四月底革命軍基本上已經控制了廣州大半土地，陳炯明之流大勢已去，逃至港地寓居當起了寓公。
就在革命軍上下歡呼之時，在京參加‘和平協商’解決廣州問題的孫文先生此時卻不幸染病去世。
孫先生的病逝，在南方革命政權內部出現了“誰繼承孫文”的問題，當時大元帥府仍然存在，誰也不敢自命爲繼承人，也提不出一個合適人選，於是只能由秘書長鬍漢民代理。
胡是國民黨右派，同共產黨不打交道，與廖仲愷等國民黨左派也貌合神離。加上蔣介石也對“大元帥”的職位垂涎三尺，於是國民黨內部出現重重矛盾。
各派軍閥出於權欲，趁機割據。廣東一個省，一下子就出現了10多路司令，如駐在東關的劉震寰，西關的廖行超，北江的趙成樑，石龍的曾萬鍾、楊池生、楊如軒，還有人數衆多、控制廣州市中心區，號稱“3萬雄兵”的總司令楊希閔，等等。其中以楊希閔、劉震寰兩支勢力最大，他們心懷叵測，又與英帝國主義和北洋軍閥暗中勾結，陰謀策劃發動軍事叛亂，圖謀顛覆廣州革命zhengf，吞併東征果實，控制廣州局勢。
楊希閔、劉震寰以爲發難機會已到，準備西聯雲南唐繼堯，北聯軍閥段祺瑞，圖謀割據廣東。楊希閔自稱滇桂聯軍總司令，調兵遣將，首先在廣州宣佈戒嚴，阻撓東征軍右路軍回師廣州，挑起了一場針對革命軍的不義之戰。
廣州形勢突然間異常緊張。在中國共產黨和國民黨左派廖仲愷等人的堅決主張下，廣東革命zhengf命令黃埔校軍等東征軍迅速回師廣州，討伐楊希閔、劉震寰部。
從兵力對比看，平叛的革命軍佔有絕對優勢。
廣州參加叛亂的滇、桂聯軍部隊大約有2.5萬人。
而在革命軍方面，參加平叛的有譚延闓、程潛、朱培德、李濟深、李福林等將軍的部隊和黃埔校軍，總計有4.7萬餘人。
這時，周圍的政治軍事環境也有利於革命軍。在潮汕方面，地方軍閥陳炯明部洪兆麟師4000人已退向福建，林虎部6000人敗兵退縮到梅江以西，短期內都暫時無力反撲；南寧方面，範石生部與李宗仁部匯合後約1萬餘人，擋住了唐繼堯進攻廣州的去路；粵西方面，鄧本殷部7000餘人一直保持中立。
5月21日，黃埔校軍官兵、師生冒着酷暑，奉命兼程回師廣州，平定劉、楊叛亂。
“孃的，我們在前方打的生死難料這幫人人倒在後面捅了我們一刀，真是可恨之極！”劉開憤憤道。
“楊劉之部，本來就於我軍有二心，這次只不過是借這次事件，徹底鬧翻而已，沒什麼放大不了，只要我革命軍擊碎他們的陰謀，那麼至此我兩廣地區將再無敵手！”胡超分析道。
“這大熱天大的，害得我們到處跑，這楊劉二人可真不是個東西。”馬騰遠說道。
“大家做好準備吧，此次楊劉聯軍來勢洶洶，我估計着之前的一切暗中對我革命軍不滿的人都要出來鬧上一鬧了。”趙清明沉聲道。
楊希閔、劉震寰的滇桂軍多是一些煙兵賭將，軍官比士兵多，煙槍比步槍多，步槍比子彈多。
無論官兵，每人都有兩支槍，一支是步槍或手槍，一支是鴉片煙槍。
這些部隊的官兵雖然在平時散漫，但打起仗來還能抵擋一陣子，他們最大的特點是戰場經驗多，火線上沉着。他們在陣地上一邊打仗，一邊抽鴉片煙，能在槍林彈雨中沉着地抽菸，煙抽足了，過癮了，就能玩命衝鋒。黃埔校軍當初不知當面敵軍的這個特點，猛打猛衝，在瘦狗嶺和白雲山一帶激戰，但收穫不大。打了一天硬仗，戰局仍處於膠着狀態。
這其實在當時也是一個現象，以川軍和雲貴軍爲典型，這些地區經濟不發達，軍閥們爲了養軍，不得以大量種植鴉片，有時候以鴉片代替大洋，因此軍隊幾乎是人手一杆煙槍！
這也導致了軍隊素質較低，普遍營養不良。
黃埔校軍的官兵們衝殺向對岸，直殺得當面之敵人仰馬翻。飛鷹軍艦上的炮發揮了重要作用。艦上的炮既老又舊，雖然能打響，但射程不遠。有一發炮彈落在廣九路車站的敵軍司令部。
那個號稱“滇桂聯軍總司令”的楊希閔，正與他的同黨、大軍閥趙成樑一同吃飯。炮彈剛好落在離飯桌很近的地方，趙成樑被炸掉了半截，當場死亡，楊希閔僥倖沒有中彈，但也嚇得夠嗆，再加上前線接連告急，於是匆匆收場，把趙成樑的屍體搬回廣州市內。楊希閔一到市內，便成了孤家寡人，狐羣狗黨們見他在前面吃了敗仗，一個個都滑腳早溜了。
楊希閔見大勢已去，只好丟盔棄甲帶着幾個親信逃進了沙面租借地，在廣東的滇軍至此全軍覆滅。桂軍劉震寰原來也有4000兵力，滇軍潰敗後，他率部退到西村，黃埔校軍已在這裡等着他了。
桂軍還未喘過氣來，就遭到一陣猛打，結果全部繳械投降，劉震寰狡猾得像只狐狸，一看形勢不對，早已作了準備，化裝逃出廣州。
自此在廣州各地革命羣衆的幫助下，黃埔軍在短時間內迅速平息了楊、劉叛亂，使革命zhengfu轉危爲安。
消滅滇桂軍楊、劉叛亂的戰鬥結束後，爲了收容俘虜，安定市民，在共產黨的領導之下，革命軍在黃埔軍校和教導團中抽調了一部分骨幹，組成全副武裝的宣傳隊。
這個宣傳隊，大部分是共產黨員，少數是青年軍官中的積極分子，由共產黨員李之龍爲隊長，左權等是這個隊的成員，他們統一穿黃咔嘰軍服，俄式軍帽，穿皮鞋，扎綁腿，步伐整齊地進入廣州市，維持社會治安。具體任務是：安定民心，防匪防盜，驅逐散兵遊勇，穩定社會秩序。他們走上街頭，受到市民們的熱烈歡迎。
平定楊、劉叛亂後，在中國共產黨提議下，廣東革命根據地原稱爲“大元帥府”的革命zhengfu於7月1日改組爲國民zhengfu。國民zhengfu以黃埔軍校教導團爲基礎，成立了國民革命軍第1軍，周主任擔任第1軍的政治部主任。隨後，又將湘、滇、粵、閩各軍改編爲國民革命軍第2、第3、第4、第5軍。程潛領導的攻鄂軍與豫軍、贛軍等部也先後奉調回廣東。
當東征軍主力回師廣州討伐楊、劉叛亂時，粵東的軍閥陳炯明又死灰復燃，乘機重新佔據梅縣、潮汕、惠州等地乃至整個東江地區，而盤踞在廣東南部的軍閥鄧本殷部也配合陳炯明的進攻，在英帝國主義分子和北方軍閥的支持下，分左、中、右、側4路，形成對廣州的夾擊之勢，企圖推翻國民zhengfu。