柯南正想着餘下的案件問題，就聽見了元太、光彥、步美三個人的叫喊聲，柯南跑到了這三個人的身邊，詢問情況。
“出了什麼事了？”柯南不解地問道。
“灰原、博士和勇也都不見了！”步美着急地回答道。
“他們是不是回博士的車裡了？”柯南問道。
“沒有，我們三個人都去過那裡了，車裡一個人都沒有，我用偵探徽章呼過灰原了，結果沒人應答。”光彥回答說。
“我們剛纔還給博士打了電話，博士電話也不接。”元太對柯南說道。
在一片樹林的其中一個地方，阿笠博士用手捂着自己的腹部，那裡已經出血了，走路踉踉蹌蹌的，走幾步路就要歇一歇，表情很痛苦。
這時勇也出現了，他看到阿笠博士這個情況，馬上跑了過去，問阿笠博士道：“阿笠博士，你怎麼了？出了什麼事？”
阿笠博士一喘一喘地說道：“我剛纔看見一個人很慌張地跑了過去，我攔住了他，就詢問你們的情況，結果他立刻地給了我一刀，然後我就這樣了。”
“哦，那個人可能是太田真人吧。”勇也思考道。
這時勇也看了一下受傷的阿笠博士，勇也站了起來便對他說道：“阿笠博士，您還要在我面前裝到什麼時候啊？不對，應該叫您太田真人先生吧。”
這時受傷的阿笠博士一驚，便解釋道：“你在說什麼啊，你沒看見我受傷了嗎？”
“別裝了，雖然您也會僞裝術和變聲術，但是演技真的不怎麼樣。”勇也冷眼地說道。
“哼，想不到我自己苦心的一番設計居然還騙不過一個小孩子，也罷，小鬼，你是怎麼知道的？”此時太田真人站了起來，撕下了自己的僞裝面具，露出了本來面目後便詢問勇也道。
“這個推理很簡單啊，第一，您模仿阿笠博士的聲音不對，雖然學的有些像，但是隻要有一個字您學不像的話，就會被我聽出來。第二，據我瞭解到，每當少年偵探團發生案件時，阿笠博士總會和少年偵探團在一起，那這回阿笠博士爲什麼沒有出現在他們身邊呢？第三，您模仿阿笠博士的體型也不對，這和真正阿笠博士的身材比有些瘦了。第四，在這起案件中，太田真人還沒有出現，所以您的這次出現，我會有些疑惑，當然這點就只是直覺了，沒有佐證證明。第五，您上衣口袋裡好像裝了什麼東西，我猜是錄音筆之類的吧，因爲我想您應該沒有見過阿笠博士，所以您不知道他的聲音，如果能把阿笠博士的聲音錄下來，再去模仿的話就好了，當然了，真正的阿笠博士應該是被您綁起來了吧。第六，您腹部的血液應該是血包裡噴出來的紅色液體吧，這個一看就知道了。順便提幾句，我讓我的人調查了您的過去，發現了線索，根據我的推理您的父親太田一郎應該是被您殺的吧。”勇也對太田真人推理說。
“小鬼，你還真不簡單啊，就像一個鯊魚般的名偵探，你說我殺了自己的父親，這個你有證據嗎？”太田真人問道。
“雖然這是3年前的案件了，證據也並不好找了，但是我的手下人查到您的母親是服毒自殺後我就明白了，您的母親寫了一封信就藏在了保險櫃裡，請原諒，我是爲了調查事情真相纔去翻找的，信裡面有一句話是這麼說的‘我真的沒想到這麼多年了我還是不瞭解他，他居然在外面找小三，還要和我離婚，其實按理說離婚也沒什麼，但是真人，你可怎麼辦啊，你現在還在讀高中，還要考大學，我不能因爲這事幹擾到你啊，可是我真的不想失去你們啊，我真的受不了，請原諒我，真人，請原諒媽媽這最後的一次任性吧。’當我知道這封信後就能立刻推理出您一定是發現了自己的父親有出軌的現象，在家中，就在父子兩人的爭吵中，你們兩人大打出手，激動之下，您用水果刀殺了自己的父親。事後，您擦掉了水果刀上的指紋，拿走了家裡的錢，隱姓埋名，離開了那裡，從此了無音訊。”勇也再次推理道。
“媽媽。。。”太田真人望向天空，淚珠從眼眶中流了下來，含淚說道，“你應該也想知道這起案子中高橋先生包裡爲什麼寫着我要殺人的紙條吧，其實當我幫他們策劃了這起事件之後，沒想到的是內田和丸山想把殺掉高橋的罪名按在我一個人的身上，紙條是他們放進去的，當然了我在他們身上安裝了竊聽器，方圓百公里內的聲音我都能聽見，還好有你們在，他們的這個陰謀纔沒有得逞，還有我出現在那兩起案子的交通事故現場，其實都不是偶然的，高橋先生是我的朋友，當時我們身上早就沒錢了，爲了能夠生存下去，我們兩個人策劃了這兩起案件，後來我不想再這麼幹了，結果遭到了高橋的威脅，他說我要是不再繼續和他乾的話，就把我殺自己父親和這兩起交通事故現場的真相告訴警察，我沒有辦法，只好在今天殺了他，現在好了，我去自首吧，一切都結束了。”
“還沒有結束吧，您告訴我阿笠博士在哪裡？”勇也問道。
“我帶你去吧，如果你這個小鬼相信我的話。”太田真人回答道。
“我相信您，不過您不用帶我去，也不用去自首，您可以繼續隱姓埋名的生活下去，您別誤會，我只不過是想讓您當我的手下，我的一個朋友會幫您完善僞裝術和變聲術，爲了自己的未來，生活下去吧。”勇也對太田真人說道。
太田真人聽完一愣，他看着這個神秘的小孩，問道：“你爲什麼要幫我？”
“因爲我也是沒有父母的孩子。”勇也回答說。
在一座小木屋裡，灰原和阿笠博士的雙手雙腳都被繩子給綁住了，嘴也被封上了，這時一縷陽光照了進來，門被打開了，是勇也，勇也看見他們就跑了過去，給他們解開了繩子。
灰原用自己的偵探徽章告訴了柯南一行人他們現在所處的位置，這起案子也告一段落。