如同曹操安排自己的心腹荀彧爲尚書令，以便自己決斷朝政一樣，周瑜特意指定由賈詡擔任尚書令。由於賈詡需經常爲周瑜的軍事行動出謀劃策，又任劉曄爲尚書僕射，協助賈詡處理日常事務。尚書檯下暫設尚書侍郎二十八人，以尚書左丞張承、右丞張範爲首。
黃門令負責照顧皇室成員的生活起居，傳達天子的旨意，也是一個十分重要的職務，爲防止宦官勾結作亂，周瑜特意啓用女官，以小喬的姐姐喬瑩爲黃門令，從女兵營中選取數十名長相俊秀的女兵，入宮照顧天子及皇太后等人。
文臣宣讀完畢，便是武將系列了。
袁紹謀逆，部下弒殺先帝，所任大將軍一職自是被剝奪，由周瑜執掌，成爲名義上的全國軍隊總指揮。董承傳遞衣帶血詔、驅除曹操有功，被封爲西陽侯，任職驃騎將軍，僅次於周瑜的大將軍一職。
爲安撫劉備，天子詔令封關羽爲壽亭侯、車騎將軍，兼任冀州刺史，張飛爲光亭侯、衛將軍，兼任幽州刺史。其意十分明顯，待擊敗袁紹、打下冀青幽並四州後，冀州和幽州的地盤就是劉備兄弟的了。劉備靡下週倉、廖化、杜遠、裴元紹等皆被封爲將軍。
甘寧被封爲左將軍，兼任水軍大都督，是江東水軍各部的最高統帥。
臧霸被封爲右將軍，兼任騎兵大都督，是江東騎兵各部的最高統帥。
高順被封爲前將軍，兼任步兵大都督，是江東步軍各部的最高統帥。
王越被封爲後將軍，兼任弓兵大都督，是江東弓兵、輜重兵各部的最高統帥，軍種包括弓兵、弩兵、投石兵、攻城兵等。
周瑜帳下的多員虎將全部得到了封賞，如張遼任鎮東將軍、徐晃任鎮北將軍、趙雲任鎮西將軍、太史慈任鎮南將軍、黃忠任北中郎將、魏延任南中郎將、周泰任西中郎將、程普任東中郎將、陳武任昭武將軍、凌操任奮威將軍、蔣欽任武威將軍、徐盛任橫江將軍、潘璋任破虜將軍、董襲任討逆將軍、祖郎任山越將軍、黃蓋任忠義將軍、韓當任鉅野將軍等。
天子的安危自是重中之重，詔書封女兵營統領陸倩爲皇宮侍衛統領，所率部下皆爲女兵，都是從女兵營中精挑細選而來，既要有過人的武藝，還要有赤誠的忠心。
在皇宮之外、都城之內負責治安的是羽林軍，統領是周瑜的貼身護衛長全柔，被升爲執金吾。羽林軍的將士全部由原周瑜的親衛隊組成，共三千精銳。
周瑜則從各軍中挑選一千精兵，新組親衛隊，統領由一直在暗中保護他的曹偉擔任，副統領爲曹陽，此二人在江湖上的身份則是伏虎派的掌門和堂主。
秣陵既爲都城，都城及附近的守衛自是一副重擔，主將不僅要能武，還要能文，善於與朝官相處，詔令由余姚營統領呂岱擔此責任，呂岱屬下的三萬屯田兵經過數年的訓練已經頗有戰鬥力，也隨着呂岱一起移駐秣陵。另在餘姚新募三萬屯田兵，半軍半農，繼續耕種糧食。
地方官員方面，按照周瑜的意思，對益州牧劉璋大加褒獎，加封其爲蜀侯，掌管益州。封馬騰爲涼侯，任職涼州刺史，另一股涼州實力強大的勢力韓遂則被封爲安侯，任職涼州別駕。
既然公孫度已經據有遼東各郡，爲了拉攏他，使其不和袁紹勾結在一起，天子下詔封公孫度爲遼東侯，改遼東爲平州，拜公孫度爲平洲牧，擁有平州的軍政大權。
鍾繇、裴茂治理關中一帶成績斐然，頗有民望，宜繼續留守，且二人以漢臣自居，效忠漢室，故天子下詔改司隸校尉部爲司州，由鍾繇任司州刺史，裴茂任司州別駕，替朝廷鎮守關中地區。
其餘各州刺史人選按照先前的安排，由陳宮任徐州刺史，魯肅任豫州刺史，張昭任兗州刺史，呂範任荊州刺史，孫權任交州刺史，諸葛瑾任揚州刺史。這些人都是當世之人傑，亦是周瑜的親信，劉備雖然不是很情願，但見此時揚、交、荊、徐四州已完全被周瑜統治，豫州和兗州大部分郡縣也都望風臣服了周瑜，劉備也只能是徒喚奈何了。
劉元登基的當晚，周瑜安排了盛大的晚宴，天子、三位皇太后皆參加，朝中百官以及參加登基儀式的地方官員也都參加了。江南的春夜溫潤柔和，酒宴的氣氛自是熱烈非常，能夠擁立新君，那可是一件大事，在觥籌交錯間，又有江南舞女翩翩起舞，演繹了一番江南的旖旎風情，令參加酒宴的衆人心情更爲舒暢。
酒宴結束後，周瑜回府，在皎潔的月光之下，獨自憑欄，任思緒飛揚。
作爲一個穿越者，周瑜深知，他已經改變了歷史歷史上漢獻帝劉協活了很長時間，被曹丕逼迫退位，是漢朝的最後一位君主。而現在，劉協提前死了，而自己另立了新君，不知道在後世的書本上，該會如何描述這一段歷史？
此刻，展現在周瑜面前的是一片波瀾壯闊的前景。經過這些年的蓄精養銳，讓轄地內的百姓們休養生息，周瑜已經有足夠的兵力和財力來爭霸天下而且隨着自己擁立新君，被封爲吳侯，升任大將軍，自己的名望將會達到頂峰。
秣陵城，已經是新的都城，還將源源不斷地吸引着天下有識之士來投，有了充足的人才，自己的霸業將會更快地得到實現，那時，百姓們將會真正地重新過上幸福安定的生活，而自己將會建立一個全新的中華帝國，對內發展經濟、普及教育，對外開疆拓土，讓中華帝國成爲全世界最爲強盛的帝國，讓漢人屹立於民族之林，永遠繁榮
一陣清風吹來，讓半醉的周瑜頭腦清醒了些。周瑜知道，要實現自己的終極夢想，還需要自己團結很多人，付出艱苦卓絕的努力，才能夠實現。。.。