2079年7月3日上午7點鐘，日本列島以東約1000公里外的太平洋 。
天氣陰沉，風浪頗大，四周暮靄沉沉，天氣和海況非常不適合飛行和航行。但這片洋麪上正在航行是地球聯邦駐北太平洋的第七特遣艦隊。
自從地球聯邦建立之後，各國的軍事力量經過合併大幅削減，全世界的海陸空軍數量已經很少了。這個第七特遣艦隊隸屬於太平洋艦隊，總共有7艘戰艦，有一艘大型航空母艦，排水量6萬噸，有40架艦載無人戰機，一艘小型核子動力無人潛艇，一艘滿載數百名武裝機器人的萬噸級兩棲登陸艦，此外還有四艘快速瀕海無人戰艦，排水量2500噸。因爲都是無人操作和機器人武裝，基本上只需要很少的軍官操作。
幾公里外，一架灰色的小型飛行器正高速接近艦隊，航空母艦的通訊聯絡顯示，這是從北美地區飛來的cobra特別行動小組。
雖然風浪不小，但是飛行器很快就穩穩的降落在母艦的甲板上，打開降落板，李隊長爲首的cobra小組一個個的走下來，迎着北太平的強風，一名機器人軍官跑過來迎接他們，指引他們去母艦的指揮台。
指揮官是一名少將，約莫40出頭，這年頭當兵的人不多了，薪水啥的也不高。少將給cobra小組介紹了情況。他說：“東京成田核電站旁邊的部隊早些時候報道，核電站已經被不明身份的分子佔據了，他們試圖突破進去，但是他們後來卻沒有了迴音。”
李隊長問：“衛星圖像呢？”
少將搖搖頭，說：“衛星在經過東京地區時候就失靈，好像被激光武器照射了似的。我們派出了無人偵察機，也沒有迴音，可能是被擊落了。”
李隊長問：“您的計劃是？”
少將說：“請看地圖，成田核電站就在東京灣幾公里之外，我們艦隊將航行到東京灣，可以動用武力恢復秩序。”
李隊長點點頭：“眼下只能這樣了，您知道敵人是誰麼？我收到的訊息說是黑暗軍團。”
少將冷冷的說：“我還不清楚是誰，不管是誰，我們此行都是要驅逐他們。”看起來少將對於敵人是誰並不關心。少將繼續說：“我們還有3-4個小時就可以到了。你的小組跟我們一起前往，不能單獨行動。”
李隊長心裡還是感覺到此行暗藏的危險性，直覺告訴他並不會輕鬆。
艾達跟羅斯、伯克、奧伯萊恩還在看着窗外的大海聊天，他們也很少做軍艦出海的經驗。
李隊長想起當時進攻幽靈城的情況，幽靈們會不會故伎重演呢？很難說。
伯克過來問：“真不知道他們要佔領核電站做什麼？”
艾達說：“可能是用來發電？”
奧伯萊恩說：“我看製造恐慌還差不多。”
羅斯則說：“製造**吧！裡面有很多核廢料呢！”
李隊長沒有說話，他自己在想，他對於這些幽靈們瞭解的很多，但是又覺得自己知道的太少。這個系統裡隱藏的秘密恐怕自己一輩子都不知曉。
大約過了一個小時，風浪漸漸的停了下來，陽光撥開厚厚的雲層，直射到大海的海面上，閃閃發亮。隊員們都站在甲板上享受着海風的洗禮，就好像這次是出遊一樣，而不是軍事行動。
李隊長眯縫着眼，躺在一邊，看着其他人。在這個時候，突然他的戒指發出了亮光，他自己一驚。他感覺有什麼東西正在附近某個地方。是什麼？他猛然想到容克博士說的，他可以感應到另外一個李隊長。難道是他在附近了？！
李隊長趕緊通知其他的組員，並告知了少將，敵人可能就在周圍。
少將下令進行雷達的搜索，但是一無所獲，什麼都沒有發現。那種感覺卻一直在李隊長身上揮之不去，他有點惴惴不安起來，他內心裡就害怕另外一個自己。自從幽靈城見過一面之後，他就覺得這一切非常的不對勁，他的生活從此換了個天地，原先爲之奮鬥的事業也沒有下文。從2080年來到2079年另外一個世界，這樣大的轉變一時半會兒也不好接受。他甚至懷疑這是個幻覺，不是真的。系統的存亡真的跟他有莫大的關係麼？上帝從哪裡而來呢？他的疑問不減反增。
戒指的亮光漸漸黯淡了下來，李隊長長噓一口氣，他走了。大家也鬆了口氣。面對這樣的對手，不是身體的勞累，而是心理上壓力帶來的精神憔悴。
又航行了一段時間，到了10點鐘，地圖上顯示，特遣艦隊已經到了離東京灣十多公里的地方，前方甚至都可以看得到東京的高層建築羣。
少將命令飛行部隊起飛，甲板上的無人戰機紛紛向成田核電站飛去，在上午的陽光下就如同一羣鳥兒一樣慢慢的消失在空中。
幾分鐘的功夫，前方飛機彙報，成田核電站周圍發現了快速反應部隊的武器，但是沒有一個人，就好像蒸發了一樣。裝甲車、汽車都廢棄在路邊，沒有戰鬥過的跡象。核輻射情況稍微超標，但是仍在安全範圍之內。
飛機掠過了核電站上空，表面來看，也沒有什麼特別的情況。
少將獲得彙報後，嚴肅的臉鬆了下來，說：“請李隊長的小組和我們的兩棲登陸部隊上岸吧！祝你們順利！”
兩棲登陸艦靠岸後，放下了入口板，幾百名武裝機器人和裝備很快就登陸上岸，非常訓練有素的一隻部隊，沒有喧譁聲，機器人和車輛都按照順序登陸。
李隊長的飛行器也起飛了，低空飛過部隊上空。組員們顯得有點失望，原以爲是一場激烈的進攻，結果好像什麼事情都沒有一樣。艾達嘟着嘴表示很無趣。
無人機部隊還在附近上空盤旋，正在等待部隊進入核電站區域。
Cobra小組從飛行器上面下來，然後跟着登陸部隊，呈扇形的向目標區域接近。
經過一大堆快速反應部隊留下的裝備時，機器人上前檢查，李隊長也去看什麼情況。機器人報告，這些裝備都受過能量的強劑量輻射。但是按照編制，應該還有不少的機器人士兵失蹤了。
Cobra小組繼續前進，艾達還在抱怨敵人逃跑了，真是沒意思。羅斯嚼着口香糖，對這些事情也覺得無趣。
一路上非常的順利，但是爲了保險還是慢慢前進，機器人部隊報告，核電站門戶大開，沒有發現核泄漏跡象。但是等到進入到裡面的時候，卻驚人的發現，裡面的核原料都不見了！難道他們是來偷原料？！大家都感到震驚，從沒有人來偷這個東西，太危險了吧。
李隊長將現場情況回報給航母上的少將。少將說，他們也接到了能源局的報告，說是其他的幾個核電站都出現了原料被盜的情況。少將說，能源局認爲，這次攻擊可能就是以奪取核原料爲目的，而且核原料的生產基地也遭到了同樣的遭遇。關於現場快速反應部隊的殘留情況，少將說，他徵求過MAX公司的容克博士，他後說應該是能量輻射的緣故，敵人使用了大量的能量進行輻射，就會導致瞬間的空間錯位。
部隊接到命令，一部分留守接管核電站，一部分開始返回特遣艦隊，cobra小組看來也得回去了。
李隊長看着這空蕩蕩的核電站，摸了摸頭說：“看來，我們這次是撲了個空。”他想起幽靈城的事情，心裡還是不甘心的。他想知道另外一個自己老是跟自己捉迷藏的目的。
伯克也不解的說：“這羣傢伙要核原料是幹嘛？難道自己要建電站！？”
奧伯萊恩說：“有可能吧，不是說他們非常需要能量的麼？”
李隊長點點頭：“黑暗軍團要捲土重來，能量的補給非常重要。這種可能性非常大。”
艾達搖了搖腦袋：“哎，無聊了，跑了半個地球，就是這個結果？”
羅斯說：“那些快速反應部隊的殘餘裝備作何解釋？”
李隊長說：“容克博士說，可能是大量能量導致的空間錯位。我在破碎虛空也見過能量極大的情況下也會導致時間的變慢和終止。看來我能回到2079年，也是這個緣故吧。”
這時候，安全局又打來一個通信電話，說是又出其他的問題了，讓他們趕緊回去。