另一個大難題是現在大明已經生產出超過八十萬枝靖康論和大大小小上萬門火炮，要是一下子邁入到新武器時代，這些武器如何處理，這些可都是錢啊。雖然大明不差錢，但是也不能這麼敗家呀。
劉浩然只好想了想。斟酌了又斟酌。經過幾天的思量和與樞密院等軍方大佬的商議，劉浩然於明歷九年六月十日宣佈，北京、和林、遼陽三衛戍區三十萬常備陸軍在兩年內退伍，他們將被安置在東北地區，在那裡安家立業。
這是由於漠南漠北地區的保甲制度已經完善，加上東北諸族近四十萬人口遷居漠北，並在那裡安居下來，漠北漠南的形勢已經穩定，不需要那麼多的兵力。而這三十萬常備陸軍大部分都是北伐時期入伍的，甚真還有部分將士是在安定江南時期入伍的，算下來也有近二十年了，也該讓他們退伍了。
但是這次大規模退伍引起激烈爭辯是由於劉浩然允許這三十萬退伍軍人帶着發給他們的靖康乙式滑膛槍回到地方。三十萬枝可以稱之爲兇器的滑膛槍現在全部掌握在已經轉爲百姓的人裡，這讓許多保守派想不通。
劉浩然開口說話了：“有滑膛槍又如何？難道嚴格控制住了滑膛槍就能防止百姓造反？當年暴元統治，百姓們民不聊生，連把菜刀都不齊全，還不是揭竿而起。將其驅逐。光是捆住百姓的手腳，堵住百姓的嘴巴，卻不給他們一口飯吃，是阻止不了他們造反的。所以我們不要花心思在防止百姓造反，而是要花心思在讓車姓們不造反。關鍵是收住他們的心。”
在劉浩然心裡，這些經歷了數年乃至十幾年戰火錘鍊的士兵們在忠誠度是母庸置疑的，而且東北地區雖然遷移走了近四十萬人口，但是依然還有數十萬人口甚至上百萬人口，這裡面肯定有不少躲在山林裡不服“王化者”爲了徹底消化這一地區，劉浩然和樞密院、內閣特意制定了這些屯墾計劃，以三十萬退伍軍人爲主力，全力佔據東北的區，他們雖然會每戶每人分到大片土地，但是一定會集中居住，到時憑藉他們良好的軍事素質和手裡的槍。肯定能逐步逼退那些“不服王化”的傢伙。
同時劉浩然與樞密院、陸軍部商議，靖康戊式步槍裝備一批，淘汰下來的靖康乙式步槍就轉而裝備守備部隊，到後來，大明陸軍常備部隊主力裝備靖康戊式步槍。守備部隊主力裝備靖康乙式步槍。依然現在大明軍工企業的生產能力。估計三到四隻間可以換裝完畢。
忙完這些，劉浩然又馬不停蹄地趕到機械研究所，關注他一向非常重視的蒸汽機研航經過近十年的研究，劉浩然發現自己進入兩個誤區，第一個誤區那就是蒸汽機沒有橡膠密封就不行，實際上機加工精度對蒸汽機更爲重要，密封可以在高精密度機加工出來的閥門輔以其它密封墊也可以達到實用效果；第二個誤區就是劉浩然一直以爲蒸汽機是靠蒸汽推動活塞而產生動力，實際上當大明機械研究所根據劉浩然的指導進行研製時，第一部蒸汽機實際上是“真空蒸汽機”
先將氣缸裡的活塞提升至氣缸頂部，蒸汽迅速進入活塞下部的汽缸中，關閉進汽閥，由於蒸汽在鐵製氣缸內壁冷凝，造成部分真空，活塞上的大氣壓就會迫使活塞向下運動。機械研究所根據蒸汽機這一特點，。向汽缸外壁中噴入冷水使蒸汽更加迅速和大量冷凝形成更有力的真空,而活塞上面的大氣壓力也更大，再採用高精密度加工，加以高精密度鋼密封圈和石棉密封墊，提高了缸體和活塞密封性，使得真空蒸汽機可以實用。
機械研究所將這種“真空蒸汽鬆，應用在深井吸水，他們在活塞連接一個大扛杆的一端。另一端連接一個配重和抽水汞。開始的時候，配重由於自身重量，通過扛杆將活塞提升，這時打開進氣閥，放入蒸汽，當活塞到達氣缸頂部時關閉進氣閥，向氣缸外部注入冷水，蒸汽冷凝，形成真空，大氣壓使得活塞向下運動，由於枉杆原理，配重和抽水汞被向上拉。機械研究所的研究員發現，只要蒸汽機氣缸面積比抽水泵大，就能抽起數十米深的水。
當劉浩然看到這種真空蒸汽機抽水機時不由目瞪口呆，真是盡信書不如無書，要是大明機械研究所的研究員真要是按照自己的指點去研究蒸汽推動的蒸汽機，不知還要研製到何時？
這種真空蒸汽機被命名爲明五式蒸汽機，並開始應用在蝶礦和鐵礦的排水上。不過它的熱效率非常低，而且體積龐大，想改立式爲臥式非常麻煩。大明機械研究所在明五式蒸汽機的基礎上開始研究更新式的蒸汽機。
先研究所增加了一個冷凝室和平衡閥，平衡閥就是使活塞處於上下平衡，活塞由扛杆另一端的配重拉昇到頂部後，平衡閥關閉而進汽閥打開，將蒸汽引入汽缸上端，同時排汽閥開啓使活塞下汽缸部分和凝汽器接通而形成真空，活塞受壓下降，從而拉起提水乘的拉桿。活塞被壓到下端後關閉進汽閥和排汽閥，同時打開平衡閥連通汽缸的上下端，配重遂再次拉起活塞。如此循環作功提水。爲了從凝汽器中抽除凝結水和空氣，研究員還設計了由扛杆帶動的抽氣汞，同時他們還在汽缸外壁加裝夾層，用蒸汽加熱汽缸壁，以減少冷凝損失。這種新式蒸汽機被稱之爲明六式蒸汽機。
到了明歷八年，機械研究所對明六式蒸汽機又做出了改進，第一是在活寒工作行程的中途關閉進汽閥，使蒸汽膨脹作功以提高熱效率；第二是使蒸汽在活塞兩面前作功（雙作用式）以提高輸出功率。由於活塞既要向下拉動扛杆又要向上推動扛杆，因此機械妹究所得研究員們便發明了平行四邊形扛杆，並在劉浩然的指點下發明瞭曲柄滑塊機構，從而可以帶動飛輪，使得活塞的往復運動轉換爲主軸的旋轉運動。這種蒸汽機被稱爲明八式蒸汽機。
機械研究所的研究員們再接再厲，他們開始嘗試將蒸汽機從立式改爲臥式。在劉浩然的指點下，他們發明了十字聯動機構，十字聯動機構分爲十字頭和十字導軌。活塞的推杆連在十字頭的一面，在十字頭的另一面則連接一個環銷連接的連桿。活塞推杆推動十字頭在十字導軌上做前後運動，而十字頭又來回地拉動連桿，連桿一端也是環銷連接在一個飛輪的偏心處。
當十字頭被來回拉動時，連桿拉動飛輪轉動，由於環銷連接是可以轉動的，因此十字頭的來回直線運動便轉爲飛輪的旋轉運動了。這一點跟蒸汽火車非常相似。
更重要的發明是在劉浩然的指點下，研究員終於改平型閥門爲柱塞式閥門。閥門是蒸汽進入汽缸的咽悄。通過汽閥的汽量決定蒸汽機的功率。因此，閥式和性能影響着萎消機的轉速、功率和減塞黨附川實際上是一種滑閥，與活塞氣缸運動類似，它受壓對稱，又裝有石棉樹脂等混合物組成的耐高溫活塞環，故磨損密封性好。更重要的是柱塞式滑閥可以通過曲柄扛杆與十字頭連接，從而達到柱塞式滑閥與活塞運動聯動同步。如活塞向前，推杆向前推，十字頭向前運動，通過曲柄扛杆使的柱塞式滑閥向後運動，關閉後閥門，打開前閥門，蒸汽進入氣缸的前部分。推動氣缸停止向前運動，改爲向後運動。活塞向後運動，推杆也向後，十字頭隨之向後運動，通過曲柄權杆拉動柱塞式滑閥向前運動。關閉前閥門，打開後閥門，使得蒸汽進入氣缸後部分，推動活塞又向前運動，如此反覆。
此外。機械研究所的研究員們對蒸汽機的動力提供所一鍋爐也進行了改進和完善。他們最先研製出了火管鍋爐，它由一個被很多管子穿過的水箱組成。由煤或木柴燒熱所得的熱氣體從這些管子中通過加熱水箱中的水,從而使得水箱裡的水被加熱成蒸汽，但是在火管鍋爐中，整個水箱都處於高壓之下，因此一旦水箱破裂將造成大爆炸，非常危險。
劉浩然根據自己用過的燃氣熱水器的原理。指導這些研究員們逆向思維，研製出水管鍋爐，在這種鍋爐中。一排管子位油火加熱的氣體中，而水從這些管子中流過，而且管子儘量做得扁平，增大與被加熱氣體的表面接觸。以達到盡最大可能從燃燒的燃料中吸取熱量，從而提高
雖然在蒸汽方面取得重大的突破，但是還有很多東西需要改進，如氣缸與活塞的配合、活塞潤滑、氣缸外部的保溫、滑閥配汽機構、調速機構、密封性、提高熱效率等方面，還需要進行完善和改進，這樣才能達到實用效果。製造出可以用於仿織、治煉、機器製造、採礦和運輸等方面的動力機器，但是這種改進和完善又需要大明機械製造工藝和材料工藝的提高。只有大明機械製造工藝越嫺熟、加工精度越高、材料越完善，蒸汽機的效率、實用性、穩定性就越高，從而達到實用價值。
這些都是急不來的，劉浩然估計還得有個三五年，研究所的最新式蒸汽機纔可能投入實用。
在接下來的時間裡，劉浩然開始考慮如何將大明兵器研究所進行分拆，提高效率。過去研製的東西不多，所以合成一個研究所沒有什麼問題，但是隨着大明武器技術水平越來越高。以前大而全的架構已經不適用了，必須走專而精的道路，讓研究員專心於某一項專長，這樣使得他們的效率更高。而且當發展到一定程度，還可以引入競爭機制，鞭策他們充分發揮創新精神和想象力，研製出更好更新的武器。
七月初五。劉浩然發佈命令，將大明兵器研究所分拆。趙氏研究所，專門研究槍支，重點在前端閉鎖旋轉後拉槍機方面；潘氏研究所，專門研究槍支。重點是左輪和下落閉鎖和後擊錘式槍機方面；範氏研究所，專門研究槍支，重點在於後端閉鎖的旋轉後拉式槍機，當初大明後裝銅殼步槍有兩種備選，一是零九式，二是後端閉鎖旋轉後拉式的範式步槍，範式步槍射速比零九式要略高（一旦裝配了彈匣，區別更大）。但是現在大明的材質和工藝不夠完美，炸膛的概率還是有的，而一旦炸膛，前端閉鎖情況下士兵較大可能受傷，較小可能死亡，後端閉鎖情況下士兵較大可能死亡，較小可能受傷，所以大明陸軍最後還是選擇了前端閉鎖的零九式。
這些研究所都是專門研究槍尖，只是他們各自的設計理念不同，所以走的路也不同，劉浩然乾脆將他們全部分拆開來。各自專注於各自的特長，免得在一個研究所被埋沒。
杜氏研究所，專門研究火炮，重點是前裝線膛炮；安氏研究所，專門研究火炮。重點是楔式炮閂類型的後裝線膛炮。槽式炮閂分爲立楔式或橫楔式兩種。即在炮尾中作垂直滑動或水平滑動。立楔式炮閂通常能爲裝填作業提供更大的活動範圍，因爲它活動的平面影響裝填的機會比較少。另一方面，橫楔式炮閂只需要較小的操作力，而且不管身管高度如何所需要的操作力都是一樣的。楔式炮閂的主要優點是結構簡單，使用安全。操作容易而迅速，適用於中小口徑和射速高的火炮。
巴氏研究所，專門研究火炮，重點在螺式炮閂類型後裝線膛炮。當初巴洛陽根據螺母、螺栓啓發提出螺式炮閂，螺式閂體裝在固定在炮尾一側的鎖扉上，可以在開、關閂時自由迴轉。鎖扉是固定在炮尾右側的；但是需要時，它也可以固定在能在裝填作業時進行上下轉動的地方。關閂時，閂體上的螺紋與炮尾內表面上相應的螺紋相咄合。巴洛陽甚至還提出了“斷隔”螺紋或“開槽。螺紋概念。螺式炮閂的優點在於。其重量要輕得多，原因是在發射時火炮氣體產生的縱向應力分佈在所有螺紋上。
螺式炮閂的另一個主要優點是，緊塞裝置是這種炮閂的一個組成部分，使火炮不再需要藥筒了，可以直接進行推進藥和彈體分開放置，適用於大口徑火炮。缺點其一是由於比較複雜。因此難以製造，螺式炮閂螺紋的螺距必須保證產生足夠的摩擦力，以防止閂體在火炮射擊過程中轉動或打開。對大明機加工來說是一種考驗；其二是操作緩慢，尤其是還沒有發明一壓閂柄就能使螺式閂體解脫和打開的傳動裝置，裝填彈藥所需的時間就更長了。
巴式火炮在當前無法使用，但是劉浩然敏銳的發現，安將是此後重炮的發展趨勢。於是便被分離出來。
塗氏研究所，專門研究火炮，重點走向炮和迫擊炮。
劉氏研究所，專門研究手榴彈和銅殼底火式炮彈。
丁氏研究所，專門研究銅殼子彈，即丁氏底火子彈。
伍氏研究所，專門研究彈道學。
劉浩然還順手將機械研究所、冶煉研究所和化學研究所也給分拆。第一機械研究所，專門負責大型機牀的研究；第二機械研究所，專門負責大明現在急需的精密加工機牀的研究；第三機械研究所，專門負責蒸汽機以及衍生品的研究；第四機械研究所，專門研究精密機械加工，如鐘錶、齒輪等；第五機械研究所，專門研究切削加工所需的合金刀具；第一冶煉研究所，專門負責鋼和鐵冶煉技術的研究；第二冶煉研究所，專門負責銅、鋅等金屬的冶煉行究；第三冶煉研究所，專門負責金銀等貴金屬的冶煉研究；第一化工研究所，負責基礎化學研究；第二化工研究所，負責軍用化工研究