董子寧練了半年時光，漸漸感到自己身體起了明顯的變化，精神倍添，內力也凝聚了，不象以往行動一下就感到軟弱無力，略略到谷底搬動一些枯枝、柴草，便感到上氣不接下氣。有一次，他試從一株樹上攀折一支較粗的枯枝，這手腕粗的樹枝居然叫他一折而斷。這明顯地告訴他：他內力恢復了。董子寧又驚訝又興奮，暗說：“我真的恢復了內力麼？”他又去搬動一塊石頭，一運氣，石頭應手而起。他頓時大喜過望，原來我真的恢復內力了。不用等四、五十年。這《神功秘笈》真是一部奇書。有了它，我又何必去盼那失傳了幾百年的《九陽真經》？一心一意地練神功不更好？他回到巖洞，虔誠地朝《神功秘笈》拜了三拜，心無旁念，全神貫注日夜苦練。
董子寧怎麼也不會想到，他所練的《神功秘笈》，正是鬆月禪師所說的《九陽真經》。
三百多年前，甘氏的祖先是甘修竹，在金兵入侵中原的混亂中，憑自己的輕功和機敏，從少林寺竊取了這部《九陽真經》後，一直深藏隱居在深山老林中，將這部真經一字不漏地背誦下來，銘刻在心，然後又默寫出來，對照一下，全無錯漏，然後將《九陽真經》撕成碎片，燒成灰燼，拋落大海中，將自己默寫出的《九陽真經》，添上自己的心得和體會，取名爲《神功秘笈》，所以少林寺歷代高僧，四處尋找《九陽真經》，全無下落，原因在此。
甘修竹又秘密地遷來人跡罕到的桂黔邊上的荒山峻嶺中，在沉崖落魂山找到了這一秘密巖洞，化裝爲當地山民，結廬而居，安家立業，娶妻生子。繁衍下來。
由於甘修竹本身已具深厚的內功，再練九陽真經上的氣功，本身的真氣與練來的九陽真氣相牴觸，弄得他氣息不順。而他又急於求成，一下走火入魔，造成半身不遂，雖有絕世神功，人已殘廢，行動不得，抱恨不已，臨終前他誠戒後人，有內力者，切忌強練，練到神功中的三、四成，感到氣息不順，便不能再練下去了。誰知第二代又重蹈覆轍，功沒練成，又成了殘廢。第三代甘維琪，憑自己的天聰和毅力，練到了神功的六成，這六成九陽真功，已使他能摘葉飛花傷人，揮綢成刀取人性命，武功罕世少有。由於他遵循祖父的教導，既不與武林人士來往，更不輕易顯露武功。一旦顯示出來，必殺人滅口，不容對方有一人逃生，泄露自己的真相。
正所謂學武之人，絕無止境。他練到神功的六成後，並不心滿意足，仍日夜苦練，一時不慎，又走火入魔，燒斷了三焦，因此在《神功秘笈》的最後，寫上了自己的教訓，連同他甘家的《劍術精髓》，一併藏入這小木箱子裡，深藏在這洞中之洞的石龕上，再不輕易傳示後人。同時將自己的武功，繪成圖形，刻在石洞的石壁上，口傳身授，只有在自己臨終之前，纔將洞中之洞的秘密告訴後人，甘氏後人憑前人口傳身授的武功（其實是九陽真經中的四、五成功夫），足以傲視武林，橫行江湖了。由於甘氏後人遵循祖訓，不與中原武林人士交往，所以在武林中，極少有人知道甘家的武功。他們要採取行動，住往蒙了面孔，一旦交手，絕不容情，令黑道上的人物聞風喪膽。
到了甘氏的第五代祖先甘震宇，突遭橫死，這洞中之洞和這兩部奇書的秘密，便再無人知道了。從此以後，甘氏後人只知前洞石壁上的武功，而不知洞中有洞，更不知道後洞絕谷巖洞口的石壁上，秘密藏着這兩部武功秘笈。
董子寧爲甘驥所逼，無意中撞開了這洞中之洞的小洞口。在自殺時，又無意撞在這秘藏奇書的石龕封閉處，發現了這兩部武林中的珍寶，恰恰董子寧的武功爲化功丹化去，內力全無，武功全廢，正象甘維琪所要求的：“心似白紙，胸如深淵，身若空谷”。心似白紙，可以任意練什麼武功，不受限制；胸如深淵，可彙集大地百川之水；身若空谷，可容納天地之氣。所以董子寧練起九陽真經來，九陽真氣在他體內不受原有內力的阻擋，源源而入，當九陽真氣充溢十二經脈後，又流溢到奇經八脈中儲存起來。十二經脈如河涌，奇經八脈似湖泊，它可以儲存容納源源不斷的真氣涌入。所以《九陽真經》中的第二頁便練奇經八脈中陽蹺脈，以便打開這一湖泊。好儲存、容納其氣的涌入。目前董子寧只練了半年。九陽真氣不算充裕。但這半年，足以使甘氏子孫相形見拙了。這是董子寧的巧合，也是他的奇緣，非人力所爲，更是甘氏祖先所想不到的事。
董子寧嚐到了練《神功秘笈》的好處，更不急於出去了。絕谷中的巖洞，既沒外人進來，更無任何野獸干擾，成了董子寧極好的練功地方，他心無旁鶩，將一部《神功秘笈》一字不漏地背得滾瓜爛熟，按照二十幅圖一幅幅練下去，他不知道自己在巖洞裡度過了多少個日日夜夜，飢時吃娃娃魚乾，渴時飲深潭水，一時見外面瑞雪紛飛。一時見烈日炎炎照絕谷，一時是谷中山花爭放，一時又是山稔果結滿枝頭。數九寒冬，他身穿單衣不覺寒冷；三伏酷暑，他身近火堆不覺炎熱。每當他練功時，漸漸頭頂凝結了一團白霧，這時他練的九陽真功，已達到相當的火候了，舉手投足之間，便立可致人於死地。只不過董子寧渾然不覺自己的內功已達到了當今武林最上乘的境地。他不知不覺已在巖洞裡度過了三年。這三年裡，勝過別人練四、五十年功的成就，他不但將十二經脈全部練成，就是奇經八脈，也練成了六條經脈，只差衝脈、帶脈沒練成。衝脈和帶脈，是氣功中難以攀登的高峰，稍一不慎，便筋斷脈裂而死，令人望而生畏。當今武林中最上乘的一流高手，連陽維脈，陰維脈也不敢輕易去練，別說衝脈和帶脈了。董子寧自從練成了其他六條奇經，便一步步攀登這一頂峰。他苦於無法打通這兩條經脈的穴位，練了幾十次，不但不能打通，反而感到氣息澎湃，心悶難言，有經斷脈裂之感。他不敢再強練下去了，跳進潭中清醒自己。每每他練功練到氣息亂涌之時，這深潭清涼之水是使他內息鎮定下來的良方。這潭水真有一種叫人不可思議的物質，不但醫治外傷，還能使氣息漸漸平息下來，要不是這深潭水，董子寧有幾次便會走火入魔，成了終身殘廢。這一醫治，也是他仍然而發現的。有一次，他在打通任脈、督脈的穴道時，身體氣息亂涌，渾身似火燙一般。他一陣頭暈眼花。從練功處滾下了巖洞裡，跌進了深潭，一下使他內息平靜下來。爬起來再練時，竟意外地打通了這兩處穴位，這也是董子寧的奇緣。甘氏祖先在內急亂涌時，強行運氣，沒機會跌進深潭裡，結果便造成終身殘廢，空有絕世神功。董子寧不會強行運氣，順其自然，意外地得到了好結果。
董子寧試圖再一次打通衝脈、帶脈的穴道時，結果氣息比以往更爲澎湃亂涌，令到他手足亂揮，掌力腳勁所到之處，石壁岩石似粉狀般地紛飛四散。幸而他心智還比較清醒，縱身一跳，飛落到深潭裡。良久，才感到氣息漸漸地平息下來。
董子寧爬上岸時，心想：看來真的不能再強練下去了。世間上哪有十全十美之事？我練到內功能恢復如初，也該心滿意足了。他仍然不知自己的內功已達到了九陽真經中八成功力，這已是武林中少有的人物了。他完全能夠憑自已雄渾無比的真氣，輕而易舉地摘葉飛花傷人，揮綢成刀取人性命。就是不用任何兵器，單憑一雙肉掌，也可以擊敗當今武林中的任何一流上乘高手。他踏上絕谷的巖洞口時，瞧見四周石壁紛紛剝落，石壁下積了一層薄薄的石灰，驚訝異常，暗想：這石壁怎麼會變成這樣了？難道是年深日久，起了風化麼？他仍然不知是自己剛纔手足亂揮，所發出的掌風腳勁所造成的。他根本沒想到自己會有這樣勁道奇強的內力。他只隱若感到，自己內力不但恢復了，而且比以往略勝一籌。他只從自己的輕功中感到比以往輕靈敏捷得多。他象一個糊塗渾然的百萬富翁一樣，只知道眼前身邊的一點點銀兩，竟不知自己是腰纏萬貫的大富翁。
此時，又是一個初秋的天氣。董子寧暗想：我在這巖洞裡大概有三年了，現在武功在身，內力恢復，可以能推開那塊堵塞洞口的石頭了吧？他本想檢點一下，休息一晚，第二天出去。可是到了夜裡，天黑似鍋底，大雨傾盆而落，暗想，我何不趁這雨夜而走？不怕給人發覺，豈不更好？於是，他點燃了火把，將兩部奇書藏在懷中，爬到那小洞口。他仍然沒十分信心能推開那塊大石頭。誰知他輕輕一推，大石應手而開，他大喜如狂，暗想：老天爺終於沒有絕人之路，想不到我董子寧還有逃出巖洞的日子。他提着火把走到巖洞口的石門，將火把熄滅，一按機關，石門輕輕打開，便閃身出去。仰望天空，依然黑似鍋底，大雨不息，兼有雷聲，再望山下，落魂山莊甘家大院裡，仍是燈火處處。他不禁想起了小菊姑娘捨生忘死救自己的恩情，想臨走前向她道謝纔對。可是一想到甘驥和通天猿，他便遲疑起來。我去道謝不要緊，要是給甘驥和通天猿發覺了，我一死沒什麼，可害了小菊姑娘。還是別去的好，寧願以後再找機會，報答她和她家的小姐，也顯得我董子寧不是忘恩負義之徒。於是他在大雨的黑夜裡，一步步摸下山來，打算到了甘家後園，施展輕功，翻牆而去。他完全忘記了小菊姑娘曾對他說過的一段話，其他方向別走，只能往北方而去。
董子寧快走到山下時，突然“轟隆”一聲，他整個人翻落到陷阱中去了，躍在一個軟綿綿的東西上面，他還來不及反應，這個軟綿綿的東西又一下將他包起來，自己彷彿一下給人提起來似的，懸吊在半空中。
原來甘家這個練武的秘密巖洞，三年前給董子寧闖進來以後，甘驥感到這個家傳武功的秘密巖洞，再也不秘密了，已經爲外人所知道，他耽心以後還會有人來窺探他甘家的武功，於是在巖洞四周，佈滿了陷阱和機關。董子寧恰恰便跌落到這個陷阱裡，裝進了特別制的皮袋中。要不是大風大雨，董子寧一跌落陷阱，恐怕早驚動了甘家的人，將他連捆帶打，拖到甘驥和老夫人面前。
董子寧給裝進袋中後，倒也不怎麼慌張。他自問憑自已的武功，完全可以破袋而出。他試用雙手想撕開皮袋，誰知這皮袋是用特製的獸皮製成，柔軟而帶韌性、董子寧怎麼也撕不破，別說是用手，就是用刀劍，也不能劃破這皮袋。甘驥早已預防武林中的高手和身配刀劍之人，故用犀牛皮配合特製藥水製成，刀砍不入水火不傷。董子寧雖然身懷絕世神功，一來在袋子中不能施展；二來他根本沒想到自己身負神功，不運用掌力擊破這皮袋，而是動手來撕，可哪裡撕得開？這一下，董子寧才慌了，呼救嗎？在這大風大雨的夜裡誰聽得到？就是聽到，也是甘家的人，他們到來，還不是一陣亂棍將自己打死？面且這皮袋密不透風，連外面的雨水也滲不進來，自己呼救，外面的人怎能聽到？看來，只有等到天亮，甘家人來了，自己是生是死，只好聽天由命了！想不到我董子寧在巖洞捱了三年，依然逃不脫甘驥的手掌，到頭來還是一死。
由於皮袋密不透風，董子寧在皮袋中呆了一會，漸漸感到難受起來。便運行起九陽真功。九陽真氣由奇經緩緩流入十二經脈中，又由十二經脈的各處穴位，源源溢出體外，充盈皮袋。皮袋密不透風，散發不出去，九陽真氣又從各處穴位流入到十二經脈中，再度流入到奇經八脈裡，九陽真氣越積越厚，又再次經十二經脈流溢體外。如此反覆循環多次九陽真氣將皮袋充盈得象一個大皮球似的，董子寧如泡在九陽真氣中，體內體外，無處不充滿了九陽真氣，渾身七百多處穴位，無不開放。這時，董子寧幾乎快要悶死了，感到經暴脈漲，這正是水火相濟、龍虎相會的兇險時刻，稍遲一會，董子寧便經斷脈裂而死，突然“膨”地一聲巨響，柔軟堅韌無比的犀牛皮袋，給董子寧的九陽真氣衝破了，變成片片碎皮，飛散四周。董子寧也在這一聲爆炸巨響之中，全身彷彿給一道無形無情之力擊得一口鮮血噴了出來，飛落地下，他苦於無法打通衝脈、帶脈的兩處穴位。也在這一擊中突然打通了。雖然口吐鮮血，卻全身舒服暢通，精神百倍，眼露藍湛湛的精光。他已達到了古人無法攀登的武林高峰，練成了蓋世的神功——九陽真功。他意外地符合了甘維琪所留下的遺言：“欲神功告成，需在密不透風之密室中，不使真氣外泄……”
當日甘維琪雖然想到了密不透風的密室，可怎麼也不會想到這一着，不然，他早已鑽進密不透風的皮袋中去練了。可這也是極兇險的一着，早一點不行，奇脈穴位沒打通，遲一點也不行，會經斷脈裂而死。而只有恰到分寸，皮袋應時而裂，才能神功告成。
過去少林寺歷代高僧，都有人練九陽真經這一神功，可卻沒一人能達到董子寧這樣的高峰境地，原因是沒有內外這兩個條件——全無內力和一處密不透風的密室，更不會想到把自己裝進密不透風的皮袋子中去。這兩個條件互爲依存，單有密室而非“內力全無”，結果便會象甘氏幾代祖先一樣，走火入魔，終身殘廢；單是“內力全無”、而無密室，也練不到最高境界。所以過去有人練九陽真經，能練到五、六成的人，已是鳳毛麟角，達到七、八成的人，兒乎沒有。天賜奇緣，董子寧卻恰恰具備了內外這兩個條件，練到了前無古人，後無來者的最高境界。這時的董子寧，就是用滴水爲暗器，也可以封人穴位，置人於死地了。只不過他渾然不知罷了。他要是知道，又何須害怕甘驥？單憑輕功一項，就是連天山怪俠也追不上他，甘驥更是望塵莫及了。