純血脈的巫族們見了，都心寒了，這樣下去，遲早巫族會徹底滅族的，巫族便不再參與兩者之間的大戰了，不過蚩尤和手下八十一個巫人也很難抵擋。
後來，黃帝請來龍和其它奇怪的猛獸助戰。蚩尤的兵士雖然兇猛，但是遇到黃帝的軍隊，加上這一羣猛獸，也抵擋不住，紛紛敗逃。
衝出迷黃帝帶領兵士乘勝追殺，忽然天昏地黑，濃霧迷漫，狂風大作，雷電交加，天上下起暴雨，黃帝的兵士無法繼續追趕。原來蚩尤請來了“風伯”和“雨師”來助戰。黃帝也不甘示弱，請來天上的“女魃”幫忙，驅散了風雨。一剎那之間，風止雨停，晴空萬里。蚩尤又用妖術製造了一場大霧，使黃帝的兵士迷失了方向。黃帝利用天上北斗星永遠指向北方的現象，造了一輛“指南車”，指引兵士衝出迷霧。活捉蚩尤。
經過許多次激烈的戰鬥，黃帝先後殺死了蚩尤的八十一個兄弟，並最終活捉了蚩尤。黃帝命令給蚩尤帶上枷鎖，然後處死他。因爲害怕蚩尤死後作怪，將他的頭和身子分別葬在相距遙遠的兩個地方。蚩尤戴過的枷鎖被扔在荒山上，化成了一片楓林，每一片血紅的楓葉，都是蚩尤的斑斑血跡。蚩尤死後，他勇猛的形象仍然讓人畏懼，黃帝把他的形象畫在軍旗上，用來鼓勵自己的軍隊勇敢作戰，也用來恐嚇敢於和他作對的部落。後來，黃帝受到了許多部落的支持，成爲了人族共主，而因爲是通天教主教導皇帝，故而沒有像後世一樣御女三千，只有嫫母一位妻子。
三皇之中，天皇給人族帶來了文明，地皇給人族帶來了豐裕，而人皇則給人族帶來了力量，經歷了三皇之後，人族氣運已經大漲，五帝也只是錦上添花，基本上沒有什麼功德了，衆位聖人也不再爭奪了，黃帝在位九十八年後，壽終正寢，同樣被接到了火雲洞，而通天教主也因爲皇帝獲得了不小的功德，而且截教的氣運也是大漲，蓋過了人教和闡教。
黃帝身爲三皇之末，也是五帝之首，起了一個承前啓後的作用，黃帝之後，顓頊繼位，姓姬，號高陽氏，居住河南濮陽縣一帶，相傳是黃帝的兒子昌意的後代。二十歲時，黃帝將帝位傳給了他。古書記載：“高陽氏有才子八人”，可能這是八個氏族。即位後，進行政治改革，顓頊又進行了一次重要的宗教改革。被黃帝征服的九黎族，到顓頊時，仍信奉巫教，雜拜鬼神。顓頊禁絕巫教，強令他們順從黃帝族的教化，促進了族與族之間的融合。後來，有個部落的首領共工對顓頊非常不滿。傳說他憤怒地用頭撞倒了不周山。頓時，撐着天空的柱子斜了，拴者大地的繩子斷了。於是天向西北傾斜，日月星辰移動；地在東南窪陷，江河隨之東流。顓頊在位78年，死時90多歲。顓頊子孫很多，屈原就是自稱顓頊的後裔。
而在顓頊之後，帝嚳繼位，帝嚳姓姬，號高辛，黃帝的曾孫。父親叫矮（交矮）極，顓頊是他的堂房伯父。帝嚳在位時人才濟濟，把天下治理得很好。帝嚳在位70多年。相傳帝嚳生於窮桑（西海之儐），母握裒因踏巨人足跡而生。帝嚳少小聰明好學，十二三歲便有盛名，十五而佐顓頊，封有辛地方（今河南商丘），實住帝丘（今濮陽），三十而得帝位，遷都毫邑（今河南偃師縣西南），享壽百歲。死後葬於濮陽頓丘城南臺陰野之秋山。
堯帝，姓尹祁，號放勳。因封於唐，故稱“唐堯”，由於他德高望重，人民傾心於帝堯。他嚴肅恭謹，光照四方，上下分明，能團結族人，使邦族之間團結如一家，和睦相處。堯爲人簡樸，吃粗米飯，喝野菜湯。自然得到人民的愛戴。只是堯帝在位之時，洪水滔滔，堯命鯀負責領導與組織治水工作。鯀採取‘水來土擋‘的策略治水。鯀治水失敗後由其獨子禹主持治水大任。禹接受任務後，首先就帶着尺、繩等測量工具到全國的主要山脈、河流作了一番周密的考察。
他發現龍門山口過於狹窄，難以通過汛期洪水；他還發現黃河淤積，流水不暢。於是他確立了一條與他父親的‘堵‘相反的方針，叫作‘導‘，就是疏通河道，拓寬峽口，讓洪水能更快的通過。
大禹治理黃河時有三件寶，一是河圖；二是開山斧；三是定海神針，治水期間，有不少水中妖魔鬼怪阻擋大禹，但是任何妖魔都擋不住他的決心，而大禹身邊，最大的功臣，卻是一隻渾身白色的猴子，這隻猴子雖然年紀不大，但是控水之能據說已經超過了當年的水神共工，大禹治水完成之後，赤尻馬猴白智獲得了其四成的功德，道行也是大漲，而自此，三皇五帝全都歸位，人族大興。
玉皇大帝有一個妹妹，名爲瑤姬，天庭十分的冷清，瑤姬受不了天庭的冷清，便私自下凡間，而在人間，認識了學富五車的楊天業，兩人一見鍾情，不到一年，便談婚論嫁，瑤姬也成爲了楊天佑的妻子，甚至，爲楊天佑生下了三個孩子，長子名爲楊業，次子楊戩，最小的女兒楊蓮，一家人本來過的很好，但是此事卻被玉皇大帝知道了，自己的妹妹竟然和一個凡人成親，實在是丟了仙界的臉面，
盛怒之下，玉皇大帝派出了天兵天將前往捉拿瑤姬，而遠在東海的趙紫龍卻是看向了天庭，趙紫龍自然聽過楊戩劈桃山救母的故事，而能夠救楊戩的玉鼎真人現在還是個凡人呢，不過玉皇大帝竟敢派兵干擾凡間秩序，看來這個玉皇大帝最近過的太消停點了，想着趙紫龍眼中露出一絲寒光，傳音道：“公明，你前往灌江口，那裡有一戶人家，玉帝派人干擾凡間秩序，你去將那些人拿下，丟到南天門門口吧。”趙公明聽了，點點頭，道：“弟子遵命。”隨即趙公明便離開了。。。