不過，在這之前還是儘量多做準備，自己的頭腦遠不如新一好使，那麼多做些預備絕對有好處，自己無論何時都必須留有底牌和自保力量才行。正如孫子兵法裡面說，“夫未戰而廟算勝者，得算多也，未戰而廟算不勝者，得算少也。多算勝，少算不勝，而況無算乎？”千鈞的相貌依然沒有什麼變化，可是相熟的人感覺千鈞的氣質與以前相比大不相同，給人一種非常玄妙的感覺，與他同居的幾個女孩感覺最爲明顯。
整個秋季學期千鈞都隨着新一東奔西跑的處理案件，絲毫沒有察覺吉野綾花最近心事重重，她幾次想向千鈞提出來，可是話到嘴邊就又改了口。綾花知道自己捨不得這裡的一切，整整4年相處，那種彼此信賴彼此相知的感情，早已潛移默化的影響到了她的身心。可天下沒有不散的筵席，她馬上就要大學畢業了。綾花接到家裡的來信，知道有些事情自己必須去做，也是到了與千鈞分別的日子了。不過，在那之前，自己還有一件重要的事情要做，完成自己也是千鈞嚷嚷了4年的心願。
時間飛快流逝，1996年終於到來，千鈞已經17歲，時間依然在向前運行，人的生物鐘卻全部開始進入緩慢的停滯狀態，而所有的人都毫無察覺，只有千鈞明顯感覺到了這種影響巨大的變化，心中動盪不安。接下來的寒假，千鈞除了回到家裡陪爺爺、父母和曉月外，就是與好友文良、普立、飛霄、立彬等進行聚會，到新莊家看望師祖，去天文臺拜訪那位老館長和藤森香保留，約阿笠博士和藤野樹人商談了手機生產的問題，還諮詢了博士網絡的一些問題。
寒假過後進入考試月，千鈞由於陪新一在案件上花費了大量時間，這次期末考試的成績在班裡只佔到了中游，而新一依然是名列前茅，這就是天才。在日本，高中階段就開始學習高等物理學、高等有機化學和微積分數學，據說在z國這些知識居然要到大學才學習，被日本人視爲笑談，難道他們初中和高中一直學幾何和代數嗎？
千鈞最討厭的就是日本的歷史，尤其是近代歷史，很多地方明顯有篡改痕跡，別人不知道，可千鈞親耳聽家裡那位爺爺談起過他們當年搞出來的事情，而且還沾沾自喜從不掩飾。而藤野先生對當年的事情是深惡痛絕，提起來也是一臉懊悔。可是有一點，他們都沒有掩飾當年的真實情況，反而是歷史書寫得狗屁不通。用新一的話說反正都臭了，不如拿張紙掩蓋一下，至少糊弄一下這些青少年，其實等他們稍微長大點就明白了當年的事實，如同z國在歷史上也強調一個黨派的重要性刻意忽略另外一個黨派在那場戰爭中所起到的重要作用一樣。千鈞聽完新一的高論，徹底無語，這個好像性質差得多了點。
考試結束後，進入春季，千鈞就主動約了靜楊、小雅、直子、由美和綾花一起去富士山看櫻花，他想在事情開始前好好陪陪她們，他現在也不知道一旦劇情開始會發生什麼樣的變化。幾個女孩都奇怪千鈞突然變得曲意逢迎起來，靜楊說他一定是做賊心虛，或者打算做什麼壞事。大家都想到了千鈞那個在高中畢業前變成禽獸的言論，全都恍然大悟。千鈞這個怒，自己這次可真的沒忘那個地方想。看着她們幾個女孩笑盈盈地一起站在繽紛飄落的櫻花下拍下合影，千鈞忽然想起一句詩，待到山花爛漫時，她在叢中笑。
隨着春季學期開學，大家正式進入高中二年級，新一出於案件原因考慮，與千鈞商量後二人雙雙退出足球隊，而這時候的麻美學姐已經考入大學離開帝丹高中。曉月進入帝丹國中三年級，在大阪的千尋進入改方國中一年級，吉野綾花正式拿到了大學的畢業證。
這時候，劇情的齒輪已經完全啓動了。新一決定儘快把小蘭給推倒，於是問計於千鈞。千鈞惱怒，這是把我當做愛情顧問了，轉而一想自己還不是諮詢過兩位妹妹。千鈞就給他制定了一套最簡單的辦法，先請小蘭去樂園玩，在這過程中找個適當的機會進行表白，小蘭接受後，在回來時請小蘭到工藤宅喝咖啡，如果小蘭肯去，那就好辦了，剩下的事情就是新一搞定她。等小蘭這邊徹底解決後，再考慮去大學找內田麻美，至於能否順利實現新一的願望，只能看天意了，所謂謀事在人成事在天。
幾天後，目暮警官突然打電話過來請他們過去幫忙，新一和千鈞就知道目暮警官肯定碰到了棘手的案件。果然，等他們過去時，目暮警官介紹，八菱銀行總經理山崎先生莫名奇妙死在樹老爺家的一間密室裡面，這個樹老爺今天舉行了宴會，邀請了很多客人。老爺由於腳受傷，一直坐在輪椅上。管家、女僕和下人們都忙着招呼這些客人，後來才發現山崎先生不見了，等找到時就已經遇害身亡了。
新一一聽就明白了，這是典型的密室殺人案件，而且密室窗戶下沒有任何腳印。新一開始進行了周密的調查，很快就有了結論。“什麼？工藤老弟，你已經知道密室的手法了？”目暮很是吃驚，這個太快了點。新一自信滿滿，“兇手是利用了房間的樓檐結構，設法用了陽臺和繩子，進入密室作案。”目暮詢問具體的手法，新一根據推理詳細解釋了兇手的手法，並且讓目暮警官派手下調查陽臺的痕跡。
樹老爺在旁邊大吼大叫，揚言要目暮警官趕快停止調查，因爲這影響到了他的客人們。目暮警官和氣的推拒，詢問新一是否兇手就在宴會上？新一給了肯定的答覆，所有人吃驚起來，樹老爺怒吼要將新一趕走。目暮滿頭汗，笑着問新一兇手到底是誰？新一拉風的伸出手，“在這段時間內能夠自由活動而又不讓人起疑的只有一位，兇手就是你。”
大家驚訝的發現新一所指的兇手竟然是老爺，他當然拒絕承認。新一說，能把山崎先生騙到那間密室而又非常熟悉房屋結構的人只有這位老爺。大家都疑惑老爺的腳上有傷，怎麼能做出那麼多複雜的動作。目暮警官這時接到手下的報告，原來新一已經提前讓人諮詢了老爺的主治醫生，他的腳上已經痊癒了。
老爺還死不承認，新一冷笑，突然踢出足球擊向老爺，老爺大急之下在大家驚訝下目光從輪椅上跳起來逃跑，剛跑到門口，他就看到了滿天星星，然後華麗的倒在地上。千鈞像拖死狗一樣把他拖過來扔到了目暮警官面前，目暮警官正式將其逮捕。老爺殺死山崎總經理的動機是私底下與山崎先生有金錢交易，後被法庭二罪俱罰，判處8年徒刑，新一和千鈞受到警視廳b級獎勵。
案件結束後，大家剛出門口，一大堆新聞記者就把工藤新一給包圍了，在一片閃光燈下新一侃侃而談，自信滿滿。千鈞自然把風頭都讓給新一，自己落在後面一言不發。由於新一憑藉過人的推理能力，已經多次幫助警方破獲大案，所以也被稱爲日本警察的救世主。目暮警官很讚賞新一，使勁拍他，新一鬱悶，忍得很辛苦的。
在這個瘋狂崇拜推理和高智商犯罪的世界，媒體一致讚譽新一和千鈞是平成年代的夏洛克福爾摩斯和華森醫生，此時新一的名頭已經遠遠超過原本的世界的狀況，私底下已經有人認爲工藤新一是日本第一的名偵探，至於千鈞自然被大家華麗的忽略了。在趕往警視廳做筆錄時，千鈞突然發現外圍出現了兩個生命磁場非常不規則但很強大的人物，千鈞感嘆終於來了啊，只有天化組織的超級戰士纔會有這種奇怪的生命磁場。千鈞謊稱綾花讓自己去幫她挑選內衣，在新一和目暮警官戲謔的眼光下匆匆開車離去。
夜晚，在一間隱秘的餐廳裡，劍齒虎問，“暴龍大哥，這次組織派人取什麼東西這麼重要？居然出動了西非獅和北非獅，還讓我們做預備人員。”暴龍搖了搖頭，“我也不知道，但是不是取東西，是銷燬，那個樹老爺手裡面有一份跟我們組織交易的資料。”劍齒虎奇怪，“派超級戰士的話，一個就夠了啊。”暴龍嘆氣，“自從渡渡鳥單獨行動成功逃脫後，組織就規定所有超級戰士行動至少要2人以上才行。”這時候，暴龍接到外圍人員傳來的消息，那份資料已經銷燬了，大家放鬆一下後就能回去了。
而這時候，西非獅和北非獅正笑着離開樹宅，打算去找yj的學生妹happy一下，剛走到牆下準備飛躍離去時，突然聽到了奇怪的聲音，一張奇怪的帖子從空中飛落到二人面前，瞬間燃燒起來。空氣中傳來聲音，“一旦無常到，方知夢裡人。萬般帶不去，只有惡隨身。”二人馬上反應過來是超音波攻擊，來得可能是渡渡鳥。他們也是高頻率聲波攻擊的高手，他們忍住音波攻擊，快速起跳，接着傳來槍聲，西非獅不敢置信的看到北非獅的眉心中槍倒在地上，忽然他醒悟過來，那個死神帖上一定有什麼奇怪的東西導致了北非獅行動遲緩了一下。
傳說中的龍魂使者到了，死神帖與情人槍。西非獅發出驚天怒吼，強大的音波將附近建築的玻璃全部震碎，可戴着龍形面具的龍魂使者絲毫未受影響，他手中一把飛快的紅色短劍如影隨形的追上西非獅，西非獅高速飛退，瞬間開槍，卻沒有擊中龍魂使者，他也只想延緩一下龍魂使者的速度，可惜根本沒有起到作用。
飛速前行的龍魂使者掌中的紅劍劍氣已經追上了西非獅，西非獅驚駭萬分，“你不是渡渡鳥……”，話音未落已經被劍鋒切斷頸部。確認二人已死後，龍魂使者收回彈殼等東西，隱身於黑暗中離開，當然他順便以隱秘的方式通知了秘密調查局的外圍人員。
回到住處的千鈞的收拾利索後，全身也是被汗水溼透了，這次行動的出手時間沒有超過5分鐘，千鈞已經使出了全力，並且做了周密的計劃，那個死神帖上他破例放置了代表星際塵埃的毀滅力量，還使用了生命磁場的保護、五音之波、暗之隱身，風之飛翔，以及以氣御劍和高速射擊的能力，還動用了瀝血劍。
剩下的事情他相信那位山本一夫大叔會搞定的，最好能抓到天化組織的高級成員。山本一夫這時候已經趕到現場，下令全力封鎖樹宅，並立即派人向警視廳瞭解樹老爺的案件情況，要求提審此人。山本同時下令徹查樹老爺從小到大的一切情況，並觀察了2具屍體，全是一擊必殺。
他立即推斷出是龍魂使者的手法，再加上莫名的通知，他就笑了，果然敵人的敵人就是朋友，看來龍魂使者是渡渡鳥無疑。那麼這兩個人應該是天化組織的高級成員，甚至是超級戰士。秘密調查局根據從兩個死者身上找出的線索緊急出動，開始全力追查天化的秘密據點。
不過，得益於西非獅的強大的音波攻擊，暴龍與劍齒虎也得到了消息，二獅已死，山本一夫出現，暴龍也是大驚失色，他實在想不出來兩隻獅子是怎麼暴露的，秘密調查局的人怎麼輕易殺死他們的。劍齒虎大怒，他認爲一定是那兩頭色獅在玩女人的時候口無遮攔不小心泄露了行蹤。
暴龍點了點頭，他也知道那兩個傢伙的個性，嘆了口氣，他已經緊急下令切斷相應的聯絡線，並讓組織人員儘快轉移，至於二獅的屍體是弄不回來了。很快消息傳來，相關外圍組織成員只來得及轉移了部分人員，其他的地方都被山本一夫的人強力摧毀，不少人員戰死和被俘，不過幸好所有的線都已經切斷了。
山本一夫已經從那些被俘的人員嘴裡知道了這兩個死者正是組織的超級戰士，代號西非獅和北非獅，這次是來銷燬一份資料，這兩個傢伙非常好色，不過他們知道的也僅僅如此了，那個樹老爺更是一問三不知，看來只是因爲某種原因湊巧捲入了事件。不過，這對山本一夫來說，這已經足夠了，那兩人的屍體他已經秘密帶回讓專業研究人員檢驗，這還是秘密調查局第一次弄到超級戰士的屍體，可以說是巨大的成功，相信高層人員知道檢驗結果後會重新給以自己暴力行動自主權。
山本一夫心情舒暢，他知道渡渡鳥這次向自己示好，擺明了有結盟的意思，雙方在沒有會面的情況下，就配合默契，第一次聯合行動就給了天化組織沉重的打擊，這是好的開始。一個特別小隊隊長嘆息，“如果這兩個超級戰士活着就好了，我們就能知道更多的情況。”山本一夫淡淡的說，“有時候死人說的話也不少，你們都說說看，從現場和屍體上還能告訴我們什麼？”一個手下分析：“這裡有好幾個警方看守被打暈，說明他們要銷燬的資料非常重要，而且這兩人很厲害，他們不想把事情鬧大，因此沒有殺死任何一個看守。”
另一個也說：“音波攻擊，這應該是兩個超級戰士之一的特殊能力，他們兩個身上都有槍，應該槍法不錯。”另外一個陰沉的說：“龍魂使者不但是個用槍高手，還是劍道高手，速度也很快。應該有對付音波攻擊的辦法。他使用的子彈是特製的，現場沒有找到彈殼，說明他非常縝密。”山本一夫對手下的推測非常滿意，“我們要回去會找出對抗音波攻擊的方法，還有，想辦法查明白這兩隻色獅接觸的女人，男人在做那種事情的時候難免會透露些什麼信息。”;