何平也有點糊塗了，這究竟是怎麼一回事？最初的時候，他聽說的所謂黑幕，是神樹集團自導自演了這一齣戲，畢竟除了神樹集團自己之外，其他勢力很難在同一時間入侵神樹集團的倉庫，從中拿出這麼多的病毒進行散播，而目的則是爲了讓自己成爲遺留下來的最大勢力，從而重建社會的秩序。
但問題在於，神樹集團在這個世界上的地位已經是其他勢力難以動搖的了，根本沒有必要再玩這樣的花招，他們已經把握了世界的社會秩序，已經是最大的勢力，而且這一次的生化危機對於神樹集團來說，也必定是有害無益的事情，神樹集團完全沒有任何的必要將整個世界的秩序推.倒重建。
正是基於這一點，這個世界的不少人，比如說邁克爾等人，還有何平自己，都不認爲神樹集團是生化危機的罪魁禍首，他們應該也是受害者，幕後黑手應該是除了神樹集團之外，不爲世人所知的另一股龐大的勢力，幕後黑手的目的，纔是將社會的秩序推.倒重建，以此來讓自己在新的世界當中佔據主導地位。
何平一直都認爲這個推斷是最合適的，但也並不是完全沒有疑問，最大的疑問就是，如果說是有另一股勢力想要將這個世界弄得一塌糊塗，然後渾水摸魚，壓倒神樹集團，讓自己成爲世界上最大的勢力，那麼在生化危機已經爆發之後的第三年，怎麼說，這個幕後黑手都應該已經要忍不住跳出來了纔對。
簡單的說，此時已經是人類復興開始的最佳時機。如果有心要在復興之後的人類社會當中佔據一席之地，那麼此時應該已經要開始活動，整合自己的勢力，不斷的壯大，然後收攏倖存者了。就像在何平的鼓動下，邁克爾和妮娜他們所做的那樣，若是想要成爲復興後的最大勢力，那應該早就開始行動，並且此時已經形成不小規模，有了不小名氣纔對。
可事實上呢？目前就何平所知道的情報。就倖存者們知道的情報來看，這個世界上的最大勢力，依舊是神樹集團，所謂瘦死的駱駝比馬大，所謂百足之蟲死而不僵。就算是因爲生化危機這件事，神樹集團失去了他們原有的絕大多數資源和地位，失去了人們的信任，但他們剩下的那一點資源和人手，卻依舊不是其他勢力能夠對抗的。
都已經連毀滅世界這種事情都策劃出來，並且付諸實施了，最關鍵的是最終還成功了，都已經做到這種程度。若是在背後有幕後黑手，有其他的勢力打算和神樹集團對抗，那麼他們絕對不可能在最關鍵的時刻掉鏈子。將復興過程中的主動權再一次的交給神樹集團，而沒有其他勢力壓倒神樹集團的原因，很可能就是根本不存在那個何平和其他倖存者想象中的幕後黑手。
這個疑問，何平雖然一直都有，但是因爲沒有其他的合理解釋，所以就一直被他放在了記憶深處。之後去了神樹集團之後，因爲所遇到的事情太多。也使得他沒有多少時間去想這些，直到在神樹集團的地下室當中發現魔神的蛛絲馬跡之後。這個疑問再度出現，如果神樹集團真的和魔神有勾結，那麼就絕對不是這個世界上其他勢力能夠撼動的，有魔神做後盾，生化危機這種事情，也就只有神樹集團自己才能夠做出來了。
神樹集團自己做的，還是幕後黑手，也就是其他勢力做的，在何平看來，應該就只有這兩種可能，但是從生物計算機這裡得到的信息，卻將所有的線索都指向了是魔神自己更改了巨大生物的指令，控制了巨大生物，並且還剝奪了生物計算機對活體兵器的控制權，最終將這些病毒在同一時間進行了散播，造成了生化危機。
這個結果讓何平一時間不知道該如何處置，其他所有的始作俑者都因爲各種原因被排除了，最有可能的就是魔神自己毀掉了自己親手創造出來的傀儡，毀掉了這個本應該爲他們提供資源的世界，現在，人類雖然還能夠復興，但毫無疑問，沒有魔神的幫助，又失去了巨大多數的技術，最終就算是將喪屍清理乾淨，這個世界的文明等級也將會降低。
兇手已經能夠初步斷定，接下來，就該作案動機了，神樹集團是魔神培養出來，用於對這個世界做一些小動作的傀儡，按理來說，神樹集團這個傀儡應該還是做的很不錯的，他們已經是這個世界上最龐大的勢力，全世界各個國家都要給他們很大的面子，如果魔神的最終目的是進入這個世界，那麼毫無疑問，神樹集團將是他們最大的助力，他們應該是沒有毀滅神樹集團和這個世界的動機纔對。
難道說是魔神所在的那個世界也有內訌？所以纔會導致這個世界背後的魔神的敵人，做出了毀滅神樹集團和這個世界的舉動？這倒也不是不可能，但一個已經高度發展到開始朝着平行世界擴張的世界，會有這麼大的內部矛盾嗎？至少在何平看來，若是主世界想要擴張，各個國家之間應該會提前達成協議，將內部矛盾暫時壓下來纔對。
何平看了看生物計算機，魔神相關的信息已經被刪除了，所以從生物計算機的口中也無法知道太多的東西，只能通過詢問其他信息，來進行推斷了，於是何平便繼續問道：“在病毒開始散播之前，時間段大概是一年，在這段時間裡，神樹集團的主要研究方向是什麼？”
時間段、研究方向，檢索中……”生物計算機說道：“這段時間裡，神樹集團的所有研究部門都在對神樹病毒進行研究，主要研究方向爲，祛除病毒當中的副作用。”
神樹病毒！關鍵依舊是神樹病毒！何平繼續問道：“神樹病毒的起源是什麼？爲什麼神樹集團會獲得神樹病毒並進行研究？難道說神樹病毒也是和你一樣，來源被刪除了？”
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