當然關於SEELE，新舊版本的福音戰士世界是有區別的，最直觀的就是數量不同，舊版中有共計12名，並且是有真實肉體存在的，即是說背後是個人，而在新劇場版中，黑色石碑影像的背後並非是活生生的正常人。
不過不論是新舊版本，SEELE的目的應該都是類似的，即是所謂的“人類補完計劃。”
而這個計劃的第一步，就是首先要消滅掉所有來襲的使徒。
畢竟這些號稱得到了生命之果的準完美生命，存在的意義是毀滅吃了智慧之果的人類，所以人類不論想要實現什麼計劃，使徒都是必然的敵人。
“第四使徒來襲與其被殲滅……”
“還有第三適格者的接收和初號機的啓動……”
“大致按照既定之數進行着……”
“雖然初號機的初戰並不順利，以及零號機的巨大損傷也不在預計之內。”
“即使多少有些不完美，但是隻要知道第五使徒出現的時候能夠使用就行了。”
幾個黑色“石碑”陸續傳出聲音。
“這方面不用擔心，除了基本完好的初號機之外，二號機及其附屬駕駛員已經在德國進行實證測評試驗，三號機以及後續機型的建造也在按計劃進行之中。”碇源渡撐着下巴的姿勢一點未變，平靜的回覆道。
“合理利用NERV和EVA是你的責任，希望你不要讓我們失望。”
“的確，畢竟消滅使徒只不過是與莉莉絲契約的一小部分，人類補完計劃纔是我們的最終目的。”（關於契約的部分，顯然是新劇場版的新劇情，因爲還未最終結局，因此細節未知。）
“現在問題在於未知力量的介入，我等在文書中並未得到任何相關的信息，顯然不在計劃之內。”
“難道是來自於別的地方，比如我等世界之外。”
“來自於宇宙嗎？與莉莉絲類似之物？”
“顯然並沒有如此可怕的力量，不必危言聳聽。”
“確實，不過既然不在計劃之內，就要徹底排除，人類補完計劃不容絲毫誤差。”
“贊成。”
“贊成。”……
“知道了，一切都將按着SEELE的劇本進行。”
……
這些陰謀詭計暫且不提，讓我們來看一下如今人類的主角正在做着什麼。
實際上他什麼都沒做，就是穿着一身病號服望着窗外的夕陽在發呆。
原本接到父親的召喚多少有些期待的心情早已經七零八落，使徒、EVA、可怕的怪物，殘酷的戰鬥，這一切明明只發生在昨天，但是卻又如此的讓人感覺不真實。
整個醫院空空蕩蕩，也不知道是因爲這裡是專門爲碇真嗣這樣的適格者服務，還是因爲在第三新東京繁華的背後，實際上就是如此的空洞蕭條。
少年慣有的沉默，卻不是如同他父親那樣的城府陰沉，而是一種更加接近於發呆的自閉，前來接他離開醫院的葛城美里看到的就是這麼一個身影。
葛城來此的目的是帶領碇真嗣回到基地聽從進一步安排的，畢竟碇真嗣在之前一戰中實際上也只是因爲神經反饋而承受了一點痛苦，左手臂和右眼有些後遺症，卻是身體對於神經反饋的過分反應，這基本上屬於神經科的治療範疇，並且只是一點小毛病而已，很快身體就會自動調整過來。
不過身體上的問題事小，碇真嗣那沒有多少積極性的態度卻更加讓葛城擔憂。
而當她帶着碇真嗣面見了碇源渡，兩父子的疏離以及讓碇真嗣獨自居住的安排讓這種擔憂達到了最高。
“沒關係，還是一個人好，反正到了哪裡都一樣。”碇真嗣微笑着這麼說，看起來極爲平靜，卻讓葛城下定了決心。
於是她決定讓碇真嗣搬到她家裡去住。
可喜可賀，這可是少年成長的第一步啊，與一個火辣御姐的同居，各種日常劇情的展開也讓那個看起來永遠沉默平靜的少年各種hold不住。
另外一個關鍵，則是葛城帶着碇真嗣來到了第三新東京市附近的山頭，讓碇真嗣第一次俯視整個城市，看着地下都市的功能建築在陽光中升上地面，收集陽光和進行各種作業。
“這就是迎擊使徒的專用要塞都市，第三新東京市，我們的城市。”
“也是你參與保護過的城市。”
這多少讓少年那顆對世界充滿疏離的心靈找到了一點真實感。
原來他的到來並非毫無意義。
也並非只是父親這個因素而已。
當然身爲碇源渡司令的兒子以及EVA駕駛員的身份很不一般，但是身爲十四歲的少年，與同齡人的接觸對於身心的健康成長是很有必要的，於是碇真嗣就這麼被安排進入一個附近的學校就讀。
這似乎也是日本漫畫的一個重要元素，可惜在這個福音戰士世界裡畢竟還是有些不同，性格內向的碇真嗣對於學校的安排也僅限於聽話而已，距離融入校園生活或許還有很長的一段路要走。
而狠狠捱了一頓揍這種事，或許反而讓他對自己的校園生活有了一點真實感受。
至於EVA駕駛員該不該被普通人揍這種事，其實恰恰相反，正是因爲他說出駕駛過EVA，然後就被打了。
原因似乎是因爲在上一次使徒襲擊事件中，打他的那個人的妹妹受了傷，現在還在醫院裡。
另外一件讓他在意的事，則是那個曾經有過一面之緣的藍髮少女也在他的班上，看起來她身上的傷已經好多了，雖然右手還吊着繃帶，但是起碼能夠來上學了不是嗎。
只是這位少女最常做的事情就是定定望着窗外，或者獨自一個人呆在某處不做任何事，她的身邊似乎帶着拒人於千里之外的光環，班上的同學不會主動與她交流，而碇真嗣更是從未聽到她主動說過任何一個字。
當然除了這些小事之外，碇真嗣也終於開始接受正正經經的駕駛員訓練了。
畢竟NERV不能指望初號機依靠覺醒來消滅所有敵人，EVA的維修費用可不便宜，零號機到現在還在修復當中呢，初號機的戰鬥力提升顯然有利於減少戰鬥中的損失。