賽義德愣神，星球司令官的彙報讓他察覺陰謀的氣息，他立刻下令：“拒絕他！禁止任何船隻進入星系！”
司令官面色爲難道：“可是…親王殿下，薩凡艦船已經進入星系，正停泊於近地軌道上。”
賽義德斬釘截鐵：“立刻驅離，只警告一次，抗命立刻擊毀！”
然而片刻過去，指揮部內一片寂靜，賽義德的命令並未得到執行，他聲音冰冷道：
“你要抗命嗎？司令官！”
與此同時，憲兵、傀儡軍團、各軍政委和阿斯塔特都收到一條訊息：“發生四號狀況，啓動最高警戒預案！”
四號狀況指的是最高指揮官叛變，各級士官和士兵將拒絕叛徒命令，直接聽命於傀儡，執行最高警戒預案。
自軍事改革以來，四號狀況和最高警戒預案還從未出現過，弗拉克斯是第一次。
霎時間，弗拉克斯上所有軍師旅團指揮建制被打散，傀儡接過指揮權，隨即命令各部隊原地不動，否則視作叛徒！”
星球司令部中，最高指揮官辯解道：“親王殿下您誤會了，薩凡主教是個忠誠之人，不會叛變！”
他話未說完，被傀儡掏槍指着腦袋，傀儡怒吼道：
“我以帝國親王，戰爭委員會主席，帝國所有武裝力量總司令的名義下令，逮捕弗拉克斯總指揮，違抗者視同三害，將遭到無情清算！”
話音剛落，大批司令部衛隊衝進堡壘，但是槍口並未對準司令官，而是賽義德傀儡。
四周參謀神色僵硬，面無表情，對此視而不見，賽義德冷笑道：
“看來你們叛變了，我想知道你們哪來的勇氣？混沌邪神？還是某種異形？又或者叛徒阿爾法？”
“但無論如何，你們的結局只有死亡，不僅你們，你們的家人、朋友、學生…所有有關係的人，都將跟你們陪葬！”
“準備好迎接神皇怒火了嗎？卑劣的雜碎！”
“薩凡說得沒錯，帝國已經腐朽，急需一場聖戰來切除身上的腐肉，這就是我們正在做的事情。”
司令官沒有說話，回答來自傀儡身後，傀儡轉過身，微弱的燭光照亮一個巨大的身影，身影大部分隱藏於黑暗，只有九頭蛇標誌褶褶生輝。
賽義德瞬間知道薩凡的幕後主使——阿爾法軍團。
原本歷史的弗拉克斯叛亂中，薩凡被克里格打得節節敗退，然後得到阿爾法的增援。
阿爾法勾結混沌信徒舉行褻瀆儀式，召喚黑軍團前往弗拉克斯，讓原本打十二年的戰役，硬生生拖了十八年。
此時阿爾法的出現，讓賽義德肯定薩凡一開始就得到阿爾法的幫助。
阿爾法的間諜遍佈帝國，多年來如陰溝老鼠，不斷煽動叛亂和起義，但都被迅速鎮壓，始終成不了氣候。
它們與老對手異端審判庭互相攻防，被持續擊敗，但猶如九頭蛇一般，始終無法被消滅。
對此，賽義德不屑嘲諷：“無論你如何辯解，都無法掩蓋你們卑劣叛徒的本質，你們背叛了神皇，背叛了人類，背叛了帝國！”
“阿爾法軍團，帝國大軍正在趕來，我保證你們贏不了！”
阿爾法軍團上前將傀儡打碎，然後說道：“無論你信不信，親王殿下，我們在用自己的方式貫徹忠誠！”
在意識斷開前，賽義德依舊輕蔑嘲諷：“忠誠不絕對，就是絕對不忠誠！等死吧叛徒！神皇與我們同在！”
阿爾法平靜回道：“是嗎？”
他打了個響指，高頻聲波通過星球各處廣播，蔓延整個弗拉克斯，聲波微弱，人們恍若味覺。
只有極個別凡人神色一怔，露出迷茫的神色，片刻後恢復如常，在無人察覺之時，眼中散發危險的光芒。
弗拉克斯星港首先爆發叛亂，叛軍突襲忠誠派，爆發激烈交火，忠誠派被打個措手不及，損失慘重，被叛軍消滅只是時間問題。
但在傀儡的指揮下，忠誠派依舊堅持抵抗，操縱軌道防禦系統擊毀薩凡艦船，然後引爆星港，與叛徒同歸於盡。
但薩凡並未死去，他乘坐雷鷹炮艇與信徒空降地表，與最早叛亂的起義軍匯合，並且擔任了領導者。
他帶領起義軍接受了星球司令部的招安，然後宣佈忠誠派軍隊爲叛軍，號召它們倒戈相向。
隨後，起義軍與星球司令部合流，張開虛空盾，一副固守待援的模樣。
原本歷史上，忠誠派被快速肅清，但此時的忠誠派佔據絕對兵力優勢，通過最高警戒預案，星球所有帝國精銳都在傀儡指揮下。
賽義德一聲令下，忠誠派主力向司令堡壘合圍，大批輔助軍進駐各個陣地，構築一道堅固包圍圈。
他們磨刀霍霍，就等着向弱勢叛軍發起總攻，將叛亂捏碎。
但一股不祥預感籠罩賽義德心頭，通過傀儡，他環顧忙碌的輔助軍，心中涌起一股不真實。
和阿米吉多頓不同，弗拉克斯作爲戰爭委員會直轄星球，派駐大批傀儡，甚至有兩個區塊兵木之土，每週生產四億傀儡。
雖然傀儡經常被抽調增援帝國各處，但僅存部分足以強化對弗拉克斯的控制。
因此叛亂髮生後，監軍傀儡第一時間被派駐到全軍排級單位，隨時監視和應付突發狀況。
除此之外，還有數個完全有傀儡組成的輔助軍團和巨神兵戰團，作爲忠誠派的最後保險。
所以賽義德實在想不通，帝國世界那麼多，阿爾法爲何作死一般，偏偏在防備最嚴密的弗拉克斯上煽動叛亂。
但很快，賽義德就知道了答案，那些原本發誓忠誠的軍官忽然偷襲監軍傀儡，猝不及防下，大批傀儡殞命。
緊接着，叛徒對不知所措的士兵高呼：“誅滅泰拉僞王，迎接神皇歸位！”
這一幕接連發生在忠誠派陣線上，軍官們偷襲傀儡，然後用個人威望團結士兵，揭露泰拉陰謀。
剎那間，接近七成的軍官叛變，最終三成軍官叛變成功，兩成軍官被傀儡反殺，一成軍官被忠誠的士兵殺死。
在軍官們宣傳中，以賽義德爲首的泰拉權貴打算弒神，然後賽義德成爲新的神皇，統治帝國。
賽義德不禁疑惑，弗拉克斯經歷不止一次微觀掃描，軍官們的言行舉止沒有絲毫問題，又怎會突然叛變呢？
微觀掃描沒有死角，任何觀測結果都遭到嚴密的心理評估，基本不可能出錯，因此賽義德心頭浮現一個猜測。
叛變軍官都是阿爾法的間諜，他們被阿爾法催眠，清除了記憶，以忠誠派的身份，不斷滲透弗拉克斯。
依靠這一手，這些叛變軍團躲過一次又一次微觀掃描，直到弗拉克斯叛亂，這些埋藏的暗子才被激活。
賽義德嘆氣，催眠太犯規了，即使有所警惕，一時間也沒有解決辦法。
在被激活之前，賽義德無法甄別誰是臥底，只能記錄大腦數據，匯合機械教生物賢者和科學家進行破解。
此時此刻，前線三成軍官叛亂，帶領麾下叛軍與忠誠派鏖戰，和忠誠派相比他們兵力不多，很快被壓制。
但隨着司令堡壘的增援，情況急轉直下，忠誠派輔助軍再也無力鎮壓叛亂，向後方請求增援。
賽義德立刻讓傀儡輔助軍加入戰鬥，並且投入了極限戰士子團和巨神兵，成功掰回局勢。
傀儡輔助軍協助抗線，極限戰士空降敵後，打擊叛軍樞紐和物資倉庫，巨神兵後方掠陣，阻止阿爾法軍團滲透。
爲了預防意外，恆星基地派出星系艦隊懸停近地軌道，對叛軍發動軌道打擊。
司令部堡壘雖有虛空盾，但範圍有限，無法保護外圍叛軍。
在精確軌道打擊下，叛軍損失慘重，不得不向內龜縮，然後遭到極限戰士的前後夾擊。
軍官叛亂雖然增強了叛軍的兵力，卻依然未能改變力量對比，薩凡主教用廣播不斷揭露“泰拉陰謀”，卻再無一人倒戈相向。
底層士兵不是傻瓜，無論泰拉陰謀是真是假，至少強弱對比一眼便知。
叛軍被打得節節敗退，忠誠派地面兵力佔優，天上有艦隊增援，更別說帝國親王親自指揮，基本穩操勝券。
哪怕不知陰謀真假，至少應該站在勝利一方，避免戰後清算。
如果此時倒戈到叛軍，就會有首鼠兩端的嫌疑，被叛軍當成炮灰，證明自己的立場。
所以任憑薩凡主教口燦蓮花，叛軍和忠誠派已經涇渭分明，沒有任何作用。
與此同時，司令部堡壘內，薩凡憤怒地質問他的親信：
“馬蒙，你當初建議我來弗拉克斯，不會一早就和帝國叛徒勾結了吧！我忠於神皇，怎能跟叛徒爲伍！”
從一開始，薩凡反對只是帝國，不是神皇，阿爾法是神皇敵人，根本沒打算與他們攪在一起。
在馬蒙協助下，他成功掀起宗教狂熱，之後發生一切完全偏離軌道。
不僅帝國察覺不對，叫停巡遊，把薩凡召回泰拉，還導致阿爾法軍團提前介入，將薩凡架空成爲傀儡。
原本歷史上，薩凡主教掀起宗教狂熱，在弗拉克斯成功叛亂，被克里格暴打後阿爾法才介入。
此時由於賽義德提前介入，薩凡沒起任何作用，逼得阿爾法提前跳出。
馬蒙臉色不復之前的恭敬，平靜道：
“主教閣下，這場戰爭已經不在你的掌控之中，服從九頭蛇的指示，發揮應有作用，纔是最好的選擇。”
薩凡面色陰沉問道：“馬蒙，你何時投靠了叛徒？”
馬蒙也不裝了，手一攤說道：“你是指阿爾法嗎？我在認識你之前，就已經爲他們做事，我們都是此次叛亂的棋子。”
“帝國的腐朽，教會的腐敗，軍隊的暴虐，都是我們讓你看到，讓你反思，讓你發動聖戰！”
薩凡面若死灰，感情自己的偉大理想，不過是叛徒手中玩物，猶如吊在毛驢面前的胡蘿蔔，可笑至極。
這一刻，薩凡的信念崩塌，發出愧疚絕望的哀嚎，與他同樣命運的，還有他的大批門徒追隨者。
在堡壘之外，混沌信徒正舉行各種褻瀆儀式，他們抓來囚犯和平民，在震天的慘叫聲中，弱化現實與亞空間的帷幕。
阿爾法軍團清楚，僅靠現有兵力，根本無法與帝國抗衡，所以在叛亂開始前，就已經和混沌教派搭上線，準備各種褻瀆儀式。
茫茫多的惡魔從堡壘涌出，殺向忠誠派的陣線，有了生力軍增援，叛軍穩住陣腳，與忠誠派僵持。
但來自天上的打擊一顆不停，軌道轟炸成批成批屠戮惡魔，叛軍依然處於下風。
賽義德無奈嘆息，忠誠派輔助軍與惡魔接觸，靈魂遭到污染，此戰無論輸贏，他們都必須被淨化。
與其戰後被淨化，不如英勇戰死，驕傲地前往黃金王座。
於是賽義德命令全軍不得後退一步，傀儡輔助軍組成督戰隊，槍決任何潰退的逃兵。
賽義德拼命掩蓋戰後處決的真相，但阿爾法可不會讓賽義德如願，潛伏在忠誠派中的間諜悄悄散步流言，說戰後凡人輔助軍會被清洗。
賽義德得知後，立刻指揮政委和憲兵督戰隊四處搜捕，以擾亂軍心罪名，槍斃大批散佈留言的軍官士兵。
除了阿米吉多頓，帝國清洗惡魔入侵倖存者並不多見，所以士兵們半信半疑，暫時保持忠誠與穩定。
但賽義德心中已經隱約有種不好的預感，作爲計劃通阿爾法，肯定還有後招，但他一時猜不到。
他決定以力破巧，立刻命令星區守備軍團增援，但弗拉克斯星系卻出現強烈的亞空間風暴，援軍無法靠近。
星區司令正是暗黑天使戰團長——阿茲莫代，他立刻申請一座黑石要塞，掩護軍團艦隊穿過亞空間風暴，增援弗拉克斯。
至此，賽義德心中稍定，只要有軍團抵達，無論弗拉克斯出現什麼牛鬼蛇神，都將被一舉掃平。
但在援兵抵達之前，阿巴頓便根據混沌教徒的信號，率領黑軍團艦隊抵達星系外圍。
至此，忠誠派失去制宇權。