自由聯盟政府與金獅帝國的談判從一開始就遇到了困難。
最初，被派來談判的代表都是雙方軍部的人——兩名將軍，更確切地說，就是帝國混編艦隊的指揮官辛巴德上將與自由聯盟紅星野戰軍團的指揮官崑崙上將。兩名剛剛打過一場硬仗，猶如仇人一般的傢伙，在談判桌的兩邊坐了下來。
可是？這兩位將軍剛剛進入談判室沒有多久，在談判室門外等候的衆多媒體就看見兩名上將氣勢洶洶地從裡面走了出來。兩人都沒有理睬打算上前採訪的記者，互相只留下一句：“戰場上見！”，然後就徑直離開。
第一次談判破裂了。自由軍在談判破裂的當天，就恢復了對小行星帶的攻勢。崑崙上將的旗艦毀滅級母艦紅星號一馬當先衝入小行星帶中。除了主炮沒有發動，紅星號上其他的武器系統都被啓動了。紅星號旁，自由軍的各式戰艦都爭先恐後地衝入敵陣。帝國混編艦隊佈置在小行星帶邊緣的防守力量根本低檔不住紅星號的攻勢，幾乎一觸即潰。自由軍重新回到了小行星帶。
當紅星號推進了將近四分之一的星域後，帝國混編艦隊的旗艦晨星號出現在了戰場上，跟隨着晨星號是混編艦隊的主力艦隊。小行星帶中再一次烽煙四起。無數漂浮在小行星帶中的隕石都被高能炮瞬間氣化。帝國軍和自由軍就像兩隻巨大的猛獸在這一星域互相撕咬。怪獸身上不斷地有血肉被對方咬下。
帝國艦隊自從佔領的小行星帶後，就在這裡建設防禦系統，這一次，這些系統起了大作用。在這些防禦系統的協助下，混編艦隊抵擋下了自由軍的這次猛攻，兩艘毀滅級的母艦最終都沒有進行主炮對轟。畢竟，雙方都不想看到那種兩敗俱傷的局面。
在雙方又損失了不少戰艦之後，戰局再次陷入僵局。帝國在武器系統上佔有優勢，而自由軍在數量上的優勢彌補了武器質量上的一絲不足。於是，雙方再次回到了阿瑞斯星上的談判桌前。
第二次談判的代表換人了。帝國派出了內務部的高官，而自由聯盟也派出了專業的外交人員。這一次談判進行了整整一天，談判結束後，帝國代表沒有接受媒體採訪，而自由聯盟的談判代表則對媒體說：“雖然，這次談判取得了一定的進展，但是，彼此之間還是存在了一定的歧義，我們都將和自己的政府彙報後再開展下一階段的會談。”而就這個歧義是什麼？自由聯盟的代表卻不肯再透露。
雙方的歧義其實就是關於小行星帶的歸屬問題。自由聯盟政府在接到自己的談判代表的彙報後，給出的底線是：“不能放棄小行星帶。”而帝國方面給自己代表的底線則是：“一定要獲得小行星帶上的那些礦場。”
在雙方代表等待彼此的政府最終的授權時，小行星帶中，自由軍又發動了幾次小範圍的攻勢。雖然大部分都無功而返，不過在其中的一兩場戰役中，自由軍突破了帝國的防線，深入了另外四分之三的星域。而帝國艦隊則在這幾次小範圍衝突中，也有幾次反攻入自由軍佔領區。當雙方的談判代表第三次坐在了談判桌上時，整個小行星帶上的勢力分佈形成了犬牙交錯的狀態。
由於雙方代表都得到了自己政府的授權，這一次談判比前一次更深入。談判過程中雖然因爲一些細節達不成一致，不過總體上雙方都取得了一定的共識。在三天的談判結束後，雙方代表一起出現在媒體面前，並且發表了聯合公報：“此次談判求同存異，我們在很多方面都形成了一定的共識，但是，目前還有部分細節需要經過彼此的領導人最後確認後才能最終公佈談判的成果。”
第三次談判結束後大概又等了一週時間，其間，小行星帶沒有再發生任何的戰事，雙方都很默契地停火了。
當第四次談判的時候，帝國的首席談判代表變成了商務大臣，他在進入談判室前對媒體說：“此次，我得到了皇帝陛下的全權授權，我相信，有關小行星帶的問題，一定能夠在今天得到解決。”而自由聯盟排出的首席談判代表卻是自由聯盟政府外交部長卡儂，卡儂在談判開始前，也對媒體說：“我得到了我們政府的授權，我本人對今天的談判結果保持樂觀。”
第四次談判沒有像前幾次雙方都是由10來個人出席，這次除了首席談判代表外，各自只帶了兩名助手。兩個政府高官在談判室中進行了將近6個小時的會談，當他們再次出門時，他們在會談室的門口互相握手，並且一齊宣佈：“此次會談很成功。”
歷時1個半月的小行星帶的戰事在阿瑞斯星上的第四次談判之後結束了。帝國和自由聯盟政府在這裡簽署了最終的停戰協議。這也是自由聯盟政府成立以來第一次真正意義上與帝國簽訂的和談協議。從某種程度上來說，帝國已經將自由聯盟視爲了真正的對手，而不再是原先一直稱爲的內部叛亂分子。這次協議被以談判簽署地命名爲阿瑞斯停戰協議。
阿瑞斯停戰協議規定，帝國佔有伊斯卡利星與西格瑪星系之間小行星帶四分之三的星域，而自由聯盟政府則佔有四分之一的星域。雙方最後一次交戰的那片範圍爲10萬平方公里的星域則成爲了真空帶，這裡是帝國和自由聯盟的在小行星帶中的分界線。
阿瑞斯停戰協議生效後，雙方需要互換戰俘，由於帝國戰時都將來自自由聯盟的俘虜，包括士兵和平民都關押在了伊斯卡利星球上，因此，帝國派遣了5艘運輸飛船將這些俘虜運往自由聯盟的星域。不過，在運輸途中，有3艘運輸船卻莫名其妙地失蹤了，只有2艘按時抵達了俘虜交換點。接到消息的自由軍和帝國艦隊同時派出了戰艦搜尋失事的星域，不過根本沒有找到那些失蹤的運輸船，於是這三艘運輸船上的人被計入到戰爭死亡及失蹤人數之中，由帝國出面，給那些失蹤者的家屬進行了經濟補償。這只是雙方在履行阿瑞斯停戰協議中的一個小插曲。不過，在半年後，據說在一些偏遠的礦場或星球上，有人發現這些失蹤戰俘，但彼時，這些戰俘都成爲了奴隸。
海神星那個神秘組織5號的私人療養院中，5號在參加組織的秘密會議。1號說：“這一次，大家都做的很好，我們不僅讓自由聯盟受到了教訓，而且，我們還獲得了一批質量不錯的奴隸。”
“這都是1號的領導英明。”剩餘11人齊聲迴應。
“這一次，5號和9號的功勞最大，所以，我決定在下半年的分紅中，額外給他們獎勵百分之一的紅利，大家沒有意見吧？”1號又說。
“我等都無異議。”其他人附和。
“謝謝1號。”5號和9號則恭敬地說。
“好，爲了我們共同的事業，請諸位再接再厲！”1號說完結束了會談。
自由聯盟政府，克勞德主席的辦公室中，神秘人影子已經坐在了克勞德主席的辦公桌前。
“我的老朋友，今天我給你帶來了你所需要的信息。”影子和往常一樣將自己裹在厚厚的黑袍裡。
“你們知道了那個搗鬼的第三方是誰了？”克勞德非常有興趣地問。
“這是一個叫做商業聯盟的組織。他們是一個非常古老的組織，他們的歷史據說可以追溯到起源星時代。”影子回答。
“哦？商業聯盟！”克勞德輕輕地重複着這個名字，突然他問：“你們知道他的成員是誰？”
“他們的成員分佈整個人類社會。不僅僅是在金獅帝國那裡，我相信，就連你們武穆星中也有他們的成員。”影子說。
“你說我們自由聯盟裡也有這個商業聯盟的成員？”克勞德將身子往前探了探，他說話的時候，眼中一絲精光閃過。
“是的。不過，我們無法知道所有會員的真實身份。我們所獲得的消息是，這個組織的一切行動都是由一個最高委員會安排的。這個委員會一共有12名委員。”影子依舊保持了自己淡淡的語氣。
“我想你來找我，肯定不會是單單告訴我有這麼樣的一個組織存在吧？我想，你們或許已經知道了這個組織某些人的真實身份了？”克勞德又將身子靠回了椅背上。
“是的，我的主席先生。雖然我們無法知道商業聯盟的所有人的身份，但是，我們還是通過特殊的渠道，打聽到了其中的一個。他是一名帝國的貴族，但同時，他也是一個暗殺組織的老闆。”影子突然停住了。
“暗殺組織？”克勞德一時沒有反應過來，他反覆咀嚼着這四個字，突然，他像是想到了什麼？“你的意思是？”
“是的，你終於想起來了。我們調查的結果顯示，引發此次帝國與你們自由聯盟戰爭的那一系列刺殺活動，就是由這個暗殺組織執行的。”影子說完，看着克勞德。
“謝謝你的消息，我知道接下來要做什麼了。”克勞德意味深長地說。
就在克勞德和影子談話的時候，帝都，情報署長巴頓的私人別墅的密室中，巴頓正在和1號進行密談。
“9號，你做的很好。”1號說。
“1號，你爲什麼要我把消息露出去？”巴頓對自己做的事情還是感到迷惑。
“5號在這些年做了一些損害了我們共同利益的事情。因爲上一年組織的收入突然縮水，我纔會安排人手去調查原因。這一調查，不僅讓我知道自由聯盟所做的損害我們利益的事情外，還讓5號的那些見不得人的事情浮出了水面。”1號說到5號的時候，口氣很冷。
“那5號做了些什麼事情呢？”巴頓有些好奇。
“這個不是你需要知道的。”1號突然語氣生硬地對巴頓說。
巴頓是心頭一陣寒意。“我知道了，1號！”
“9號，你要記住，只要對組織忠誠的，組織就絕對不會虧待你，但是，任何敢損害組織利益的，無論是誰，都會受到嚴厲的制裁。”1號重重地講。
“我明白了，1號。能爲您和組織盡力，是我的榮幸。”巴頓非常真誠地說。
“你很好。我已經將重新獲得的行星礦場中的一箇中型能源礦場劃到了你的名下。這是組織對你的獎勵。”1號很滿意巴頓之前的那番話，他的語氣又變得平緩。
“謝謝您！”巴頓有些驚喜地回答。