原來，當初盤古劈開混沌之時，混沌當中有一清一濁兩團氣流外泄，後鴻鈞道人強行捕獲。在雙方爭鬥中，濁氣化作一頭強悍兇獸，鴻鈞道人稱作混沌獸。而那一團清氣則被鴻鈞道人收取。
後來，鴻鈞道人將混沌獸封印於一座山峰之中，並且設下重重結界，十萬靈都不得靠近。可不曾料到的是，就在鴻鈞道人封印之際，混沌兇獸將幻化前所剩的最後一絲濁氣，強行注入到了那一股清氣當中。
封印完兇獸混沌之後，鴻鈞道人擔心那股清氣會徹底被這一絲濁氣給侵蝕，就想運用自己的力量，徹底從那團清氣當中剔除那一絲濁氣。
然而，出乎鴻鈞道人意料的是，僅憑他一己之力，無論如何也無法從那一股清氣之中徹底清除濁氣。
於是，他便馬不停蹄地將這團清氣帶回天外天，交給了天外神帝與太聖天尊。
結果，太聖天尊、天外神帝三位大神合力，方纔將這團清氣給分離開來。可是被分割開來的清氣，卻感染上了天外至尊之神的靈氣，從而化而爲靈，便成了太上、原始和靈寶如今這三種形態。
太上與元始這兩尊靈體，至純至淨，全無雜質，可是那一絲濁氣，已經融入到了最後分離出來的那一團清氣當中，並且那一團清氣也已經化成了靈寶天尊而且也已經有了意識和靈體，而那一絲濁氣也侵蝕到了靈寶天尊的神魂，若是繼續任其發展下去，這一生毒氣就會徹底侵蝕清氣，最終轉化爲魔氣，那後果將會不堪設想。現在，即使太聖提天尊他們神魂俱散，也無法徹底消滅那一絲濁氣，即使把最後那一團清氣也給消滅了，那一團濁氣也不會，反而會去吸收天外天的靈氣，從而變得越來越強大。
所以唯一的辦法就是，將其封印於體內，等到將來再歷一場殺伐大劫，就可徹底除去除去那一絲濁氣。
之後，這三清便跟着鴻鈞道人，並做了他的徒弟，而且在天外天世界，吸收了大量能力。
因爲三清的靈體是由乾坤清氣淨化而來，故而他們的體質也是非同一般。他們只用了數十萬年時間，便使自己身體所能吸收的人氣達到飽和，並且全部轉化爲神力。
青龍神君他們到達天外天之時，這三清正是在天外天各處吸收着靈氣，所以也就沒有遇上，而當時的太上天尊，也沒有跟他們講起這件事情，所以青龍神君他們自然也是不知道的。
然而現在，因爲有玄武神君在場，這些經歷自然是帶過不提，他只說是三清體質特殊，沒過多久，便擁有了超強神力。
至於三清用了數十萬年修煉神力的事情，也是後來鴻鈞道人告訴給他們的。
聽完了鴻鈞道人的講述，衆神也方纔明白這三清的具體來歷。
朱雀玄女說道：“如此看來，我之前叫你老祖，確實一點兒都不爲過，結果你還那般謙虛，真乃我等學習之楷模。”
鴻鈞道人言道：“萬不可如此說，如今他們能有此成果，也分我一力之功，所以也不必如此擡舉於我。其實此事最大功勞，非太聖天尊和神帝莫屬。”
青龍神君說道：“可他們畢竟去不了地球，而你剛纔也說過，你與三清必定會常駐地球，故而你領下這功勞又何妨？再者說，你們皆是天外天生靈，卻又都是那裡最高神靈，你替他們領了這功勞，他們也不會有失身份，他們也必定不會怪罪於你。”
鴻鈞道人言道：“如此看來，我是逃不掉了。臨來之時，太聖天尊和神帝都曾與我說過，說是爾等要將三清之功歸於我身，當時我還百般推辭，當他們把緣由講於我聽時，我的心中仍是不願。如今看來，我是難以推辭了。如此，我便代替天尊和神帝，再次愧領新功了。”
女媧說道：“什麼愧領不愧領，如今你們也都是我們這裡的創世神之一，既然他們有不得已的理由，獲取功勞，那麼就將這些功勞歸於於你身，又有何不可。再說，以你之人，領受這些功勞，也都是理所應當，並沒有什麼過處。”
鴻鈞道人：“既然如此說，那我也就不再矯情，便領了這些功勞。不過，不管怎麼說，我都得感謝你們擡愛，瞧得起我，讓我有機會成爲新世界的創世之神。既是如此，之前我便說過，如若你們所需，我定會竭盡全力幫助於你們。接下來，我所要做的第一件事，便是與你們一道創建神界，而後再創建四片大陸和其餘五界。”
說幹就幹，接下來的十多萬年裡，他們便開始創建起了四片大陸與六界。
一切都已建設完成，他們又花了兩萬年時間，將資產創造出來的所有森林，進行分類安置。
首先安置的就是神界生靈，神界的人包括神和仙兩個體系。且皆爲混居，神與仙所居之所並無區別，只是只論神位與仙位高低罷了。
神界天宮，共分九十九重，三百九十六層。第一重天宮共有有三萬六千五百座神仙府邸，每往上一重天宮便會少三百六十五座神仙府邸，又因爲每一重天宮都有一座主事大殿，所以到了九十九重天，就只剩下了六百三十座神仙府邸。每一重天宮，便是一重天，故而天上一共有九十九重天宮。
這九十九重天宮分上三十三重天、中三十三重天與下三十三重天。下三十三天則叫做上清真境，中三十三天則稱爲玉清聖境，上三十三天則名爲太清境。又稱作上清天，玉清天和太清天，或者是，上清境，欲清境和太清境。
而這九十九重天的命名來源，皆是因爲三清，而且在創建這九十九重天之時，除了青龍神君、青龍玄女與朱雀玄女，就數他們功勞最大，就算是鴻鈞道人也都遠不及他們，故而以他們三清名號命名。
三清所居之所，第九十九重天，分別是上清重華宮，玉清乾元宮和太清兜率宮。
作爲創世神的另外幾位大神，同樣是住在九十九重天，青龍神君住在至尊神龍宮，朱雀玄女住在至尊靈玉宮，青龍玄女則住在至尊女媧宮，白矖與騰蛇隨其居住於至尊女媧宮，玄武神君居於上尊玄武宮，鴻鈞道人則居於至尊紫霄宮。
而創建的地下地下宮殿，也稱之爲黃泉，或是地府。其中有幽冥地府、陰曹地府、鬼王宮、閻羅殿等等三萬六千五百座地府宮殿，每座宮殿皆有無間地獄、阿鼻地獄、酆都地獄、幽冥地獄等大地獄三十六重，每重大地獄之下又有小地獄七十二個。還有若水河畔奈何橋、輪迴隧道、彼岸花等物無窮無盡。
水下宮殿唯有水晶宮一座，內有大小宮殿七千二百座。
最後便是下神地仙府邸，各山山神、各方土地，以及地府城隍所居之所。
而餘下五界便是人界、鬼界、精靈界、妖界與魔界。而人神鬼，這三種生靈皆爲人，故而人界之人又稱凡人，所以這人界又叫凡人界、凡間、人間。
鬼界之生靈皆歸於地府宮殿。
天地六界，每一界都有主宰，每一界主宰和頭領皆可稱之爲皇、帝、王、君等等。
青龍神靈他們將五界生靈，平均至於四片大陸，那麼這每片大陸上的五界，自然也就都有他們的統治者。
這四片大陸分別是：東方神州大陸，屬青龍神君管轄，西方日不落大陸，屬女媧管轄，南方九州大陸，屬朱雀玄女管轄，北方扶桑大陸，結束玄武神軍管轄，在這每片大陸之上，又分分東南，西北四方，如此繼續往下分，直至無窮無盡，難以再分。
起先，太聖天尊原本告訴他們，他會另外派其他生靈，去地球西邊創建生靈，卻因爲黑龍封印突然鬆動，天外天所有高等生靈，都要重新加固封印，故而無人可派。太聖天尊與天外神帝這才讓鴻鈞道人帶着三清，前來協助於青龍神君他們。
至此以後，這三清自然也成了創世神之一，從而進入到了創世神的行列。
他們先是從每片大陸上的五界中，選出統治者，然後教他們生活生存技能，再讓這些統治者，回去傳授於下面的生靈。
傳授完以後，這四方守護神、鴻鈞道人、三清、白矖、騰蛇等創世大神皆迴歸神界。
然而在神界，也必須有一個領導來掌管，因爲神界需要掌管其餘五界和四片大陸，而作爲神界之主，必須要統管六屆所有生靈，維持六界與四片大陸之平衡，而在這天地間，所有生靈都由神界掌管者來做主，故而這神界之主，又稱之爲天地共主，天地共主，掌管六界生靈的生死存亡，管控六界興亡盛衰，是這天地間權力至高之神。只因中三十三天與上三十三天，還未有神仙，故而主神殿便設在了，下三十三天的第三十三重天——上清真境大羅天。
而這首任天地共主，便由造出高等生靈的青龍玄女，也就是女媧來坐，而這也是衆望所歸之事，也就無人反對。
女媧坐上天地共主，便開始封神封仙，立下天規天條。使天地六界與四塊大陸，都能井然有序的向前發展，天下所有生靈，都能安安穩穩的生活，和諧平等共處。