目前中華軍手中的地盤包括了整個的臺灣島，呂宋島和大半個棉蘭老島，還有北邊的琉球羣島，整個時候還包括東南沿海的一些島嶼，這些地方除了琉球島上目前暫時沒有駐軍意外，其他地方都駐紮着中華軍的軍隊，一萬多人的軍隊，除掉海軍以外，剩下的軍隊數量實際上還不到一萬兩千人，再細分到各地，留在基隆的，或者說是能夠緊急調動的軍隊數量還不足五千人，這對於實現中華軍的目標來說還是有很大的差距。
擴軍的問題被再度提上了日程，而這個時候隨着大量的人口的遷徙過來，實際上中華軍能夠從中招募很多的士兵，這裡面固然有很多年老體弱的老人，但是也不乏很多年輕力壯的青年，但是大多數還是拖家帶口的家庭舉家遷徙，項玉打算在這羣人中間招募兩千人，然後在民兵中間招募五千人來轉成軍隊，這樣一來中華軍能夠調動的軍隊的數量就能夠達到一萬兩千人了，這個規模相對於清廷的百萬軍隊來說確實還是有巨大的差距，但是就目前來說也是能夠應付得了。
隨着移民的增多，臺南開始逐漸的充實起來，之後許多人口開始分流向臺東和臺中，這兩個地方的人口還是太少，尤其是臺中，這裡有一處石油的出產地，但是周圍都沒有百姓居住，因此很多補給都要從基隆運輸過來，不僅費時費力，而且還容易遭到島上中部山林裡面的部落人的襲擊。
對於這些部落人，中華軍的態度是很強硬的。但是也是比較有原則的。那就是隻要這些部族不來主動襲擊和妨礙中華軍的生產建設。中華軍對於他們的存在就當是默認了，也不會特別針對他們，但是一旦他們踏過紅線，主動挑釁中華軍，或者襲擊各地的百姓，那麼中華軍採取的就是零容忍政策，發現一個這樣的部族就堅決的打掉一個，根本就不跟他們講什麼民族政策或者是特殊待遇。
項玉想要的是一個安定的臺灣。因此島上註定不容許有太強大的反抗勢力的存在，他可不想將來再跨海對清朝作戰的時候，自己的大本營會被這些原住民搞的亂七八糟，因此長痛不如短痛，這個時候抓緊時間趁着外部沒有大的戰事，就一下子將這些問題徹底解決掉好了。
中華軍這邊於是派人進山通知各部族，要麼向中華軍表示臣服，並且將整個部落遷徙出來，中華軍這邊會負責他們的安置，要麼就選擇留在原地但是不允許擁有武器。只能進行農耕生活，只有這兩個選擇提供給他們。
這樣的政策自然被這些人毫不猶豫的給拒絕了。那麼這樣一來就給了中華軍一共出兵的藉口，項玉決定對這些原住民用兵，徹底剿滅他們。
根據之前荷蘭人留下的情報，島上的少數民族的數量大約有五萬到八萬人左右，但是其中大部分都是高山族人，而這個時候高山族已經向中華帝國俯首稱臣了，所以也不再是中華帝國的威脅了。
經過清點，高山族的人口一共有三萬六千七百餘人，也就是說島上其他少數民族的人口數量大概在一萬五千人到四萬五千人左右了，具體的數字實在是難以統計，只能夠估算，但是根據投靠中華軍的高山族人和其他少數民族的原住民情況來看，他們的耕種技術十分的落後，而且島上的主要的耕地都集中在南北兩端，東西兩側也有小部分的耕地，但是臺灣中部因爲山林衆多，因此可能用於耕種的土地的面積十分的有限，而且他們的耕種技術和種子都比較的落後，往往畝產還不到一百五十斤，這樣一估算，島內的少數民族人口應該在兩萬五千人以下。
這些人中就算是成年男子全部是作戰人員，那麼估計大概的兵力應該在八千到一萬人左右，而實際上的數字會比這個要低上不少，這主要是這些少數民族內部也會出現爭鬥，他們之間互相廝殺不斷，因此成年男子的數量必然不會很多。
中華軍這一次一共出動了十支部隊，每支部隊的人數大概在三百到八百人不等，這些部隊分成幾個方向，沿着不同的線路從北到南開始向臺灣中部的山脈挺進，他們的作戰命令很簡單，那就是將抵抗者全部肅清，這一次的軍事行動被後世的人稱爲二月屠殺事件，主要的原因是島上的原住民的抵抗意識非常強烈，往往是全民皆兵，不僅是青壯年男子，甚至是婦女和兒童也會拿起武器參與作戰，因此給中華軍帶來了不少的傷亡。
而隨後惱羞成怒的中華軍士兵們，則完全將心中的憐憫之心拋之腦後，嚴格的執行了上面的對敵政策，凡是抵抗者全部肅清，因此往往是軍隊走到哪裡，哪裡的原住民要不就是被屠殺乾淨，要麼就是全部逃走了，這一行動一直持續了兩個半月，一共造成了一萬九千餘名原住民的死亡，剩下不到三千人被俘虜，倖免於難的人口數量還不足一千人，在幾百年之後，這些原住民的子孫們對於被稱爲中華帝國國父項玉依然懷有極大的仇恨，始終認爲中華軍是外來的侵略者，而項玉則是徹頭徹尾的屠夫，不過這些項玉當然不會知道了。
到了四月底，持續兩個多月的行動終於結束，中華軍這邊也付出了慘重的傷亡，一共有三百餘名士兵陣亡，超過兩千人受傷病影響，陣亡和受傷的士兵之中，大部分都不是在和敵軍的戰鬥之中所受的傷，而是在行軍的遇到的各種不利的條件，比如說各種毒蛇和蚊蟲以及各種各樣的生物。
好在這些傷兵們的傷勢並不是很嚴重，一經脫離了島中山林的那種環境，他們大多數都能夠在短時間之內恢復過來，並不會對軍隊造成太大的影響。
但是這場軍事行動的意義卻十分的重大，經此一役之後，中華軍在對外用兵和作戰之中將再無顧忌，島內的安定局勢會使得中華軍全身心的投入到正面戰場上去，也使得在之後的戰鬥裡面中華軍大軍勢不可擋，連戰連捷。(。