2079年7月1日晚上8點，紐約，MAX公司總部大樓。
MAX公司總部大樓燈火依然通明，很多人還在加班。11樓的一個角落裡亮着紅燈，一個大大的LED告示牌：“特別區域，通行證才能進入”，旁邊還畫着一個大大的骷髏頭標緻，顯示這是個高危險的區域，一般人是不可以進入的。門口還站着兩個機器人警衛，門上還有攝像頭在旋轉，可見是個戒備森嚴的地方。
“叮咚”聲一響，一個穿白色大褂的博士模樣的人從11樓的電梯裡走了出來，正面往這個特別區域走來，步子在夜晚裡顯得格外響亮。走到門口的時候，一個警衛轉動這電子眼望着該博士，發出聲音：“王博士，請出示通行證！”
那王博士不慌不忙從上衣的口袋裡拿出一個白色的證件，交給那警衛，警衛把證件放在門口的一個掃描儀上，嘟嘟的聲音掃描很快就完成，“掃描完成，身份通過”的字樣出現在顯示屏上。警衛往旁邊一站，手一伸，那門自動的從中間打開來。王博士頭也不擡的就往裡面繼續走。門又自動的合了起來。
王博士繼續走着，走到一個房間門口就停住了，只見房間門上有個標誌顯示：“特級保護間”幾個字。王博士將證件往上面一刷，門又自動的打開來。王博士看了看四周，就進去了。
房間很大，但是沒什麼東西陳列，像是個儲存什麼東西的地方，正中間是一個直立的圓圓的透明玻璃柱子，大概有一人來高，裡面看起來結了冰一樣。不知道什麼東西凍在裡面，再仔細看看，好像是一個人！
王博士定睛的看着那個柱子裡的人，過了一會兒，他很快的打開旁邊的控制桌上的按鍵，啪啪的輸入了密碼，按了幾個按鍵。好像是啓動了什麼東西。那玻璃柱子裡面開始冒出煙氣。那人從冰凍狀態開始解凍了。不一會兒，就露出來面目和身體，那樣子居然跟李隊長一摸一樣，如同是個複製品。
王博士還站在旁邊，在等待着。
玻璃柱子的那個長的跟李隊長一樣的人突然睜開來眼睛，四肢也動彈了一下，像是醒來了。兩手伸出，那手就好像有萬斤的力量一樣，玻璃生生的被砸穿，再來幾下，那人就爬出來了。他面色如紙，像死人一樣。
王博士看着他有點發抖，戰戰兢兢的說：“主人，你終於出來了！”
被稱爲“主人”的人眼光如電的看着王博士，低沉的說：“我的東西帶來了沒有？”
王博士趕緊從口袋了拿出一個亮晶晶閃着的戒指，恭敬的交到“主人”的手上。那人看着戒指，眼睛分明是發出白色的光芒一樣奇特，他很快就戴在右手的手指上，面色迅速的由白轉紅，就好像活了一樣。他表情輕鬆愉快，陰絲絲的笑了起來，他說：“你做的不錯，我們終於回來了！”他說完，就拉住那王博士，施了魔法一樣瞬間的就消失的無影無蹤了。
這時候，房間外的報警器也突然的響聲大作，整座大樓都聽得到。
很快，cobra小組就接到了緊急的任務通知，李隊長看事態緊急，就全部從波士頓坐飛行器出發，沒用多久就抵達了MAX公司總部大樓。
迎接李隊長他們的是MAX公司首席技術顧問容克博士，他面色暗沉，受過很大打擊一樣。他看見李隊長的模樣，心裡也一驚，不過很快就平靜了起來。
李隊長問：“究竟是怎麼回事？又失竊了？”
容克博士回答：“是的，不過這次不是東西失竊。而是一個人！”
李隊長也吃了一驚：“什麼人？失蹤了？”
容克博士神秘的說：“給你看看照片”
大家都湊過去看，一看不得了，這不是李隊長麼，只不過穿的衣服不一樣而已。
艾達說：“什麼啊？惡作劇啊？！”
李隊長揮手，繼續問：“容克博士，這是怎麼回事？”
容克頓了一下，說：“李隊長，想必你們都見過白色的上帝了吧！”
李隊長一驚，說：“你怎麼知道？”
容克繼續說：“科學發達到這一步，其實很多事情都知道了，我們知道這個世界是有上帝的，這個宇宙外還有別的宇宙。李隊長，其實你不知道，你並不在你原先的那個世界裡了。”
李隊長大驚：“什麼？這是哪裡？”
容克博士繼續說：“你在的那個世界已經末日來臨了，這裡是另外一個世界，是另外一個李隊長存在的空間。你懂了嗎？”
李隊長想起時間的差異，現在是2079年，而不是2080年，原來是因爲他根本就不在他原先的那個世界！天哪！李隊長原先還想努力阻止明年的世界末日呢，這下落空了！
還沒等李隊長說話，容克博士繼續說道：“這個世界的李隊長的靈魂昇華後變成了黑暗勢力的首領，他想要摧毀這個宇宙，他要至高無上的自由，他要挑戰上帝！不過，上帝把他禁錮住，就在我們MAX公司11樓特別區裡面。已經快一年了，但是幾個小時前，他手下扮成工作人員的樣子進入到裡面，釋放了他。”
李隊長摸摸頭，說：“什麼！另外一個我！難道是我在破碎虛空裡見到的我？”
容克博士說：“破碎虛空？你去過？是的。他的復出必然會進行報復的，我想上帝把你帶到這個世界裡，就是爲了專門對付他。”
李隊長不解的問：“我記得在破碎虛空裡，他自己跑掉了。”
容克神秘的說：“李隊長，破碎虛空的時間其實是不一樣的衡量，前後不是像我們這裡那麼分明。上帝給了我指令，他說把你帶來就是要在時間線上消滅他，從而就不會有以後的幽靈城！”
李隊長一聽突然的想明白了，原來是要在時間線上做了手腳！天哪，上帝的算盤這麼精。
容克博士繼續說：“你可能會疑問爲什麼我知道，其實知道這個事情的人不多，我是其中之一。其實一開始，另外一個你是上帝最喜歡的屬下，爲他效力，也獲得了上帝的魔戒。但是有一天，上帝發現另外一個你非常的野心，能量也非常大，妄圖取而代之，所以他決定要消滅另外一個你。但是破碎虛空並沒有完成這個任務。而在宇宙裡能夠打敗他的就是另外一個世界的你！你懂了沒有？李隊長！”
李隊長很快就懂了，其實就是用一個宇宙的李隊長來消滅另外一個宇宙的李隊長。
組員們都似懂非懂，實在是太拗口的事情。
李隊長繼續問：“爲什麼要我？難道是因爲我也有超能力？”
容克博士點點頭：“沒錯，上帝想盡了辦法，都沒有奏效，他決定還是在原先的時間線上用你來消滅那個壞的李隊長。”
李隊長說：“我們cobra小組的組員每人都有一個魔戒。”
容克博士解釋道：“是的，他們四個也是選定來幫助你的，不然你的能力還不足以消滅他。不過你的魔戒比他們四個的強，所以你是隊長。”
李隊長說：“爲什麼這次能夠讓他跑掉？爲什麼不早點消滅他！”
容克博士表情嚴肅的說：“因爲這個系統已經被破壞了很多地方，他的黑暗勢力已經在四處滋長了，你們也清楚最近的時間裡發生了很多奇怪的事情，都是他的勢力在作怪。而且我們不能直接摧毀他的身體，他是特殊的體質，所以只好暫時的禁錮起來。”
李隊長說：“爲什麼不早點說呢？現在有點晚了。”
容克博士說：“系統出問題了，很多原本要執行的事情都沒有實現，我們的世界就像電腦一樣，出了故障，你還沒有到來這邊的時機，哎，可能都是天意啊！”
李隊長搖搖頭說：“好吧，事到如今，我們怎麼去解決？”
容克博士也有點沮喪：“哎，沒想到他跑的那麼快，他的勢力也越發強大了。我們還不清楚他去了哪裡。他可以穿梭於這個宇宙的空間，可以無所不爲。所以得適當時機了。不過你也是有點優勢的，你跟他的頻率幾乎一樣，所以一旦他在你的附近，你是可以感應的到。”
李隊長點了點頭，然後看着組員們一字一句的說：“我們以後得團結一致才能打敗他了。”
組員們聽了都有點憂心忡忡，這些事情是從未有過的挑戰。下一步該怎麼辦呢？