陳標這個時候隨軍駐紮在瓊州，海南一帶有很多少數民族，主要是苗族、黎族和回族人，其中苗人和黎人向來不服王化，經常舉兵造反，僅在明朝末期大大小小的起義暴動就達上百起，因此尚可喜在瓊州除了派遣一支海軍之外，還另外調遣了一萬多名陸軍士兵分守各地。
苗人黎人對於明軍的戰鬥力是知根知底，但是對於清軍的戰鬥力那就是兩眼一抹黑了，清軍這個時候還算的上是善戰之軍，不僅是滿清八旗士兵能征善戰，就連手下的這一干子漢人將領的軍隊也能打硬仗，苗人和黎人的幾次暴動被有意殺雞儆猴的尚可喜追住一頓胖揍，這下可算是將他們給打怕了，這才安穩了十幾年，不過尚可喜爲了以防萬一，還是在島上維持了當初的那個軍隊規模，並沒有因爲局勢的穩定而消減駐軍。
中華軍摸清楚了尚可喜的軍隊部署之後，決定暫時不管廣州城外的那批水軍戰船，因爲他們的數量只有十餘艘，而且都是小型戰船，對中華軍的制海權構不成威脅，所以先要解決瓊州的這支清軍。
經過三天的短暫休整之後，中華軍出動了包括三艘鐵甲艦在內的六十餘艘戰船組成的艦隊開赴海南島，意圖一舉剷除清軍在東南沿海一帶最後的一支水師力量。
而其他的艦船則在剩餘的鐵甲艦的帶領這些繼續對東南沿海的其他地方進行清理，這一段時間內沿海一帶只要是噸位超過一百噸的船隻，戰船就會被直接擊沉，商船則被扣押，商人給予小船放回去，船隻則被中華軍收繳，目的就是徹底的切斷清軍的戰船來源。
不僅如此，中華軍還對沿海的幾處造船廠進行了炮擊，這些造船廠是清軍戰船的主要來源，依照清軍一個半月就能下水一艘戰艦的速度。只要給他們一年半的時間，他們就能夠再次組建一支規模達到甚至是超過施琅之前的那支艦隊，這是一件非常可怕的事情，中華軍當然不能容忍這些造船廠的繼續存在了。
不過這些造船廠所處的位置往往都比較先要。周圍也大多建設有固定炮臺，好在炮臺上面的火炮這個時候大多是老式火炮，對中華軍的艦隊的威脅有限，但是因爲清軍在陸地上的軍隊力量十分強大，所以中華軍這邊也沒有冒險派出軍隊進行登陸。沒有陸上軍隊的協助，想要徹底的破壞這些造船廠是十分困難的，所以中華軍對其進行了長時間的炮擊，而且還在之後每間隔一段時間就來炮擊一次，使得清軍的造船廠大受影響，出現了很多還怕被炮擊而逃跑的船工，而且船塢裡面的在建戰船也大多會遭中，往往建造到一大半的時候就會被中華軍炸的千傳百孔，需要進行維修乃至重建，這些問題使得清軍之後一年多的時間裡面只有有限的幾十艘戰船建成下水。這個數字可謂是下降了九成以上。
爲了應對這個局面，清軍在後來將這些工匠和船廠的設備都轉運到了長江一帶，在長江沿岸的內陸城市興建造船廠，這樣局面稍稍好過一點。
在騷擾萬清軍的造船廠之後，中華軍隊沿海一帶的島嶼進行了清剿，這些島嶼星羅棋佈，遍佈於沿海一帶，很多島上都有清軍的駐軍，但是這個時候隨着其海軍的全軍覆滅，這些島嶼就會受到來自中華軍海上的巨大威脅。所以清軍在戰後便開始着力從這些島嶼上面撤兵。
等到中華軍開始清剿的時候，很多島嶼上的清軍已經完成了撤退，但是還是有一些島上還盤踞着一些抵抗勢力，有些是還沒來得及撤退的清軍。另外就是還有一些活動在沿海一帶的海盜。
對待這兩股勢力中華軍自然是毫不留情，清軍一律剿滅，願意投降的就抓到臺灣的礦上去勞作三年，然後再將其放回，至於海盜則沒那麼幸運了，這些海盜大多手上都站滿了鮮血。中華軍自然是嚴厲打擊，一旦他們拼死抵抗的話往往是不留俘虜的，如果他們願意投降，那麼根據其過往的罪行對其實施懲罰，罪行太深的直接處死，剩下的視情節嚴重程度發配到礦上去上工，罪大的上工的時間長，罪責小的上工的時間稍短一些。
中華軍的這一系列動作搞出來的動靜可是不小，最初只是在廣東和福建一帶的海域施行，後來逐漸擴大到了浙江、江南甚至是山東和直隸省，各地遇襲和交戰的戰報和奏摺就像是紙片一樣紛至沓來，一時之間朝堂內部議論紛紛，之前水軍主力幾乎被全殲，五萬大軍全軍覆滅已經讓朝廷震動了，這個時候敵方搞出來的動靜就像是要準備大舉進攻一樣，一時間所有的人都搞不清楚狀況，不斷的有人四處打探那個中華帝國是個什麼樣的國家，國家位於哪個地方？人口幾何，稅負多少，軍丁又有多少，這些情況不僅是普通大臣們搞不清楚，就連幾位輔政大臣也弄不明白，之前還有一個懂得詳情的施琅在，這個時候隨着施琅的戰死，這個信息來源就被掐斷了，清軍這個時候又喪失了制海權，想要從對方那裡打探到一些消息實在是難上加難。
不過朝中的大臣們不瞭解，但是民間卻是遍地流傳，到處都在謠傳說這個中華帝國就是之前明軍的遺臣，一支退守到海外的明軍，他們立志要推翻滿清的統制，還廣大漢人一個正統的地位，甚至還有人說前朝太子就在這個新建立的國家裡面，他們幅員遼闊，人口有數百萬之多，雖然比不上大清朝的人口數量，但是比起滿人的百來萬人口還是要多得多，不僅如此，他們還有帶甲之士上百萬，戰將上千員，不日就將劍指中原驅逐韃虜，這些謠言就像是有人故意散播一般，在很短的時間裡面就從江南之地流傳開來，一路傳到四川、雲貴。北邊傳到了山東、直隸，江南一帶也是人人知曉，一時間朝野再一次震動，這個謠言帶來的衝擊相比於他們目前獲得的戰報更加具有衝擊力。。