六部初步定了下來，剩下的就是對軍隊的詳細編制。
這是他盧俊義的軍隊，他是要造反的，所以根本不在乎什麼私改軍制的罪名，原來他沿用了一部分宋軍的軍制，後來覺得用起來很不習慣，還是用後世解放軍的軍制熟悉些。
一個現代人穿越到古代，成爲某個軍隊的絕對統治者，一言九鼎那種人物，讓他用他不熟悉的軍制去編制軍隊，讓他去指揮那個用他不熟悉也不喜歡而且還被證明對軍隊戰鬥力有少許副作用的軍制編製成的軍隊，那不是在折磨人嘛。如果盧俊義現在隸屬於宋朝禁軍，被童貫或者高俅指揮管轄着，借他膽子，他也不會luàn改軍制，這個可是要殺頭的。
最關鍵的是，這隻軍隊是盧俊義自己的，他還是用自己熟悉的軍制來編制來指揮合情合理點。（不能片面地追求古代歷史的真實感，回到古代的穿越人要改變的東西太多了，如果每個都要照着古代的樣子搞，到頭來這個歷史還是沒有改變。不想多解釋了，總之一句話，一個制度合理不合理，要辯證去看，不能一杆子打倒。）
盧俊義針對這個時期基層軍官很難培養的特點，沒采用後世的三三制，而用了四五制。
一個班五個人，一個正班長，一個副班長兼政委。個排四個班，二十人。正副排長各一名、一名政委。
一個連五個排，一百人，正副連長各一名、一名政委。
一個營四個連，四百人，一個營長兩名副營長、正副政委各一名。
一個團五個營，二千人，一個團長兩名副團長、正副政委各一名。
一個師五個團，一萬人，一個師長三名副師長、一名正政委二名副政委。
一個軍五個師，五萬人。一個軍長三名副軍長、一名正政委二名副政委。
各級隊伍地順序按照編碼從第一到第二。以此類推。
因爲各地地俊義武館紛紛關閉。原場地由盧俊信接手。改作其他生意。擔任助教地近衛士兵紛紛撤回。同時徵召該地地流民加入。喬裝改扮。奔赴梁山。一個月內。從河北、山東等地回來地原近衛士兵有一千七百五十名。他們招攬過來地流民有三千多人。因爲真正地動luàn大災年還沒有爆發。再加上原來地孤衛一千人和寒衛一千人。盧家地佃戶家丁一千多人。原梁山地七百多人。俘虜歸順地禁軍士兵一千五百多人。總共一萬多人。那些身體羸弱有殘疾地轉做工匠、養殖。這樣一來。有近一萬名四肢健全、身體健康地可編爲正式軍人。
盧俊義宣佈成立一個滿編師。編號爲第一軍地第一師。綽號，倒頭歸順。盧俊義看了看所有地下屬將領裡深諳騎兵之術的沒有幾人，索超敗在自己手下，但相對於其他禁軍將領無疑也算優秀地。以後會陸續上來許多騎兵將領，到時候梁山的規模也極大地擴張了，自然會有他們地位置。
騎兵團的職責有整體衝鋒、他下面的騎兵營有配合其他步兵團行動的職責，到時候都會有統帥部統一調配。但如果遇到緊急戰況，步兵團和騎兵團可以先配合戰鬥，再稟告統帥部。這個舉動主要是吸取宋軍死板教條的失敗教訓，給與前線指揮官一點靈活的決策權。
騎兵團的整體配置有彎弓、長槍、彎刀，豹子頭林沖那一營身披重甲，是重騎兵，其他四營身着皮甲，爲輕騎兵。通常採用重騎兵正面bī近，輕騎兵兩翼包抄的戰術。
第一師的第三團爲步兵團，團長爲賽秦瓊王進，盧俊義原本想讓他擔任騎兵團團長，後來覺得林沖更擅長騎兵作戰，而王進步戰和騎戰都可以，便任命王進做步兵團長。王進的副團長爲黑旋風李逵、雲裡金剛宋萬。李逵負責一個突擊長槍營，之所以把他安排在王進麾下，是因爲王進武功超高過他，能壓制住他，讓他不得不服，否則找他晦氣的人太多了。
第一師的第四團同樣爲步兵團，團長爲當初黃山四傑的老大磨雲金翅歐鵬，他的副手爲跳澗虎陳達、摸着天杜遷。任命歐鵬做爲步兵團團長，而沒用一開始就從龍的史進，原因就是史進太過年輕，個xìng衝動，需要錘鍊，而歐鵬老成持重。
雲裡金剛宋萬和摸着天杜遷這兩個人，跟後來出現的險道神鬱保四一樣，顧名思義，都是大個子，本事平庸，難得是有眼sè，盧俊義爲了團結原來梁山的八百人才這麼安置，否則以這兩位的資質，做個副連長都勉強，他們只是做副團長，一個擺設，並不負責指揮。
其實盧俊義現在手下的將領中，只有王進、林沖和岳飛是合格的，其他人都需要特訓，合格上了才能帶兵上戰場，否則就由俊義武館出來的人來頂替。未來幾個月內他們除了軍事訓練外，就要參加由盧俊義刻意開辦的梁山軍校的軍官速成班。
每個步兵團都配備了二個弩兵營，二個長槍營，一個騎兵營。實戰中，步兵的刀殺傷力遠不及長槍，俗話說三箭不如一刀，三刀不如一槍。不過宋代的弩箭威力強勁，強勁到不是盔甲和盾牌可以抵擋的，既然shè擊抵擋無用，乾脆就丟掉微薄的防禦力換取最大的殺傷力。
騎兵營的作用除了做追擊衝鋒sāo擾的戰術外，還有一個斥候偵察的作用。
每個團配備的政委、營連排班級別政委的人選基本都是從盧俊義的三衛裡面挑選。
第一師同時還轄有一個水兵團，由海上歷練回來的張順擔任團長，李立、童猛擔任副團長，日後的阮氏兄弟會先派到海上進修半年，再讓他們回來，這樣海上湖上jiāo替作戰，一則防止他們結黨營私，二則防止河海戰術的不兼容。孟康率領了一半工匠來到梁山，開始打造適合梁山的戰船，另外一半船匠留在密州，由盧俊遊統領，繼續爲李俊的海軍打造戰船。
李俊東海上的海軍編號爲第二師第一團，如果李俊能夠將二千海盜發展到一萬人，便委任他爲第二師師長，隸屬於第一軍，軍長自然還是盧俊義。這個自然是後話了。
（宋朝自己定下的規矩是五百人一指揮，五指揮爲一軍，十軍爲一廂的正規編制，可是看遍大宋八十萬禁軍也沒有一支軍隊是按照這個規矩來編制的，真的不知道幹什麼還要定下這個規矩。而且全國的軍隊編制的如此混luàn，比如那個什麼歸恩軍僅有二指揮，就算這二個指揮都是滿員的，一軍也只有一千人，真的不知道當官的是這麼想的，爲了一千人就單獨編制爲一軍，換了我就是不嫌luàn還要嫌麻煩那。宋代的編制實在太luàn太爛，如果要還原那個時代的話，我自己怕是先要吐血了。）