這次聖城之行，也讓林有意識到了與對手的巨大差距，原來是在玄境強者上的差距。瀟湘宗原有約二十人是玄境，這次在疏桐國殞命兩個，至少還有十八人。按照他們的宗門體量，過幾年又能恢復到全盛時期。現在，隨着傅竟的身隕，聖鬥士上的差距無疑是致命的。
因爲琴臺宗遭遇截殺，他們也向教廷進行了控訴，教皇聞訊下教令對這般惡行進行了嚴厲譴責。但畢竟是發生在廣楚和疏桐國的行爲，並不在聖斗城，教廷能做的也有限。雖然有琴臺宗的指控，但廣楚帝國是全盤否認，至於瀟湘宗，他們本就與琴臺是死仇，教廷也不能過多幹涉他國宗門事物，只能警告蕭炎不要再生事端。
甌越帝國也遣人向廣楚和疏桐國表達了不滿，並開始在西南和西北陳兵以壯聲勢。廣楚帝國對甌越進行了冷處理，不予迴應，只加強了邊境的兵力佈置，對於截殺一事是打死不認。而疏桐國則是趕忙撤去了對琴臺宗人的通緝，而後又派使臣向甌越帝國解釋自己身不由己，並送上厚禮以表誠意，此事纔算告一段落。
大陸宗門中，五雲門雖然想爲琴臺出頭，但考慮到宗門間的利害關係，也只是對惡行進行譴責，沒有指名道姓地指責瀟湘宗。宗門這份不痛不癢的譴責，讓南宮一家在小院中着實是跳了好幾天的腳，當年他們襲殺舊琴臺是這樣，現如今五雲的態度還是如此，這不能不讓南宮一家失望。香葉宗自詡爲大陸第一宗門，按理也要爲受害的宗門出頭，就像當年琴臺被滅一樣，他們也是站出來不痛不癢地朝天罵了幾句，跟放屁沒什麼區別。果然自己的事，外人終究是靠不住！
現在的情勢，廣楚或者瀟湘輕易不敢越境殺人，他琴臺宗能躲在甌越以求自保，不過這並非長久之計。
於是，林有做了三件事。首先是厚葬傅竟、陳姣和陳小東，傅竟屍身不存，只以衣冠建冢，並帶領衆琴臺弟子公祭這次死難的琴臺壯士。陳姣幾人出殯的那日，戴明、傅明、小星、小月和小塵都是哭成了淚人，凌雲的臉上也是全程掛滿淚水。穆紫嫣也是被擡着去了現場，送了姐妹最後一程。林有想哭，但他不能，他要化悲痛爲力量，要帶領琴臺衆人蟄伏潛修，重振宗門。接着，他又開始安排起了琴臺宗的人事。因爲首義、玉淵和玉翠三堂堂主身隕，他在三堂分別拔擢了三名化境修爲的資深弟子暫攝副堂主。之後，他取來了許多封印寶藏中可供修煉的晶石丹藥，命各堂分發了下去，以期助益門人提升修爲。最後是廣發告示，打算以封印寶藏裡的金銀爲支撐，重金招攬弟子，不惜代價要爲琴臺宗打造一批高階鬥士，這些人才是超級宗門的基石所在，也是日後他與瀟湘對決的資本，必須早做籌謀。
穆紫嫣的傷勢很重，林有雖然每日給她調養，但卻難見好轉，他本想將神鬥經傳授與她，希望以神鬥經的逆天之能修復她的傷勢。但這神鬥經只傳有緣人，穆紫嫣又如何能看見那金色蝌蚪文？光憑林有的解說根本無法理解，所以也是一籌莫展。或許，只能再次去聖斗城求教皇醫治，但好不容易纔從聖城逃回，短期內這根本不現實。思來想去，林有也只能延請鬥士名醫，乃至甌越宮中太醫前來醫治。折騰了三月，總算是讓穆紫嫣那虛弱的身軀恢復了一點氣色。雖然恢復很慢，但有進步總歸是好事。大約又半年多，紫嫣總算是能下地行走了。
這近一年中，琴臺宗的整體實力也在慢慢恢復。這戴明發誓要爲陳姣報仇，在這一年中日日苦修，用心參悟聖鬥經，魂力竟神奇地達到了65級。重賞之下，琴臺宗也來了不少化境虛境的高手。經過林有戴明等人的層層考察，拔擢了三個虛境鬥士充任首義、玉淵和玉翠三堂堂主，其餘人都編入各堂。而六堂中，獨孤語晨也是虛境高手，上官浩已經化境59級，傅明也早就邁入資深化境。張小寶和戴雨農也已突破了化境，小寶被拔擢爲舊宗堂副堂主，雨農則被安排在上官浩的玉筆堂擔任副堂主。根據積功表現，傅明也推薦了自己的一個副堂主。這樣，琴臺宗六堂堂主的實力反而比起之前更強了。
接下來，林有將琴臺日常事務付託給了明戴和王良，自己再次入後山苦修。他要儘快參悟全部的神鬥經，激發自身剩餘的聖鬥士魂力，儘快提升修爲。這些年，他在神鬥經的加持下，已經漸漸吸收了爺爺留下的大部分魂力，但還有些殘餘需要再融合消化。另外，他的神鬥經還有三分之一左右仍是空白，他需要儘快參悟。
這樣，他再一次進入後山。這一次，親歷的慘痛更堅定了他復仇的決心，讓他定身在後山，片刻不曾離去。在那處洞府中，他看着日升又日落，雲卷又云舒，看着春花開了又謝，夏雨停了又下，秋月圓了又缺，冬雪來了又走，看着光影不斷變化，時空不停流轉，他在心底裡感受着天地間，蒼茫下，人世中，一人一洞，一心一念，他與時空那頭的他，度過了一季又一季，一年又一年。拋卻俗世雜念，建立修真意念，走向大成圓滿，直衝聖境境界，這是他的進階之路，雖然路還長，但他意念堅定，再難走的路，也要走下去……
就這樣，整整過去了五年，他利用神鬥經吸收了聖鬥士爺爺留下的全部魂力，修爲也一升再升，終於是達到了玄境73級的境界。
而這五年間，穆紫嫣終於是康復了，只是她的修爲根基遭到破壞，停留在了虛境，這與當年嘉佑帝的情況極爲相似。她與凌雲偶爾去看林有，但輕易不打擾，鬥士修行，從來苦悶，沒有孤獨的歷練，那絕不可能會有非凡的成就。而琴臺這五年，六堂堂主的整體修爲再有精進，上官浩和傅明先後突破虛境。長老戴明實力又進了2級，達到67級境界。長老王良過了百歲生辰，修爲也精進到了74級……
不知不覺中，時間悄悄來到聖歷一一五七年的冬月，距離廣楚那次截殺已經過去了整整六年。