爲了應對從2000年開始出現的侵略組織“創世者”（理論上爲舊十年全部的怪物組成，也有部分人類是其成員。核心領導者不明，目前活動最頻繁的種族爲奧菲以諾和Worm。內部劃分爲三個組織，戰鬥組織：掠食者；精銳組織：收割者；偵查組織：窺視者。其中收割者的每個成員，掠食者和窺視者的精銳均有對應的代號），人類組建了名爲“騎士聯盟”的官方抵抗組織，通過開發或收集騎士系統，遴選並訓練適格者，使他們以“假面騎士”的身份抗擊侵略者。
第一卷的故事發生在2020年，聯盟第一支部戰區，高文區部署了一次對創世者秘密據點的清剿行動，爲確保計劃順利實施，中央戰區派遣遊騎兵部隊（即騎士聯盟的精銳行動部隊）的高劍鳴（假面騎士Faiz），李晴希（遊騎兵部隊的專職聯絡員，隸屬中央戰區參謀部），劍熾風（假面騎士Kaixa）協同作戰。而在行動中，一個在據點中甦醒的，身份不明的人類青年，在意識恍惚的情況下，使用萊歐騎兵系統殺死六名聯盟的戰鬥員，卻在逃出據點後被劍熾風擊敗並俘虜。（第一章）
在對青年進行檢查後，聯盟發現他喪失了記憶，也無法查出關於他的任何信息，因此將其羈押。但當高劍鳴看到青年的容貌時，卻好像想起了過去的一些經歷，令他倍感驚愕，也有意無意地想要袒護這個俘虜。當晚，青年被不明身份的人釋放，卻在離開聯盟分部後遭到螃蟹奧菲以諾的追殺，但在後者即將得手時被一個來路不明的騎士，林銘士（假面騎士decade）救下。（第二章）
雖然林銘士救下了青年，但卻也對他動用私刑，此時引發了高劍鳴的不滿。在離開聯盟後，林銘士便與收割者的大將血玫有過交流，似乎他的身份與創世者有關。青年被救回後，按照高劍鳴的安排被收入一間普通監室。此時，創世者突然襲擊市中心醫院。聯盟緊急出動時，埋伏在聯盟內部的窺視者成員“潛爪”（鼴鼠奧菲以諾）來到青年所在的監室中欲要奪取暗藏其中的Delta腰帶。但在關鍵時刻，青年憑藉直覺完成變身，擊殺潛爪。也令趕回來的衆人大爲驚愕。（第三章）
Delta是一條被聯盟雪藏十餘年的騎士系統，因爲至今都沒有人能夠使用。因此高劍鳴通過自己的身份上報中央戰區，在得到參謀部的理鍔參謀長和戰務部的張雲泊總長兩名高層的批准後，向高文區的高層申請同意青年參與戰鬥。高文區的蔣區長最初嚴詞拒絕，但後來因爲祁巒秘書長的同意只能作罷，但祁巒似乎對青年的身份有些許瞭解。高劍鳴爲青年起名爲“易彬”，並安排他作爲自己的副手參與戰鬥。易彬對此言聽計從，也通過對蜘蛛Worm的戰鬥證明了自己的實力。但隨後，收割者的大將魔龍（人類名北騰，奧非以諾龍）突然現身，在搶走易彬腰帶上的核心芯片後，用一條沒有核心芯片的腰帶同樣變身爲Delta，令易彬陷入苦戰，幸好高劍鳴使用加速形態的Faiz奪回芯片，才幫助易彬脫險。（第四章）
因爲高文區出現了異常的收割者活動報告，中央戰區進一步增派人手。遊騎兵部隊的成員司空宏（假面騎士Kabuto），隊長吳天崎（假面騎士Blade）和中央戰區駐守騎士夜芷儀（假面騎士Chalice）被先後派往高文區，而他們和高劍鳴都是訓練兵時期的好友，也都因爲五年前一場被聯盟隱匿的舊事，對易彬心懷情愫。在此期間，收割者的大將戮翼（假面騎士Psyga），霜刃（鱟型Worm），血玫（奧菲以諾玫瑰），鬼蝠（奧菲以諾蝙蝠）逐一登場，並在高文區展開多起殺戮行動。同時出現的還有一直在追擊戮翼的青年，皇昭陵（假面騎士Orga）。易彬與前輩們一同與這些對手展開惡戰。（第五章，第六章，第七章）
在第六章中易彬成功救下一位名叫陳西峰的被害者，並在隨後的戰鬥中與司空宏，吳天崎一起擊殺霜刃。但其實陳西峰就是霜刃擬態的，假裝被擊殺也只是爲了繼續潛伏安排的戲碼。而霜刃和他背後一個不明身份之人，纔是整起陰謀的幕後黑手。而在戰鬥中，司空宏注意到，易彬的攻擊方式兼具收割者和騎士聯盟的影子，而在看到收割者的標誌時，會讓易彬陷入嗜殺的狀態。（戰鬥情節爲第六章，司空宏的分析在第七章）
其後，易彬和夜芷儀相遇，而夜芷儀似乎對易彬心懷憐憫，因此刻意地接近他。（第七章）兩人一同行動時，在別墅內發現了下一名被害者魏哲悉（死因是被鬼蝠射殺），隨後血玫突然化作奧菲以諾的形態出現在兩人面前，雖兩人攜手對抗卻仍處下風，最後在劍熾風趕到時血玫逃竄。此時易彬發現了被刻在牆上的描寫記憶女神摩涅莫緒涅的詩句。（第七章）
在戰鬥中，高劍鳴逐漸領悟了強大的意義，力量不是用於復仇，而是用於保護應該保護的人，因此被司空宏交付了由上一任Faiz適格者，同時也是高劍鳴的恩師，乾健託付的Faiz Blaster，升級爲爆裂形態，與皇昭陵一同斬殺戮翼。乾健已在兩年前的一場會戰中，因爲北騰的偷襲而死，而這也是高劍鳴對北騰仇恨的由來。在交談中，高劍鳴得知，皇昭陵也曾參與到兩年前的戰鬥中，因爲崇尚光明正大的對決，所以對北騰偷襲的行徑深惡痛絕，卻不料遭到戮翼陷害。同僚被害，自己也被收割者通緝，因此才離開收割者，獨自追蹤戮翼以報仇雪恨。經過高劍鳴的勸勉，皇昭陵決定在聯盟之外繼續對抗收割者，並和高劍鳴約好了下一次公平的對決。（第八章）
雖然收割者的戰將接連被擊殺，但鬼蝠精湛的射擊也使得越來越多的目標遇害。陳西峰向聯盟申請希望以自己爲餌，誘殺鬼蝠，但被聯盟拒絕，改由易彬擔任誘餌（第九章）。深夜，陳西峰利用時停能力離開聯盟找到北騰透露計劃。（真相是易彬是霜刃計劃中的核心，而鬼蝠兩次刺殺易彬未果，因此執意要殺死易彬。爲了以防萬一，霜刃便決定除掉鬼蝠。而北騰的目的是單純享受與易彬戰鬥並將其折磨的快感，因此霜刃和北騰暫時達成合作，在這次的行動中留住易彬的命）（第九章）按照計劃引誘出鬼蝠之後，聯盟全員出動，蔣區長也安排了本是狙擊手的秘書金杉支援衆人，最後除了北騰逃走以外，參戰的奧菲以諾被全數消滅，鬼蝠則被易彬和夜芷儀合力擊殺。（第九章）
隨着大部分對手被消滅，身處中央戰區，作爲衆人身後技術顧問的好友孫煕浩（中央戰區技術部部長）也分析出了這次事件的全貌，收割者的核心目標是一批生物化學專家，而在這些人之中還有一個最關鍵的人物：劉東政尚未被找到。衆人一邊處理戰區內剩餘的敵情，一邊搜索劉東政的下落。而易彬和劍熾風在偶然來到魏哲悉遇害的別墅時，易彬藉由現場遺留的一些蛛絲馬跡判斷這其中必有玄機，並發現了化學試劑架後的一扇暗門，隨後找到了藏在裡面的劉東政。劉東政原本非常不配合，但在看到易彬的樣貌後突然變得無比愧恨，就在他表示願意和兩人一同離開時，一直潛伏在衆人身後的血玫突然動手殺死了劉東政，並搶走了他口袋中的一管試劑。劉東政在臨死前，爲易彬注射了一管不明藥物，再次對他表示了慚愧後，囑咐他前往中央戰區去找張雲泊總長，之後死去。拿到藥物的血玫與北騰一同離開。霜刃也聯繫了一個叫翠魍的人，得知接下來在中央戰區會有大動作。而在別墅之外，林銘士也在暗處注視着，並且對易彬產生了興趣。（第十章）