福建的戰事還在繼續，藍理、年羹堯堅清壁野的戰術給明軍向南推進帶來了不少麻煩，而藍延珍的艦隊主動出擊更是讓王東在大意之下吃了個悶虧，尤其是後者，在海上神出鬼沒，甚至還威脅到了明軍向前線的運輸船隊。
朱怡成的指示下達時，鄔思道就加重了對運輸船隊的保護，同時也對於前線的物資調撥更爲重視，爲了保證物資供應，他徵得朱怡成同意後把部分物資的運輸直接交由浙商進行，以補充民壯的不足，同時也因爲有浙商的加入，使得部分閩商見利也加入了進來，兩省商人的配合下使前線物資緊張得到了一定緩解。
不過最重要的還是藍延珍的聯合艦隊，這支艦隊存在嚴重威脅到了明軍南下的整體計劃，要想破局，必須解決這個問題，但究竟如何解決，這卻不是那麼容易。
當初朱怡成打杭州，佔南京的時候澎湖水師就用過這一招，藍延珍面對這種情況並無什麼辦法，只能和澎湖水師在福建沿海兜圈子，從而失去了掩護藍理進攻溫州的機會。而現在，藍延珍把對手的戰術重演，如果明軍以同樣方式應付的話雖然可以起到一定效果，可對於水陸兩軍合擊福建的整體戰略卻無法執行了。
經過仔細盤算，再由莊巖的總參謀部進行推演，明軍最後決定採取你打你的，我打我的新戰術。南下的水師主力和澎湖水師重新進行組織，在保證澎湖和運輸艦隊的安全之外，其水師主力對福州以南的清軍各港口城市進行襲擊戰。
這樣做，非但能打破被藍延珍牽着鼻子走的困局，同時也能迫使藍延珍放棄海上游擊戰，從而找到同清軍水師進行決戰的機會。福建沿海上千裡，大小城市有十幾個，如果再加上廣東的藍延珍南澳老巢和其他城市，那可攻擊的目標就更多了。
爲此，明軍選擇了以泉州、廈門、東山、南澳一線爲攻擊目標，水師主力並不戀戰，採取以多打少，以快打慢的戰術，對攻擊目標也以破壞爲主，一時間福建沿海各城損失嚴重，就連清軍在廈門的金門島都曾被圍攻整整一日，躲在廈門港口的福建水師小部根本就不敢出戰，明軍炮擊金門幾個時辰後這才主動撤離，而金門工事損失不小，真正死傷者雖然只有百多人，但給予清軍在士氣上的打擊是極其巨大的。
炮擊廈門後，明軍水師直接又去了南澳，南澳可是藍延珍的老巢，而且南澳方面根本就沒料到明軍水師在未解決藍延珍的聯合水師情況下就大搖大擺地南下，一時間倉促應戰，差一點兒被明軍水師攻破防禦。同堅固的金門相比，南澳的損失更大，明軍撤離前直接一把火還燒掉了南澳碼頭，作爲南澳水師駐地，碼頭被毀的南澳起碼一個多月無法恢復，之後明軍又大搖大擺地離開，至於去了哪裡惶恐不安的清軍也不知道。
明軍戰術的改變，一下子使得福建方面極其難以適應，沿海各城更是人心惶惶，消息傳來，拖兒帶口向內陸遷移的百姓數不勝數，這給清軍對福建的防禦帶來了極大困難。
藍延珍是過了七八天後才得知消息的，知道這情況時他的艦隊正在琉球，此時的琉球是大清的屬國，上國艦隊在屬國港口駐紮當地官員當然不會說什麼，而且還竭盡全力爲藍延珍提供補給。
按藍延珍原本的打算，他準備用海上游擊戰術反客爲主，牢牢把主動權抓在手中。可誰想明軍除了一開始的不適應後很快就調整了戰術，從而採取了現在的戰術來進行應對。
面對這種情況，藍延珍一時間犯了愁，如果繼續之前的游擊戰，或許他的聯合艦隊能夠給明軍的後勤帶來一些麻煩，可是福建沿海各城的安全卻無法保證了。尤其是自己南澳老巢的遭遇更令藍延珍憂心忡忡，畢竟明軍水師無論從規模還是精銳程度都比他的聯合水師更大，這種戰術實際上是逼迫他的聯合水師由游擊戰改爲正規戰，以徹底解決海上問題。
藍延珍沒有太多的選擇，也許有人可以說藍延珍完全可以不顧福建情況繼續進行海上游擊戰，這樣做不僅能給對手帶來麻煩，更重要的是能保全自己實力。可不要忘記明軍南下作戰是兩軍並進，除了水師之外還有陸軍，而整個戰略上來看陸軍纔是起決定因素的，水師的主要任務是爲陸軍提供海上支援和護送物資南下，如能完全拖住明軍水師，自然會給藍理和年羹堯爭取到一點機會，但現在要拖住明軍水師已成了泡影，這樣一來明軍的陸軍依舊可以繼續向南推進，福建在烽火四起，沿海各城自身難保的情況下戰局會走到那一步藍延珍心裡非常清楚。
再者，藍延珍雖是南澳總兵，但他的職權並不像所想象的那麼大，他不僅要受年羹堯的節制，更要受朝廷的命令。和戰報一起送來的還有年羹堯的命令，命令中讓藍延珍必須確保福建沿海地區的穩定，爲防守福建爭取時間。
這道命令令藍延珍左右爲難，不過藍延珍也不會傻到直接派艦隊和明軍水師在海上決戰，因爲他根本就沒把握在決戰中取得勝利。爲此藍延珍思索良久，最終決定掉頭北上，直接去打寧波。
這是一着險棋，藍延珍只所以做這個決定是想圍魏救趙，直攻對方的要害部位以達到調動明軍水師的目的。對於寧波，藍延珍並不陌生，而且他也很清楚寧波不是那麼好打的，當年施世驃就是在寧波城下大敗後自殺，藍延珍想僅憑手上這支艦隊佔下寧波簡直就是白日做夢。
但這樣做有個好處，寧波是明軍的重要基地，而且寧波外圍的舟山羣島更是明軍海貿商船的聚集地，一旦他帶艦隊攻擊寧波，寧波必然不能坐視，而明軍水師也必然會來救，甚至以期在寧波一帶海上同自己艦隊進行決戰。
這樣的話，就能把明軍水師調離福建沿海，逼迫他們北上，以達到穩定福建沿海的目的。