建立醫學院，成立大明皇家醫院，並不是朱載坖拍腦袋決定的。
早在見到李時珍的時候，朱載坖有已經有了這個想法。只是那時的李時珍還一門的心思在修本草綱目，朱載坖也願成人之美。
如今朱載坖覺得，時機已經成熟，便挽留李時珍爲醫學院的山長，和大明皇家醫院的院正。原先的那些太醫院太醫，都要經過李時珍的考校。能者進入醫院治病救人，或是到醫學院教學。濫竽充數的，則罷免其太醫之職。
連地址朱載坖都已經替李時珍選好了，就在南薰坊南邊，紫禁城外西南角，緊靠着翰林院。他選的這個地址，足見對於醫術的重視，要建立現代醫院體系。
李時珍給朱載坖把完脈，叮囑了一些注意，又重新開了兩張藥方。一個方子是爲了調理朱載坖的身體，另一張方子，則是固本培元溫補之用。
朱載坖建立醫院與醫學學的旨意一下，朝中大臣們倒是沒有反對的。
因爲朱載坖在醫院裡，給了朝中大臣一些治病報銷的福利，並將之形成了制度。各個品級的官員，按品級劃分報銷的額度。如此一來，這些官員看病，便可給自家省了一些。關鍵是中醫十三科除了祝由科，其他十二科都集中在一起，這樣看病極爲方便。
還有一個不同之處，便是對於民間同樣開放。
這旨意一下，天下都被震動，無不稱頌朱載坖是位仁德之君聖明皇帝。
此時塘沽、上海、泉州、廣州四大市舶司已經成立兩月，第一批的關稅銀子也已經到帳。讓朝中羣臣驚訝不已的是，這兩個月的關稅銀子，竟然多達二百餘萬兩之巨。
大明的絲綢、茶葉、瓷器，歷來爲海外所喜。這次開海，海外諸國積壓已久的購買慾完全暴發，兩月之間的交易量簡直驚人。
除了大部分被弗朗機人買去，還有許多都被朝鮮、日本及南海諸國所購買。
如此一來，朱載坖手中可用的銀子便有了富餘，正可讓他做些事情。
再一次召見成國公朱希忠，朱載坖與之商議錦衣衛的用途。
朱希忠對於朱載坖，如今是非常信服。
“陛下召見老臣，問錦衣衛之事，可是有何不能公之於衆的事要做。”朱希忠知道錦衣衛是特務機關，如此說也是有原因的。
“錦衣衛在成國公的手中，朕還是很放心的。只是錦衣衛以前所做之事，已讓百官十分詬病，其用途應該改一改了。”朱載坖沉吟道。
朱希忠有些不解，“陛下，錦衣衛收集軍政之情，拱衛陛下安危，這是太祖之時爲了駕馭不法之臣而定下的，不知陛下要如何改？”
朱載坖頜首道：“世異則時移，錦衣衛所管之事太多太廣，官民皆怨。又有陸炳弄權，致成先帝之殤。所以，錦衣衛要將權柄收一收，不如專職於海外軍政資情收集。錦衣衛也改名，稱之爲情報司。”
“陛下有命，老臣自當遵從。”朱希忠是沒有閒話敢說，但是卻也不能糊塗，“只是陛下的安危，又有何人來擔。”
“朕的安危，自然是交由親軍來負責。”朱載坖笑道：“這些親軍，必須都是上過戰陣的。如今只從京營出戰之兵中挑選，便可組成擅戰親軍。如此，也不會再是以前的花架子。”
至於誰來監督羣臣不法事，朱希忠也不再問，這位陛下顯然已經有了主意。
果然，沒過一會兒，黃錦便被一同召上殿來。
“內臣黃錦，見過陛下。”黃錦在嘉靖大行之後，便一直留在司禮監中，給田義打下手。
雖然朱載坖曾答應過，必定不會虧待他，可是他也不敢抱太大的希望。
朱載坖看向黃錦道：“東廠如今還可堪用？”
朱希忠心中一緊，東廠原來可是爲了制衡錦衣衛而建，陛下這麼問，可是錦衣衛中又出了亂子？他這顆心，便又一下子提了起來。
“東廠自先帝信重陸炳之時起，便已經投閒置散。”黃錦低頭恭敬道：“若陛下有事，內臣必不讓東廠偷閒。”
“如此甚好。”朱載坖點頭笑道：“朕說過會重用於你，絕不食言。東廠便監督羣臣諸官不法事吧，六科十三道的給事中與御使，統統調入東廠。此後不可再有風聞奏事，必由東廠查實，而交由六科給事中或由御使上本彈劾。此後，東廠便改爲監察司，由你掌管，向朕直接負責。”
黃錦一下子張大了嘴，陛下給的權力有些大啊。這等於有負責監察天下的職責，那可就極其重要了。
將錦衣衛改爲情報司，又將東廠改爲監察司，朱載坖直接發了中旨。
百官即使有些不願，可也不敢輕易違逆新君。與從前相比，朱載坖對於百官算是放鬆了綁繩，至少情報司去管大明境外之事了。而監察司雖然全面擔負起了監察天下的職責，卻不能隨意的抓人。
其中唯一讓朝中大臣們不滿的，就是將科道言官都給弄到了監察司裡。監察司的前身是東廠，屬於內廷機構。如此一來，這些科道言官的身份，就不好界定。將來升遷，也不好安置。
但是科道言官向來不招人喜歡，這些傢伙風聞奏事，早就讓衆臣看不入眼了。因此大家也就默認，沒誰替他們說話。
朱載坖將朝堂架構修修補補，這個時候看起來，六部制其實已經有點亂。但他如此做，卻也有自己的章法。不打亂舊有的朝堂格局和制度，將來便不能順利的建立新的制度。
對於朝堂的權力分配，朱載坖還是要使其互相制約的，但不是六部制這種舊有的儒家制度體系。
但是爲了減少大明的動盪，朱載坖還有一件事要做，那就是藉着擴土開疆的威信，首先改革軍制。