南京應天府西南，大勝關
身披龍袍的崇禎皇帝，在親衛扈從的前呼後擁之下，拾步踏進了這座空蕩蕩的關隘。
但凡帝駕所過之處，將士盡皆舉起刀槍，高聲歡呼，聲浪一層層地傳播開來，如同大海狂嘯一般。
大勝關此地，曾是昔年朱元璋戰勝陳友諒的地方，故而得名。但是自從大明立國以來，這座關隘就再也沒有發揮過任何作用，綿延數裡的城牆多已失修，即使徵調十萬民夫，沒有一個月也無法完成修葺。
所以，當東軍主帥，南京兵部尚書呂維祺倉皇逃離蕪湖戰場，帶着幾千殘兵敗將退到大勝關之後，面對着這座到處都是塌方缺口，並且既沒有守軍接應，也沒有儲存半點兒軍械糧秣的要塞廢墟，頓時就徹底絕望了。他手下的東軍殘部看着大勝關居然是這般破敗模樣，連軍糧都沒着落，同樣是一個個涼透了心，紛紛各自開了小差，哪怕呂維祺大把撒銀子犒賞，也是無用連飯都沒得吃了，有銀子又如何？
等到數萬西軍的大陣和崇禎皇帝的御駕，一齊開抵大勝關下的時候，守關的東軍已經逃得只剩了數百人，而且一看到崇禎皇帝的龍旗，剩下的人也喪失了戰鬥的意志，而是抓緊時間一鬨而散。就連東軍主帥呂維祺的親信僕人，都揹着主人偷了他的行囊，瓜分了裡面的值錢玩意兒，然後各自逃亡了。
絕望之下，呂維祺只得找了個地方懸樑上吊，同時留下一份悔過書，乞求崇禎皇帝饒恕他的家人。
遺憾的是，如今這位換了魂兒的穿越版崇禎皇帝，在對待叛徒的態度上，只會比前任更嚴酷！
“……呂維祺啊呂維祺，你既然知道自己深受國恩，被朕封爲南京兵部尚書，卻背叛君王、擁立僞帝，乃是十惡不赦的大逆不道之舉，當初爲何又要跟那班東林逆黨沆瀣一氣，直到上個月都不見你悔改呢？”
看着手中這份祈求憐憫的遺書，崇禎皇帝的臉上滿是譏諷之色，“……明明自知罪無可恕，卻妄想靠着自己的一條老命和一張薄紙，就爲全家求得赦免，你以爲自己是個什麼東西？莫非是以爲朕懦弱可欺嗎？若是汝這老狗當真天良未泯，心中尚有忠義，先前的蕪湖之戰，爲何不見汝臨陣倒戈，棄暗投明？
如果朕僅僅憑着這麼一紙討饒的空話，就寬恕了汝這罪魁禍首，又該如何獎賞那些忠心追隨於朕的臣子？速速擬旨！將罪臣呂維祺的頭顱傳示三軍，屍身挫骨揚灰！呂家滿門抄斬，罪誅九族！”
聽了皇帝的嚴刑重處，盧象升的嘴脣皮動了動，似乎想要說些什麼勸解的話，但最終還是沒能說出口：畢竟，像這種擁立僞帝的謀反大罪，事敗後誅殺九族乃是自古以來的常例，誰也不能說崇禎帝太殘酷。
在離開大勝關的時候，崇禎皇帝又收到一則捷報，原來王鬥自從奉命率部三千南下攻打徽州之後，一路勢如破竹，所遇抵抗極爲輕微。現已順利攻佔徽州府城，生擒南京僞朝任命的徽州知府，收編僞朝降兵約兩千人，周邊各縣也紛紛宣佈易幟，故而向後方報捷請賞，順便請示自己這支部隊的下一步行動方案。
得知此事，崇禎帝當即龍顏大悅，覺得這似乎是個好兆頭，便跟軍中諸將討論此事，諸將皆表示南京這邊兵力已經足夠，不需要王斗的幾千偏師再趕過來添亂了。於是崇禎帝就加封王鬥爲浙西總兵，令其率部跨越省境，繼續向東進討，伺機收復浙西北地區理論上依然尊奉南京朝廷的安吉、淳安等縣。
然後，在全軍和平通過了大勝關之後，巍峨壯麗的留都南京，就出現在了崇禎朝廷一干君臣的眼前。
懷着某種難以言喻的複雜情感，崇禎皇帝手持一隻西洋望遠鏡，站在高處，眺望着這另一座雄偉壯觀的大明帝京，只見東面的鐘山像盤龍一樣蜿蜒環抱，西面的石頭山像猛虎一樣雄踞在大江之濱。浩浩的長江從金川門下向東北方向流去。城內東南角那一片金光耀眼的樓臺殿閣，便是南京的大明皇城。
觸目所及，崇禎皇帝忍不住好一陣的心懷激盪逃離北京的倉皇，丟失北地的無奈，輾轉中原的落魄，武昌募兵的艱辛，誓師東征的豪情……過去的一幕幕的往事，全都浮現在了他的眼前。
整整一年了，從在穿越之初的茫然，到清兵進逼之下的絕望，再到衆叛親離之下的倉皇逃生，然後一點點地忍辱負重，收拾殘局，積累實力，扭轉乾坤……時至今日，他終於迎來了第一場決定性的勝利。
作爲大明帝國的正統君王，他終於能夠奪回一座屬於自己的都城了！
雖然前方還有帝都金陵的高大城牆，但這並不能擋住他前進的步伐。
的確，南京的城牆比北京還要更加堅固，也更加雄偉，可就算是再堅固的城牆，也需要有人來守衛才行。而如今的金陵城裡，除了極少數“逆黨首腦”還在妄圖負隅頑抗之外，絕大多數的王公大臣、文臣武將，都已經派遣使者，跟崇禎皇帝進行了卓有成效的秘密溝通，表示要棄暗投明、撥亂反正。甚至就連掌握着城內絕大部分軍隊的幾位國朝勳貴，也往崇禎皇帝的軍營裡派來了子侄“隨駕”，或者說是充當人質，取信於天子。說是隻等着討逆大軍來到城下，就會幹掉那幾個逆黨首腦，然後開門易幟，迎接帝駕入宮。
然而，正當崇禎皇帝和西軍諸將駐足於城外，期待着“南京無血開城”的場面之時。首先等到的卻不是城內官紳迎接“真命天子”御駕的儀仗隊，而是一支從城南方向繞過來襲擊的騎兵！
而更不可思議的是，在這些騎兵的腦袋後面，全都赫然拖着一條金錢鼠尾辮子！
“……這是……遼東韃子？真是奇了怪了！他們怎麼會跑到南京來的？”
崇禎皇帝先是看得目瞪口呆，旋即便醒悟過來，頓時就是勃然大怒，“……豈有此理！這幫東林君子之前已經是扶立僞帝，毫無忠心。如今更是連韃虜都敢勾結了！他們這是把聖賢書都讀到了狗肚子裡嗎？”
雖說這幫女真韃子突然在南京出現，讓原本一心等着摘取勝利果實的西軍上下，一時間都有些措手不及。但驚訝歸驚訝，這南京城還是一定得要進去的，畢竟大家都歷經了千辛萬苦，才把仗都打到了這一步，崇禎皇帝和西軍諸將也已經沒有了半點退縮的餘地，只能跟這些來攪局的辮子兵死戰到底。
幸好，在這個時空，由於黃石在遼東戰無不勝的輝煌戰績，還有其餘幾位明朝陣營穿越者的亮眼表現，滿洲鐵騎“女真不滿萬，滿萬不可敵”的戰場神話早已破產，而是普遍被認爲是一羣憑運氣撿漏的傢伙。大多數的明軍雖然對上清軍還是敗多勝少，但至少不會一看到他們腦袋後面的辮子就心裡發虛了。
更何況，在屢屢遭到毀滅性的重創之後，如今這個被困在兩淮的大清帝國，不管怎麼看都只能用“苟延殘喘”四個字形容失去了苦心經營多年的遼東根據地，在新的佔領區內沒有任何根基，從正常的角度來看，這樣一幫只有武力還算彪悍的落魄盲流，是絕無可能在異國他鄉建立起穩固統治的。
因此，在盧象升的指揮下，雙方很快就在南京的郊區附近展開了一場前哨戰。由於這裡人煙稠密，地形複雜，房舍樹木甚多，擁有數量優勢的明軍固然施展不開，但清軍的騎兵更加衝擊不起來。
於是，在一番混戰之後，這一千多名前來騷擾的清軍騎兵，很快就損失慘重，被逐出幾條主要街道，只能在遠處徘徊。而崇禎皇帝率領的五萬大軍，則得以繼續向着南京的西側城牆迅速挺進。
與此同時，南京城內也是一片烈火熊熊，喊殺聲震天，早已扯旗“反正”的魏國公徐弘基，正率領着他府上的兩千多名親信家丁，和其他幾位手握兵權的南京勳貴一起，跟闖入城中的清軍先鋒展開巷戰。
從揚州率領八千辮子兵渡江南下，登陸鎮江之後，雖然皇太極已經明白時間緊迫，所以沒等後續兵馬全部到齊，就匆忙點起五千兵馬，以最快速度往南京城飛奔而去。但南京城內還是在清軍趕到之前，就已經變了天：以大明開國第一名將徐達的後人，魏國公徐弘基爲首的南京勳貴，率領他們掌握的武裝力量悍然發動兵變，準備迎接崇禎皇帝入城。手頭兵微將寡的首輔周延儒，很快就被他們打得大敗。
當皇太極帶着五千辮子兵，一路緊趕慢趕地狂奔到南京城外的時候，作爲內應的周延儒，也已經被倒戈的勳貴們逐出皇城，正率領少數親信逃到了太平門。而崇禎皇帝的御駕都已經過了大勝關！
面對這等危局，不肯服輸的皇太極，只好親自率領四千辮子兵，從周延儒還能控制的太平門進入南京市區，準備打垮發動兵變的南京勳貴，奪取皇城和南京城防，把崇禎帝的大軍拒之門外。同時又命令阿巴泰率領一千清軍騎兵擔任別動隊，從郊外繞到南京城西，盡一切可能阻滯崇禎帝的兵馬進城。
最終，皇太極的上述戰術目標，只有百分之二十五得到了實現：雖然在一番激烈的廝殺之後，他成功地擊退了勳貴們的家丁，打進了南京皇城，控制了很大一片市區，但因爲時間緊張的緣故，還是僅僅控制了不到一半的城門。另一邊，因爲長途跋涉而早已疲憊不堪的清軍別動隊，也沒能攔住崇禎皇帝的六萬大軍，反而因爲陷入不利地形的緣故，被打得損失慘重，連首領阿巴泰都在混戰之中受了重傷。
接下來，崇禎帝的兵馬大舉跨過秦淮河，通過南京西面的清涼門、聚寶門，源源不斷地進入市區，與南京勳貴掌握的殘兵匯合。到了這一刻，原本由東林黨一手操持的那個南京小朝廷，事實上已經是土崩瓦解，不復存在。在南京戰場的主角，從此只剩下了兩個：崇禎帝的明軍和皇太極的清軍。
自從去年那場圍繞着北京城的激烈爭奪戰之後，這兩位彷彿命中註定的老對頭，此時又爲了爭奪跟上一個戰場相距千里的南京城，而再一次投入了彼此全部的底牌，展開了最瘋狂的較量！