建安元年四月，初步在許都站穩了腳跟的曹操，開始積極謀劃新的人事佈局。
一朝天子一朝臣，曹操欲執掌朝政，自然是準備在重要的部門安插進他自己的人，這樣才能上達下聽，自己的意圖纔會被傳達。自天子劉協逃出長安城後，相當的一部分官員沒有來得及逃出，被亂兵所殺。一路的顛沛流離，因爲匪兵的襲擊、飢餓和疾病也奪去了不少人的生命，有不少缺員需要進行補充。在轉移的路途上，天子劉協還臨時封了不少將軍，魚龍混雜，根據新的形勢，也必須進行調整。
劉協先後正式任命的高級將領包括：大將軍韓暹、驃騎將軍楊奉、車騎將軍胡才、徵北將軍李樂、徵西將軍馬騰、前將軍公孫瓚、後將軍楊定、右將軍袁紹、衛將軍董承，此外還有鎮東將軍曹操、鎮南將軍周瑜、鎮西將軍韓遂、平東將軍呂布、安南將軍劉表、安東將軍張揚、輔國將軍伏完等。
至於原來的後將軍袁術，因從未給朝廷貢奉過，爲人又傲慢、冷漠、無禮，被劉協給撤了。
韓暹、楊奉、胡才、李樂、馬騰、韓遂、楊定等人，不是白波賊帥，便是西涼叛軍，儘管他們曾獲得過軍職，此一時彼一時，此時他們皆爲朝廷的叛逆，對他們的任命自該撤銷。
袁紹、呂布、劉表、周瑜、公孫瓚等人皆爲一地的諸侯，雖然不在朝廷的控制之中，但是他們也還都沒有明着自立爲王，有了給他們封的官職，名義上都還歸許都這個朝廷的領導，保留着當然好。董承和伏完二人都是天子的老丈人，保留個軍職也是有名無實罷了，不會有什麼威脅。
於是曹操草擬了一份軍職的名單，呈給了天子劉協，劉協覺得也有道理，便下發了詔令，該撤的撤、該換的換，至於撤掉韓暹後空餘出來的大將軍一職，地位超過三公，又掌管着全國的軍隊武裝，劉協將此職授給了曹操。
與此同時，經過反覆斟酌，曹操對文官體系也進行了大幅度的調整。
三公，即太尉、司徒、司空，皆爲金印紫綬，是皇帝身邊掌管軍事、民政、監察的最高職官員，但自霍光以大將軍一職掌管天下兵馬後，太尉便不再管理軍隊了，實爲丞相，爲文官之首。三公可分別開府，置僚佐。
此時朝廷的三公分別爲，太尉楊彪、司徒淳于嘉、司空張喜，都是先朝舊臣，忠的必然是漢室，曹操自然不願意他們繼續佔據這樣的高位，便要求天子劉協將他們三人同時免職了。
曹操以袁紹功績大爲由，將太尉一職送給了袁紹。這是爲了安撫袁紹，畢竟袁紹曾經是關東盟軍的盟主，也曾經是曹操名義上的上司。其實曹操還有一絲促狹的心理，你袁紹不是不願迎接天子麼？正好給了我這個機會，從此我的指令便是朝廷的詔令，讓你後悔去吧
同時，曹操讓當朝名士趙溫當了司徒，統管民政。趙溫字子柔，蜀郡成都人。趙典侄，趙謙弟。初爲京兆郡丞，嘆道：“大丈夫當雄飛，安能雌伏”遂棄官歸四川。正遇家鄉災荒，慷慨施放家中積糧賑救饑民。後封江南亭侯。十三年後，趙溫因爲拍曹操的馬屁，推舉曹操之子曹丕到其府中爲掾，卻被曹操上奏趙溫闢臣子弟，選舉不實，免趙溫官，同年去世。
司空因暫無合適人選，曹操乾脆將其空缺。
在曹操的主持下，許都的漢室朝廷先後徵召名士趙岐、張儉、桓典、徐繆、陳紀等人補充進來，加上尚在其位的韓融、榮欱、楊奇等人，基本保證了朝政的日常運轉。
趙岐其年已九十歲，絕對高壽的年齡，當年曾出使關東。張儉是個老黨人，本年也已經八十三歲了。陳紀則出身於潁川郡著名的陳氏家族，在許都一帶很有影響力，本人也已七十一歲了。他們已經不太可能再做什麼實質性的工作了，曹操擡他們出來，也就是裝個門面，掛個金子招牌，擴大許都朝廷的影響力而已。
曹操最爲重視的卻是朝廷的日常辦事機構--尚書檯。尚書檯由漢武帝始設，是朝廷的中樞機關。光武帝劉秀鑑於西漢末年大權旁落於貴戚大臣，所以竭力把權力集中於君主，凡機密之事全部交給尚書，以此制約三公。因而加重了尚書的職權。因尚書的官署在宮禁內而稱爲臺閣，故有尚書檯之稱。
尚書檯的組織有：尚書令一人，秩千石。若以公爲之，則增秩二千石，儀禮亦加。尚書僕射一人，秩六百石。職署尚書事，尚書令不在，則代行處理公務。尚書左、右丞各一人，秩四百石，掌錄文書期會，佐令、僕治事。六曹尚書，秩各六百石。三公曹，掌管年終對州郡官吏的考績；吏部曹，掌管選舉和祭祀；民曹，掌管一切有關修建和鹽池苑囿的管理；客曹，掌管護駕邊疆少數民族朝賀事務；二千石曹，掌管司法訴訟事務；中都官曹，掌管水、火、盜賊等治安工作。尚書侍郎36人，秩四百石，每曹6人，職掌文書起草。
還有尚書令史18人，秩二百石，每曹3人，主書。東漢尚書檯權力極重，既出詔令，又出政令；朝臣選舉，由尚書檯主管；還擁有糾察、舉劾、典案百官之權；參預國家重大政事的謀議、決策，對朝政有着重大影響。
尚書檯權力雖重，但臺官職位卑微，長官尚書令不過千石，尚在九卿之下，這樣位卑權重，皆由皇帝親任幹練之士充任，便於控制，發揮效率高。
在曹操心目中，早就有一個人適合來掌握這個要害部門，此人便是荀彧。荀彧曾在天子身邊擔任守宮令，熟悉宮內事務，性格沉穩，考慮問題周全細緻，他又出身潁川大族，很容易與天子及各位老臣們溝通。當然，最重要的一點便是，荀彧是曹操的心腹，對曹操忠心耿耿，是絕對信得過的人。
從此以後，在曹操領軍在外的時候，尚書令荀彧就成了後方的大管家。荀彧也不負衆望，將各項事務處理得井井有條，爲曹操分了不少憂，堪比昔日的張良張子房。
預知後事如何，且聽下章分解。
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