創世紀毀天滅地的一擊消滅了近四層的聯合軍艦隊，其中甚至包括了原本聯合軍艦隊的旗艦。
作爲新型主力艦的艦長，娜塔爾.巴基露露在艦隊混亂不堪的情況下臨時接過了指揮權，向全艦隊下達了暫時撤退的命令。
因爲艦隊突然遭受如此重創，全艦隊上下混亂不堪，必須要立刻進行一段時間的修整，重塑指揮系統、獲取補給，才能重新投入戰鬥。
接到了命令的聯合軍戰艦和MS都開始撤退，李伯庸也帶着倖存的部下，混在一堆殘兵敗將裡朝着預訂的重新集結點退卻。
但是扎夫特軍又怎麼可能輕易的放過撤退中的聯合軍。
放了和核彈就想走？
天底下沒有這樣的好事！
甚至在國防總部的追擊命令下達前，扎夫特軍的機師就自行駕駛着MS追了上去。
那些機體受損導致撤退時落在後面的強襲短劍，頓時就成了扎夫特軍發泄怒火的目標。
“竟然敢再次使用核彈！”
“我弟弟還在博阿茲裡！”
“卑劣的自然人，好好體會我等同胞的憤怒！”
扎夫特軍MS部隊對着機體受損的強襲短劍羣進行了掠殺，即使有個彆強襲短劍的機師發出了投降信號，也完全不被扎夫特軍機師所接受，全數斬盡殺絕。
剛剛擊落了全部核彈的基拉見不得這種屠殺般的場面，駕駛着自由一個個擊傷扎夫特軍的MS，來讓一些受損的聯合軍能夠獲得逃生的機會。
阿斯蘭雖然能夠理解同胞們的憤怒，但還是跟着基拉一同出手。
在自由和正義的作用下，一些落後的強襲短劍幸運的獲得了逃生的機會。
但是現在扎夫特軍在國防總部的命令下開始了全線追擊，自由和正義也無法對抗那麼多數量的扎夫特軍MS，向着三艦聯盟的隱藏地點返航。
在扎夫特軍的追擊下，聯合軍付出了不小的傷亡，才擺脫了追擊，在預計的集結點重新合流。
在重新合流地點，倖存的聯合軍艦隊一片哀鴻遍野。
由於指揮系統的混亂，大量受損的戰艦和MS得不到救助，許多幸運返回母艦的機體甚至得不到補給，受傷的機師也得不到有效的醫治。
就是在這樣一片混亂的情況下，李伯庸駕駛着全裝短劍回到主天使號的機庫，跟在他後面回來的就只有一臺強襲短劍。
由於他的部隊本來是突入雅金防線作戰的，所以在撤退的時候，只比那些機體受損的友軍快上一些而已。
在自由和正義退去後，扎夫特軍的追擊再次涌了上來，他的小隊兩度被戰鬥波及，雖然他擊墜了一些敵機，但部下還是不可避免的出現了傷亡。
出擊時的九個部下，能夠活着回來的就只剩可憐兮兮的一個了。
唯一倖存的部下，在出了強襲短劍後就精神奔潰，一個人躲進機師的休息室，死活不出來。
李伯庸嘆了口氣，也沒心情去給一個路人雜兵做心理輔導，只是吆喝着讓整備班加緊爲全裝短劍進行補給。
“你們幾個，趕緊給我的機體補給……”
話音未落，主天使號的機庫又回來了兩臺MS，分別是搶奪和災禍。
李伯庸等了等，始終沒有看到另一臺機體的身影，看來禁斷真的是被創世紀的攻擊波及到了。
這樣也好，免得要爲“誤傷友軍”的事情多費脣舌。
三小強倖存的兩個一起從機體裡出來，明顯已經藥物發作，一副痛苦不堪的樣子。
但是兩個傢伙忍受着這樣的痛苦，明顯已經神志不清了，嘴裡卻還一直唸叨着已經失去的夏尼。
“可惡！夏尼那傢伙竟然死了。”
“混蛋，竟然敢比老子先死！”
李伯庸默然，他並不是對夏尼的死有所愧疚，只是有些感慨。
原來三小強也會有同伴意識，也會爲同伴的失去而產生情緒波動。
這些被藥物控制的實驗體終究不是機器，而是實實在在的人啊！
這三個年齡不過十八九歲的小夥，如果沒有被施以這種慘無人道的實驗，又會擁有怎樣的人生呢？
一起上學，一起吃午餐，然後在放學後結伴同行，在回家的路上順道去遊戲廳玩耍，最後在分別前討論一下各自喜歡的女同學？
或許吧……
在兩個強化人機師被研究團隊帶走後，李伯庸搖搖頭，便不再想這些了。
也許他動過惻隱之心，但終究沒有那份能力，也沒有可以豁出性命的決心，所以也就只能在心裡感慨一下而已。
現在真正能夠讓他去拼上性命的人，只有兩個。
一個正在這艘主天使號的艦橋裡，而另一個則還在扎夫特軍中。
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在倖存的聯合艦隊重新集結後，艦隊在巴基露露的指揮下對指揮系統進行來在編成。
主天使號成爲了聯合軍艦隊的新旗艦，同時托勒密月面基地集結起來的第二波艦隊也帶着補給朝雅金杜偉防線出發。
面對創世紀的巨大威脅，聯合也拼上了全力，原本內部的一些派系不和，也都被拋開到一邊，開始同力合作。
必須在創世紀對地球發射前將其摧毀，這些全體聯合高層的共識。
而原本的第一波艦隊，進行了數個小時的再編後，在鳥人的強硬命令下，再次向雅金髮起攻擊。
雅金杜偉防線再次爆發慘烈的戰鬥，這次交戰的雙方都拼上了全力。
扎夫特軍這邊不想再吃聯合的核彈，而聯合也拼死想摧毀創世紀。
兩邊的MS隊在各自艦隊的火力掩護下，交錯於戰場之上，開始了一場慘烈無比的決戰。
在這種時候，沒有哪一方擁有退路，只能拼上全力。
而這個被一分爲二的世界，似乎也走到了存亡的分歧點。
而三艦聯盟，也在這種時候投入帶了這次戰鬥之中，試圖在這死局之中爲和平謀求一線生機。
戰鬥開始後，李伯庸駕駛着全裝短劍帶着剛加入的部下，也投入到了這場決戰之中。
他的部隊在艦隊再編中又獲得了一些補充，五個失去了母艦的倒黴蛋，就這麼被分配到了李伯庸這個友軍死神的麾下。
戰鬥進行的異常慘烈，全裝短劍帶着五臺強襲短劍進入戰鬥還沒十分鐘，在擊墜了兩臺蓋茨之後，就又被擊墜了三臺強襲短劍。
五分鐘後，等李伯庸在亂戰之中，突進擊沉一艘納斯卡級時，剩下的兩臺強襲短劍也都被幹掉。
這個五個根本連名字都不知道的部下，就這麼成爲了狀態工具人，讓李伯庸在倖存者技能和友軍死神稱號的作用下，獲得了不小的能力加持，讓他這個雜魚隊長能夠在慘烈的戰鬥中生存下來，並獲得了一些的戰果。
就在正面戰場剛的悲壯無比的時候，創世紀的第二發發射了。
毀天滅地的光束再次閃耀在宇宙中，在重創了聯合的第二波支援艦隊後，一炮轟在了月球上。
聯合軍的月面基地托勒密，在創世紀的威力下化爲月球上的一片殘骸。
聯合艦隊新旗艦主天使號艦橋。
“什麼？”
得知支援艦隊被重創以及月面基地托勒密被毀的消息，鳥人震驚不已，同時向輸紅了樣的賭徒一樣向和平開創者隊下達了出動命令，並讓在前線的搶奪和災厄回來進行護航。
而和平開創者隊的目標，則依然被選定爲PLANT的本土衛星羣。
對此，巴基露露提出反對，“理事！現在我們的首要目標應該是摧毀敵人的要塞炮。”
作爲一個軍人，她根本無法理解這種時候用核彈炸燬衛星羣有什麼意義。
如果不能摧毀創世紀，讓地球捱上那麼一發，後果根本不敢想象。
但是巴基露露沒想到自己理所應當的反對，竟然會激起鳥人的極端反應。
只見這個平時一個以分度自舉的藍色波斯菊盟主，一臉扭曲的掏出手槍對準了巴基露露，“爲什麼你老是要違抗我的命令？”
鳥人有些癲狂的喊道，“只要把那些醜惡的沙漏打掉的話，就是我們的勝利！”
見巴基露露不再說話，鳥人坐會了自己的位置，對巴基露露說道：“明白了的話就立刻執行我的命令，主天使號也上前對和平開創者隊進行援護。”
巴基露露無奈，她知道這樣下去只會造成最壞的局面，卻發現自己根本無力改變些什麼，身爲軍人的她選擇向命令屈服。
和平開創者隊的出動也吸引了三艦聯盟的注意，搭載流星裝備的自由和正義連忙放下手頭的敵人，飛向和平開創者所在的宇域。
由於慘烈的戰鬥，雅金防線早已經千瘡百孔，和平開創者隊在搶奪和災厄的掩護下，突破雅金防線，再次朝着PLANT本土衛星羣射出了核彈。
但是這些核彈再次被自由和正義擊落，三艦聯盟所屬的其餘MS開始攻擊和平開創者隊。
而三艦聯盟中的大天使號，則開始對和平開創者隊的母艦集羣進行炮擊，因爲瑪琉認爲那些母艦上面還攜帶有多餘的導彈，必須儘快擊沉。
而主天使號，則就在大天使號的前進路線上。
就在這種時候，李伯庸駕駛着全裝短劍從前線撤了回來。