運河遭受攻擊後，崇禎皇帝再無與多爾袞戰鬥下去的決心，而多爾袞亦心照不宣，連夜將八旗軍撤往張家口，醞釀多日的明清決戰竟然如此草草收場。
朱由檢隨即派谷大用率兵東進，沿運河南下，切斷劉芳亮退路，力求將流賊殲滅於淮河以北，山東以南的平原地帶。
於此同時，忠親王多爾袞率領八旗軍主力，匆忙向口外撤離，建奴以軍功立國，靠擄掠其他民族獲得民族凝聚力，現在這個軍事體制行將崩潰，多爾袞的號召力也就沒那麼強了。當然，對於多爾袞來說，眼下還有更重要的事情，那就是回到盛京，與豪格貝勒爭權。八旗軍在密雲受挫後，盛京關於忠親王的流言蜚語越來越多，甚至有人議論說輔政王已經被明國買通，否則很難解釋，爲何所向披靡的八旗勁旅，在多爾袞帶領下，連連敗於明國，而且是像密雲這樣的小城。
不管如何，明清明清雙方心照不宣，都選擇了退兵。
崇禎十七年六月初六，谷大用率領兩千新軍抵達山東臨清，在臨清附近燒殺搶掠的劉芳亮部提前得到消息，準備向南逃竄，卻被左良玉麾下大軍死死堵在了運河以南。這位左良玉，平日裡遇上流賊只是逃走，或者在朝廷三令五申下稍稍抵抗，只爲保存自己實力。不過這次他對妄圖南逃的順軍卻是毫不手軟，幾乎把所有親兵都押上了。
兩三年前，奴酋阿濟格率八旗一部破口而入，攻略大明，從喜峰口一直打到山東腹地，奔馳上千裡，明軍觸之擊潰如，韃子入無人之境。那時候也沒見到左良玉如此強悍。
話說回來，這也難怪，由臨清再往南，就是左良玉的地盤，對於這位準軍閥來說，人可以死，地盤是不能丟的。
更何況對付流賊，明國將官自然平添很多信心，在他們看來，流賊與韃子不可等日而語。簡單來說，明人在內鬥這件事情上無疑更有天賦。
順軍發現很難突破左良玉大軍防線，便使出了他們從前慣用的伎倆，派遣使者向左良玉賄賂，希望對方能高擡貴手，放自己一條生路。
就在左良玉猶豫不決，不知該當如何時，谷大用率領兩千新軍殺來了。接下來的事情過於平淡，無需多說，總之是劉芳亮部傷亡慘重，三四千人只逃走了一千人不到，死去的流賊都被谷大用派人投進運河，祭奠死難的英靈。
劉芳亮策劃並實施的這場殺戮幾乎讓朱由檢陷入絕境，倘若多爾袞再晚走些時日，也許北京城已經讓韃子攻破了。
不過事情過後，仔細梳理事情脈絡，朱由檢發現此事倒也不是沒有任何好處，一個驚喜是，經過這場戰亂後，從前那些桀驁不馴，堅決抵制漕運改革的漕幫勢力被嚴重削弱，這就爲崇禎皇帝裁撤漕運提供了便利。
谷大用率大軍一路追擊，從河南一路追到陝西，朱由檢遂命令谷千戶停止追擊。畢竟窮寇莫追，另外更重要的是，再追的話，就進入李自成地盤了，勢必引起順軍激烈反抗，崇禎皇帝現在還沒有做好與李自成決戰的準備。
“劉芳亮叛亂，佔據河南，擁兵自重，李自成不會饒過他的，李闖中間又要起內訌了。李闖流賊，不足爲懼了。”
崇禎皇帝站在皇極殿上長生嘆息。說話之間，對李自成的革命事業流露出深深的惋惜之情。
當然現在還不是多愁善感的時候，他必須珍惜這段難得的和平時光，繼續大明的建設事業，同時開疆拓土，着手解決南方問題、
留守南京的那套班子該撤了，這些人只是混吃等死，除了白白耗費大明俸祿錢糧，再無任何作用。
“王承恩，隨朕去慈寧宮，“
兒女情長也是必要的，整天打打殺殺不近女色，那就是變成斯巴達三百勇士了，準確來說就變成gay了。
司禮監太監王承恩忐忑不安道：“皇上，原定今日午時舉行的獻俘儀式，您看？”
“哦，“朱由檢眉頭皺緊，自言自語道：“還有五百多高麗棒子還沒殺呢，那就晚些再去看皇后，先去殺人。”