人爲的麥田圈大多製作得非常粗糙。如圖是2007年8月1日麥田圈與2013年7月6日人爲仿製的圈的對比。
在很多麥田圈裡，麥稈折彎處會出現節點，是結構改變導致彎曲，且彎曲後作物還能正常生長。人爲用木板壓制麥田圈的方法無法產生這一現象。
很多麥田圈當年對土壤產生了某些深層次的影響，從而對第二年該麥田區域的作物生長繼續產生影響，以至於在航拍或衛星拍攝時可以看出部分麥田圈輪廓，這一現象被稱爲“幽靈麥田圈”，這也是人類所辦不到的。
在極端天氣下也有可能出現麥田圈。2013年7月29日，荷蘭stadskanaal下了一夜的雷雨，頭一天傍晚klundert夫人在麥田對面的一個公寓樓裡拍攝了一張照片。第二天雨過天晴，她就發現那個地方有幾個麥田圈在那裡，於是又拍攝了一張。
此外，描繪外星人外形的麥田圈也不少。其中最複雜的當屬2002年8月15日在阿雷西博天文臺附近出現的一個麥田圈。該麥田圈倒伏的麥子分很多高度，有從根部彎折的，也有從中間彎折的，也有從頭部彎折的，這樣構成了深深淺淺的明暗色階，人力幾乎無法完成。
至於外星人如何製造麥田圈，主要有兩種說法：一種說法是，麥田圈是“印”上去的，如圖是打偏了的麥田圈；另一種說法是，製作者是有智慧的，而不是智能機器。他們用“帶狀飛鏢”製作麥田圈，如圖“輔助線”支持這種說法。
典型的麥田圈，完全沒有破壞痕跡，麥稈絲毫無損地在被壓下而改變方向（並非踐踏或機械屈曲而成），麥田圈和周圍的土地上有一些人眼無法看到的磁性小粒，分佈均勻，離怪圈越遠顆粒越少；麥稈像分層編織：順或逆時計針方向間隔倒下，有時多至五層，但每粒谷仍像精緻安排的一般秩序井然；圖形以精確的計算繪畫；無論圖形多麼複雜、工程多麼浩大，它們都是一夜造就；並且，形成過程無人目擊。
也有人認爲，麥田圈只是一種自然現象，成因還未被人類發現。就像雷電，古時候人類也是以爲是雷神電母做的。
對於麥田圈中經常出現人文信息的現象，他們認爲這只是人們“先入爲主”造成的錯覺。
龍捲風說
從有關記載來看，麥田怪圈出現最多的季節是在夏天，有人認爲，夏季天氣變化無常，龍捲風是造成怪圈的主要原因。很多麥田怪圈出現在山邊或離山六七公里的地方，這種地方很容易形成龍捲風。也有氣象學家提出：大量塵埃包含在陸地上生成的小型龍捲風中，在風的作用下，塵埃與空氣劇烈摩擦產生靜電荷。神秘怪圈就是在帶有靜電荷的小型龍捲風的作用下產生的。
磁場說
有專家認爲，磁場中有一種神奇的移動力，可產生一股電流，使農作物“平躺”在地面上。美國專家傑弗裡·威爾遜研究了130多個麥田怪圈，發現90%的怪圈附近都有連接高壓電線的變壓器，方圓270米內都有一個水池。由於接受灌溉，麥田底部的土壤釋放出的離子會產生負電，與高壓電線相連的變壓器則產生正電，負電和正電碰撞後會產生電磁能，從而擊倒小麥形成怪圈。
預告說
一些人相信，麥田怪圈背後有種神秘的力量，就像百慕大三角一樣。根據這種猜測，有人認爲麥田怪圈是“災難預告”。
高頻輻射說
俄地質協會成員斯米爾諾夫決意解開此謎。斯米爾諾夫從麥田裡撿了一些蕎麥稈，並把它們帶回自己的實驗室。他把蕎麥稈放進微波爐裡，然後加入一杯水，在600瓦的高頻輻射下，經過12秒鐘，蕎麥稈發生了奇異的變化，所有試驗的麥稈都在節瘤處發生了彎曲，其形狀與陶里亞蒂麥田裡倒伏的麥稈完全一樣。斯米爾諾夫因此得出推斷，陶里亞蒂的麥田一定是受到了高頻輻射，但哪兒來的高頻輻射呢？斯米爾諾夫認爲，也許來自地球內部的磁場變化。
俄電工學院的專家阿爾將耶夫的觀點與斯米爾諾夫正好相反，他認爲高頻輻射來自閃電。阿爾將耶夫稱，高頻輻射使草本植物發生規律性倒伏並不稀罕，50年前他們就在學院的草坪上幹過這事。當年，阿爾將耶夫與兩名年輕的助手一起在學院的草坪上試驗高頻設備，當懸在草坪上的高壓電纜被接通時，電纜下方的草坪立刻呈順時針方向倒下，形成一個極其規律的圓圈。阿爾將耶夫解釋說，當電纜通電時，草坪被電磁化，此時的草坪相當於電機裡的定子，而電纜是轉子，在電磁扭力的作用下，草坪上的草便發生扭曲。阿爾將耶夫認爲，電纜所產生的電磁現象相當於人造閃電，而大自然的閃電更加奇妙，它會產生更加複雜的電磁場，因而也就可以畫出更加奇妙的圖案。
關於麥圈這一神秘現象的形成，阿爾將耶夫與斯米爾諾夫兩位學者的觀點似乎都很有說服力，不過，就算麥圈是高頻輻射現象所爲，但兩人都沒有證實，高頻輻射來自哪裡，是地磁現象？還是天空閃電？
1.外太空粒子束或能量束擊打造成。大自然是鬼斧神工的最大製造者，在短時間內創造出如此大且規則的傑作而不被人察覺，人爲製造的可能性非常低；另外怪圈出現在地球的能量帶處且植物和土壤有明顯變異特徵，可以判斷絕不是機械手段造成的，而最大的可能性是受到外太空飛來的粒子束或射線束的擊打造成的。綜上，怪圈很有可能是來自外太空的能量束受到地球磁場的影響後發散擊打造成的。
一份名爲《地面標記調查案例》的文件顯示，1940年5月，飛行員發現康沃爾郡北紐奎地面曾出現奇怪標記，並拍下照片。對照片研究後發現，那些標記是由農業用石灰按規律堆放而成。1941年5月，蒙矛舍郡地區的玉米田中，出現一個不尋常的標記，大約30米長，好像是一個大寫字母‘g’。1943年10月，肯特郡附近，飛行員看到地面出現一個巨大白圈。據報道，這些來歷不明的“地面標誌”，讓當時正處於戰爭中的英國情報部門如臨大敵。公佈的文件稱，1941年當大衛·佩特里被任命爲mi5主管之後，他奉命對此進行調查。據稱，爲了查明真相，mi5不僅暗訪了多名英國各地農夫和空軍官員，而且與各盟國密切合作調查。