制定了初步的殖民計劃之後，首先就是對俄羅斯進行重組。俄羅斯地廣人稀，經過大戰後，人員死傷甚重，俄羅斯義軍又都是一幫子沒有統治經驗的農奴，只知道把農奴主家的土地，金銀，女人往自己家裡送，根本就沒有什麼建國的想法和計劃，包括那些首領都是如此。義軍的首領們將希望全部放在了明軍身上，希望明軍能幫助他們建立自己的國家。明軍的顧問根據命令將俄羅斯帝國具體的分成了三份，分別組成了北俄，中俄和南俄。
爲了加快速度，明軍顧問建議義軍安排那些具有統治經驗的農奴主來擔任一部分不是很重要的官職，除了皇帝之外的重臣可以由明軍顧問擔任，在義軍首領和明軍顧問的努力下，三個新的國家建立了，每一個國家都不約而同的廢除了他們最痛恨的農奴制，並且開始重分土地，分發農具，建立了各級的地方政府，選好了首都，三個義軍的首領在不同的時間裡登基做了皇帝。所有的建國工作做完之後，三個皇帝分別收到了明朝的賬單，包括對義軍的武器裝備支援，出兵相助的各種費用一共加起來每個國家將向大明朝付出十二億兩白銀的代價。很明顯這個代價貴了一點，可是這三個義軍首領都是眼高手低的野心家，只要能當上皇帝，什麼都可以，至於大明朝的賬單無非就是多剝老百姓幾層皮而已，他們是不在乎的。
一切都準備好之後，新登基德皇帝們下令按人頭徵收重稅，非常重，可是就算是這樣，對於那些以前每天累得吐血卻什麼也不可能得到，還有可能隨時像狗一樣被處死的農奴們來說已經很滿足了，除了收稅，新的國家還要在武器，船隻，和一切需要外購的項目中優先購買大明朝的產品，對於木材和糧食等物還要以及優惠的價格提供給明朝，大明遠征軍駐俄羅斯的軍隊給養，包括食物還有其他一切俄羅斯有的東西都有三個國家均攤，所有的新的國家的軍隊的高級將領都有明軍顧問，三個國家還要組建數目近十萬的遠征軍協助大明遠征軍作戰，俄羅斯人只能擔任低級軍官，所有的一切條件三個國家的皇帝都全數答應下來，即使這樣，三個國家被解放的農奴們對大明的“無私”援助都心存感激，有很多沒有出嫁的俄羅斯姑娘都以嫁給大明遠征軍的士兵爲榮。就這樣用了半年的時間，俄羅斯就成了大明遠征的一個後勤基地。
在俄羅斯的事情進行的同時，大明的官員在天竺也開始了建立殖民地的事項。在天竺設立總督一職，握有天竺國除了軍隊外的最高權力，包括掌管稅收，出口和香料的出售權，天竺國所有的可以外銷的東西全部由殖民政府統一收購，價格由政府制定。各級官員除了少部分偏遠地帶外，大多由明朝人擔任。所有天竺人不得私自擁有船隻和武器，所有的天竺農民都要繳納土地的管理費，所有的適齡男青年都有義務參加由殖民政府組建的大明遠征軍天竺軍，協助大明遠征軍作戰。可能是那些印度阿三天生就有就是被外族統治的基因，並沒有人做出造反之類的事情，反而有很多天竺人爭先恐後的以進入殖民政府做事爲榮。但是考慮到要長期對天竺進行統治，殖民政府爲了更好的統治，將收購香料的事情交給天竺國內的高種姓家族來做，讓他們從中可以獲取利益，並且下令高種姓家族可以免交除土地稅之外的所有稅款，這樣一來高種姓家族就成了大明統治天竺的有力的幫手，使大明在天竺的殖民統治得以順利展開。
南洋的菲律賓由於佔領已久，很快建立了殖民政府，制定了收取漁業稅和人頭稅和船隻稅和農業稅。至於菲律賓由於盛產黃金，白銀和銅礦，所以朝廷派出了大批的採礦人員，在菲律賓尋找和開採黃金礦，白銀礦的事宜，所需人力全部由水師在印尼各島抓捕回來的奴隸擔任，經過一年多的努力，菲律賓的礦開始產出，大批的黃金白銀由水師運回了大明，爲將來的水師擴建提供了大量的資金。在同時，大明還派出官員在印尼也開始建立正規的殖民統治，在各個島嶼上建立了殖民管理點，由於我生活的那個時空中，印尼人曾經對中國人犯下的滔天罪行，所以我對印尼的殖民統治也格外殘酷：每一個印尼人都必須繳納人頭稅，土地稅，漁業稅和資源開發稅，由於印尼島嶼衆多，所以在印尼挑選了一些華人代爲管理。印尼人的每一樣稅款都是其他殖民地的三到四倍，並且印尼人不得擁有武器，船隻，所有的船隻都要收繳，再令印尼人再行購買漁業權，購買漁業權的條件是並須一次性繳納一年的所有稅款後，才能向殖民政府租用船隻。每個島嶼的殖民政府的一把手都對印尼的未婚女子擁有初夜權，沒有殖民政府的同意，不得擅自結婚，生子，結婚有結婚稅，生子有生子稅，反正稅款已經牽扯到印尼人所做的每一件事。
在印尼的殖民政策進行推廣之後，有好幾百個島嶼同時進行造反，對抗大明殖民政府，就連左光斗和楊鏈也表示對印尼人的殖民規定過於苛刻，而我一想起當初印尼人****的事情就氣不打一處來，對兩個人的建議根本聽不進去，而是直接命令大明水師進行清繳，所有造反的島嶼挨個進行清繳，不放過造反島嶼上的每一個人，聖旨上寫的很清楚，大明水師的任務就是將這些島嶼變成無人島。大明水師強悍的戰力，印尼人根本抵抗不了，在不到兩個月的時間內，所有造反的島嶼被盡數滅光。楊鏈建議修改對印尼的殖民規定，否則印尼將永無寧日。對於印尼這幫雜種，我根本就不想放過，要不是現在水師兵力不是很充足，我肯定會下令將所有的印尼島嶼全部屠光，對楊鏈的建議我只說了一句話“對印尼的殖民法案不變，如果再有造反的事情嘛，朕不介意殺光他們！”我下令在印尼的殖民政府僱傭當地的華人，西班牙人和一些其他國家的人組成治安軍，配合殖民政府的鎮壓，雖然殖民規定相當過分，但是在屠殺了幾十萬印尼人之後，印尼人就開始適應接受這些條件了，平定下來的印尼，每年的稅款額都是各個殖民地中最多的。
搞定印尼之後，接下來就是對奧斯曼的殖民政府建立了，奧斯曼帝國其實就是一個宗教國家，對其殖民統治要充分利用各地的宗教機構，錦衣衛在我的授意下，開始收買和拉攏那些神職人員，讓其可以爲大明效力。而原來的那些統領和城主卻不願意放棄自己對城市的管理權，而我則要充分利用宗教對奧斯曼人進行有效的統治，明軍的大部隊平時都在伊斯坦布爾，對地方上的影響力爲零，鑑於這種情況，殖民政府向各個城市的統領們建議，在每一個奧斯曼城市裡安排一個明軍顧問，但是奧斯曼的城主們依然不同意。爲了防止這些城主統領再一次聯合起來造反，殖民政府在我的授意之下不再提及此事，反而答應將城市中規定稅收的數量和時間由各個城主統領說了算，明軍每年只象徵性的收取一小部分的稅款。
消息一出，那些統領異常高興，都紛紛表示會永遠忠於大明。可是我卻沒有打算偌大的奧斯曼帝國一年的稅收只有數百萬，所以下了一道旨，由殖民政府出面通知那些城主統領到伊斯坦布爾接受殖民政府的加封。那些城主們都高興的來到了伊斯坦布爾，準備接受加封。我的聖旨後半部分寫的是將這些城主統領全部幹掉，然後在每個城市中安排大明的官員擔任城主，按照大明規定的條件對奧斯曼進行統治。那些城主們一到伊斯坦布爾便全部被抓起來，帶到港口全部絞死，然後大明的官員帶着自己的親隨，到各個城中去任職。這樣做的後果是奧斯曼的幾個地方發生了叛亂，不過規模不大，所以很快被鎮壓了下去，在各地被明軍收買的神職人員的幫助下，大明的官員在這些神職人員和明軍實力的雙重幫助下，一年之內便接受了奧斯曼的各個城市，開始了對奧斯曼進行殖民統治。
奧斯曼殖民統治的例子並沒有在埃及推廣，因爲埃及是一個計劃中的商業中轉站，所以對埃及的統治都是以照顧商業爲重心的。埃及各地的地方官員依然由那些酋長們擔當，每年殖民政府都會給他們錢和東西，目的是靠他們來維護埃及的穩定，只有一個穩定的埃及纔有可能被建立成一個商業中轉地。在商業上，首先以明朝政府的商業機構爲主和明朝一些有實力的商戶，在明軍的保護下在埃及以合理的價錢從埃及人手中購買土地，建立商站，並大批僱用埃及人做工，工資待遇只比明朝的工人略低，對所有埃及人不徵收漁業稅和人頭稅，可是土地稅卻高的離譜，沉重的土地稅足以使種地這個營生根本就只有餓死的份，這樣做的目的就是使埃及人放棄務農，而轉向爲大明的商戶去工作。這樣一套下來，及穩定了埃及，又使在埃及的商業活動有了豐富的人力資源，所以埃及建立商站的事情進行得很順利。
在根據不同的國情，在各個國家實行的殖民政策下，大明朝在這些殖民地獲取了巨大利益，每年各個殖民地的稅款達到了十數億，殖民地豐富的人力資源爲明軍組建協同軍提供了方便，至於鉅額的稅款除了在各個國家組建協同軍花費一部分之外，其大部全部送回了大明朝。沒有多長時間，大明的經濟狀況得到了很大的改善。與此同時印尼的大批人力在兩河治理中發揮了巨大的作用，雖然在上游的工程中死傷極慘，可是大明水師卻在印尼擄掠的苦力卻源源不斷地送回了大明，使得工程進度很快。另經濟狀況的改善，爲擴建海軍和爲遠征軍提供大量的後備力量提供了基礎，戰略休整兩年之後，我再次開始了爲征服歐洲而進行的大規模擴軍。