由許心素派遣的福建明軍在四月中旬同時從漳州泉州兩地出發，這麼大規模的軍隊調動自然無法完全瞞過所有人，而關於這數千明軍的去向，許心素對外的說法是在福建海峽與海漢軍一同進行軍事演習。至於福建的文武官員們信不信這個說法，他其實也不是太在乎，誰要是覺得跟海漢軍混在一起有什麼不妥，那大可給朝廷寫奏摺告狀。
對許心素來說，其他的事情都可以先暫時放一放，必須要先處理十八芝餘黨在海外有所擡頭的跡象。海漢提供的情報表明日本平戶正在大規模地興建戰船和各種武器，十八芝餘黨明顯是想借助平戶這個地方東山再起，這是許心素絕對無法接受的事情。
許心素雖然如今過着養尊處優的生活，不用再四處奔波，但終究也架不住一年一年逐漸衰老，身體也慢慢扛不住遠赴海外帶兵作戰的要求了，只能是將麾下部隊的指揮權移交給子侄後輩，自己坐鎮福建保障後方的穩定。
不過在這次許裕拙離開漳州之前，許心素就已經對他下了死命令，不惜一切代價也要殲滅十八芝餘黨，特別是與鄭芝龍相關的人員，更是必須斬草除根，不能給對方再留下任何重新起勢的機會。當年沒有趕盡殺絕的後果，現在已經顯現出來了，這次可不能再犯下同樣的錯誤了。
所以許裕拙在與石迪文會面之後，便也提出了要將十八芝餘黨剿殺乾淨的要求，但石迪文認爲實際操作中會有不小的困難，未必能夠達成許心素所要求的目標。
許裕拙沒有能夠爭取到盟友的全力支持，也不免有些鬱悶，便向石迪文討要了平戶當地的詳細地圖，召集手下軍官一起研究作戰計劃。
“關鍵之處，還是在於封鎖海上通航，不要讓目標渡過平戶海峽逃到九州去。一旦過了海峽，我們這點兵力就很難再深入內陸追剿目標了。”
在研究過地圖之後，許裕拙也不得不承認石迪文的意見比較客觀，要靠有限的兵力徹底封鎖平戶島出逃的路線的確是相當困難，而一旦目標逃到近在咫尺的九州地區，那再想抓到人就難了。
九州和平戶雖然都是島嶼，但九州是日本第三大島，面積近三萬八千平方公里，相當於兩百多個平戶島的面積。而九州的大部分地區都是山地密林，目標只要逃入這些地區藏身，對當地環境完全陌生的明軍就很難再進行追蹤了。
“將軍，我們船隻有限，要在海上完全封鎖航道是很困難了，倒不如集中力量去清剿平戶島海岸上的大小港口，在最短時間內把島上的船隻控制住，或許要比封鎖航道更有效一些。”
許裕拙手下也不乏頭腦聰明的人，很快便想到了解決這個難題的的辦法。這個做法其實也不算新鮮，海漢在北邊控制遼東海岸線，便是使用了這樣的手段讓清國片帆不得出海。
福建水師的實力雖然不及海漢海軍，但要對付平戶藩這種級別的對手應該還是不在話下，雖然平戶藩原本就有一定編制的水軍，而且有證據表明當地正在成批建造戰船，但許裕拙對己方的實力仍有充分的信心，畢竟福建水師近年多次隨海漢參與海外征戰，在戰場上與形形色色的敵人交過手，實戰經驗肯定不是平戶藩這種閉門造車的水軍能比的。
只要能設法控制平戶島的港口，那也的確可以起到切斷敵人出逃通道的作用，不過這個計劃在實施中肯定也會存在一定的困難，比如說對當地情況並不熟悉的福建水師要在短時間內找到島上每一處可以出海的港口，就並非一件易事。哪怕是海漢所提供的詳細地圖，上面也只標出了島上的一些主要目標，還需要作進一步的實地偵察才能確認還有哪些不知名的小港口。
福建水師的大部隊抵達朱家尖島之後進行了整整七天的休整。之所以在朱家尖島逗留這麼長的時間，主要還是在等朝鮮這邊的北路軍到位。由於西歸浦港的條件有限，倉促之間也很難變成合格的軍事基地，爲即將出徵的北方艦隊和特戰團提供後勤服務，因此錢天敦不得不發動人手先對西歸浦的港口設施做了一些臨時改建，以滿足作戰需要。
這樣一來，出兵的日期就只能往後推遲了。不過將領們也抓住這難得的緩衝時間，進一步完善行動計劃，讓手下的部隊能針對接下來的作戰進行準備。唯一比較麻煩的是南北兩路人馬無法進行及時交流，只能通過每天的電報聯繫來進行溝通，其效率也就可想而知了，好在時間比較充分，幾天下來也對行動的大致方案達成了一致。
因爲西歸浦地方上的原因所耽擱的時間，多少是在海漢的預計之外，雖然作戰計劃並未因此作出大的改動，但卻給對手也留出了更多的備戰時間。在此期間北方艦隊從西歸浦派出了第二波偵察船隊，但目標區域主要是五島列島海域，也沒有再冒險派人登陸偵察，因此並未獲知平戶藩所發生的權力更替。
時間來到五月初，南北兩路人馬都已經準備停當，於是聯軍便按照約定的時間開始行動。而這次針對平戶藩所展開的軍事行動，在福建方面的建議之下被命名爲“除根”，意指行動目標是要消滅藏身於平戶藩的十八芝餘黨。
南路的東海艦隊因爲起點定海港距離目的地較遠，所以先行出發，而藏身於朱家尖島東岸的福建水師也在同一天出發，兩支艦隊在舟山島東北方向的海上會合之後，以混編隊形緩緩駛往日本方向。
在這支聯軍艦隊當中，倒是遠道而來的福建水師佔了大頭，足足一百多艘大小帆船，比起東海艦隊出動的船隻數量多了足足兩倍。不過要論戰船的平均噸位，那還是海漢大大領先，特別是兩艘排水量接近兩千噸的威嚴級戰艦，碩大的船體在這支混編艦隊中更是十分搶眼。
許心素這幾年嘗試過好幾次向海漢求購威嚴級戰艦，他也知道要買新的不太現實，所以主動提出購買有一定服役年限的船，但均被海漢以現役威嚴級戰艦尚不足以滿足海軍需求爲由婉拒了。海漢甚至都沒有進一步商談價格的表示，這明顯就是在向許心素指出，威嚴級戰艦目前仍是未被納入外銷名錄的非賣品。
當然了，有這種打算其實也不止許心素一家，安南國也向海漢執委會提過同樣的要求，試圖要購買一艘威嚴級戰艦來作爲安南艦隊的旗艦，但同樣也未能達成目的。
海漢拒絕這兩方的求購要求並不只是考慮到先進造船技術外泄的風險，的確有大部分原因是因爲威嚴級的建造進度跟不上海漢對外擴張的速度，自用都尚且不夠，當然不會考慮外銷了。
不過據說國防部和造船機構已經在研究威嚴級的改進型號，這些盟友想要購買，或許還得等到威嚴級的新型號入列服役之後，舊型號纔會被納入到外銷名錄當中。而且外銷的威嚴級戰艦肯定會有所削弱，比如船上的蒸汽系統就不會保留下來，必定會在移交之前全部拆除，只交給買家一個純風帆動力的版本。
而就已知的資料來看，日本方面沒有任何一種戰船能夠與威嚴級戰艦進行正面抗衡，就連平戶當地正在趕工建造的中式戰船，其噸位也僅有威嚴級的五分之一左右，艦載火力強度更是不可同日而語。
但爲了求穩，這次行動中兩支艦隊總共出動了三艘威嚴級戰艦，光這三艘戰艦所代表的戰鬥力，其實就足以擊敗這個時代東亞地區的大多數武裝艦隊了。海漢調動這麼強的戰力參戰，也是爲了能在交戰中穩穩拿下平戶藩的水軍，同時防備九州方向有其他武裝力量支援平戶。
且不說規模龐大的南路人馬，在西歸浦港集結的北方艦隊出動船隻要比南邊的聯軍艦隊少得多，也依然是讓當地的港口一度陷入了癱瘓。北方艦隊比聯軍艦隊晚兩天出發，而兩支艦隊的會合地點便是第一個攻擊目標，位於五島列島南端的福江島。
前期北方艦隊的袁峙來這邊偵察的時候，已經發現了一處隱匿在海灣中的造船廠和港口，通過這個跡象可以確認島上必定有一定數量的十八芝餘黨人員活動。而按照作戰計劃，對於這處秘密據點的攻擊行動，將會由福建明軍負責實施。
按照預定的時間，兩支艦隊在福江島以西二十里的海面上完成會合，然後福建水師分出十餘艘戰船，東海艦隊分出四艘探索級戰船，一同掩護搭載着一千二百餘名明軍火槍兵的運兵船前往目標區域登陸。
這麼一支規模龐大的艦隊出現在福江島附近，也很難瞞得過島上的監視措施。平戶數日前已經發來了警訊，要求島上人員加強對周邊海域的巡視，一旦出現敵情要儘快設法上報。
島上的人員所採用的警報信號是非常原始的手段，聯軍艦隊出現在海上不久，福江島海岸的某處山嶺上便冒出了濃濃的黑煙，片刻之後就升騰到百丈高度，估計十幾裡之外都能看到。負責實施登陸作戰的這些船隻還沒有抵達目的地，島上的人便已經收到了外敵來襲的警告。
但島上的人根本無法預計到他們所面臨的攻勢有多麼強大，即便是提前觀察到了有武裝艦隊逼近本地，也還是難以立刻組織起像樣的抵抗。
在雙方水面武裝力量懸殊的狀況下，出海決戰無疑是自尋死路的舉動，所以島上的人只能選擇在陸上守島，但福江島面積超過三百公里，足足有兩個平戶島那麼大，島上的人想要迅速轉移去某一個點完成集結是不太可能的事，所以即便看到有一支船隊朝着島嶼北邊的秘密基地去了，也無法及時對當地進行增援。
運兵船在離岸邊還有百丈左右的時候，遭到了來自岸上的武力抵抗，但這種抵抗的力度也很是有限，僅僅只有百人左右的規模，所使用的武器有弓箭和火槍。抵抗者的攻擊很難對有防護措施的運兵船造成人員傷害，倒是因爲主動暴露了位置，召來了運兵船兩側的戰船反擊。幾艘船隻用船艏炮向岸上的目標轟了一輪，便迅速驅散了這些戰鬥意志並不堅定的抵抗者。
運兵船很順利地在距離那處秘密海灣入口約兩裡外的一處平緩海岸實施了登陸，先頭部門的士兵們不等靠岸，便將火槍高舉在頭頂上，翻過船舷跳入沒膝深的海水中，然後蹚水上岸。
在此期間被艦載炮火擊退的抵抗者再次出現，試圖阻止外來者的登陸行動，但這次回報他們的不僅有來自戰船上的火炮打擊，同時還有登陸先頭部隊的火槍射擊。在丟下了數具屍體之後，抵抗者再次退入了內陸，將登陸點拱手相讓。
儘管來自島上的抵抗力度不強，但由於登陸點的地勢比較狹窄，運兵船難以一次全部靠到岸邊，因此登陸的速度並不算很理想。大約用時近一個小時，一千多名明軍才悉數從這裡轉移到岸上。不過好消息是在此期間抵抗者的幾次嘗試都被毫無懸念地擊退，而明軍方面的傷亡狀況也僅在個位數，遠遠要少於對手的死傷。
在岸邊完成集結之後，這支步兵便開始向內陸進軍，他們的目標是港灣內的那處造船廠。
按照地圖來看目標所在的位置並不遠，只要穿過海邊的大片農田就到了。不過進入內陸之後，海上的戰船就無法再爲他們提供火力支援，所以接下來的戰鬥就只能由他們自行發揮了。
這裡的農田依然是以水稻種植爲主，這個時候春種已經結束，目力所及之處都是大塊的秧田，倒是不用擔心會有大股敵人在附近設伏。