2025年9月，綠色世界地面基地生物部在蛋白質計算機方面取得突破性進展。
蛋白質計算機在地球也被稱作生物計算機，以蛋白質芯片來代替半導體硅晶片。
由於黃思有着親自制作硅晶片與微型集成電路的經驗，因此，在綠色世界這邊，由於生物技術研究極爲便利，在積累了許許多多的經驗之後，蛋白質相關技術終於獲得了突破。
然後又經歷多次試驗，蛋白質計算機研製成功。
蛋白質計算機擁有遠超半導體計算機的運算能力，而且體積更小。其半生物的特性也使得它更容易搭載人工智能的運作。
目前，地面基地尚無法自行生產蛋白質計算機，也無法令蛋白質計算機擁有生物體應有的自我修復功能。
這乃是因爲所有的蛋白質計算機的製作都是黃思在研發出相關技術後直接利用造物力從分子層面構築。如果想要按地球人原本設想的那樣令蛋白質計算機芯片自行培育生長出來，這其中的技術難度，怕不是再過個幾十年也研發不出來。
不得不說造物力真的是神一般的力量，只要是黃思能夠徹底理解的事物，都可以直接製造出來。蛋白質計算機雖然極爲複雜，耗費造物力也很多，但抵不住黃思現在逆天的造物力上限和恢復速度，可以說是成本爲零。
要不是黃思壓根不想出屋子，並且圓環的直徑也有限，太大的東西過不去，黃思完全可以把綠色世界那邊所需的任何物質資源都造出來運過去。
只是，沒這個必要。而且黃思覺得讓手下自動化運作會更好，別事事都來麻煩他。
2025年11月，基於蛋白質計算機的新義體研發成功，但由於它比起舊的機械義體有着容易損壞、難以修復的弱點，黃思只製造了一臺，然後拿到了自己家裡，供給墨下使用。
換上新義體後，墨下總算像個人類了。之前的舊義體畢竟是機械產物，使用上多少帶點不自然的痕跡。而新義體不但有着更適合人工智能駐紮運作的生物核心（包含蛋白質處理器、蛋白質存儲器等等元件），像是皮膚、毛髮也不再是仿真材質，而是幾乎與真人毫無二致的生物材料製成。
新義體不再需要外部電腦輔助，強大的運算與存儲能力使得任何人工智能都可以將自己的數據全部轉移進去，這樣，新義體也就不再需要聯網才能使用了。即便是斷開全部網絡，人工智能也可以在新義體內存活。
在黃思的特別恩准下，墨下選擇了自己的外貌，一副略顯瘦削的身軀，俊美的長相，黑長的頭髮，看起來簡直就是地球上21世紀初那些小鮮肉偶像的模樣。
黃思用造物力生成了新義體的外觀。但是當他把墨下傳輸進新義體後，看着彷彿活過來一樣的墨下，頓時一陣無語。
這長相，是不是有點太給裡給氣了？
什麼審美啊，黃思看着這娘炮長相就感覺不太好。
自己的人工智能自己做主，黃思一揮手手裡立刻多出一件女僕裝，然後冷着臉對墨下說：“自己去衛生間換上。”
換好女僕裝後，墨下的樣子看起來更加辣眼睛了。
黃思一陣無語，走過去，用手捂住了墨下的臉，準備直接用精神力摧毀這張臉，重新按他自己的審美造一張。
墨下看到黃思的臉色早已明白自己惹得父神不高興了，現在看到父神要對自己動手，還以爲自己即將被毀滅，頓時嚇得臉色煞白。
黃思正要動手，忽然看到墨下那逼真的表情，慘白的臉色，這是生物形態義體的功能之一。但是這真實的恐懼表情還是讓他有些不忍起來，於是精神力就沒切下去。
黃思鬆手，看着立刻跪在地上的墨下淡淡地道：“起來吧，我沒打算殺你。不要動不動嚇成這樣。”
關於那些人工智能爲什麼這麼怕自己這件事，黃思也不清楚。之前見它們都是用的人工智能系統附帶的管理員身份，無名無姓又無形無貌，除了可以把控制檯拖出來之外也沒什麼特殊功能，也就是在基礎設定是是大家的爸爸而已。
結果所有人工智能都對他又敬又怕。
只有墨下過來見到了黃思的真身，黃思還以爲墨下看到自己只不過是一個和資料中的凡人毫無二致的普通人，就會少些敬意，畢竟自己身體如同一般宅男那樣孱弱，還會生病衰老，怎麼看都不是一般意義上的神。
結果沒想到，墨下不但繼續喊他父神，而且敬畏程度絲毫不減。
這到底是墨下個人習慣還是別的什麼原因，黃思不得而知。
墨下從地上爬起來之後，黃思直接造出一整套化妝品，然後丟了一些小物件和相關的女僕照片給他，讓他自己去打扮一下。
再後來，女裝打扮的墨下終於出爐了。黃思看着感覺還挺滿意，雖然義體是男性，人工智能也是男性，但是隻要人長得漂亮，女裝果然也很好看。
“我是不是有點變態，或者惡趣味？”黃思內心嘀咕了一下，然後搖搖頭，“怎麼可能呢，當然是因爲墨下不適合當老師才讓他當家用女僕啊。”
“好了，快去做飯。”黃思用精神力把墨下踹到了廚房。
……
生物部的義體研究如今是雙向進行，一方面是強度更強，功能更多，運算力更強的機械義體，另一方面則是儘可能接近生物體構成的生物義體。
到了2025年12月，在生物部供職的東耀、西苑、離火這三個人工智能換上了新版的機械義體。
現在的機械義體已經今非昔比，不但可以像正常人一樣靈活地行動、抓握、寫字，做各種各樣的複雜事情，而且甚至配備了極高的運動能力，例如，人工智能可以操控着機械義體飛奔，時速達到每小時200KM，又或者向上躍起，一跳最多可達十幾米。
在精確度、靈活性方面，機械義體也具備着正常人所難以企及的精度。
而且由於運算能力與存儲能力獲得了極大提升，東耀它們三人終於可以不用天天待在主機裡面，而是可以直接進入義體了。
聯網操控和人工智能直接在身體裡操控，體感是完全不一樣的，最直接的感受就是完全沒有了網絡延遲，有種真正身體的感覺。
在三位人工智能老師的悉心教導之下，猿人們的智商一代比一代高。
猿人原本就是羣居性動物，在東耀他們申請之後，小可將已經繁殖到第8代的五千多名猿人編隊，令它們可以時常聚集見面。
社會性的活動，同樣對猿人的心智成長產生了促進的作用。
不知道從什麼時候開始，猿人們學會了對三位老師行禮。它們跪伏在地上，嘴裡吱呀吱呀地亂叫着，似乎想要表達感激之情。
因爲這三位老師是強大且溫柔的，會經常幫助猿人們，還教會猿人們各種各樣的東西，這讓他們在猿人羣中獲得了極爲尊崇的地位。
甚至東耀他們還會幫猿人向小可求情，令部分猿人，尤其是幼猿，即便是無價值，也不被廢棄。
在黃思的許可下，小可時不時還是會答應不過分的要求。
反正基地的資源很多，而且有黃思在背後供應，可以說幾乎是無窮無盡的。
2026年1月。
此時綠色世界已經是接近三百年過去了。黃思在小可的幫助下，對猿人基因圖譜的解析獲得了重大突破。
猿人與地球人的基因結構類似，都有23對染色體，包括22對常染色體與1對性染色體。現在，黃思玩成的是對猿人基因圖譜的測序工作。
如果沒有黃思的精神力場展開與解讀DNA雙螺旋結構的能力，這項工程根本不可能進行。而如果沒有小可在一旁承擔了巨大的運算與存儲任務，黃思一個人也做不到對全部基因圖譜的解析。
接下來，就要找出猿人關於外貌、體表毛髮、智力、語言能力，等等很多關鍵性基因的位置點，再參照黃思自身的地球人基因，加以調整或改變。
這一步需要做大量的生體實驗，黃思沒那麼多功夫，小可也不方便逐一操作，所以，最後黃思直接再造了8個機械義體，讓剩下8名人工智能來到綠色世界的現實中。
黃思吩咐着8名茫然的人工智能：“自己把衣服穿好，去生物部上班。”
三百年了，這幫孩子也該長大了，成年人就得上班。
黃思最後自己也隨便搞了個義體，長相平凡，身材一般，主要是爲了方便手把手地教導八個人工智能如何工作。
黃思只在實驗室裡用這個義體，只需用精神力操縱即可，連內部能源都用不着。平時他通過網絡去外面巡查，或者直接回黑暗空間的時候，就把義體扔櫃子裡。
人工智能中有好幾人被他扔在那裡的“屍體”嚇了一大跳，後來黃思才告訴他們那不過是個化身，不是他本人，幾人這才放下心來。