的將作監進行整修。
另一方面，趙昺又讓修造所在靠近東宮牆外的空地上修建了個小四合院，並開了個直通東宮的角門，作爲‘經撫房’的辦公用地。此處距離前朝兩府的朝房也不遠，走着也用不了十分鐘。但是他考慮經撫房的名稱已經被王黼搞臭了。而賈似道也成立過類似的機構‘機房’名聲也不大好，其只由賈似道一人署理，下設僚佐兩名，由賈似道的親信許自、家鉉翁擔任，總理全國的軍政大事。
它們的設立都是由於當時處於戰爭年代，軍情壓倒一切，所以機房的實權已經凌駕於相府、樞密院之上，成爲國家最高決策部門，可見兩位皇帝批准設立這種特權機構的舉措，當屬兩宋的重大行政改革，只可惜所帶來的效果實在令人不敢恭維，總會讓朝臣們不時想起大宋兩個最爲黑暗的時代。趙昺想想還是叫‘軍機處’最爲恰當，雖然也是剽竊後人的，但自己這個時候先用上了，那雍正再用就是山寨自己的。且這個名字比經撫房和機房都要收斂些，讓人一聽就是處理軍機要務的機構，也會讓6秀夫等人心中好過些。
而趙昺所處的情形比之雍正還要險惡，那時其應對的只不過是準格爾叛亂，對清朝來說只不過是癬疥之瘡，可其仍認爲軍情如火，需立即處理，且必須保守秘密。不過清承於明制，決策權在國家行政中心的內閣手中，而內閣設於紫禁城太和門外的文淵閣附近，而雍正皇帝在養心殿處理政務、就寢，兩者相距一千餘米。宮禁重重，手續繁多的處理流程，極易延誤時機；而軍報到京，先經內閣，也容易泄露機密，其也需要一個密近的處理緊急軍情的機關。
現在大宋政權早已崩潰，只剩下一幫殘兵敗將，可趙昺還未親政，更無法完全掌控朝政，若是軍務皆經朝議後執行，不但晚了八村，更無法保守機密。且瓊州和大陸只隔一條海峽，根本沒有防禦縱深，再一旦失去先機，那就是死局，所以無論如何都要把軍事決策權抓在手裡。而‘前人’的實踐已經給趙昺提供了可借鑑之處，‘白拿’主義已經經過多次論證是百戰不殆，他沒有理由不用，藉以打造一個屬於自己的權力中心……