在星矢他們成功的奪回黃金聖衣後，聖域來的刺客們全都接連襲來，在我方衆人的努力下，聖域來的刺客接連敗陣，這次，連白銀聖鬥士也要出動了。
蜥蜴座的米斯迪及天鷹座的魔玲奉命前來日本，要取星矢等人的性命。在星之子學園附近的海灘上，米斯迪向星矢襲擊，他更揚言白銀聖鬥士與青銅聖鬥士有如神和蟲的分別。
魔鈴爲救星矢，放出空拳令星矢假死，但是卻被米斯迪識破，星矢與米斯迪的一戰立刻爆發。
面對着米斯迪，星矢的必殺絕技流星拳已沒有作用，他反而被米斯迪的輕輕一擊而倒在海中，難道他們的實力差別真有如神和蟲嗎？
星矢幾經艱辛，終於使出新的必殺技天馬彗星拳及天馬迴旋粉碎把米斯迪打敗。
但是白銀聖鬥士白鯨座摩西斯及獵犬座艾斯提利昂也來到了海灘，懂得讀心術的艾斯提利昂知道了魔鈴已背叛了聖域，於是在海灘把魔鈴打傷了。
星矢感到魔鈴的小宇宙突然消失了，於是趕回海灘，看到了魔鈴被綁在海中，危在旦夕。星矢爲救魔鈴，只好打敗眼前的摩西斯。
當摩西斯預備使出最後的一擊時，說出了魔鈴是星矢的姐姐，因而令星矢的小宇宙急速燃燒起來，把摩西斯也擊倒了。
星矢雖然不敵艾斯提利昂，但是剛被貴鬼救回來的魔鈴把艾斯提利昂打敗，可是她在星矢醒來的時候已經走了，只在海灘上留下了『星矢，守護雅典娜』的字句。
衆人回到競技場，艾俄洛斯終於把十三年前所發生的事說了出來。
原來沙織是每數百年轉生一次的女神雅典娜的化身，當年在希臘，還是少年的他帶着剛剛降生還是嬰兒的雅典娜女神躲避追殺，而在這逃走的過程中身受重傷的他被正巧來希臘旅行的城戶光政所救，爲了躲避追殺，最後被城戶光政帶回了日本。
————此時，聖域方面————
教皇眼見衆多聖鬥士都被星矢等人打敗，終於連聖鬥士之中最高級的黃金聖鬥士也召來了。
天蠍座的米羅奉召到來，得知十二件黃金聖衣的秘密，雖然萬般不願意，但是都接受了教皇的命令，去把星矢等人消滅。
不過，爲了補償哥哥艾俄洛斯的罪行，獅子座的艾歐里亞自動請纓，在教皇的批准下前赴日本。
星矢回到了日本，但是因爲體力未曾回覆，所以被安排到療養院休養，但是莎爾娜再次要取星矢的性命。
原來當星矢在聖域修業時，無意中看到莎爾娜善良的真面目，這是對女性聖鬥士的侮辱，所以她常常襲擊星矢。
當莎爾娜繼續向星矢攻擊的時候，遠處突然有一股強大的小宇宙向他們二人襲擊，原來艾歐里亞已從聖域趕來，並出現在兩人面前。
莎爾娜因爲知道艾歐里亞的厲害，叫星矢先走，自己則向艾歐里亞出拳，不過艾歐里亞只用一隻手指便把莎爾娜擊倒。
星矢接着使出流星拳，但對擁有光速動作的黃金聖鬥士完全沒有作用。當艾奧里亞使出光速拳要解決星矢的時候，莎爾娜突然用身體硬擋了這一拳。
性命垂危的莎爾娜終於向星矢道出追殺星矢的原因。原來女性聖鬥士被看見真面目後，只有兩種做法，一是把對方殺掉﹔一是深愛着對方，莎爾娜到這時終於明白到自己已深愛着星矢。
艾歐里亞被莎爾娜的愛所感動，決定先帶莎爾娜回聖域療傷，但是教皇派出監視艾奧里亞的三名白銀聖鬥士現身，向星矢攻擊。
突然，人馬座黃金聖衣不知從何而來，穿在星矢身上，瞬間把三名白銀聖鬥士打敗。
艾歐里亞看到人馬座黃金聖衣的出現，並穿在星矢的身上，自然不會就此罷休，戰鬥隨之展開。
星矢無論怎樣努力，也不能打敗艾歐里亞，相反，艾歐里亞的閃電光速拳令星矢毫無還手之力，連趕來的冰河及瞬也被擊暈。
這時，沙織以女神的身份出現，向艾歐里亞說明十三年前的故事。
十三年前的一過晚上，教皇原本要把年幼的沙織殺掉，幸好得艾俄洛斯相救，帶着射手座聖衣逃出聖域，更在途中不幸受到重傷，而後被冠上叛徒的罪名。
由於沒有實在的證據，艾歐里亞還是半信半疑，最後艾俄洛斯的靈魂出現並幫助星矢把光速拳推回去，終於令到艾歐里亞覺悟，立時發誓效忠雅典娜，並帶莎爾娜回聖域，找教皇瞭解真相。
在衆人注意力都在別處的時候，一個小小的光團從星矢穿着的射手座聖衣上離開並漂浮走了。
————城戶宅————
‘回來了嗎。’
蓮‘看’着穿過窗戶飄進房間內的小小光團，這個小小光團正是從星矢穿着的射手座聖衣上飄走的那個。
‘快點回到你的身體裡吧。’
蓮對着小小的光團‘說’道。
小小的光團像是聽懂了蓮的話一樣，飄到正橫躺在沙發上沉睡的男子身體上方，此時躺在沙發上的男人不是別人正是艾俄洛斯。
小小的光團‘飄’進了艾俄洛斯的身體、融入了進去，沒過一會，沉睡的王子睜開了眼睛。
“非常感謝，蓮大人，幫我這個忙。”
‘只不是用積屍氣冥界波幫你把身體和靈魂分離，再讓其附身在聖衣上，不用那麼謝我。
但是，這麼做還是太危險了，要不是看在你決心已定的份上，我纔會幫你的，但是隻要你露出一絲猶豫，我就不會幫你的。’
“再次感謝，蓮大人，同意我這麼任性的要求。”
‘不用再謝了，但是寧可用這種方式也不去見艾歐里亞自己的親弟弟，不讓他知道你還活着，這樣好嗎？’
“嗯，現在見面還不是時候，艾歐里亞已經成爲了一名出色的聖鬥士了，我相信他會理解此時此刻我的做法的。”