故事的情節發展適當的調快下節奏，在保持原本歷史大步驟的前提下，儘量緊湊發展，畢竟，對東林黨的鬥爭只是主角東廠帝國的一個前奏。而且考慮到小說的娛樂性，太多對於真實歷史的描寫容易讓你們產生疲勞感。
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楊漣是有自知之明的，對於韓爌提名自己爲總憲，他可是一點希望也不抱的，因爲前幾日朝會上葉向高提名自己爲總憲時，皇上可是當廷就給駁了。從皇上對自己的態度來看，楊漣已經是絕了出任總憲的念頭。
高攀龍的離去讓楊漣倍受打擊，但他天生就是一個不服輸或者說不願意面對現實的人，他決定起草一篇新的奏疏，這次不再是直接針對魏忠賢，而是改爲針對司禮監凌駕內閣之上，剝奪內閣擬旨權利進行彈劾，進而先壓制住內廷，從而削弱魏忠賢對朝政左右的能力。
在楊漣心中，他一直堅信，魏忠賢是大明的禍害，只要他在一天，朝堂裡就肯定會污煙障氣，同時，他也深信自己代表的就是天下人心所望的公理與正義！因此，只要能削弱司禮監的權力，便是對魏忠賢的重大打擊。
爲了能夠讓皇上相信自己，採絕果斷措施打壓內廷，楊漣在疏中如此寫道：數月之間，中旨屢見疊出，問之閣臣，閣臣不知也！聽聞內廷魏忠賢曾在人前大言不慚說“內閣不知何妨也！”如今，上諭動不動就給大臣扣上“結黨亂國”的罪名，不知黨人有何負於國？
所謂黨人結社這項罪名只不過是奸人用來欺騙皇上而掃清善類的藉口罷了。臣冒死上言乞請皇上，把票擬之權還於內閣，把黜降之權還給六部，把彈劾之權還給科道。聖上即使寬免魏忠賢不死，也應嚴加戒諭，令其小心謹慎，勿待人操刀，自取罪殃。
楊漣這份奏疏寫好之後，恰逢去打探陳於廷消息的胡良機回來，便將奏疏給他看了，胡良機看後，立表贊同，憤慨地說道：“楊公早該振作起來，前番一擊不中，給了魏閹喘氣之機，短短几日，我東林接連去了幾位重臣，再這樣下去，朝中便再無我東林立足之地！楊公儘管將這疏遞進宮去，我這便也寫一封，叫院內同僚們都上表，這回，無論如何也要好好的和內廷鬥一鬥！讓他們知道，我東林黨絕不是他們可以隨意拿捏的！”
說做便做，當下，胡良機便就着楊漣的書案寫了份《劾魏忠賢及魏廣微三十二斬罪》，準備明日與楊漣這份奏疏一起送上。
胡良機同時也做了最壞的打算，當天他便將已把妻兒老小送回原籍安徽桐城，然而他沒有料到，家中的下人夏三卻“不小心”的在書房裡看到了他的這份奏疏，然後又不小心的給泄漏了出去。
獲悉楊漣和胡良機他們又要上疏的情報後，負責科道這一塊的番子掌班是前二檔頭張文元的嫡系杜老五，靠山已倒的他明智的決定立即將這個重要情報稟告給廠公新貴袁大海，袁大海得知後立即進宮向王體乾彙報。
在司禮監中，袁大海與王體乾暗中做了一番謀劃，準備蓄意尋找藉口，趁着陳於廷倒戈的難得機會，順勢把楊漣和胡良機、魏大中那幫東林黨的御史們給革職掉，在都察院來個大清洗。
就在這時，天啓再次下旨，叫內閣儘快把會推吏部尚書與總憲人選報上來。
陳於廷已經決定上疏推讓，王體乾自然不可能再把事情壓下，他便將韓爌的推薦名單報到了天啓那。
天啓看後，對內閣的推薦人選十分不滿，言語中對楊漣的態度一如那日朝會，對陳於廷的出任卻是可有可無。
等王體乾再將陳於廷的推讓疏給遞上後，天啓立即就發話了，叫內閣重新推舉。
韓爌得知皇帝不同意陳於廷與楊漣的任命後，不禁再次發愁起來，也顧不得找來陳於廷問問他爲什麼要上疏推讓，急忙就找來吏部相關人員，都察院的僉都御史王圖、曹於卞等人，經過協商，再次列了個候選名單出來，這次，名單上是三個人，分別是喬允升、馮從吾、汪應蛟三人。
喬允升、馮從吾、汪應蛟這三人原先都曾擔任過部院大臣，且又是東林黨人，頗有聲望。喬允升時任禮部右侍郎，馮從吾則是做過工部尚書的，汪應蛟則是南京吏部侍郎。這三人無論是資歷還是黨內的影響力，都要比陳於廷要強些，與楊漣卻是無法並提的，但無奈，楊漣如今逆在聖心，要捧他上來已是不可能。
四月十五日，會推三人的名單送進宮中，又是袁大海第一個反對，他對剛從涿州回來的魏忠賢說絕不能前門剛走了虎，後門又進來狼！這會收拾的是在京東林黨人，南京那邊千萬不能摻和進來，否則南北鬧起來，事情不好收場。
魏忠賢深以爲然，吩咐李永貞道：“你去面奏皇上，就說這喬馮汪三個人都與楊漣是一黨，必是楊漣在幕後策劃，據說魏大中、胡良機等東林黨人也參加了討論，可這落款的職名卻隱去了楊漣，實屬居心叵測！”又對王體乾如此安排道：
“王公去和夫人說說，叫夫人無論如何勸動皇上，這回一定要罷了楊漣、魏大中、胡良機三個人的官，尤其是楊漣，絕不能容他御殿上疏！”
奉聖夫人客印月一出馬，本就對朱國禎包庇魏大中、夏嘉遇，後又以辭職要挾不滿的天啓，頓時對東林黨人更加沒有好臉色了。尤其是對楊漣，更增添了幾分痛恨，他命令王體乾擬旨，立即將楊漣、胡良機、魏大中三人革職爲民。
聖旨這回沒有讓魏廣徽擬，而是由袁大海毛遂自薦，親自操刀就在司禮監給寫了出來，袁的文言功底不強，聖旨中可謂是文白相結，大意是吏部、都察院久爲黨人所佔，此次會推仍是擬用私人，而楊漣、魏大中、胡良機等鉗制衆人，抗旨徇私。
又聞楊漣與高攀龍前在陳九疇一事上，相互勾結，不秉公辦事，公然欺朕，真老奸巨猾頑鈍無恥。楊魏恣肆欺瞞，大不敬無人臣禮，俱革了職爲民！
這聖旨可以說是相當的無恥，顛倒黑白的有些過了份，陳九疇和謝應祥他們的事是魏廣徽和朱國禎較勁的後果，而推出喬允升和馮從吾他們是韓爌做的決定，裡外都和楊漣沒有關係，但聖旨卻把所有的過錯和罪名全推在了楊漣身上，說袁大海無恥透頂也不爲過。