庖犧自跟隨清虛學道之後便具有了神通，幫助族人獲得了更多的食物，從清虛處學來的漁獵之術也幫助族人能自主的獲得食物，伏羲又根據蜘蛛織網的樣子製成網罟更加方便了族人的捕魚，同時又教授族人馴養野獸，將其變爲家畜，使風兗部落的人類更加的富足，慢慢的庖犧在部落中的威望越來越高，族長覺得庖犧已經長大了，可以替族人做出各種決定，可以將部落發展的更大，便想將族長之位傳給庖犧。
庖犧以自己年齡還小，且還在跟隨老師學習爲由婉拒了族長的要求。華胥聽說後向庖犧問到：“你爲什麼不接下族長的位置呢？你的能力已經超過了族長許多，而且族長已經老了，部落現在需要一個更年輕更有力的首領來帶領他們，難道你學了強大的法術便想丟棄族人嗎？”
庖犧答道：“母親，庖犧不是不願幫助族人，而是老師的東西我還沒學玩，一旦接受族長的位置我就沒有那麼多的時間來向老師學習，我想學習更多的東西，以後便可以更好的幫助族人。”“庖犧是母親誤會你了。”
如此又過了兩年，清虛對庖犧說道：“如今該交給你的我已全部交給你了，你也該去接任族長的位置完成你的使命了。”說完便將女媧娘娘送來的伏羲琴交給庖犧說道：“洪荒中有許多危險，此物交給你護身。”庖犧見已經留不住清虛了便說道：“那請老師參加完弟子接任族長的儀式再走吧。”清虛點頭答應了。
此時風兗部落的族長已經老的快死了，聽見庖犧終於願意接任族長的位置了，萬分的高興，忙讓族人準備庖犧接任族長的儀式，七天之後，庖犧在清虛的見證下接過了族長的位置。清虛對庖犧說道：“你如今已然接掌了族長的位置，再用庖犧這個名字已然不適，今你可改名爲伏羲。”庖犧聽完說道：“弟子伏羲謝老師賜名。”清虛點點頭便駕祥雲而去。
伏羲自從接過族長的位置之後便勵精圖治，帶領族人過的越來越好，周圍部落的人聞聽伏羲之名皆舉族來投。慢慢的風兗部落越來越大，以前的小寨子已然無法容納太多的族人，伏羲便帶領族人在陳這個地方建造可都城，以供族人居住，和躲避猛獸的侵襲。那是人們只是用樹的枝葉簡單的圍在身上，每到冬天便有許多老人、小孩和傷病患者耐不住嚴寒而凍死，伏羲便又用動物的骨頭製作了骨針，以動物的筋做線將獵物的皮做成衣服，以提高族人禦寒的能力，使族人，免於凍死。
那時人們是用在繩子上打結的方法來記錄每天的收穫，而部落越來越大伏羲見用結繩記事的方法不能很好的記錄發生過的事，便又發明了一種簡單的符號來記錄發生的事伏羲將其稱之爲書契，故後世之人又將伏羲稱之爲“人文始祖”。
倡導男聘女嫁的婚俗禮節，使血緣婚改爲族外婚，結束了長期以來，子女只知其母不知其父的狀態。又依照伏羲琴發明陶壎、琴瑟等樂器，創作樂曲歌謠，將音樂帶入人們的生活，幫助人們“修身理性，反其天真”。將其統治地域分而治之，而且任命官員進行社會管理。還創制了曆法，使人們狩獵都有了時間的根據，避免了錯過最好的捕獵時間的事情。
由於洪荒天庭被毀，而昊天所建的天庭人手有限，不能很好的管理風、雨、雷、電、等力量，使得各種災害不斷，使人族經常遭受各種各樣的災難，造成很大的損失，失去許多族人，伏羲極爲着急，想能不能避免這種損失。便夜晚觀察月亮、星斗運行的規律，白晝觀察太陽運行的路線，查看山川河嶽，傍晚便坐在洛水旁思考其中的聯繫。
這一日他又在洛水旁思考着，突然他聽見了兩聲奇怪的吼聲，擡頭看去，只見從洛水中浮起一隻大龜，龜背上馱着一本書，從洛水對面的山洞中跑出一匹赤紋綠色，高八尺五寸，類駱有翼，蹈水不沒，馬身而龍鱗的異獸，此異獸正是龍馬，龍馬背上放着一張捲圖，此二獸將背上之物放於伏羲身前便消失不見，此物正是那先天靈寶河圖洛書，此寶自帝俊身隕後便不知所蹤，今日感伏羲爲天下百姓的那一股毅力，神物有靈遂現出本體將河圖洛書送於伏羲。
伏羲上前將河圖洛書撿起，只見那河圖洛書上蘊含着極爲濃郁的靈氣，不在老師清虛送於自己的寶物——伏羲琴，忙將其收入懷中，回到不落將其祭煉完成後便開始慢慢體會其中所蘊含的大道，伏羲這一入定卻是持續了八八六十四天，六十四天之後伏羲醒來，仰首大笑道：“如此則族人無憂已，說完便伸手在地上畫下了一太極八卦圖，乾一、兌二、離三、震四、巽五、坎六、艮七、坤八，八個符號圍在太極圖周圍，這八個符號看似簡單卻是蘊含大道，可以用來推算萬事萬物，而且其最奇妙的是就算是沒有一點法力的凡人只要將其所代表的涵義記清楚也可以用之推算。
伏羲想道：“若將此法教會族人，他們便可以用它來推算，已達到趨吉避凶的目的。想到此處，伏羲臉上不由露出了笑容。就在此時天空之上異香陣陣，朵朵天花散下，一團霞光落下融入伏羲體內，伏羲的道行瞬間提升了一大截，而在王屋山天空中也有一團功德降下，清虛展顏一笑，將這份功德收入袖中。
卻原來是伏羲畫出八卦使得人族有了躲避災禍的能力，對天災雖然還是無法可想，可是畢竟有了躲避的可能和時間，上天感念其功，故降下功德以示獎勵，而清虛由於教導伏羲有功，故上天也降下了一份功德。
伏羲回到部落後便挑選出部落中極爲聰慧的族人，自己開始教授這些族人八卦之術，數年後待這些族人將運用八卦推算之法悟出一點皮毛之後伏羲的聲望更是漲到一個前人所無法企及的地步，又有數十小部落前來投靠，融入風兗部落之中，使得風兗部落成爲黃河流域最大的部落，十餘年後伏羲的威名傳遍整個洪荒人族部落，衆部落感念伏羲爲人族做出的貢獻遂推伏羲爲人族共主。而伏羲見自己的部落越來越大，僅靠自己和幾個長老已然管理不過來，便將族人分爲幾塊，每一塊都有數個聰慧的族人管理，使得人族有了最原始的一批官員出現。
如此過了數十年伏羲的修爲日漸高深，他隱隱感覺到自己能留在人族的日子不多了，可是他又不放心整個人族，想在人族中找一個有德之人接替自己的位置，照顧還在洪荒中苦苦掙扎的人族，花費數年時間終於找到了一個伏羲覺得可以接替自己位置的人——朱襄氏。