木葉邊境的海域內，漂泊着六艘巨大的航空母艦，這些航空母艦奇形怪狀雕鏤着各種人臉，靜靜的停息在這片海域之上，而母艦上一羣空之忍者整裝待命着。
距離海域不遠的密林中，率先出動的迎擊四人小隊卡卡西、佐井、志乃在智囊鹿丸的指揮下緊鑼密鼓地進行反擊，雖然人數面對數千上萬的空忍實在是螳臂當車，但在鹿丸的謀劃下木葉的這點不足反而被充分避過，而四人小隊成員的優勢卻被大大的發揮。
首先便是第七班新出場的佐井出戰，利用空忍的輕視，吸引敵人注意力的同時殲滅空忍派出的幾隻先遣部隊，之後鹿丸用影子束縛術幹掉臨近海岸的空忍，正當航空母艦上的空忍補給完畢準備再次空襲木葉村時，航空母艦卻是紛紛坍陷並爆炸，原來志乃cao控着蟲子趁着空忍注意力被鹿丸等人吸引的間隙，吞噬了航空母艦的動力系統從而引起母艦爆炸損毀，而因爲事發突然，空忍來不及逃命便被全殲...
而另一邊木葉村外，一片熱帶雨林之中，三條樹幹做成的小舟載着昨日結成小隊的葉清、小月、小櫻，雛田、鳴人以及鳴人在空忍來襲當天遇到的神農、雨硫“師徒”共七人，由於比原著中多了葉清和小月，是以小月便和雛田小櫻劃一條，而葉清很不幸的跟鳴人和充作嚮導的雨硫在一條小舟上，而白鬍子帶着深紫色頭巾的神農則單獨划着一條小舟緩緩地行駛在亞驢遜河上，向着木葉邊境方向潛進。
一路上由於鳴人的尿性，在小舟上如同原著般和雨硫激烈的辯爭，而同在一條舟上的葉清攔都攔不住，便懶得再搭理這兩個傢伙，斜斜的躺在舢板上，葉清將目光投向劃在最前面的神農身上，“這傢伙纔是整個【羈絆】劇情裡最終的BOSS好吧，看着慈眉善目一副救死扶傷的醫生模樣，還真讓人想不到其真面目。話說原著裡這傢伙自稱是爲了啥暗黑CKL激活狗屁零尾，從而達到毀滅木葉報仇的目的——真特麼的費勁，有那航天母艦以及會飛的城堡的技術還搞不死明顯技術落一個文明的木葉？真爲這傢伙的智商捉急。不過話說回來，這老頭馬上就要‘死’了吧，呵呵，爲了不那麼浪費篇章，哥就讓你徹底的死掉吧！”，葉清暗自忖道。
忽然，前方的神農停下動作，揮手示意大傢伙有情況，而雛田早在神農發現異常前打開白眼觀測四周後說道：“上空500米處有一個散發CKL的飛行風箏，和襲擊木葉的東西一模一樣！”，“納尼！這可不太妙，大家趕緊劃到樹蔭下去！”，此時的神農尚未暴露，裝的挺像那麼一回事。
“嘩啦”，河流上的三隻小舟各自藏到了樹蔭下，由於葉清在上船之前特意將小舟貼着河岸線，所以很容易的便把小舟帶進樹蔭裡，倒是抹殺掉了鳴人的一場豔’遇，不一會，葉清清楚的感知到上空一隻鳥人盤旋在上空，良久才掉頭似乎是並沒有發現異常，但葉清知道其實他們的行蹤早就暴露，只不過神農爲了他的詭計從而隱忍不發。好吧，就讓你忍個夠，哥待會就給你個痛快的！
很快，船到了盡頭，神農急於表現其內心的“真善美”，cao着一把柴刀就一馬當先的走在荊棘叢生的熱帶雨林中，爲身後衆人砍出一條小路。葉清倒是無所謂的聳聳肩悠哉遊哉的跟在神農身後，偶爾在神農太辛苦的時候上前“扶”了神農一把，一個紫黑色的空間術式悄無聲音的出現在神農身上繼而隱去，原本只是葉清圖省事方便宰了神農的舉動，倒是讓不知情的神農誇讚不已，說木葉忍者果然頗有俠義之風，這讓葉清老臉一紅，心說如果你個老東西知道事實真相恐怕就要破口大罵了吧！
不一會，幾人穿過叢叢的雨林，來到雨硫的村子前，卻赫然發現村子似乎剛被襲擊，房屋四處蔓着戰火，硝煙滾滾，這讓一向愛護村子爲己任的雨硫大吃一驚，她不顧被大火吞沒的危險急匆匆的跑進一處正熊熊大火的樓臺，想找到一些倖存的村民但她失敗了，畢竟演戲就演全套，小月小櫻鳴人雛田四人見狀也是四下裡尋找倖存者，而葉清則是遠遠地冷眼旁觀着這一切陽謀的締造者-神農的動作。
果然茫茫大火中，心急的雨硫不小心絆倒了一處機關，“嗖嗖”“嗖嗖”，數百枚苦無射向毫無防備的雨硫，“雨硫，小心！”，慈眉長者模樣的神農刷的出現，將嚇呆的雨硫推開，而他自己則是被飛來的十幾枚苦無擊中。
“啊——神農老....老師！！”，從苦無下逃出生天的雨硫看到渾身上下插着苦無的神農，不由得尖叫一聲，爬過去抱住神農。神農裝模作樣的痛苦萬分一番，纔在雨硫千呼萬喚中睜開彌留的眼睛，看着眼前的雨硫道：“沒想到呢，我會爲了救你而拼上老命。”“爲...爲什麼...”“因爲...你是我的...得意門生啊”，神農假模假樣的咳嗽幾聲吐出幾口鮮血，在雨硫感動哭泣的目光中緩緩地解下自己的頭巾放到雨硫手中道：“接下來就交給你了...和大家齊心協力...找到遺蹟並把村民們救出來.....”，接着又是一陣shen吟，神農的臉上浮現出死人的灰，很快在聞訊趕過來的小櫻搶救下死掉了...
偌大的村子，除了熊熊的火焰燃燒木頭的噼裡啪啦聲響，就只剩下雨硫嚎啕大哭，“神農老師——”，但衆所周知，你並不能指望一心裝死的人被你救活過來，所以在悲傷過後雨硫還是在木葉鳴人等人的幫助下爲神農做了一個墳，獨自躲起來黯然神傷一陣，鳴人小櫻小月雛田幾人卻是散開來搜尋所謂的遺蹟........
許久之後，日暮西山後，夜晚來臨。原本聳立的神農墳頭上面的泥土忽然一陣抖動，繼而塌陷進去，早就守候在一旁的葉清心道：“來了”，默默的感知着留在神農身上的空間術式，葉清兩手搓出一個嗡嗡作響的風遁核聚變手裡劍，繼而“啵”的消失不見。
而在墳頭下方數公里的地下，原本死去的神農此刻竟然出現在一個城市般大小的戰艦上，此刻正站在一個金光閃閃的陣法前洋洋得意：“嘎嘎！復活完畢，一切都已在我的掌控之中，就等着雨硫內心的零尾爆發暗黑CKL啓動安克班迪安啦！只要將世界捲入戰爭，那麼暗黑CKL將會取之不盡用之不竭！到那時，就可以讓我們空之國真正的復興啦啊哈哈——呃啊，納尼！！”
神農突然慘叫一聲，臉上的笑容早已被痛苦取代，原來是被空間跳轉而來的葉清風遁核聚變手裡劍擊中，瘋狂的核聚變風屬性在自然CKL的加成下急劇的撕裂神農的身體，剎那間一道耀眼的極光閃現，核聚變完成入侵，在神農體內爆炸，破碎的神農肉塊爛骨頭濺的滿戰艦都是，仔細一看，原著裡吸收零尾暗黑力量不斷重生的神農眼下卻是死的不能再死了。
解決掉【羈絆】劇場大BOSS後，葉清開始在戰艦內埋伏大量的起爆符，畢竟這種逆天的玩意還是毀掉了吧！正要引爆葉清忽然想起這頭頂上似乎還有小月鳴人他們在，而且似乎雨硫村子裡的村民就被困在這安克班迪安飛船上面。
感知到村民位置後，葉清便“啵”的一聲來到戰艦內倉監牢處，果然發現一羣衣衫襤褸的男女老少被莫名力量困住，葉清嗤笑一聲，示意惶恐的村民們躲開，緊接着便一記核聚變打破監牢，在一衆村民的愕然眼光中，葉清大手一揮，CKL唰的把這監牢內的一干人等籠罩，繼而聽得“啵”的一聲，葉清與數十名村民消失不見。
而在葉清將村民們時空跳轉脫離到安全地帶後，很快又回到了安克班迪安外倉，心神一凝右手換了個手印：“飛雷神五段-開！”，只聽“啵”的一聲，埋藏在地下山石泥漿之中的安克班迪安戰艦竟然消失不見，導致周遭的泥土樹木瞬間塌陷，地面上的鳴人小月小櫻雛田四人察覺到異常，急忙帶着雨硫逃開，短短數十秒原本平整的大地竟然“轟隆”塌陷出一個巨大的深坑，這讓小月小櫻等人面面相覷，倒是忽略了身後雨硫的異樣.......
而在不遠千里的雨之國境內，“啵”的從天空中掉落一個小山一般的戰艦，“轟”砸在雨之國的中心之塔上，硬生生的將高聳入雲的中心之塔碾壓成渣渣，這還不算，只聽“轟隆”一聲巨響，雨之國腹地繁華中心建築算是徹底淪爲了廢墟.........