劉明遠對懷遠軍進行了大刀闊斧的改革，在編制上，軍銜上，還有軍服等全部都進行了了改革，還有樞密院的架構上，完成了懷遠軍的又一次進化。
此時，隨着劉明遠的改革開始，懷遠軍陸師四十萬人，被劃分成爲三十個師，建立十個軍，海軍將近十萬人，被編制爲八個師，編制爲兩個軍，每個師配備戰鬥海船四十到五十艘，同時還有運送海船不等。
劉明遠對懷遠軍初步完成了改革，同時未來懷遠軍的擴建也將全部按照這個標準建立，也將避免了軍隊臃腫和建制混亂的局面，同時對於指揮調動，還有軍令指揮也將更加便利，而不是之前計算人數參戰，大大提升了指揮調動能力。
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同時劉明遠也明確了軍隊的編制番號，陸軍就是以“陸”字開頭，然後後面是簡明的阿拉伯數字，然後就是部隊的級別。
比如陸一軍，就是陸軍的一個軍的番號，陸一師，就是陸軍一個師的番號、陸一團，也就是陸軍一個團的番號，陸一營，就是陸軍一個營的番號。
海軍也是如此，這樣的編制番號非常簡單明確，在戰鬥中非常實用，同時對於軍隊的管理也非常方便。
於是懷遠軍陸軍就有了十個軍的番號，三十個師的番號，九十個團的番號，四百五十個營的番號，然後就是連、排、班。
同時海軍也是如此，有了兩個軍的番號，有了八個師的番號，然後就是二十四個團的番號，一百二十個營的番號。
這樣的編制也非常詳細，對於軍隊的指揮作戰有很大的幫助，也是對軍隊管理最好的方式，以後也不會在稱呼某部的人馬了，直接可以使用番號，就可以明確軍隊數量。
此時剩下的就是軍銜制了，這也是武將們最關心的事情，隨着新的軍事改革開始，劉明遠也在龍鳳五年實行了新的軍銜制，這也是明確指揮和等級的重要標誌，也是爲了明確未來戰場上的指揮權。
劉明遠授予了陸軍四個上將軍銜，分別是常遇春、傅友德、馮國用和馮國勝四人，此四人中除了馮國用一直在樞密院之外，其餘的三人已經是懷遠軍中的三位統軍大將了。
同時劉明遠還授予了陸軍十一箇中將軍銜，分別爲花雲、胡大海、繆大亨、王弼、華雲龍、鄧友德、張龍、陳桓、張天佑、唐勝宗、廖永忠。
這十一人除了唐勝宗不在軍中任職之外，剩下陸師十人全部本任命爲軍長，統領十個軍的人馬。
劉明遠將廖永忠暫時劃歸到陸軍之中，也是爲將來海軍陸戰隊做準備，廖永忠熟悉水戰，劉明遠準備將讓他在陸地上再歷練一番，然後組建未來的海軍陸戰隊。
隨後就是陸軍少將軍銜，趙德勝、康茂才、吳楨、盧德茂、沐英、繆義、藍玉、郭興、郭英、胡延瑞、張定邊，張必先、陳英傑、李明道、鄧克明、朱亮祖等，一共有上百人。
這些人大部分都被任命爲師長，其中更多的都是懷遠軍中從戰爭中漸漸成長起來的子弟兵，就像以沐英爲首的青年將官，經過數年的戰場生涯，加上被劉明遠軍事思想的影響，已經可以獨擋一面了。
劉明遠也非常看到張定邊和張必先，還有陳英傑、鄧克明這些投降的將領，於是也毫不吝惜地授予阞少將軍銜。
劉明遠知道這些人中有很多人都是可以擔當獨擋一面的大將，但是他們是投降過來的，如果上來就授予高軍銜，會讓很多懷遠軍老兵心中不服，於是劉明遠讓他們暫時擔任統領一萬人的師長，於是在陸師九十個師的編制中，這些人就不顯眼了，同時他們任職的師戰鬥力自然也只是一般的師。
在海軍方面，劉明遠授予了兩位中將，分別是俞廷玉和廖永安，然後就是少將，沒有上將軍銜，也是因爲海軍畢竟晚於陸師，而且海軍投奔到懷遠軍之前，那時懷遠軍陸師已經初具規模，很多將領都已經在裡面廝殺多年，所以劉明遠沒有授予海軍上將軍銜，只是授予了俞廷玉和廖永安中將軍銜。
然後海軍少將爲，桑世傑、張德勝、華高、俞通源、俞通海、俞通淵、趙庸、趙馘等。
劉明遠對海軍給予了非常高的期望，但是此時天下還沒有統一，北伐大業也沒有開始，陸師依然是重點。
敵人，陸師依然是這個時代最重要的一支力量，所以陸師將來只會壯大，甚至可能超過百萬的規模。
劉明遠這次針對懷遠軍的改革也是非常深入的，就是將來他登基稱帝了，懷遠軍也已經不用再進行改動了，只需要對稱謂進行一番改變就可以。
劉明遠清楚，後世的軍事思想和編制，自然是有道理的，而且又是軍事發展數千年來的一個結果，所以劉明遠纔會採用這一套軍事制度，完全廢棄了這個時代落後臃腫的軍事制度，建立一套近乎現代的軍事制度，也爲懷遠軍的發展壯大奠定了基礎。
劉明遠的改革是全面的，但是最先開始的就是軍隊，軍隊是劉明遠的基業，也是一切的基礎，所以他要最先改革，讓軍隊的改革完成之後，他纔開始對行省和文官進行改革。
此時行省文官們看着劉明遠熱火朝天地改革軍隊，也是一陣眼紅和好奇，但是和歷朝歷代不同，劉明遠的軍隊改革讓文官完全插不上手，就是李善長也只是一個看客。
文官們此時也深深地體會到了，他們和軍隊完全沒有任何交集，軍隊就是劉明遠一個人的天下，從軍隊編制到軍人的制度，都是劉明遠一人的思想，任何人都沒有插手的機會，就是樞密院的馮國用也全部聽命劉明遠的安排。
於是衆人就看着劉明遠一個個地下達軍令，文官們完全插手不進來，一時間讓很多文官都感受到了劉明遠的威嚴和智慧。
這些人此時才明白，整個懷遠軍的五十多萬正規部隊，全部都是聽命劉明遠的，任何人都調動不了，指揮不了，文武完全分開。
於是在經過龍鳳五年半年的軍事改革之後，懷遠軍的改革也全部完成了，懷遠軍頓時煥然一新，全軍上下士氣高昂。
此時文官們知道，懷遠軍的改革完成了，然後就是他們了，他們清楚劉明遠是一個個地來，因爲這需要時間，同時也是爲了穩定，最重要的軍隊已經牢牢地控制在劉明遠手中，並且完成了改革，那麼文官制度如何改革都已經沒有任何難度了，也是劉明遠一個人說了算的事情。
但是文官改革還需要一個契機，那就是此時劉明遠的身份要變動一下了，此時劉明遠還是大宋朝江南行省的丞相。
劉明遠對軍隊的改革是自成一派，無論是軍隊的編制還是官職軍銜，都是不同於這個時代，外界也不會引起任何波動，畢竟懷遠軍就是劉明遠的，劉明遠如何改革都是他說了算。
而且劉明遠沒有使用這個時代的官職稱呼，懷遠軍又和地方行政體制分離，所以不會影響到行省，也不會影響到安豐的大宋朝廷。
但是劉明遠對文官的體制的改革就不同了，因爲衆人都知道劉明遠這個改革是爲了將來登基稱帝做準備，但是此時頭上頂着一個行省丞相的名頭，於是下面的改革和任命，還有官職的設置就有些不方便了。
而且劉明遠手下的文官們也不希望他們的官職太低，就像李善長只是一個長史，但是誰不知道他就是丞相呢，大家都希望能夠得到實實在在的官職。
而且隨着懷遠軍越來越強盛，劉明遠手下的文武官員早就對現在劉明遠的名頭不滿了，衆人紛紛希望劉明遠能夠去除大宋朝的名頭，自立一家，甚至直接稱帝。
尤其是此時懷遠軍已經統一了南方，有了實力和底氣，所以這種呼聲也越來越高。
隨着龍鳳五年上半年，常遇春對元庭湖廣行省展開最後攻勢，元庭湖廣行省平章阿思蘭也是潰不成軍，野戰不是懷遠軍的對手，元軍退守城池之後，也無法擋住懷遠軍火藥的攻擊，於是殘留在元庭手中的湖廣行省，被常遇春在三個月內就平定了，阿思蘭也被常遇春俘虜了，然後被押解到了金陵城。
此時隨着湖廣行省徹底平定，還援軍海軍也登陸了海南島，於是懷遠軍已經完成了統一南方的戰略，此時還有云南未統一，進入雲南的通道很崎嶇，都是大江大河，和川蜀一樣，劉明遠此時還沒有對雲南攻擊的計劃。
此時隨着懷遠軍統一南方，於是擁護劉明遠稱王的呼聲越來越高，而且這次出面的不只是一些下面的官員，還有懷遠軍中重量級的將領們，常遇春在平定湖廣，回到金陵之後，也擁護劉明遠稱王，同時行省李善長也出面了，帶着萬人請命書，請求劉明遠稱王。