掌握了軍隊，就掌握了一切，在很多時候，這是真理。
因爲掌握了內衛，並在很大程度上控制了左、右羽林衛及左、右金衙衛，李晨在很短時間內就控制了大明宮和太極宮中的局勢，繼爾將整個長安城的局勢都控制住。
所有不願意支持他的將領，都在第一時間內被清洗出局，換上他信任的人。
裴炎、李敬玄及其他反對他的大臣，也基本被他清洗出去。很多大臣是被免或者被貶，一些是主動提出辭職或者致仕。對於主動提出辭職的這些大臣，李晨也給了他們面子，沒有難爲他們。
經過忙忙碌碌地十幾天，長安城內的局勢基本平靜下來，李晨完全控制住了一切。
李顯的喪事也如期進行，李晨依武則天的授意，給予了李顯高規格的追贈，給予其“孝和皇帝”的諡號，廟號爲高宗，將其墓葬之命名爲“定陵”。
不過李晨並不急於登基稱帝，現在時間已經是接近年末的九月底，他準備過了年後，再登基稱帝。
這段時間，朝事可以假借武則天名義，代爲處置。武則天也是挺配合的，在這些事情上並沒難爲他，而是儘量配合。在公開場合，她也一再重申，她完全支持李晨繼位稱帝，並相信李晨能給大唐帶來繁榮昌盛，讓李晨當大唐的皇帝，會是天下之大幸。
只不過兩人之間的私情卻完全斷絕，兩人即使單獨相處，也沒有一點曖昧。這主要是武則天之故，她一副公事公辦的樣子對待李晨，絲毫不流露出熱情和渴望。
李晨知道，武則天肯定恨他，對此他也早做好了心理準備，沒太多的在意。
當然，暗地裡的朝政決策權，還是大部分在他手上。朝中官員的變動，也主要是他的主意。
裴炎被貶，李敬玄主動提出致仕，薛元超也去了職。歸隱了，武則天親自提拔重臣都離開了朝堂，她的影響力也基本在李晨身上。李晨還算尊重她，在朝事及人事任免上，會問詢她的主意。
李顯的喪事結束後。李晨也改組了政事堂，他有了初步往內閣制度改變的想法。
李晨知道，權力過於集中並不是好事，爲了子孫後代，爲了大唐的江山穩固，爲了社會的穩定發展，他必須要有取捨，後世那些成熟的制度，他必須借用，一步一步讓時代朝前發展。選舉制度不可能在這個時代出現。但那些比現在制度先進，可以在這樣時代實施的東西，他可以弄出來。
也在完全控制局勢後，李晨也很快撤換了朝中很多官員。
他重新拔高了尚書省官員的權力，以尚書令爲尊，委裴行儉爲尚書令，爲百官之首。
再以狄仁傑爲尚書左僕射，駱賓王爲尚書右僕射，張柬之和劉審禮爲中書令，魏玄同和岑長倩爲侍中。魏玄同領吏部尚書。這七個人加裴行儉組成政事堂，以裴行儉爲首輔大臣。
郭正一和郭待舉依然爲黃門侍郎，王德真和劉景先爲中書侍郎，魏元忠爲禮部尚書。原任中書舍人的李嶠被任命爲戶部尚書，李懷遠以兵部左侍郎身份主持兵部事務，兵部尚書之職暫時空缺。韋承慶以刑部侍郎身份主持刑部事務，尚書之職也暫時空缺，敬暉以刑部侍郎身份主持刑部事務，桓彥範以工部侍郎身份主持工部事務。
因爲被免及被貶和主動辭職的大臣太多。李晨覺得能信任的大臣已經不夠用，一些重要職位上，他信任的人資歷又不足，只能先以低級官職主持高級事務。
也還好，有了這些官員的重新任命後，國家機器還能繼續運轉。
爲了安撫武則天，武家幾名子嗣，與李晨有仇恨的武三思和武承嗣，李晨也給了他們官職。只是李晨知道，這幾個人物，註定會在歷史長河中默默無聞，再沒機會折騰起風浪。
禁軍將領方面，李晨也做出了大的調整，他以自己的親信王單領內衛將軍職，以吳羽爲左金衙衛將軍，以李凡爲右金衙衛將軍，再以突騎施人達曼爲左羽林衛將軍，以弓仁爲右羽林軍將軍。李多祚和契苾明的左右羽林軍大將軍之職依然保留，在這次行動中，這兩人也給予了李晨以非常大的支持，李晨也以實際行動表示了對他們的信任。
吐蕃人弓仁是李晨想栽培的，所以給予其非常的信任。突騎施人達曼是烏珠的最得力手下，他奉烏珠之命，率兩千突騎施武士秘密抵達了長安，並接受了李晨的統領。
而李晨也充分運用了這兩千武士的力量，在李顯身死後，控制住了長安城內的各軍衛。如果沒有這點私兵可以動用，李晨在做這件事的時候，肯定會多一些擔慮。
就在李晨爲朝事忙碌的時候，這段時間表現低調的太平公主，又來找他了。
“李晨，我有事想問你，”太平公主說話的口氣中帶着嘲諷，“我是喚你名字呢，還是要稱呼你皇帝陛下？”
“現在我還沒稱帝，所以還不是皇帝。不過即使我稱帝了，也隨便你叫，在宮中，你有這特殊的權力，”李晨絲毫沒在意太平公主的挪揄，笑着回道：“別把我想的那麼不近人情，那麼陰森可怕，我比任何人都陽光，都大量。你一直對我這麼不友好，我不是一直沒計較。呵呵，說起來，我還是你的堂兄呢，當兄長的，呵斥一下妹妹，也是應該的。你有什麼問題就儘管問我，我不會隱瞞的。”
“我的皇兄李顯，是不是你殺死的？”太平公主咬着嘴脣問李晨。
李晨知道太平公主想問的就是這個問題，也沒什麼意外，坦誠地將那天的情況解釋了一下，再道：“其實那天我出的殺了你的皇兄也沒什麼，畢竟他刺劍準備殺你的母后。連自己的母親都要殺的人，與禽獸何異？所以你也不要計較這事，不必爲你的哥哥耿耿於懷。我承認，我是利用了你的母親，利用她的信任，掌握了禁軍，才能成今日之事。”
“或許你不知道，我一直在母后面前說你的好話，說你是個很不錯的人，值得信賴，並說你是我心目中最出色的男人，我真的想嫁給你。母后這般信任你，與我的態度也是有關係，但她是不會讓我嫁給你，你我是族兄，更不可能成爲夫妻，”太平公主似乎挺感慨，說話間也有點語無倫次，“只是我沒想到，事情會變成這樣子。我的父皇，我的兄長都死光了，只剩下母后。”
頓了頓後，太平公主又很認真地問了李晨一句：“李晨，有朝一日，你會不會對付我母后，會不會對付我？”(。)