在去年收購黃蜂隊失利後，喬丹似乎變得對NBA不再關心。就在00年1月10日的時候，喬丹還在對着記者信誓旦旦地說着：“我現在百分之百地告別籃球，我現在比兩年前幸福多了，我變成了愛笑的人，壓力沒有了，我體會到家庭的溫暖和幸福，我認爲這是我最好的決定，我在這種日子裡活得很開心”。
可在美國時間1月21日，華盛頓奇才隊證實退役整一年的喬丹正式購買了球隊的部分股權，並謀得該俱樂部籃球事務主席的職位，他將主掌球隊的實權。喬丹有權開除或者辭退教練和高層職員，主管選拔、轉會、定薪等關鍵性事物。
在記者會上，喬丹穿着黑西服、打着碎花金領帶，微笑着出現在記者眼前。他剛剛乘飛機抵達華盛頓，最後有爭議的細節是在飛機上協商完成的。他將以新的身份出現在賽場上，以主人的視角挑剔當時排在倒數第二位的奇才隊球員的表現。當然沒有一場球迷爆滿的現象也將因喬丹的到來而得以改觀。
喬丹重返NBA令世界球迷興奮鼓舞，這位創造了偉大奇蹟的球員能否成爲創造奇蹟的老闆，人們對他並不缺乏信心。新聞發佈會剛剛結束，華盛頓上空熱烈地傳遞着一個消息:飛人回來了!喬丹降落在華盛頓了!
雖然他已經在1月21日上任，但正式被NBA理事會批准卻已經是在一個月以後了。因爲在美國要想成爲職業籃球俱樂部的股東，必須得到理事會的批准。不過，對於像喬丹這樣的名人，理事會是否批准其爲奇才隊的股東並不重要，重要的是他事實上已經是這個俱樂部的股東了。NBA29名理事日前一致通過決議，批准喬丹購買華盛頓奇才俱樂部的部分股權，並真正成爲該俱樂部的股東之一。接着喬丹購買了奇才隊的10%的股權。
在新聞發佈會上，喬丹表示他已把相當一部分錢投入到俱樂部，希望將來自己的投資能得到回報。就在成爲球隊老闆的第二天，MCI 體育館裡，身爲老闆的喬丹比所有隊員來得都早。飛人身穿奇才隊23號隊服，和隊員們一起訓練。他的身手依然讓隊員們驚歎，更讓人驚歎的是，喬丹幾乎同時扮演着老闆、總裁和主教練的角色。
主力後衛斯特里蘭德是奇才隊的三位爺級人物，另兩位是霍華德和里奇蒙德，三人年薪均超1000萬美元。依照慣例，斯特里克蘭卡着鐘點，最後一個到場。
飛人對羅德笑着說:“你最好明天早點來，不然我只好順路去你家接你。”
喬丹和隊員們交融在一起，時不時地開個玩笑。而且還參加了戰術訓練和鬥牛，人們看到的飛人依然神奇地扣籃，高速運球和突破。而用喬丹自己的話說:“我要讓他們覺得訓練其實是種樂趣。”
喬丹出山後，許多人認爲他嚴重地犯傻，走進一條死衚衕，以天下第一的無敵身份墮落成替人打工的高級白領，可謂是“智者千慮，必有一失”。只有幾乎曾和喬丹同樣優秀的伯德瞭解喬丹。他說:“邁克爾的靈魂就是競爭。我認爲他在合適的時機下選擇了合適的球隊，因爲只有這樣，他才能在新的領域內再一次證明自己罕見的能力。”
此後的訓練，喬丹每次都是按時到場，奇才隊員也都知道喬丹不是隨便可以糊弄的，因爲他是飛人，曾經是籃球場上的主宰，瞭解場上的一切，正是這點使得諸多同行眼饞，費城76人隊的總經理比利就說:“喬丹對球員的瞭解程度是任何NBA高層管理者無法比擬的。”的確，喬丹的優勢就在於他了解籃球，瞭解籃球場上瞬息萬變的一切。但一個球隊總經理只懂籃球還不行，他還要了解球隊的運作、工資上限的分配等等所有繁雜的商務規則和規矩。喬丹還有很多要學的地方。
喬丹明確地表示:“奇才有三個具有潛力的球員，里奇蒙德、斯特里克蘭和霍華德。這個隊伍的改變就從他們身上開始，”可事實上喬丹重建奇才隊也就是從這三人着手的。這三個拿天價工資，出工不出力的老爺明星們，一方面他們佔用了許多工資上限空間，致使奇才隊在球員轉會市場難有作爲，一方面又影響了其他新人的情緒，要激起他們的鬥志是喬丹的第一道難題。再者就是中鋒威廉姆斯膝傷未愈，無法預測其出場的時間，喬丹手中的牌本來就不好，這一來又添了一道坎。也累得喬丹面臨巧婦難爲無米之炊的尷尬。球隊仍然一輸再輸。
華盛頓人在用噓聲表達他們對奇才的失望和氣憤，這當中也包含了他們對信誓旦旦的喬丹的失望。喬丹在比賽時一般都不到現場，通常是坐在他的辦公室，通過電視觀看奇才比賽的，他也無法忍受奇才的表現。他甚至說奇才是“對華盛頓球迷的羞辱”，可斯特里克蘭照樣不買他的帳，“邁克爾不打球了，對不對?”
“我沒這樣生氣過，”對於奇才，喬丹直言不諱，“從來沒有。這對我來說是一種全新體驗，自從在公牛隊時一次訓練中和科爾打架，我還沒這麼生氣過。這些傢伙不是爲贏球而比賽，而是爲了不輸球。他們太害怕失敗了，讓我坐在球館看他們打球實在尷尬。我理解球迷們爲什麼要噓，你該看看我看球時是什麼樣子。我拿着遙控器砸電視機，我對着電視機詛咒他們。問題是我對他們期望值很高，而他們對自己毫無指望。我想改變這些人的心理狀態，就像我在芝加哥開始一切時那樣。許多球員在比賽開始前就認爲他們會輸球，他們沒去努力!”
即使這樣，喬丹也發誓要完成他和奇才的五年合同。喬丹說他要努力改革奇才隊陣容，提拔一些像漢密爾頓、洛佩斯和懷特那樣的年輕球員，但對霍華德、斯特里克蘭和里奇蒙這三個高薪低能的球員，他依然無計可施，“這些是我繼承過來的球員，大家得給我時間改變一切，送走一些人，然後招來我想要的人。”
但是人們希望喬丹能改變一支被詛咒的球隊，一個看臺荒蕪的球館，並且成爲在華盛頓擁有第二大影響力的人，除了總統。
可事實上，喬丹的效應仍然不差，12月11日，當飛人鞋第11代重塑版在奧克蘭率先上市時，從早上4點開始，就有人在商店門口排長隊，等待商店10點開門，去購買這種價格爲125美元的運動鞋。可見喬丹的魅力沒有消退。而且在12月16日，喬丹在華盛頓接受了《芝加哥太陽時報》專訪，元第一次公開表示他對退役的後悔，他其實根本不臨願意離開籃球，他相信公牛王朝還沒走到盡頭，但他無法改變當時的公牛隊。
雖然說無法改變當時的公牛隊，但對奇才隊違紀的球員喬丹並不含糊，在12月28日，喬丹自從出任華盛頓奇才隊籃球部主席後，第一次出面懲罰奇才違紀球員，組織後衛斯特里克蘭因爲遲到和訓練缺席將接受內部禁賽的處罰。
喬丹說:“球隊在新賽季開賽前就立下規矩，每一位球員都將爲自己的行爲負責。斯特里克蘭違反了規定，因此將在下一場比賽被禁賽。”
斯特里克蘭是奇才隊三名高薪球員之一，年薪1000萬，還有一年的合同。可惜，他同霍華德1680萬和里奇蒙德1000萬的組合並沒有讓奇才隊展示出衝擊季後賽的絲毫跡象，相反還創下5勝24負的球隊最差開賽紀錄，並在29支球隊組成的NBA聯盟中名列倒數第二，僅勉強領先今非昔比的公牛隊3勝24負。
在做奇才隊籃球部主席的同時，喬丹還持有美國冰球聯合會的華盛頓首都隊的股份。在12月13日，美國冰球聯合會（NHL）一致同意喬丹成爲華盛頓首都隊的合夥經理人。這位籃壇傳奇人物參加了正在夏威夷棕櫚海灘進行的NHL高級例會，在會上喬丹被正式接受爲會議成員。
華盛頓首都隊總裁里奧尼斯已經開始他和喬丹的合作，但是他沒有透露喬丹到底佔球隊多少股份。外界猜測，喬丹應該是持12%的股票。NHL專員說:“邁克爾在首都隊的股份比他在奇才隊的股份要多。”
不過人們對他在NHL的舉動並不關注，人們的焦點更多地停留在奇才隊的身上，奇才隊的球迷在苦苦等待了幾個月後，仍然不見老闆喬丹有過任何舉動。他們開始對喬丹抱怨，批評他很少現場觀看奇才隊的比賽。就連媒體也頻頻發表文章爲喬丹和奇才隊出謀劃策。
不過，看得出來，喬丹正在非常嚴肅的轉變自己的生活方式。他要從一名成功的籃球運動員變成成功的球隊老闆。不過，這個轉變恐怕不像看上去那麼輕鬆。在過去的很長一段時間裡，喬丹從前的對手們都紛紛表示不會在球隊經營和球員交換上給予喬丹任何方便，這無疑會讓喬丹在NBA中四處碰壁。
而在此之前，奇才隊正式提出與即將卸任的總經理昂塞爾德續約5年，這正好是喬丹出任奇才隊總裁的期限，從中可見喬丹之心機。早在87年昂塞爾德就成爲奇才隊副總裁和總經理，但正是從此以後，奇才隊一路下滑不見任何起色，可以說昂塞爾德具有不可推卸的責任。但是作爲NBA50大球星之一，昂塞爾德在奇才隊根深蒂固，他還是奇才隊前身子彈隊惟一一次奪取總冠軍的頂樑柱，因此喬丹不想揹負一朝天子一朝臣的罵名。
另外，一向不涉足政壇的喬丹也向公衆展示了自己的另一面，他在一個宣傳片中極力向自己的球迷推銷曾經是NBA球員的總統候選人佈雷德利。這是喬丹第一次不爲運動鞋、飲料、服裝和長途電話做廣告代言人而出現在一部政治宣傳片裡，因爲這個佈雷德利曾是傑克遜在紐約尼克斯隊打球時的隊友，所以外界普遍推測這是喬丹看在授業恩師的面子上。
佈雷德利說:“得到喬丹的支持是我的驕傲，因爲今天之前他從來沒有涉足政治領域。”在廣告中，喬丹面對攝像機侃侃而談，向觀衆介紹曾在尼克斯隊效力的佈雷德利是個多麼出色的管理者，喬丹自己表示之所以堅定地和佈雷德利站在一條戰線上，是因爲後者對兒童健康、涉槍暴力和其他一些社會問題的政見引起了喬丹強烈共鳴。
也正是緣於他對兒童健康和其他一些社會問題，喬丹決定在當年和巴哈馬羣島政府以及太陽國際娛樂集團公司共同舉辦一項以他的名字命名的慈善高爾夫球比賽。
喬丹打算從全世界的體育和娛樂界邀請36位名人蔘賽，其中也會包括一些美國高爾夫球壇著名的好手。本次比賽爲參賽選手設置了250000美元的總獎金。除參加高爾夫賽外，喬丹還爲名人們準備了爲期兩天熱鬧、瘋狂的名人派對。本次天堂島名人邀請賽的門票及其他收入，喬丹將捐贈300000美元給北卡羅萊納州的慈善機構，再捐贈50000美元給巴哈馬當地的慈善機構。
“舉辦這項賽事主要有兩個目的，其一，爲了幫助北卡羅萊納和巴哈馬患病的兒童和父母失業的貧困家庭，”喬丹說，“其二，我希望能邀請到那些在體育和娛樂界最具影響力的名人，在天堂島舉辦一項全世界最具影響力的高爾夫名人賽。”
海洋俱樂部副總裁卡拉萬說，“喬丹是一位值得我們每個人永遠尊敬的偉大運動員，同時也是一位著名的慈善活動家。他已爲美國的慈善事業作出了突出貢獻。我還想告訴大家的一點是，喬丹現已擁有海洋俱樂部不動產的一定股份，這顯然有助於提高海洋俱樂部的知名度，並最終成爲一個舉世聞名的高爾夫俱樂部。”
作爲NBA的傳奇式人物，喬丹已在他的故地北卡羅萊納州舉辦了15屆邁克爾.喬丹名人精英賽，捐款超過2000000美元。“我所認識的喬丹，是一位心地善良、富有愛心的好人，他極具人格魅力，”喬丹的朋友老虎伍茲評價說，“他總是盡他的所能，幫助那些需要幫助的家庭和兒童。在這方面，他是所有運動員學習的榜樣。”
這次慈善賽還沒有開戰，喬丹的一次意外行動卻引起人們軒然大波。12月29日，喬丹到巴哈馬爲慈善高爾夫球賽作準備時，曾到賭場玩21點，在6小時的賭局中，他共輸了約750000美元。
雖然這次慈善賽舉辦得很成功，但同時喬丹也悄悄地備好了手術刀，他要對奇才隊的三位老爺級的球星下手了。