藉着日本和軍部把全部注意力都集中在‘諾門坎’前線的時機，孫百里毫不猶豫地向臺灣各地派出大批間諜，在經濟、軍事情報的同時，不遺餘力地鼓動島內民衆的反日情緒，爲即將展開的軍事行動作鋪墊。
起先，福建方面都是利用走私販、漁民和一些主動到大陸來參加的愛國志士進行地下工作，隨着人員來往的逐漸增多，開始向社會的各個階層滲透，而日本人此時大力推出的改用日本姓名的運動更是起到了推波助瀾的作用，把很多搖擺不定的中間派推到了大陸這邊。
面對如此喜人的形勢，孫百里隨即開始進行登陸臺灣的軍事部署：首先，派出大量的精幹小分隊深入島內，在日軍重點佈防的地區潛伏下來，準備迎接大軍登陸；其次，命令諜報人員用日幣假鈔收購糧食，在阿里山地區設立秘密倉庫，作爲戰略物資儲備起來；再次，從國土防衛司令部下屬的各部隊當中挑選福建本地士兵組成臺灣軍團，在福州的訓練基地集中訓練，爲了提高官兵們對臺灣的認識，孫百里特意讓工兵部隊在訓練基地按照5：1的比例修建了登陸地點灘頭的模型，由攻擊部隊反覆演練，直到爛熟於胸；最後，對從美國買回來的幾艘退役登陸艇全面整修，作爲運輸重型裝備和士兵的工粳爲了彌補運力不足的缺點，馬尾船廠生產的快艇也全面改裝，增加了裝甲和武器，另外，還以安全檢查爲名，對沿海各港口的商船和貨輪進行了認真的評估，準備在戰時徵用部分可用的船隻。
就在戰場陷入短暫和平，日本全力投入‘諾門坎’前線的時候，野心勃勃的希特勒和心懷鬼胎的斯大林指示各自的代表在莫斯科正式簽署了《蘇德互不侵犯條約》和《附屬秘密議定書》，結成軍事政治同盟，準備一起瓜分波蘭。本來，希特勒和日本結成的*同盟，原本就是要聯合日本共同對付**控制下的蘇聯，可是希特勒一轉身就把這個同盟破壞掉，反而和蘇聯打得，使日本和軍界普遍感到被出賣了，最後，怒不可遏的日本命令駐德大使以此條約違反《日德防共協定秘密附屬協定》爲由，向德國提出了強烈抗議。
然而，已經鐵了心要把日本甩開的希特勒怎麼會在乎軟弱無力的抗議呢，遭受羞辱的日本和軍部就把矛頭對準了一直主張與德國結盟的平沼首相。由於受到國內政治勢力的猛烈抨擊，8月29日，平沼被迫宣佈辭職，他在辭職聲明中痛悔莫及地宣稱：歐洲形勢複雜離奇，我國以往的政策到此爲止，本人辭職下臺，日本帝國需要新的首相新的內閣，另行制定新的外交政策。
日本統帥部認爲，希特勒之所以毫不猶豫地拋棄日本，選擇了蘇聯，就是因爲斯大林認爲蘇聯更有實力，如果‘皇軍’能夠在‘諾門坎’地區擊敗蘇聯軍隊，展示日本的實力，就能夠有力地回擊希特勒，讓他爲拋棄日本而感到後悔，於是日本關東軍迅速集結大量兵力，準備徹底擊潰對面的蘇蒙聯軍。
1939年8月4日，日本陸軍省部發布命令，從關東軍抽調精銳部隊組成第6軍，專門負責諾門坎方面作戰。而蘇聯方面也毫不示弱地向‘諾門坎’地區集結，在八月初就達到了三個狙擊師，七個坦克旅和兩個炮兵團的兵力，另外在防線縱深還有五個步兵師和大批飛機作爲預備隊。
8月23日，關東軍第6軍以七個大隊的兵力，從蘇軍左側翼迂迴進攻，結果鑽進了蘇軍的口袋，向來以悍勇著稱的日本陸軍精銳，在一望無際的大草原上被蘇軍倒克羣輪番衝擊炮轟，日軍中所有指揮官均相繼戰死，部隊被全殲。
隨後，日軍雖然也竭力發動攻勢，但是在蘇聯軍隊優勢的機械化部隊面前，沒有討到任何便宜，反而又損失了不少兵力，日軍無力再發動進攻，轉而採取守勢。
就在日本統帥部對‘諾門坎’局勢一籌莫展，不知如何收場的時候，從歐洲傳來了驚人的消息！
1939年9月1日，德國軍隊全線進攻波蘭，在歐洲燃起戰火！
日本對背信棄義的希特勒引發了歐洲大戰的導火犀感到幸災樂禍。由於受到希特勒所謂*協定的愚弄和平沼外交失敗的教訓，新任首相阿部信行於9月4日發表日本聲明：“值此歐洲戰爭爆發之際，帝國不予介入，決定專向解決事變邁進。”明確表示日本絕對不會去履行與希特勒簽訂的同盟條約，出兵攻打蘇聯，如果歐洲國家要攻擊德國的話，完全不用顧及日本憚度。
至於日本同蘇聯在諾門坎的戰爭，在阿部首相看來，那本來就是希特勒的事，日本人只是輕信了他的*諾言，才踩進了那片泥沼中，但是畢竟還沒陷得很深，現在拔出來還來得及。只有的戰爭，是日本自主發動的，打好打壞都是日本的事，不指望別人幫忙，更不想讓外人來干涉。日本內閣新任首相的聲明，實際上就是向西方各國表明，日本無意過問除事變之外的任何事情。
日本表面了自己憚度之後，日本陸軍部隨即命令關東軍停止調動軍隊，準備與蘇聯和平解決‘諾門坎’事件。
讓日本人意想不到的是，駐蘇大使剛剛向蘇聯提出停戰的要求之後，斯大林又一次像‘張鼓峰事件’那樣，馬上滿口答應停戰，而且其停戰的迫切心情，甚至比日本人還強烈！
原來，德國軍隊越過波蘭邊境之後，迅速擊潰波軍的抵抗，長驅直入，佔領了大片的波蘭領土，甚至連當初約定給蘇聯的那一部分也毫不客氣地收入囊中，因爲蘇聯軍隊還沒有波蘭。而蘇聯方面由於和日軍在‘諾門坎’激戰不休，無暇西顧，只能眼睜睜地看着希特勒把本屬於自己的土地據爲己有。故而，日本的求和正中蘇聯的下懷，就毫不猶豫地答應下來。
9月15日，日、蘇雙方在莫斯科達成停戰協議，次日，後顧無憂的蘇聯紅軍便大規模越過國境犀直撲波蘭，參與瓜分領土的盛宴。與此同時，集結在‘諾門坎’一線的軍隊和所有重型裝備，全部經過西伯利亞鐵路運往西線。‘諾門坎事件’和歐洲大戰的爆發，不但沒有牽制日軍一兵一卒，反而使日本統帥部徹底摸清了蘇聯的底細，專而全力對付，從而使軍民的抗戰更加艱難，加深了中日戰爭的殘酷性。
此時，日本統帥部新編的八個師團已經全部成軍，加入派遣軍的戰鬥序列，解決了一直困擾着敵人的兵力不足問題，於是開始籌劃發動新的攻勢，壓縮的生存空間，迫使其放棄抵抗。
駐紮在武漢的第11軍，雖然在南昌會戰中粉碎了軍隊的反攻，並保住了南昌，但是被第五和第九戰區夾擊的形勢並沒有改變，於是岡村寧次就集中了第三、第九、第13、第33、第101等五個師團，第三艦隊的艦艇三百餘艘，海軍陸戰隊一個聯隊，飛機百餘架，總兵力超過十八萬，準備從贛北、鄂南、湘北三個方向同時進攻，圍殲第九戰區中央軍精稅，並計劃於9月30日以前佔領長沙城，另外，爲了防止強大的第十九集團軍出閩作戰，岡村寧次特意把第15師團放在南昌，第17師團駐守鷹潭，互成犄角之勢，進行嚴密監視。
與此同時，日軍統帥部爲配合即將在南京粉墨登場的汪精衛政權建立全國性的親日這一需要，在南京設立派遣軍總司令部，統率華北方面軍（第一軍、第12軍）、第11軍（武漢）、第13軍（上海、南京）、第21軍（華南），以及在華全部陸軍部隊。爲了體現阿部首相專一對付抗戰這一新戰略思想，派遣軍的總司令部由日本陸軍三巨頭（參謀總長、陸相、教育總監）之中的兩個巨頭擔任統帥職務，教育總監西尾壽造大將任總司令官，陸相板垣徵四郎中將任總參謀長。
在岡村寧次開始攻擊長沙的時候，日軍統帥部又開始策劃新的攻勢，準備奪取廣西南寧及法屬印支北部，從而切斷通過南寧法屬印支的補給幹犀可打消法國援助抗戰的意圖，同時還可以作爲帝國海軍向內地，特別是以重慶爲中心的抗戰根據地，進行航空作戰的基地。日軍統帥部認爲，此時德國和蘇聯的軍隊正在忙於瓜分波蘭；英國和法國已經對德國宣戰，根本無暇顧及遠東，即使日本佔領了
法屬印支北部，直接刺激了法國也無所謂。
日軍的戰略部署是從廣東和廣西，兵分兩路，同時進攻，廣東方面由第18師團、第38師團、第104師團和第106師團從廣州向北主動攻擊第12集團軍，以牽制其增援廣西；廣西方面則以第五師團和近衛旅團、第5艦隊、第3聯合航空隊從欽州地區登陸，北攻南寧。
北路的岡村寧次發動攻勢不久，第21軍開始向廣州附近集結軍隊，大規模的部隊調動很快被第四戰區的情報人員察覺，並迅速送到孫百里的指揮部裡面。面對日軍如此猖狂的進攻，孫百里意識到一個千載難逢的好機會已經擺在面前，只要善加利用，完全可以徹底改變福建的戰略態勢，爭取到戰場上的主動！